Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001033112.3

Sequence Length

1472 nt

GC Content

0.3798

GGCGGGCUCUUGGCGUCUUGGGGGAACGCUGCAACCGUCGACGGGCCUGAUCAGAAGAUCGUCUUUCUCCCGUUUCUUCGCCAUCGCUACCCCUUAUUUUUGGUUGUAUUGCAGCUCAUGCCCUGGAAAAAAGAACCUUUGGGGUUAAAAACGACAACCAACAUCAGCCAUGAAAGAUCCAAGUCGCAGCAGUACUAGCCCAAGCAUCAUCAAUGAAGAUGUGAUUAUUAACGGUCAUUCUCAUGAAGAUGACAAUCCAUUUGCAGAGUACAUGUGGAUGGAAAAUGAAGAAGAAUUCAACAGACAAAUAGAAGAGGAGUUAUGGGAAGAAGAAUUUAUUGAACGCUGUUUCCAAGAAAUGCUGGAAGAGGAAGAAGAGCAUGAAUGGUUUAUUCCAGCUCGAGAUCUCCCACAAACUAUGGACCAAAUCCAAGACCAGUUUAAUGACCUUGUUAUCAGUGAUGGCUCUUCUCUGGAAGAUCUUGUGGUCAAGAGCAAUCUGAAUCCAAAUGCAAAGGAGUUUGUUCCUGGGGUGAAGUACGGAAAUAUUUGAGUAGACGGGGCCCUCUUUUGGUGGAUGUAGCACAAUUUCCACACUGUGAAGGCAGUAUUAGAAGACUUAAUUGUAAAAGCUCUCUUGUCACUGUGUUACACUUAUGCAUUGCCAAAGUUUUUGUUAGUCUUGCAUGCUUAAUAAAAGUGCUGAGACUGUUACUAAGUAAAAAGCUGUCAAACAUUUACUGAAAAUAGAAUUGGCCCCAUGGCUUGAUGUGAAGACAGCAAGGAAAGAAGCACCAGUCAAGUUGUGAACAAGCACCAAAUUAAAAGACCUAAACCUUACCAAAUUGUCUUUUUUUGAGGCUAAUCUAUCACUUGUUAAUGUCUAAACUUUAAAAUCAGUACAUUUAAUUUGAGUUCCAACUGUUAAGCAUAUUUCUCAGACUUAAAUUUGAUUAUGUCCCCAUCAAAAAGAAUCUCCAUUUUCUGAAGGUCUGUUAGUUAAUUUGAGAUAAUUUGUUAAAGGCAAGUAUGUCAUAUUACUGAGGCUACAAGUUAGUCAGCAGAUGAGUGCCAGUCCAGCCUUUUCUGGUAUGUUAUUGUUAGAAAUAUUGAGUUCUAAUGUUACAUCUGAGGAAGUAUGUAAUUUGAGAAUUGUAACUUCUAAGGGAUUCACUGCAUCAUAGCUAUGCCUGUAUGGAGUCUAACAUAUGACCAAUACCAACCCAUAAUCCAGCUGAACAAAGAUACUGUAACAUGAUUUGAGUGGUGCUUUUCCUUGCUUUGUUAACCAUCACGAGAGUCUGCAGCACAACUUUUAACAAAGCUAGAACAGUUUUGGCUUCUUAAACUUCAUAUUUGGGUAGGUUAAGCUGCCAUACGUGUUCAGUGUGAAUAGUGUUUAAGUUGAAAAUAUUGUAAAAAAAUUAUAUUUUUUCAAAAAUAUUUAAAAAAAUAAAUAAUAGUAGAACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-363.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -394.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 445.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((((..(((.(((((....((((((.(((((((.((((((((((....))))((((..(((((((..(((((((...................(((((((((((.((....((((((((..........)))))))).......(((........(((....))).........))))).))))))).))))....((((.(((.(((.((.((((((......)))))))))))))).))))....((((((((((.......))))))))))...((((......)))).((((......((((((..(((((.((((.(((...(((((((((((.(((((...)))))))(((..((((.....((((..(((((...)))))..))))....))))))).......((((.....))))......))))))))).))).)).)).)))))..))))))))))...((((....)))).(((....)))....(((...(((((....)))))...)))))))))).))))........))).)))).))))))....))))))).)))))).((((((.......(((((((((((........(((((...((((.((.((((..(.((((.(((((....((((((..((((((...))))...))..))))))..)))))..))))).)))))).))))))))).....)))))).....)))))........)))))).))))).))).(((((.(..(((((((((((..(((((((((.((((((((((.((((((..((((..(((((((.................)))))))))))..))).............((((.((....)).))))..(((((..((((((((((((......((....)).......)))))).))))))..(((((((............((((........))))...((((...((((.(((.(((.(((.((((((...))))))))).))).)))))))((((....(((((....((((.(((((.((...((((......))))..........((((((......((((((...(((((((((.....)).)))))))...)))))).....)))))))).)))))))))....)))))..))))(((((........)))))))))..........)))))))..)))))..........)))..)))))))))).))))))))))))))))..))))..)))))))))))))))))....((((((..((((..(((.(((((....((((..((((..(((((....)))..))..))))..))))....))))))))........)))).)))))).(((((((....(((((......)))))....)))))))..........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((((((,{({{,(({((,...,||,||,{||||||.|||||{((((....))))({{{..{{{{{{{..{{{{{{{...,{,,,.......,{{{(((((({((((.((,,..((((((({..........}}}))))}.......{||...,.,,,((({,{{|}}....,....||}}}.}}}||||,}||||,,|((((.((,{(({,((.((((((......)))))))))))))).))))....((((((((((.......))))))))))...((((......)))).{{{,.....(((((((,,(((((,{,((.(((...(((((((((,,.{{(((((.,.....,))))}{,((.....((((..(((((...}))))..))))....)))))}.....,,.((((.....)))),}....))))))))).))).)).}).,}})),,)))))))))}...{,(({{{.,,,)}|||,,..}}}...,||}...,,..({{{,.,,,)))})}))))}})),))))........)}).}))){|||||,{{{{{||||||{|||,||,{,..,,......,{{|{{,(((((.,.,{,,{((((,...,,,,}||.||||}.|,{|||}|,||,,,,.,{||{{..|{{{{|,,,||||.|{||{{||||||.,|,.,,..})))).)))))),}}},,,}}},,,..)))}},..)))))))))}}}...}))...))))))},))),{||||,{..{({(((((((({.,((((((((.((((((((((.{{{(((..((((..(((((((.................)))))))))))..)))....,..{,,{{{((,,,(,,,..,|,,.....{((({,.{{{{((((((((,.....{({,..|},......}})))),))))))||((({{{{...,,.{{{...((((........))})}}.)),,,..((({{(((.(((.(({{((((({...})))))))).))).)))))))|(((....{((((....((((.(((((.((,,.,{{(,,....,|))|,|,......((((({......((((((...(((((((((.....)).)))))))...))))))...,.})))}})).)))))))))....))))}..)))){{{{||.|{|...,,.,,))),.}))),....}}}}}},..}}},},,,.,}.,..)))..)))))))))).))))))))))))))))}.}}))..}))))}))))))))))),,.,|||||,..,{{,,,(((,((({{.,|,||||,.(((({{(((((....}}||,||.,}}}}..)))}.},.}}}}}))),}},,...}))},}))|||{(((,{{({{{{,,,,,},}}},}))))}},.,,|||||....,,,}}},,,.,,}}........