Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001079864.3
Sequence Length
3297 nt
GC Content
0.3773
GGUCUUUGGGGGUAGGCGGUAGUGGCGGAAGAGGUUCGGCGGCUGAUGGCGGAUCAGGAUCGGAAGCCUGCGUAACUUUCUCCCUUGAUCCGGGAGUCUUUCCACUGGAUUCACAAUGACAUCCUUUCAAGAAGUCCCAUUGCAGACUUCCAACUUUGCCCAUGUCAUCUUUCAAAAUGUGGCCAAGAGUUACCUUCCUAAUGCACACCUGGAAUGUCAUUACACCUUAACUCCAUAUAUUCAUCCACAUCCAAAAGAUUGGGUUGGUAUAUUCAAGGUUGGAUGGAGUACUGCUCGUGAUUAUUACACGUUUUUAUGGUCCCCUAUGCCUGAACAUUAUGUGGAAGGAUCAACAGUCAAUUGUGUACUAGCAUUCCAAGGAUAUUACCUUCCAAAUGAUGAUGGAGAAUUUUAUCAGUUCUGUUACGUUACCCAUAAGGGUGAAAUUCGUGGAGCAAGUACACCUUUCCAGUUUCGAGCUUCUUCUCCAGUUGAAGAGCUGCUUACUAUGGAAGAUGAAGGAAAUUCUGACAUGUUAGUGGUGACCACAAAAGCAGGCCUUCUUGAGUUGAAAAUUGAGAAAACCAUGAAAGAAAAAGAAGAACUGUUAAAGUUAAUUGCCGUUCUGGAAAAAGAAACAGCACAACUUCGAGAACAAGUUGGGAGAAUGGAAAGAGAACUUAACCAUGAGAAAGAAAGAUGUGACCAACUGCAAGCAGAACAAAAGGGUCUUACUGAAGUAACACAAAGCUUAAAAAUGGAAAAUGAAGAGUUUAAGAAGAGGUUCAGUGAUGCUACAUCCAAAGCCCAUCAGCUUGAGGAAGAUAUUGUGUCAGUAACACAUAAAGCAAUUGAAAAAGAAACCGAAUUAGACAGUUUAAAGGACAAACUCAAGAAGGCACAACAUGAAAGAGAACAACUUGAAUGUCAGUUGAAGACAGAGAAGGAUGAAAAGGAACUUUAUAAGGUACAUUUGAAGAAUACAGAAAUAGAAAAUACCAAGCUUAUGUCAGAGGUCCAGACUUUAAAAAAUUUAGAUGGGAACAAAGAAAGCGUGAUUACUCAUUUCAAAGAAGAGAUUGGCAGGCUGCAGUUAUGUUUGGCUGAAAAGGAAAAUCUGCAAAGAACUUUCCUGCUUACAACCUCAAGUAAAGAAGAUACUUGUUUUUUAAAGGAGCAACUUCGUAAAGCAGAGGAACAGGUUCAGGCAACUCGGCAAGAAGUUGUCUUUCUGGCUAAAGAACUCAGUGAUGCUGUCAACGUACGAGACAGAACGAUGGCAGACCUGCAUACUGCACGCUUGGAAAACGAGAAAGUGAAAAAGCAGUUAGCUGAUGCAGUGGCAGAACUUAAACUAAAUGCUAUGAAAAAAGAUCAGGACAAGACUGAUACACUGGAACACGAACUAAGAAGAGAAGUUGAAGAUCUGAAACUCCGUCUUCAGAUGGCUGCAGACCAUUAUAAAGAAAAAUUUAAGGAAUGCCAAAGGCUCCAAAAACAAAUAAACAAACUUUCAGAUCAAUCAGCUAAUAAUAAUAAUGUCUUCACAAAGAAAACGGGGAAUCAGCAGAAAGUGAAUGAUGCUUCAGUAAACACAGACCCAGCCACUUCUGCCUCUACUGUAGAUGUAAAGCCAUCACCUUCUGCAGCAGAGGCAGAUUUUGACAUAGUAACAAAGGGGCAAGUCUGUGAAAUGACCAAAGAAAUUGCUGACAAAACAGAAAAGUAUAAUAAAUGUAAACAACUCUUGCAGGAUGAGAAAGCAAAAUGCAAUAAAUAUGCUGAUGAACUUGCAAAAAUGGAGCUGAAAUGGAAAGAACAAGUGAAAAUUGCUGAAAAUGUAAAACUUGAACUAGCUGAAGUACAGGACAAUUAUAAAGAACUUAAAAGGAGUCUAGAAAAUCCAGCAGAAAGGAAAAUGGAAGAUGGAGCAGAUGGUGCUUUUUACCCAGAUGAAAUACAAAGGCCACCUGUCAGAGUCCCCUCUUGGGGACUGGAAGACAAUGUUGUCUGCAGCCAGCCUGCUCGAAACUUUAGUCGGCCUGAUGGCUUAGAGGACUCUGAGGAUAGCAAAGAAGAUGAGAAUGUGCCUACUGCUCCUGAUCCUCCAAGUCAACAUUUACGUGGGCAUGGGACAGGCUUUUGCUUUGAUUCCAGCUUUGAUGUUCACAAGAAGUGUCCCCUCUGUGAGUUAAUGUUUCCUCCUAACUAUGAUCAGAGCAAAUUUGAAGAACAUGUUGAAAGUCACUGGAAGGUGUGCCCGAUGUGCAGCGAGCAGUUCCCUCCUGACUAUGACCAGCAGGUGUUUGAAAGGCAUGUGCAGACCCAUUUUGAUCAGAAUGUUCUAAAUUUUGACUAGUUACUUUUUAUUAUGAGUUAAUAUAGUUUAGCAGUAAAAAAAAAAAAAAAAACCACACCUAAAAUAGACCACUGAGGAGACCAUAGAGCGGAUGCUUUCAUGCACCCUUUACUGCACUUUCUGACCAGGAGCUACUUUGAGUUUGGUGUUACUAGGAUCAGGGUCAGUCUUUGGCUUAUCAAUAAAUUUUAAUCUCUGUUAAUCUUACCUGCUUUAAAAAAAAGUUCUUGUGUGUUCGUAUCUUUAUUUAUUCCCUAGUUUGCAGAACUGUCUGAAUAAAGGAUACAAGGAUUAUUUCAAUGUUACUGCACUGAAAAACGUGUAUGUAUUAGUGUGCUAGAUUAUUUAGCAGAAUAUUCACAAGUUUCUGUUGACCUUGUUGAUUGAGCAUGACUACUAAAUAUUAUGUAAUAAAAAGCAUUUGUCAUAACAGUCUUAUGAAGUAGUUCUUCGAAUAUAGAAAGUUCUAUAAUUUAGCCCAUGAAAUGAUAGGUUUUUAAUUUUCAGAAAUGGAGCUGCAUGUAGAAUGAGAUCACAUGCUUUUAUAUGUGAAAUAUUGGUUUUAGCAAUUAACAGAAGGCAUACUUUGCUAAUUUUAUGGCAAAAUUUUAGAAUAACCUGAAUGAUUAUUUUUAAACUAUCUUGAAGUUGUAUGUAUAUAUCUAAUGGGAAAAUGGAACAAGAGAUGUCAGUAUAAUUGUUUUCCUAUUAAAUGAUCUCAUAACAGGGGUGUUUGUGGCAUAAAAAUCAUAGAAUAUAUAUCAGUAUCUUUUUUACAUUUUCCUGAUGAGAAUAUAAAUUUGAAAUAUUCUCAGUAAGUGAUUAAAAGUACAAUACAUAAACCCAAAUCAAAGUAAUGUGUUUCUUCAGUUAUGUCUGUGCUGUAUAGAACUGUCACUAACAUUAAAGAAAGAGGACACAUUUUUCAAGAUCUGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-803.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -868.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 793.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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