Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001062.4

Sequence Length

1486 nt

GC Content

0.4240

GGUACACUGUUGGAGAGAUGAGACAGUCACACCAGCUGCCCCUAGUGGGGCUCUUACUGUUUUCUUUUAUUCCAAGCCAACUAUGCGAGAUUUGUGAGGUAAGUGAAGAAAACUACAUCCGCCUAAAACCUCUGUUGAAUACAAUGAUCCAGUCAAACUAUAACAGGGGAACCAGCGCUGUCAAUGUUGUGUUGUCCCUCAAACUUGUUGGAAUCCAGAUCCAAACCCUGAUGCAAAAGAUGAUCCAACAAAUCAAAUACAAUGUGAAAAGCAGAUUGUCAGAUGUAAGCUCGGGAGAGCUUGCCUUGAUUAUACUGGCUUUGGGAGUAUGUCGUAACGCUGAGGAAAACUUAAUAUAUGAUUACCACCUGAUCGACAAGCUAGAAAAUAAAUUCCAAGCAGAAAUUGAAAAUAUGGAAGCACACAAUGGCACUCCCCUGACUAACUACUACCAGCUCAGCCUGGACGUUUUGGCCUUGUGUCUGUUCAAUGGGAACUACUCAACCGCCGAAGUUGUCAACCACUUCACUCCUGAAAAUAAAAACUAUUAUUUUGGUAGCCAGUUCUCAGUAGAUACUGGUGCAAUGGCUGUCCUGGCUCUGACCUGUGUGAAGAAGAGUCUAAUAAAUGGGCAGAUCAAAGCAGAUGAAGGCAGUUUAAAGAACAUCAGUAUUUAUACAAAGUCACUGGUAGAAAAGAUUCUGUCUGAGAAAAAAGAAAAUGGUCUCAUUGGAAACACAUUUAGCACAGGAGAAGCCAUGCAGGCCCUCUUUGUAUCAUCAGACUAUUAUAAUGAAAAUGACUGGAAUUGCCAACAAACUCUGAAUACAGUGCUCACGGAAAUUUCUCAAGGAGCAUUCAGCAAUCCAAACGCUGCAGCCCAGGUCUUACCUGCCCUGAUGGGAAAGACCUUCUUGGAUAUUAACAAAGACUCUUCUUGCGUCUCUGCUUCAGGUAACUUCAACAUCUCCGCUGAUGAGCCUAUAACUGUGACACCUCCUGACUCACAAUCAUAUAUCUCCGUCAAUUACUCUGUGAGAAUCAAUGAAACAUAUUUCACCAAUGUCACUGUGCUAAAUGGUUCUGUCUUCCUCAGUGUGAUGGAGAAAGCCCAGAAAAUGAAUGAUACUAUAUUUGGUUUCACAAUGGAGGAGCGCUCAUGGGGGCCCUAUAUCACCUGUAUUCAGGGCCUAUGUGCCAACAAUAAUGACAGAACCUACUGGGAACUUCUGAGUGGAGGCGAACCACUGAGCCAAGGAGCUGGUAGUUACGUUGUCCGCAAUGGAGAAAACUUGGAGGUUCGCUGGAGCAAAUACUAAUAAGCCCAAACUUUCCUCAGCUGCAUAAAAUCCAUUUGCAGUGGAGUUCCAUGUUUAUUGUCCUUAUGCCUUCUUCUUCAUUUAUCCCAGUACGAGCAGGAGAGUUAAUAACCUCCCCUUCUCUCUCUACAUGUUCAAUAAAAGUUGUUGAAAGAUUAACAACUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-387.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -419.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 333.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((.(((.(((((((.(((.((((.......)))).(((....)))((((.(((((...((((.(((............))).)))).......(((((((((((((...................((((((((...((((((.................(((((((......(.(((((.(((.(((((.(((.((((.((..(((((((.(((.........)))..........((((.......))))...(((((.((.....)).)))))(((..((((((((....)))))))).)))......(((((((.((..(((.((((((....((((.....))))...)))))))))..))........))))))).......)))))))..))...))))......))))))))))).))))))))))))).......(((((((((((......((((.((((((.(((.((..((((.....)))).)).)))..))))))..))))................(((((((......)))))))((((((((...((((((....))))).)...)))))).))((((((...........(((((((((((.......((((.........((((((..((((((((..((...((((((((((.....)))).))))))((((....))))((((((((.......(((((((.((....)).)).))))).(((.(((((..(((.....))).)))))))).)).)))))).................)).))))))))..))...)))).....(((((((...((......))...)))))))((((.........))))..))))(((((((.(((........))).)))))))..(((........)))))))))))))).((((((((((.((((....((((.((((......))))(((.....((.((((((.....(((((((((........................))))))..))).(((((....)))))....)))))).)))))....(((((((((.(((((..((((((((.......))).............((((....)))).)))))...)))))((((......(((((((((((.....))))..)))))))..))))..........)))))))))...))))....)))))))))))))).......))))))..)))))))))))..))))))...)))))))).......((((((.....(((........((((((((.......((((...((((((...........))))))))))......)))))))))))....))))))))))))))))))).))))).)))).((((.(((...))))))).))).)))))))))))))))......(((((((((....)))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(.(((.(({{(((((((.((((((((......,|..(((((....))))).|,,})))}}}}..........,,|.......{{{,,|..,{{,(.(((((((((((((.........,{(,,....(((((((((..,{...((({...})))...,,)))))))))....,},|,(((((.(({{(((((.{{{.......(((((((((((,,,,,,......,,),,......}}},,)))))))}.,,....{{{{{.{{...,,)}.}}}||{{{..((((((((....)))))))).}))}}.,,.||{{{|||(({.(({.((((((....((((.....))))...))))))}))..)),},.....,}|||}|........|||,,},,.....,}}.......))))))))))).))))}{|||.,,(((.{((.((((((((((({{{{.,((((,((((((.(((.((..((((.....)))).}}.))}..)))||||,,}}}....,,|||.....,,|{(((({......}))))))|||{{(((||||{||{|,}}.))))),}}..,))))),}}{(((((........{,.(((((((((((......,((((.........((((((..((((((((..,,...((((((((((.....)))).))))))((({....})))((((((({..,,,,,,{{{(((,((,..,|,.,}.}}}}}.,,{.{{{{{..{||,,,.,))),})))))}}.)).))))))..,,.........,,,.}}.))))))))..))...)))).....{((((((...((......))...))))))}((((.........))))..))))|((((((.(((........))).))))))}..(((........)))))))))))))).((((((((({{((((....{{{,.((((......)))){{{.....((.((((((.....{({((((((........................))))))..}}}.(((({....}))))....)))))).))}||....(((((((((,(((((..(((((,{{......,|||,....,,......,{{{..,,)))),))))).,.)))))|.((.(((..((((((({{((.....)}))..)))))))})).))..........)))))))))...}))}....))))))))))))))...,,}.)))))},})))))))))))...)))))}.|||..|||}.,,,,.,(((((({...{((,{{.......,,{,{||,,,,,|,,||(,,.((((((...........))))))})))})}}}.)))),}),)))...,)),,,,))))))))))))),))},,.||)}|((((.((,...,)))))).}}},))))))))))))),}......(((((((((....)))))))))...