Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001034833.2
Sequence Length
674 nt
GC Content
0.5831
AAGUGAUGCCUAAAGCUGUGGACCGCGUGGGCUCGCCUCCCUGGGACUAGGUUUCAGCGGCCGCUGCGAUGACCAAAAUAAAGGCAGAUCCCGACGGGCCCGAGGCUCAGGCGGAGGCGUGUUCCGGGGAGCGCACCUACCAGGAGCUGCUGGUCAACCAGAACCCCAUCGCGCAGCCCCUGGCUUCUCGCCGCCUCACGCGGAAGCUCUACAAAUGCAUCAAGAAAGCGGUGAAGCAGAAGCAGAUUCGGCGCGGGGUGAAAGAGGUUCAGAAAUUUGUCAACAAAGGAGAAAAAGGGACCUGGGUGCAGCCGCAGGCUCCAAGCGCCCCACCUGUGUGAUAAUGGUCAAGCCCCAUGAGGAGUACCAGGAGGCUUACGAUGAGUGCCUGGAGGAGGUGCAGUCCCUGCCCCUACCCCUAUGAGGGGCUCCGGUAGCACCUGGGCACCUGCCGCUGGAAGCUAUUGGGCUGGCAGCAGGACGACUGGCUGUCCUCCUGCCCACCCACACUGACGGCAUCUUCCCAGUUCCCCAAGGCACGCCUUCUUCCCAGGCAGCUCUAACAGCCCUUUCAUGAAGGUAAUGCUAGUCUUCUGUCCAUCAGUGCCAUUUCCUGUAGAACUAAAGGCUGUUCCAAGAAUGUGGGGUGGGGAAAGUAAAUGCUAAGACUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-254.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -264.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 109.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((...((.(((((....((.((((.((((((((((((.((.((.(((..(((...((((................))))...)))..))).)).)).)))))..))))))).))))))((((..((((((.(((((.(((.((((....)))).....(((((...(((((((((((((((..((((((.(((.(((..(((.(...(((.(((.........))).)))...).)))))).))).))))))....((((((.....(((.((.......)).)))...))))))((((((((((...))))....))))))(((....)))...((((.......))))))))))..))))).))))..)))))))).)))))...))))))..)))).((((((.........))))))(((((((((.((.((((....))).).))..)))))))))..(((((.((((((......)))))).)))))...)))))))...))))))(((((....(((((.((((.((((((.....(((..(((.....)))))).....))))))..))))((((((..((....(((.........)))....))..))))))((((...)))).)))))..)))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,.((((((...((.(((((....{(.((((.((((((((((((.((.((,(((..(((...((((................))))...)))..)))}),.}).)))))}.})))))).)))))|((((..((((((.(((((.(((.((((....)))).....(((((...(((((((((((((((..((((((.(((.(((.,(((.,...(((.(((.,....,..))).)))..,).)),))).))).))))))....((((((.....(((.((.......)).))}...))))))((((((((((...))))....))))))(((....)))...{{((.......})})))))))..))))).))))..)))))))).)))))...))))))..)))),((((((.,......,)))))),((((((((.((.((((....))).).))..))))))))}..(((((.((((((......}))))).)))))...)))))))...))))))(((((,...(((((.((((.((((((.....{((,.({{.....})))}}.....))))))..)))}((((((..({....(({.|......})))..}.}}..))))))|||{...}},,.))))),,))))}{{{....}}}...,,.....
Back