Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001075099.2
Sequence Length
1553 nt
GC Content
0.4958
ACAGGUGCCUCGCGGUGCAGCCGGGUCGCCUUCCAGCCCGUCCGCCUCCCGACCAGGGCCCGCGCCCCGUCCCGCCUCUCUCCCGCCCAGCCAAAUGCAGGCCGCCGCCCUCCCUGAGGAGAUCCGUUGGCUCCUGGAAGAUGCUGAAGAGUUUCUGGCAGAAGGUUUGCGGAAUGAGAACCUCAGCGCUGUUGCAAGGGAUCACAGAGACCAUAUUCUACGGGGCUUUCAGCAAAUCAAAGCCAGGUACUAUUGGGAUUUUCAGCCCCAAGGGGGAGACAUUGGACAGGACAGCUCUGAUGAUAAUCACAGCGGGACUCUUGGCCUGUCCCUCACAUCCGAUGCACCCUUUUUGUCAGAUUAUCAGGAUGAGGGAAUGGAAGACAUCGUAAAAGGAGCUCAAGAACUUGAUAACGUAAUCAAGCAAGGAUACUUGGAGAAGAAAAGCAAAGAUCAUAGUUUCUUUGGAUCGGAGUGGCAGAAGCGAUGGUGUGUUGUCAGCAGAGGUCUCUUCUACUACUAUGCUAAUGAGAAGAGCAAGCAGCCCAAAGGGACCUUCCUCAUUAAGGGCUACGGUGUACGGAUGGCCCCCCACCUGCGAAGAGAUUCCAAGAAAGAAUCCUGCUUUGAACUGACCUCCCAGGAUAGGCGCAGCUAUGAGUUUACAGCUACUAGUCCAGCAGAAGCCAGAGACUGGGUGGAUCAAAUAAGUUUCUUGUUAAAGGAUCUGAGCUCCUUAACCAUUCCAUAUGAAGAGGAUGAGGAGGAAGAAGAAAAAGAAGAGACAUAUGAUGAUAUUGAUGGUUUUGACUCCCCAAGUUGUGGUUCCCAGUGCAGACCCACUAUCUUGCCUGGGAGUGUGGGGAUAAAAGAGCCUACAGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAUAUUUAUGAAGUCUUGCCAGAUGAAGAGCAUGAUCUAGAAGAGGAUGAGAGUGGCACUCGACGAAAAGGAGACUAUGCCAGUUACUACCAGGGCCUAUGGGAUUGCCAUGGUGACCAGCCAGAUGAACUGUCCUUCCAACGGGGUGACCUCAUCCGUAUUCUGAGCAAGGAGUAUAACAUGUAUGGCUGGUGGGUGGGAGAACUGAACAGCCUCGUUGGGAUUGUUCCAAAGGAGUAUCUCACCACUGCCUUUGAAGUGGAAGAAAGAUGAAACCCAGGAAAUAUAUUCUUCCCUCUCUCCUGCCUUUAUGAGGAAACUGAUCAUCAAAAGUUCCCACUCCCUACUUCUGCCACCCCACCAACGCCUUGGACUCCUCUCUUUGCUGAAGAGACCCAAGUCUCUUGACACCUCAGAGUGACUGUAAGCUACCAGUAAGACAAGUGGGAAGAGGCACGUUCAUCAAACCUGUUACUAAACCAGCCUAGUCAUAGCUCAUCCCCAUCUCUAAAUGUGUCCACACAACCACAUCUGCCUUUUCCACAAGCUUUUCACAAAGAAGGUGAGAGAGAAGGAAACCUUGGGAGGAGGACAUUACUGGUUGUUCUGGCUGGUUUGAAAAGCACAAAUAAACUUGGGAUGUGGUUCCUUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-481.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 325.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(..(((..((((((((..((...((((...((((.(((((((((..((((....)))).)))...((((((((.((((.(((....(.((((..((((.(((((....))))....).)))).)))).)....)))(((((((((.(((.(((((((.((.(((.(.(((((((((((.((((.....((..((...))..)).......)))).))).((((....(((((((.(((.....((((((((((..((.....(((((.......(((((((.(((((.((((....)))).)))........)).)))))))....((((((.((((((......(((..........(((((((..........((((((.......((((..((.((((((......))))))((((....))))...........((((((........))))))..)).)))).......)))))).(((.......)))((((((((((...((.((.((((.........)))))).))....)))))))))))))))))...)))...)))))))))))).))))).....))...))))))))))........)))))))))).))))((.(((((..(.(((((.((((..((((...))))..))))...))....)))..)..))))).))((((.(((.(((((((.((......(((...(((((((.((.(((.....)))..)).)))))))..))).....)).))))))).)))..))))...)).)))))).).))).))((.((((((((((((.(((((.......)).)))))))))(((((((.(((..(((((((....))).............(((...(((((...((((........)))).))))))))....(.((((((((.(((((.((..(.....)..))...))))).).........(((((((((.....)))))).).)).....((((((((((((((((.((.(((((....))))).((((((((((((((((.......(.((.(((((((((((((.((((..(((((((((....))).))))))(((((((((........))).)))))).(((((((....(((((....(((((..................)))))((((...)))).......))))).....)).)))))......)))).))).)))))))..))).)).).....))))))))).(((((((....))))))).......)))))))((((........)))).......)).))))).)))).)))))))....((((.((((........)))).))))))))))).)..))))...))).))))))).)))))).)))))))))))).)))))))))........)))).))))).))).......)))))).))))....))))..))))))))))..)))..).))))..........((((......)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.,..{{{..((((((((..{,,..((((...((((.(((((((((..((((....)))).))),,.,(((((((,({((,{((....,.{{(({.({{(,,((((....))))....}.)))).}))).,....}}|(((((((((.(((.(((((((,((.(((.(.(((((((((((.((((.,...{(,.((...}},,)).....,.)))).))}.((((....(((((({{(((..{{.((((((((((..((.....(((((.,.{{{{{(((({{.,,{((,(({(,,,,|}||,|}|{{{,,...,,.}},))))}.{,({(((({({({(({{{{{{,{{......,}.,}}}))})),,,|,..,.||{{,,....,|,{{{|.....((((((......))))))((((....))))...........{{{{((........)))))).,}},}||||(,,,,,|}{{|}.|}|||}}}}},))}}}|}|{|||||.|},}}.,,,{...,,,,}}))},.|.(((((.,,((({...}))),.,,..))))).,}}))),)})))).))))))....))...))))))))))...,}...)))))))))).))))((.(((((..(.((({{.((((..(((,...,}}},,)}))..,))....)))..)..))))).))((((.(((.(((((((.((......(((...(((((((.((.(((.....)))..)).)))))))..))).....)).))))))).)))..))))..,)).)))))).).))).)){(.((((((((((((.(((({.......})}}))))))))(((((((.(((..(((((((....)))............,{{{,..,,.,,..}||||....,,,.|.||,||||}}}|,{..{.((((((((.(((((.((..(.....)..))...))))).).....,..,({(((((((.....)))))).}.}}.,...((((((((((((((((.((.(((((....))))).((((((((((((((((.......,.({.(((((((((((((.((((..(((((((((....))).))))))(((((((((........))).)))))).(((((((....(((((....,,((({........}}}}.....||||.,,,....}))),......))))).....))})))))......)))).)))))))))))..))).}).,.....))))))))|.(((((((....)))))))......})))))))((((........)))).......)).))))).)))).)))))))....((((.{(({........)))).))))))))))).,..))))...))).))))))).)))))).)})))))))))).))))))))),.......))})}))))),,)).....,,)))))).))))....))))..),))))))))..|}}....))))..........{({{....,|))),.},,.
Back