Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001077472.3
Sequence Length
1246 nt
GC Content
0.5401
AGACAUCUCUUGUUUUCCAGAUACUACGGGUCAUAAUCCCUAACUCCAAUCACUGGCAACUCCUGAGAUCAGAGGAAAACCAGCAACAGCGUGGGAGUUUGGGGAGAGGCAUUCCAUACCAGAUUCUGUGGCCUGCAGGUGACAUGCUGCCUAAGAGAAGCAGGAGAACAGUCAGCAAAAGCAUUGGUCCCACCUGCCCCUUUGCUGGAAGCUGUGAAGUCAGCAAGACUCAGAGGCGCCACUGCCCAGCCUGCAGGUUGCAGAAGUGCUUAGAUGCUGGCAUGAGGAAAGACAUGAUACUGUCGGCAGAAGCCCUGGCAUUGCGGCGAGCAAAGCAGGCCCAGCGGCGGGCACAGCAAACACCUGUGCAACUGAGUAAGGAGCAAGAAGAGCUGAUCCGGACACUCCUGGGGGCCCACACCCGCCACAUGGGCACCAUGUUUGAACAGUUUGUGCAGUUUAGGCCUCCAGCUCAUCUGUUCAUCCAUCACCAGCCCUUGCCCACCCUGGCCCCUGUGCUGCCUCUGGUCACACACUUCGCAGACAUCAACACUUUCAUGGUACUGCAAGUCAUCAAGUUUACUAAGGACCUGCCCGUCUUCCGUUCCCUGCCCAUUGAAGACCAGAUCUCCCUUCUCAAGGGAGCAGCUGUGGAAAUCUGUCACAUCGUACUCAAUACCACUUUCUGUCUCCAAACACAAAACUUCCUCUGCGGGCCUCUUCGCUACACAAUUGAAGAUGGAGCCCGUGUGGGGUUCCAGGUAGAGUUUUUGGAGUUGCUCUUUCACUUCCAUGGAACACUACGAAAACUGCAGCUCCAAGAGCCUGAGUAUGUGCUCUUGGCUGCCAUGGCCCUCUUCUCUCCUGCUCCCUAUCUUACAGACCGACCUGGAGUUACCCAGAGAGAUGAGAUUGAUCAGCUGCAAGAGGAGAUGGCACUGACUCUGCAAAGCUACAUCAAGGGCCAGCAGCGAAGGCCCCGGGAUCGGUUUCUGUAUGCGAAGUUGCUAGGCCUGCUGGCUGAGCUCCGGAGCAUUAAUGAGGCCUACGGGUACCAAAUCCAGCACAUCCAGGGCCUGUCUGCCAUGAUGCCGCUGCUCCAGGAGAUCUGCAGCUGAGGCCAUGCUCACUUCCUUCCCCAGCUCACCUGGAACACCCUGGAUACACUGGAGUGGGAAAAUGCUGGGACCAAAGAUUGGGCCGGGUUCAAAGGGAGCCCAGUGGUUGCAAUGAAAGACUAAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-431.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 217.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.....)))).............(((.......)))......((((((((((...(((((..(((((((((.....(((((.(((.(.((.((..((((.((.(((.((((........(((((((((((((((((..((((.(((((..(((..((..((..((((((((((((.(((..(((...))))))...)))))))...)))))....)).))....)))..))))).)).))....)))))))))))))))))(((((........)))))..)))).((((......))))(((....)))(((.(.(((.(((..((...))..)))))).).)))((((((.......))))))...(((.....(((((.((.((((((..((((......))))(((((((...........))))).))..((((((((.((....)).))))))))...)))))).))))))).....)))...))).)).))))..))..))))))))))))))))))))....((((.((((..((((.........)))).))))))))...............(((((((((((((((..((.(((.((..(((((..((((((((((((((...)))))))...........))))).......))..))))).(((((((.(((.((((.................(((((((((((((.........))))))..).))))))..((((((((((((.((((((((((((((((..((((..................))))...))))))))))))...((((((((.((.(((((((((...(((((((.((((((..(((((...((.........))...)))))......)))))).))..(((((.(((((((.(((.((......))..))))))..))))..))))))))))(((((((.((((((..((((.((((((...((((...(..(((.((((....)))).)))..)...))))....))))))...((((.....)))).....)))).))))))(((......)))..)))))))...........)))))))))))))))))))............))))))))))))).))))))).)))..)))))))......)).)))))..)))).)))).)))))))...))))).))))))))))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,.......|{{{{,...........(((.......)))......((((((((((...(((((..(((((((((.....((((,,(((.,.(((.(..{(((,{(.(((,,,,,....,,..(((((((((((((((((,.(({(,(((((..(((..((,{(,,.{(((({{(({{{.|||,,|{|,..,)))))...}||||||...|||}}..,,)),)),,..)))..))))).}}.))....))))))))))))))))),||{,.....{{{||,,|{,|||..((((......))))(((....)))(((.(.(((.(((..((...))..)))))).).)))((((((.......))))))..,{,,....,((((,{((.((((((..((((......))))(((((({...........})))).))..((((((((.((....)).))))))))...)))))).))))))).,,}.))),,,))},}),)))}}})}.}))))))))))))))))))))....((((.((((.,(({{.........)))).))))))))...........,,..(((((((((((((((..({((((.((..,{(({.,{{{{{,,(((((({...}))))))....|{{{{...,,,.})}},..},..,},,,.(((((((.(((.((((................,(((((((((((({.........}))))).}).)))))),.((((((((((((.((((((((((((((((..((((........,,........)))}...)))))))))))}|..((((((((.((.(((((((((..,(((((((,((((((,,(((((...((.........)}...))))}....,,)))))).))}.{((((.((((((,{(((.,(......,}..)))))),.})))..))))))))))|((((((.((((((..((((.((((((...((((...(..(((.((((....)))).)))..)...))))....))))))...((((.....)))).....)))).)))))){{{......)))..))))))}...,,....,.)))))))))))))))))))............))))))))))))).))))))).)))..)))))))......)).)))))..)))),,)))},))))))...))))).))))))))))....,...,....,,,,,.
Back