Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001042782.3

Sequence Length

1041 nt

GC Content

0.5831

AGUGCCUGCAGCCGGUGCUGUCCACAGGGAGCUCCAGCCCUUCUCACACUCGACCCGCAGAAACCACCCACCUUCACCAUGUCUGACGAGGAAGUUGAACAGGUGGAGGAGCAGUACGAAGAAGAAGAGGAAGCCCAGGAGGAAGAGGAAGUUCAAGAAGAGGAGAAACCGAGACCCAAACUCACUGCUCCUAAGAUCCCAGAAGGGGAGAAAGUGGACUUCGAUGACAUCCAGAAGAAGCGUCAGAACAAAGACCUAAUGGAGCUCCAGGCCCUCAUCGACAGCCACUUUGAAGCCCGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGCUGGUCGCUCUCAAAGAGAGAAUCGAGAAGCGCCGUGCAGAGAGAGCGGAGCAGCAGAGGAUUCGUGCAGAGAAGGAGAGGGAGCGCCAGAACAGACUGGCGGAGGAAAAGGCCAGAAGGGAGGAGGAGGAUGCCAAGAGGAGGGCAGAGGACGACCUGAAGAAGAAGAAAGCUCUGUCUUCCAUGGGAGCCAACUACAGCAGCUACCUGGCCAAGGCUGACCAGAAGAGAGGCAAGAAGCAGACAGCCCGGGAAAUGAAGAAGAAGAUUCUGGCUGAGAGACGCAAGCCGCUCAACAUCGAUCACCUUGGUGAAGACAAACUGAGGGACAAGGCCAAGGAGCUCUGGGAGACCCUGCACCAGCUGGAGAUUGACAAGUUCGAGUUUGGGGAGAAGCUGAAACGCCAGAAAUAUGACAUCACCACGCUCAGGAGCCGCAUUGACCAGGCCCAGAAGCACAGCAAGAAGGCUGGGACCCCAGCCAAGGGCAAAGUCGGCGGGCGCUGGAAGUAGAGAGGCCAGAAAGGCCCCUCGAGGCAGAGACCCUCCGCCCUCUUGCACACCAGGGCCGCUCGUGGGACUCCACAUCCUCCAGCCCCCACAAUCCUGUCAGGGGCUCCCUGACAGUCCUGGGGGUGGAGAGGCCAUCCCGGGGCGUCCCCCGCGUCUGUGUCCUUGCUGCCUUCAUCCCCUGGGGCCUGUGAAUAAAGCUGCAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-375.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -393.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 303.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((...(((.((((.(((((.(((((..((((((((....((........)).........((((((((.(((.((((......)))).)))))))))))....(((((((........((....)).((.(.....((...(((........)))...))....)))...(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..((((.....((.(((........)))))..))))(((...)))..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..((((.((((((((...((.....)).....((.....))...)))))).)).))))......))))))).))))))).)..)))))(((((......)))))((.((....((((((..((...(((..((.(.(((...(((((((((((......((.....)).......))))))))))).))).).))..)).).....))..))))))....))..)).((((.(.((((((..((((((..(((((((.....((((.....))))((((..........))))............((.(((((((........)))))))))...((((..((.((...(((...))).)).))((((((.(((.......(((..((((.((......)).))))....))).......))).))).)))..((((((.(((.((...(((((.........((((((.((((((....))))))..((((......((.((((.(((......(((.((((.....)))).)))....))).).))).))))))))))))......)))))..))))))).)))).....(((((.((((((.....(((((((((...)))))))))...))))))))))).)))).)))))))(((.....)))))))))...)))))).)))))...)))))))))..)))......))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,..(((((((.,,{((,((((.{((((.(({((..((((((((...,{({,,,.{,.,..........((((((((.(((.,(((......)))}.))))))))))).,,.||,||,.........({...,||.{{.({,.,,((...{((.......,|},...))..,,||,...(((.((.(((((....(((.....(((...(((((((.(((((((((..,((,...,.{(.(((........)))})..))),|||...))}..))))))).)))))))))....))))))...))))).)))))..||,}}||{(((((...|}}}}..,|,,,..||.({{{.{.....).)))).|||{|,,,,{,|}},}||,||}}}||.}.,|||}|(((((......))))){,.{{....{|||||..(((.{(,({,(({({(({...(((((((((((......((.....,,.,,....))))))))))).)}),|,||..},.{{{.{{||.{||||||..{{,,..)).,,,({(.(((,,(..,{,,,({(({{((((..{........,..))))||||}...,...,..))).)))......,.{(.(((((((........))))))))}...)))),,||}||||||(({{.{(({,{.{,((((((.(({,,.,,.,{{{.,(({(,((......}}.}}}}..,.)}}...,,.,})).))).)))|.|((((({(..,(({..,((((....{{...||,,,..((((((....))))))..||||...}}}||}|(((.((({..,,.(((.((((.....)))).))){{{{|,|{|.,,)}),)))))),)))...})}),)))}}))}}))).)))).},,,||||,.|||||{.....(((((((((...))))))))),,,|}|||||||}}.}})},)))))))))}))}}))}}}))))),}})))))),))))).,,)))))))))..}),......))))))).,,....