Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001040446.3
Sequence Length
5116 nt
GC Content
0.4349
GGAGCCCCAGCCGCUAGUGCUGGUGGCCGCCGCUGCUGCCCCAGCUGGAGCCCGAGCCGCCGCCUCUGCGUCCGCGCGUCGCUGCUUCCCAGGGCGGCGGUAUGCUGGGGAAAGGAGUAGUCGGCGGUGGCGGCGGCACCAAGGCCCCCAAGCCCUCCUUCGUGUCGUACGUACGCCCUGAGGAAAUUCACACAAACGAAAAGGAAGUAACAGAGAAGGAAGUAACUCUUCACUUGUUGCCAGGUGAACAGCUGCUUUGUGAAGCCAGCACAGUACUGAAGUAUGUCCAGGAAGAUUCCUGUCAGCAUGGGGUCUAUGGGAGGCUUGUCUGCACAGACUUCAAGAUUGCCUUCUUGGGUGAUGAUGAAUCUGCAUUGGAUAAUGAUGAAACUCAAUUUAAGAAUAAGGUUAUAGGAGAAAAUGACAUUACACUCCACUGUGUUGAUCAGAUUUAUGGAGUGUUUGAUGAGAAAAAGAAAACUCUCUUUGGACAACUGAAGAAAUACCCUGAGAAGCUCAUCAUCCACUGCAAAGACCUUCGAGUGUUCCAGUUUUGUCUGAGGUACACAAAGGAAGAGGAAGUCAAAAGGAUUGUCAGUGGCAUAAUUCAUCAUACCCAGGCUCCUAAACUGCUUAAACGAUUAUUUCUGUUUUCCUAUGCGACUGCUGCACAAAACAAUACAGUCACUGAUCCCAAGAACCAUACCGUAAUGUUUGACACACUUAAGGACUGGUGUUGGGAACUGGAACGGACCAAAGGCAACAUGAAGUACAAAGCAGUGAGUGUCAACGAAGGCUAUAAAGUCUGUGAGAGAUUGCCAGCAUACUUUGUUGUCCCCACCCCUCUUCCUGAAGAGAAUGUGCAGCGCUUUCAGGGUCAUGGCAUACCAAUAUGGUGUUGGUCCUGCCACAAUGGAAGUGCCCUUUUGAAAAUGUCAGCACUGCCCAAAGAACAGGAUGACGGCAUUUUACAAAUCCAAAAGAGCUUCUUAGAUGGAAUUUACAAGACCAUCCACAGGCCACCCUAUGAAAUUGUUAAAACGGAAGACCUGUCAAGCAACUUCCUGUCCCUGCAGGAAAUCCAGACUGCAUACUCUAAAUUUAAACAGCUAUUUCUGAUAGAUAACAGUACUGAAUUUUGGGACACAGAUAUAAAAUGGUUUUCUCUGUUGGAAAGUAGCAGCUGGCUUGACAUAAUCAGACGUUGCCUGAAAAAAGCAAUAGAGAUUACAGAAUGUAUGGAAGCACAAAACAUGAAUGUUCUUCUUUUAGAGGAGAAUGCAUCCGACCUCUGCUGUCUCAUUUCCUCUCUGGUGCAACUGAUGAUGGACCCCCACUGCAGAACCAGAAUUGGUUUCCAGAGCCUCAUCCAAAAGGAGUGGGUCAUGGGUGGCCACUGUUUCUUGGAUCGCUGCAACCAUCUCCGCCAGAACGACAAAGAGGAGGUUCCUGUGUUCCUGCUUUUCCUAGAUUGUGUCUGGCAGCUGGUGCACCAGCAUCCCCCGGCAUUUGAAUUCACAGAGACUUACCUGACUGUUUUGUCAGAUAGCCUGUAUAUACCUAUUUUUAGCACCUUCUUCUUCAAUUCACCUCAUCAAAAAGAUACUAACAUGGGUAGAGAAGGCCAGGAUACACAAAGCAAGCCUUUGAAUCUGCUCACCGUGUGGGAUUGGUCGGUGCAGUUUGAACCCAAAGCCCAGACAUUGCUCAAAAACCCUCUUUAUGUGGAAAAGCCAAAACUGGACAAAGGCCAACGGAAAGGAAUGCGCUUCAAACAUCAACGACAACUUUCUUUGCCACUUACACAAUCUAAGUCAUCUCCCAAAAGAGGAUUUUUCAGGGAAGAAACAGAUCAUUUAAUUAAAAACCUUCUGGGCAAGAGAAUUAGCAAACUUAUUAAUUCUUCUGAUGAGCUCCAAGACAACUUUCGAGAGUUCUAUGACAGCUGGCAUAGCAAGUCCACUGACUACCAUGGUUUGUUGUUACCGCAUAUCGAGGGGCCCGAAAUCAAAGUCUGGGCCCAGCGCUACCUACGUUGGAUUCCAGAAGCCCAAAUCCUAGGUGGUGGCCAAGUGGCCACUCUGAGCAAACUCUUGGAAAUGAUGGAGGAAGUCCAGAGUUUACAAGAGAAGAUCGACGAGAGACACCACAGCCAGCAGGCCCCCCAGGCUGAGGCCCCCUGCCUGCUGAGGAACUCUGCCCGCCUCUCGUCUUUGUUUCCUUUCGCUCUGCUCCAGCGACAUUCCUCUAAGCCCGUCUUACCCACCAGUGGCUGGAAAGCUUUGGGAGAUGAAGACGAUUUGGCCAAACGAGAAGAUGAGUUCGUGGACCUAGGGGAUGUGUGACCUGUUUGUUGAGUGAUUGUGAAAGAGGAAUGUGGGAGAUUGGGACAGCUGAUCCCUGGAUUUGUGUCACGCUACAGCUCAUGCUGGCUGGGUCCUUAGCCCGGCACUCCGUUAGAAUAAACCUGGGCCUUCGGGAAAAGAGGUGGCUCUCAUUAUUUUUCAUGAUUCUAAAAGACUAUGCAAUUAAAACCGCAUCUGUAGUAUUACUAAUUGGAAGGAAUUAUUACUUGACCCGUAAUAGGGUUGUGGCCGUUUUCUGAUGCCUAAGUAUUAUACAGAGCCCACAAUGGCCAGUUUACUACCAGAAAGGGCUUCAGUAAGAUAUUCUUGGACUUGAUACUUUCUUCAGAUCCUCUUUGUGCCAAGAUAAUUUAUCCAGUCAUUGGGAAUAGUAAGUUUCUGUGUAACCCAUCUCAAUUAUAGAAGCAAGUUCAGCUUUAUGUAUUUGUAUGGGGAGUUGAAGAUUCAGAUAGAGGUAUUAAGAUGUGUGGCAUUUACUUAAACCAUCACAUUUUUUUCUUUCUACGCCCCCUUGCCUGUAAAACACCUGGGAAGUUCCACUGGUGUCAUCCAUCCUGAUGCUUCAGACCACCCUCCCUUCUUCACAGACCGUGUCACUUUGCCUGUGGGUGGGGGCUAGCCAGCCACCACCCUCUUUUCUGUGCUGCCAGCCCCAGGUCUUCCUCCGCCUGCUCCACACCACUCGCCGCUGUCCCUCUGCACUCCCUGCCUUGGUGCGUGUAGUCCCAGUGUCUCACUGCCAAACCUCUUGGUUACGCUGCGGGGAUCUGUUUCUUUGCCUGAGAUCCUUCCUGAGGAGCGUCCAUUCCUCUGGAGUCUCUCCUUGUUUGGAACAAAUCGCUUCGCCUUUUUCUACUUGCCUGCUGAAGCUUUGGAGCACUUGUGAUUGCAGUUUUCUGCCGCAACCCCUGAGCCGAGUUCCUCACAUUCUUUUACCUUUAUGGACUGAUGGGAUUGGGUCACUUUUGAAUGUGGCUUUCAUAGGAAAGCAGCUUAAACAUAAAUAUCAGAAGUGAUGAUUAUCAUAUGAUACCUCAGUGAUUUUAAAAGCCAUAGAAGAAACUUGACUAUGCCUGGUCACCUUCUUGGAUCUGCUGUCUAAAUGAUAUAUAUAUGAUAUAUAUGUGAUAUAUAUAUAUCAUAUAUAUGAUAUAUAUAUAUAUAUCACAUAUAUAUGAUAUAUAUAUGAUAUAUAUAUAUCACAUAUAUAUGAUAUAUAUAUCAUAUAUAUGAUAUAUAUUUUUUUUAAUGCAGGAAAGUAUACUUUGUAAGGAGCAGAUUUUUUUGUUCUCAGUGGAACCCUGUCAAAUCGCAUAAAAGAGGAAAAAAACAAAACUCAUUAGAAUGUUUUAAAUUGAAUGUUCGCCUUUUACAUAUAUUUGCUCUUCAGUAUGGAUCCCAAUUUGAAUGUUACAUGUUCGGAAAAACUUUCAGUUGCUCAAGGGCAAUAAGAAAAUUUGAGGCCGGGUGUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUCAGGUGGGCGAAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCGAGACCAGCCGGGGCAACAUGGCAAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGUGCAUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUCCCGUGAGCCUGGGAGGUGGAGUUUGCAGUGAGCUAAGAUCGUGCCACUGCACUCCGGCCUGGGUGAUGGAGCAAGACCUCGUCUCAGAAAAUUGGAAACUAUUGACUAAGAGAAGUUUCUAGGUUUGCACUGAAUUGUCUUUUGUACAUACAGUGAAUUGUUUUGCUGUUCUCCCCACUCCAUAUUAAUGCAGGAGCCAGGUUGGUCUGUUAGGAUGAACAAAGGUUGAGGGGAGGGCAGGAUUCGUGCAUCUGGGGGCCAAACACAUGUUCCGUCUUGAUUGCCUUAAGAGUUACUAGCGAGGUCAGUGUUAGGCUUGCAAUAGGGAUUUUAAAAUACACUAACUAGUUCCUUAGCUACCUUCACAUACAUUCUAUAGGCCUUCUUAAAUUAGCACUAACCUCCACUUCCUUCUCUGCCCCAUUGCCUCCCAAAUAUGCUAUGGAGCUAUUUUUGUUACCACGUUAUAACGUGAAUAUUUAUACAGUAGCCUCUUCAGGCUUUGUAAUUUUCAUUCCAAAAAUGCCCGGUGUGAUGCUUUACACUCUACAAAGUAUGGUUUAAAGGCACAAGGUCAUGGCCUUUGUCAUAGCAGUUGAAUGUGCAUUGACAUAUUUUUCUAUGAUUUUUUAAAAUUACAAUAGAAAAAUAAGCUGUUGUAACGUGUAAGGUCAUGACAAUUUUUGUAUUUAUAUUUGAAAUCAGAUUUCUAUAACUCGUAUUUGUGUACAGAAUUCUCAAUGGAUUUAUAUAUUGUGAAAUUUUUAUCUGAGAUUGGGAUGUGGAUUAUGCUUAACAGUGAGAGCUGAAAUGAGACCAUUUACUUUGUUUAAAAUGCUGUACUGUGCAAGUUUGGAAAUGUAAAUUAAUUUACUGUAUAUAAUAUCUUGAGUUUGUUUAUACCUCCAAGUUUUUACACUGAAGAUAAACUAGCUUUAAUUCAAAACUUUUUUUUUCUUUAUAAGGGAAUAAGCUG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1568.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1662.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 964.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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