Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001040058.2

Sequence Length

1561 nt

GC Content

0.4113

AGCAGCAGGAGGAGGCAGAGCACAGCAUCGUCGGGACCAGACUCGUCUCAGGCCAGUUGCAGCCUUCUCAGCCAAACGCCGACCAAGGAAAACUCACUACCAUGAGAAUUGCAGUGAUUUGCUUUUGCCUCCUAGGCAUCACCUGUGCCAUACCAGUUAAACAGGCUGAUUCUGGAAGUUCUGAGGAAAAGCAGCUUUACAACAAAUACCCAGAUGCUGUGGCCACAUGGCUAAACCCUGACCCAUCUCAGAAGCAGAAUCUCCUAGCCCCACAGAAUGCUGUGUCCUCUGAAGAAACCAAUGACUUUAAACAAGAGACCCUUCCAAGUAAGUCCAACGAAAGCCAUGACCACAUGGAUGAUAUGGAUGAUGAAGAUGAUGAUGACCAUGUGGACAGCCAGGACUCCAUUGACUCGAACGACUCUGAUGAUGUAGAUGACACUGAUGAUUCUCACCAGUCUGAUGAGUCUCACCAUUCUGAUGAAUCUGAUGAACUGGUCACUGAUUUUCCCACGGACCUGCCAGCAACCGAAGUUUUCACUCCAGUUGUCCCCACAGUAGACACAUAUGAUGGCCGAGGUGAUAGUGUGGUUUAUGGACUGAGGUCAAAAUCUAAGAAGUUUCGCAGACCUGACAUCCAGUACCCUGAUGCUACAGACGAGGACAUCACCUCACACAUGGAAAGCGAGGAGUUGAAUGGUGCAUACAAGGCCAUCCCCGUUGCCCAGGACCUGAACGCGCCUUCUGAUUGGGACAGCCGUGGGAAGGACAGUUAUGAAACGAGUCAGCUGGAUGACCAGAGUGCUGAAACCCACAGCCACAAGCAGUCCAGAUUAUAUAAGCGGAAAGCCAAUGAUGAGAGCAAUGAGCAUUCCGAUGUGAUUGAUAGUCAGGAACUUUCCAAAGUCAGCCGUGAAUUCCACAGCCAUGAAUUUCACAGCCAUGAAGAUAUGCUGGUUGUAGACCCCAAAAGUAAGGAAGAAGAUAAACACCUGAAAUUUCGUAUUUCUCAUGAAUUAGAUAGUGCAUCUUCUGAGGUCAAUUAAAAGGAGAAAAAAUACAAUUUCUCACUUUGCAUUUAGUCAAAAGAAAAAAUGCUUUAUAGCAAAAUGAAAGAGAACAUGAAAUGCUUCUUUCUCAGUUUAUUGGUUGAAUGUGUAUCUAUUUGAGUCUGGAAAUAACUAAUGUGUUUGAUAAUUAGUUUAGUUUGUGGCUUCAUGGAAACUCCCUGUAAACUAAAAGCUUCAGGGUUAUGUCUAUGUUCAUUCUAUAGAAGAAAUGCAAACUAUCACUGUAUUUUAAUAUUUGUUAUUCUCUCAUGAAUAGAAAUUUAUGUAGAAGCAAACAAAAUACUUUUACCCACUUAAAAAGAGAAUAUAACAUUUUAUGUCACUAUAAUCUUUUGUUUUUUAAGUUAGUGUAUAUUUUGUUGUGAUUAUCUUUUUGUGGUGUGAAUAAAUCUUUUAUCUUGAAUGUAAUAAGAAUUUGGUGGUGUCAAUUGCUUAUUUGUUUUCCCACGGUUGUCCAGCAAUUAAUAAAACAUAACCUUUUUUACUGCCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-400.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -430.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 357.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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