Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001077479.3

Sequence Length

1231 nt

GC Content

0.5410

AGACAUCUCUUGUUUUCCAGAUACUACGGGUCAUAAUCCCUAACUCCAAUCACUGGCAACUCCUGAGAUCAGAGGAAAACCAGCAACAGCGUGGGAGUUUGGGGAGAGGCAUUCCAUACCAGAUUCUGUGGCCUGCAGGUGACAUGCUGCCUAAGAGAAGCAGGAGAACAGUCAGCAAAAGCAUUGGUCCCACCUGCCCCUUUGCUGGAAGCUGUGAAGUCAGCAAGACUCAGAGGCGCCACUGCCCAGCCUGCAGGUUGCAGAAGUGCUUAGAUGCUGGCAUGAGGAAAGACAUGAUACUGUCGGCAGAAGCCCUGGCAUUGCGGCGAGCAAAGCAGGCCCAGCGGCGGGCACAGCAAACACCUGUGCAACUGAGUAAGGAGCAAGAAGAGCUGAUCCGGACACUCCUGGGGGCCCACACCCGCCACAUGGGCACCAUGUUUGAACAGUUUGUGCAGUUUAGGCCUCCAGCUCAUCUGUUCAUCCAUCACCAGCCCUUGCCCACCCUGGCCCCUGUGCUGCCUCUGGUCACACACUUCGCAGACAUCAACACUUUCAUGGUACUGCAAGUCAUCAAGUUUACUAAGGACCUGCCCGUCUUCCGUUCCCUGCCCAUUGAAGACCAGAUCUCCCUUCUCAAGGGAGCAGCUGUGGAAAUCUGUCACAUCGUACUCAAUACCACUUUCUGUCUCCAAACACAAAACUUCCUCUGCGGGCCUCUUCGCUACACAAUUGAAGAUGGAGCCCGUGUGGGGUUCCAGGUAGAGUUUUUGGAGUUGCUCUUUCACUUCCAUGGAACACUACGAAAACUGCAGCUCCAAGAGCCUGAGUAUGUGCUCUUGGCUGCCAUGGCCCUCUUCUCUCCUGACCGACCUGGAGUUACCCAGAGAGAUGAGAUUGAUCAGCUGCAAGAGGAGAUGGCACUGACUCUGCAAAGCUACAUCAAGGGCCAGCAGCGAAGGCCCCGGGAUCGGUUUCUGUAUGCGAAGUUGCUAGGCCUGCUGGCUGAGCUCCGGAGCAUUAAUGAGGCCUACGGGUACCAAAUCCAGCACAUCCAGGGCCUGUCUGCCAUGAUGCCGCUGCUCCAGGAGAUCUGCAGCUGAGGCCAUGCUCACUUCCUUCCCCAGCUCACCUGGAACACCCUGGAUACACUGGAGUGGGAAAAUGCUGGGACCAAAGAUUGGGCCGGGUUCAAAGGGAGCCCAGUGGUUGCAAUGAAAGACUAAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-428.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -452.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 214.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.....)))).............(((.......)))......((((((((((...(((((..(((((((((.....(((((.(((.(.((.((..((((.((.(((.((((........(((((((((((((((((..((((.(((((..(((..((..((..((((((((((((.(((..(((...))))))...)))))))...)))))....)).))....)))..))))).)).))....)))))))))))))))))(((((........)))))..)))).((((......))))(((....)))(((.(.(((.(((..((...))..)))))).).)))((((((.......))))))...(((.....(((((.((.((((((..((((......))))(((((((...........))))).))..((((((((.((....)).))))))))...)))))).))))))).....)))...))).)).))))..))..))))))))))))))))))))....((((.((((..((((.........)))).))))))))...............(((((((((((((((..((.(((.((..(((((..((((((((((((((...)))))))...........))))).......))..))))).(((((((.(((.((((.................(((((((((((((.........))))))..).))))))..((((((((((((.((((((((((((((((..((((..................))))...))))))))))))...((((((((.((.(((((((((...(((((((((.(((((((...(((.....)))...))).)))).))))(((((.(((((((.(((.((......))..))))))..))))..))))))))))(((((((.((((((..((((.((((((...((((...(..(((.((((....)))).)))..)...))))....))))))...((((.....)))).....)))).))))))(((......)))..)))))))...........)))))))))))))))))))............))))))))))))).))))))).)))..)))))))......)).)))))..)))).)))).)))))))...))))).))))))))))...................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,.......|{{{{,...........(((.......)))......((((((((((...(((((..(((((((((.....((((,,(((.,.(((.(..{(((,{(.(((,,,,,....,,..(((((((((((((((((,.(({(,(((((..(((..((,{(,,.{(((({{(({{{.|||,,|{|,..,)))))...}||||||...|||}}..,,)),)),,..)))..))))).}}.))....))))))))))))))))),||{,.....{{{||,,|{,|||..((((......))))(((....)))(((.(.(((.(((..((...))..)))))).).)))((((((.......))))))..,{,,....,((((,{((.((((((..((((......))))(((((({...........})))).))..((((((((.((....)).))))))))...)))))).))))))).,,}.))),,,))},}),)))}}})}.}))))))))))))))))))))....((((.((((.,(({{.........)))).))))))))...........,,..(((((((((((((((..({((((.((..,{(({.,{{{{{,,(((((({...}))))))....|{{{{...,,,.})}},..},..,},,,.(((((((.(((.((((................,(((((((((((({.........}))))).}).)))))),.((((((((((((.((((((((((((((((..((((........,,........)))}...)))))))))))}|..((((((((.((.(((((((((..,(((((((,({(((({((...{{{...,.)))...)))})))).))},{((((.((((((,{(((.,(......,)..)))))),.})))..))))))))))|((((((.((((((..((((.((((((...((((...(..(((.((((....)))).)))..)...))))....))))))...((((.....)))).....)))).)))))){((......)))..))))))}...,.....,.)))))))))))))))))))............))))))))))))).))))))).)))..)))))))......)).)))))..)))),,)))},))))))...))))).))))))))))....,...,....,,,,,.