Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001077525.3

Sequence Length

2452 nt

GC Content

0.5591

AGGUUCUAGUGUCGGAGUUGGGUGCAGGCAGGUGCCAUGGGCCCGCUUGAGGCACACUGAGGGGACGCGGGGCUGGGCCAUGGCCGGCGCUCGGGCCGCCGCCGCCGCUGCCUCGGCGGGGUCCUCGGCCUCUUCAGGCAACCAGCCGCCUCAGGAGCUGGGGCUUGGGGAGCUGCUGGAGGAGUUCUCCCGGACUCAGUACCGGGCCAAGGAUGGCAGCGGGACCGGCGGCUCUAAGGUUGAGCGCAUUGAGAAGAGAUGUCUGGAGCUGUUUGGCCGAGACUACUGUUUCAGCGUGAUUCCAAACACGAAUGGGGAUAUCUGUGGCCACUAUCCCCGGCACAUCGUGUUCCUGGAGUAUGAGAGUUCUGAGAAGGAGAAAGACACGUUUGAGAGUACCGUACAGGUGAGCAAGUUGCAAGACCUCAUCCACCGCAGCAAGAUGGCCCGGUGCAGAGGACGGUUUGUCUGCCCAGUAAUCCUGUUCAAGGGCAAGCACAUUUGCAGGUCGGCCACACUGGCUGGAUGGGGAGAGCUGUAUGGACGCUCAGGCUACAACUAUUUUUUCUCAGGGGGUGCAGAUGAUGCCUGGGCAGAUGUGGAGGACGUCACGGAGGAGGACUGUGCUCUUCGAAGUGGUGACACGCAUCUUUUUGAUAAGGUCAGAGGCUAUGACAUCAAGCUGCUUCGAUACCUGUCAGUCAAAUACAUCUGUGACCUGAUGGUGGAGAACAAGAAGGUGAAGUUUGGCAUGAAUGUAACCUCCUCUGAGAAGGUGGACAAAGCCCAGCGCUAUGCCGACUUCACUCUCCUCUCCAUCCCGUAUCCAGGCUGUGAAUUUUUCAAGGAAUAUAAAGAUCGGGAUUACAUGGCAGAAGGGCUCAUAUUUAACUGGAAGCAGGACUACGUUGAUGCCCCAUUGAGCAUCCCCGACUUCCUGACUCACUCUCUGAACAUUGACUGGAGCCAGUAUCAGUGUUGGGAUCUGGUGCAACAAACACAAAACUACCUGAAGCUGCUGCUUUCCUUAGUUAACAGUGAUGAUGACAGCGGGCUGCUGGUACACUGUAUCUCAGGCUGGGAUCGGACCCCCCUCUUCAUCUCCCUCCUGCGCCUUUCCUUGUGGGCUGAUGGGCUCAUCCACACGUCCCUGAAGCCCACUGAGAUCCUCUACCUCACUGUGGCCUAUGACUGGUUCCUCUUCGGGCACAUGUUGGUAGAUCGGCUCAGCAAAGGGGAGGAGAUUUUCUUCUUCUGCUUCAAUUUUUUGAAGCAUAUUACCUCCGAGGAGUUCUCUGCUCUGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGUUUGCCAGCCCGGGAUGGAGGCUUCACCCUGGAAGACAUCUGCAUGCUGAGACGAAAGGACCGUGGCAGCACCACCAGCCUUGGCAGCGACUUCUCCCUGGUCAUGGAGAGUUCCCCAGGAGCCACUGGGAGCUUCACCUAUGAGGCCGUGGAGCUGGUCCCAGCAGGAGCGCCAACUCAGGCAGCUUGGAGGAAGAGCCACUCAUCCUCUCCACAGAGUGUCCUCUGGAACCGGCCACAACCCUCAGAGGACCGCUUGCCUUCCCAGCAGGGGCUGGCGGAAGCCAGGUCUUCCAGCUCCUCUUCCUCAAACCAUUCUGAUAACUUUUUCAGGAUGGGUAGCAGUCCCCUGGAGGUCCCCAAACCCAGAUCAGUGGACCAUCCCCUGCCCGGAUCCUCUCUCUCCACAGACUAUGGCAGCUGGCAGAUGGUAACGGGCUGUGGCAGUAUUCAGGAGCGGGCUGUCCUGCACACAGACUCCUCUCUCCCUUUCAGCUUCCCGGAUGAGCUCCCUAACAGUUGUCUGCUUGCAGCCCUGAGUGAUCGAGAGACUCGGCUGCAGGAGGUGCGCUCAGCCUUCUUGGCUGCGUACAGCAGCACAGUGGGGCUUCGGGCAGUAGCCCCCAGUCCUUCCGGUGCCAUCGGGGGCCUGCUGGAGCAAUUUGCCCGUGGUGUUGGACUCCGGAGCAUCAGCAGCAAUGCCUUGUGAAGAAGCCAGCCCAUGACAUUUUCCUGCUCCUCUCUCAGCUGAGCCCUUAGCAGAGAAUCAAAGCCAUGCCUGGCCGAAGGGGUACUUCCAGGUCAGGGGAAAUUUCAGUCCCCCAUCUCCAUCAUGAACAUGGCAGCCCCAAAGCUGAGCAAGGCCAAAGACAGGGUUUUCCAACCCCCAGCCUCUUGACUGGUGACCACCACCCCUUCUUGUCACUGUCUCCCACCCACCCCAUCUUUGCUGGGAUUCCCAUCAACUCUCAGAACUGUGUGGGGUUUCCCUGGGGCCUUGUGGAAGCCAUGACUUCACAAAGACCCUACCUGUCAGUUCUUGUUUCUGGGGAGGAGGGAUCACCUGCACUGAGAAUGAGGCAGUUUGACACAGAUCACAAAAUAAAAUCAAAGUCUUUUUGAAUAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-947.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -991.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 729.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.((((((((....((.(((((((((((((.((((....)))).))))).)))((((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((...((((((((((((((((.((((((((((((((((((..((((((.......).))))).))))))))))..))).))))).)))..((((........)))))))...)).))))))))...))))))))).......)))))).((((((..((..((((.(.(((....)))).))))..)).))))))(((.(((((((((((((.((((((((..((....)).)))))))).....)))))))..)))))))))......(((((((((((........(((((((.((.((((((((.(..(((...)))....(((((((((.(.(((...(.(((((...((((((.....((((((((...(((.....))).....))))))))...))))))....)))))).)))).)))))))))..).)))))))))).)))))))........)))))))))))(((((((((..((.....(((.(((((.(((((..((((((((....(((((.((...((((((((((......(((.((((((((...))))))))..))).......)))))))))).....))))))).......)))))))).....((((((((....((.(((((((((.(((((...(((..((.(((......))).))))).(((.....))))))))))))))))).)).))))))))(((..(((((.(((.((.....(((.(((......((.(((((.....(((.(((..(((((((.......(((....)))........))).))))..)))..))).)))))))))))))..((((.(((.(((((((((((....)))..)))))))).)))...))))............(((((...(((((....)))))...))))).((((((.......((((.....))))...)))))).)).))).)))))..))).....))))).)))))))))))))))))))..((((((((((...((((..........).)))...))))))).))).((((((.......(((((((.......((((((.....((((((.((((((..(((((((((.((..(((((((((.....)))))))))(((((((....))))))).....(((((((((.((....)).)))....((((.((.((((...(((((.((..(((.(((.(((.((((((......)))).........(((((..(((.......)))..))))))).))).))).))).)))))))))))))))))..)))).))..(((((......))))).((((((....)))))).)).))))))))))))))).(((((((......))).))))((((((.(((...))).)))))).......))))))...)))))))))))))......))))))(((((.(((((.......))))).)))))..)))))))...))))))))...........(((((((((........)))))))))...)).)))))))((((((((.(............).))))).)))))))))).((((((.((((((((.((((...((.(((((((((..(((...((((.(((((((.....(((((((((((((.((((...(((((..((((((((.............))).))).........))..)))))(((((((((..((((.........)))))))))))))..((((((..((((.....)))))))))).)))).)))).((((((..((((....))))..))))))(((((((((......)))..))))))(((...))).(((((.(((((.((.(...(((...(((....)))..)))...).)))))))))))).......))))))))).((((.(((((....))))).))))......((((....)))).((((((((.......((((((((((........))))).....((((.......))))((((......))))................(((((....)))))((((.(....).)))))))))...))))))))))))))).))))...))).(((((((.....((((((...........))))))......))))))).....((((((.(((((.(((......)))))))).).))))).))))))))))).)))).)))))))).))))))..((((.((.......))))))))))))))))).............(((((.....)))))...))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((.,.(((((.(((,,((((.(((((....))).)).))))))))..)))))...{(((((.{{.((((((((,...(((((...(((((((((((((...((((((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((,.{....}}.))))).))))))))))..))),})))).)))..((((,,...,,.)))))))...)).))))))))...))))))))).(((((((((((((({{{{{{(({..(({{(({((({{{,{({|(((((....))))).,{{{.(((((((((((((.((((((((..,{....,}.)))))))).....)))))))..))))))}}}.,,,.,(((((((((((........(((((((.((.((((((((.{..(({...}))....(((((((((.(,{{(,..{.(((((,||{(((((.|...(((({((({,,{{(....,||}..,..})||}}||...}))))}..,,))))),.}))),)))))))))..}.)))))))))).))))))).....,,.}))))))))))|((((((((..,{.,.,.(((.(((((.(((((,.(((((((({,..((({(.,|...((((((((((.....,(({.{(((((((...}))))))}..})).......)))))))))).....}}))))).....}.)))))))).,...((((((({....({.{(((((({{{(((((,..|{|.,{(|{{{...,}.)))}}},,..|||,..,,))))))))))))))))),)),))))))))(((.,{(({(.(({.((.....||,,{{{......,{,{{{(|,,,,,.,|||||,.{{(({((.......(((....|||,,....,.}||,||}}..,}}.})))}}}))}}}))))),.,|{||.(((.(((((((((((....))),.}))))))).)))..,||||.......,,,..(((((...(((((....)))))...))))).{{{{|{....,,,((((...,|))}}|||}})))|,|},))),)}||,,.))}.....))))}.)))))))}||}}}}}}}},..,,,(((((((...((({.,........).)))...))))))),|||....((((((..({((((.((...((........)).,.)).)))).)}.))))))..}})))))}..||||{((((({...,,,))))}{(((((((....)))))))}....,{{{{{{{({{(,,,,{{,||{{{,,,...}}))}||||{,|{{|||{||||||{||||||{|}(((,({,{(((,.,,.({(((((..(((({{(.({.((({({(,(({{{..,,,|,,,||,|{{{{{{(,,,,{{{{..}},,.,||}||((({(((((......))))))))}}..,|,.{((((..{{({{((((({.{{{{,,{(((((((......))).))},((((((.(((...))).)))))).,,,.,,|||{|||||||.,,,||,..,..,),)))})))},}))}}|}}.,,||.,,.|||}|||||||,,|},}},,}},)))))})),)},))})...(((((((((........)))))))))..,},}},}},}}|||{|{{{.,....,.......}.))))}.}}}.)))))))).)))).)))))|,..,.....,||}})).,))))))),...}))),|}|})||}},,})}|.,,}||}))),,,})),}.)))))))})},)))},)})}})}},}}})}},,}}))))....{|{...,)))(((((((((..((((.........))))))))))))).))))))))))))))).{(((((((.....))))).))}(((((((...(((((..((((((.({((....)).,,..,.)))))))))))((((((,..{{..(((((.(((((.{(,{...(((...(((....)))..)))...),}))))))))))).}}..,...)))))),,((({.(((((....))))),))))......((((((,{(((((((((.....))))..)))))|((((........))))}..,,........),.)))))))))))))...,,))))..)))))......(((({....})))))))))))).,}..{(((....)))))))))}|,{(((((((((((.,..,,.,,,{,{{.,(({,(((,.,|||,,|,.{{{{{(((((((.(((((((({...(((((..((((((...)))}),)))))...)))))))))....))))))}.,....})))),})})))),}.)),})}..})}...)))))))}.})))).))}.............(((((,...,)))))..,))).