Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001080434.2
Sequence Length
4945 nt
GC Content
0.7039
GUCUGCGUAACCGCACGGGAAACCCGCCACCACCUCCACCUCCCUGCCAUCCUCGACAAGAUGCCUGCCCCCGGCGCCCUCAUCCUCCUUGCGGCCGUCUCCGCCUCCGGCUGCCUGGCGUCCCCGGCCCACCCCGAUGGAUUCGCCCUGGGCCGGGCUCCUCUGGCUCCUCCCUACGCUGUGGUCCUCAUUUCCUGCUCCGGCCUGCUGGCCUUCAUCUUCCUCCUCCUCACCUGUCUGUGCUGCAAACGGGGCGAUGUCGGCUUCAAGGAAUUUGAGAACCCUGAAGGGGAGGACUGCUCCGGGGAGUACACUCCCCCUGCGGAGGAGACCUCCUCCUCACAGUCGCUGCCUGAUGUCUACAUUCUCCCGCUGGCUGAGGUCUCCCUGCCAAUGCCUGCCCCGCAGCCUUCACACUCAGACAUGACCACCCCCCUGGGCCUUAGCCGGCAGCACCUGAGCUACCUGCAGGAGAUUGGGAGUGGCUGGUUUGGGAAGGUGAUCCUGGGAGAGAUUUUCUCCGACUACACCCCCGCCCAGGUGGUGGUGAAGGAGCUCCGAGCCAGCGCGGGGCCCCUGGAGCAACGCAAGUUCAUCUCGGAAGCACAGCCGUACAGGAGCCUGCAGCACCCCAAUGUCCUCCAGUGCCUGGGUCUGUGCGUGGAGACGCUGCCGUUUCUGCUGAUUAUGGAGUUCUGUCAACUGGGGGACCUGAAGCGUUACCUCCGAGCCCAGCGGCCCCCCGAGGGCCUGUCCCCUGAGCUACCCCCUCGAGACCUGCGGACGCUGCAGAGGAUGGGCCUGGAGAUCGCCCGCGGGCUGGCGCACCUGCAUUCCCACAACUACGUGCACAGCGACCUGGCCCUGCGCAACUGCCUGCUGACCUCUGACCUGACCGUGCGCAUCGGAGACUACGGGCUGGCCCACAGCAACUACAAGGAGGACUACUACCUGACCCCAGAGCGCCUGUGGAUCCCACUGCGCUGGGCGGCGCCCGAGCUCCUCGGGGAGCUCCACGGGACCUUCAUGGUGGUGGACCAGAGCCGCGAGAGCAACAUCUGGUCCCUGGGGGUGACCCUGUGGGAGCUGUUUGAGUUUGGGGCCCAGCCCUACCGCCACCUGUCAGACGAGGAGGUCCUCGCCUUCGUGGUCCGCCAGCAGCAUGUGAAGCUGGCCCGGCCGAGGCUCAAGCUGCCUUACGCGGACUACUGGUAUGACAUUCUUCAGUCCUGCUGGCGGCCACCUGCCCAGCGCCCUUCAGCCUCUGAUCUCCAAUUGCAGCUCACCUACUUGCUCUCCGAGCGGCCUCCCCGGCCCCCACCGCCGCCACCCCCACCCCGAGACGGUCCCUUCCCCUGGCCCUGGCCCCCUGCACACAGUGCGCCCCGCCCGGGGACCCUCUCCUCACCGUUCCCCCUACUGGAUGGCUUCCCUGGAGCCGACCCCGACGAUGUGCUCACGGUCACCGAGAGUAGCCGCGGCCUCAACCUCGAGUGCCUGUGGGAGAAGGCCCGGCGUGGGGCCGGCCGGGGUGGGGGGGCACCUGCCUGGCAGCCGGCGUCGGCCCCCCCGGCCCCCCACGCCAACCCCUCCAACCCUUUCUACGAGGCGCUGUCCACGCCCAGCGUGCUGCCUGUCAUCAGCGCCCGCAGCCCCUCCGUGAGCAGCGAGUACUACAUCCGCUUGGAGGAGCACGGCUCCCCUCCUGAGCCCCUCUUCCCCAACGACUGGGACCCCCUGGACCCAGGAGUGCCCGCCCCUCAGGCCCCCCAGGCCCCCUCCGAGGUCCCCCAGCUGGUGUCCGAGACCUGGGCCUCCCCCCUCUUCCCUGCGCCCCGGCCCUUCCCAGCCCAGUCCUCAGCGUCAGGCAGCUUCCUGCUGAGCGGCUGGGACCCCGAGGGCCGGGGCGCCGGGGAGACCCUGGCGGGAGACCCUGCCGAGGUCUUGGGGGAGCGGGGGACCGCCCCGUGGGUGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGGCAGCUCCCCAGGGGAAGACAGCAGCAGCCUUGGAGGUGGCCCAAGCCGCCGGGGUCCCCUACCCUGUCCCCUGUGCAGCCGCGAGGGGGCCUGCUCCUGCCUGCCACUGGAGCGGGGGGACGCCGUAGCAGGCUGGGGAGGCCACCCUGCUCUUGGCUGCCCCCACCCCCCCGAGGACGACUCCUCGCUGCGGGCAGAGCGGGGCUCCCUGGCCGACUUGCCCAUGGCCCCCCCCGCCUCGGCCCCCCCCGAGUUUCUGGACCCCCUCAUGGGGGCGGCGGCGCCCCAGUACCCCGGGCGGGGGCCACCUCCCGCUCCCCCCCCCCCGCCGCCACCUCCUCGGGCCCCCGCGGACCCGGCCGCGUCCCCCGACCCCCCUUCGGCCGUGGCCAGUCCCGGUUCAGGCCUCUCGUCGCCGGGCCCCAAGCCGGGGGACAGCGGCUACGAGACCGAGACCCCUUUUUCCCCAGAGGGAGCCUUCCCAGGUGGGGGGGCGGCCGAGGAGGAAGGGGUCCCUCGGCCGCGGGCUCCCCCCGAGCCACCCGACCCAGGAGCGCCCCGGCCACCUCCAGACCCGGGUCCGCUCCCACUCCCGGGGCCCCGGGAGAAGCCGACCUUCGUGGUUCAAGUGAGCACGGAACAGCUGCUGAUGUCCCUGCGGGAGGAUGUGACAAGGAACCUCCUGGGGGAGAAGGGGGCGACAGCCCGGGAGACAGGACCCAGGAAGGCGGGGAGAGGCCCCGGGAACAGAGAGAAAGUCCCGGGCCUGAACAGGGACCCGACAGUCCUGGGCAACGGGAAACAAGCCCCAAGCCUGAGCCUCCCAGUGAACGGGGUGACAGUGCUGGAGAACGGGGACCAGAGAGCCCCAGGCAUCGAGGAGAAGGCGGCGGAGAAUGGGGCCCUGGGGUCCCCCGAGAGAGAAGAGAAAGUGCUGGAGAAUGGGGAGCUGACACCCCCAAGGAGGGAGGAGAAAGCGCUGGAGAAUGGGGAGCUGAGGUCCCCAGAGGCCGGGGAGAAGGUGCUGGUGAAUGGGGGCCUGACACCCCCAAAGAGCGAGGACAAGGUGUCAGAGAAUGGGGGCCUGAGAUUCCCCAGGAACACGGAGAGGCCACCAGAGACUGGGCCUUGGAGAGCCCCAGGGCCCUGGGAGAAGACGCCCGAGAGUUGGGGUCCAGCCCCCACGAUCGGGGAGCCAGCCCCAGAGACCUCUCUGGAGAGAGCCCCUGCACCCAGCGCAGUGGUCUCCUCCCGGAACGGCGGGGAGACAGCCCCUGGCCCCCUUGGCCCAGCCCCCAAGAACGGGACGCUGGAACCCGGGACCGAGAGGAGAGCCCCCGAGACUGGGGGGGCGCCGAGAGCCCCAGGGGCUGGGAGGCUGGACCUCGGGAGUGGGGGCCGAGCCCCAGUGGGCACGGGGACGGCCCCCGGCGGCGGCCCCGGAAGCGGCGUGGACGCAAAGGCCGGAUGGGUAGACAACACGAGGCCGCAGCCACCGCCGCCACCGCUGCCACCGCCACCGGAGGCACAGCCGAGGAGGCUGGAGCCAGCGCCCCCGAGAGCCAGGCCGGAGGUGGCCCCCGAGGGAGAGCCCGGGGCCCCAGACAGCAGGGCCGGCGGAGACACGGCACUCAGCGGAGACGGGGACCCCCCCAAGCCCGAGAGGAAGGGCCCCGAGAUGCCACGACUAUUCUUGGACUUGGGACCCCCUCAGGGGAACAGCGAGCAGAUCAAAGCCAGGCUCUCCCGGCUCUCGCUGGCGCUGCCGCCGCUCACGCUCACGCCAUUCCCGGGGCCGGGCCCGCGGCGGCCCCCGUGGGAGGGCGCGGACGCCGGGGCGGCUGGCGGGGAGGCCGGCGGGGCGGGAGCGCCGGGGCCGGCGGAGGAGGACGGGGAGGACGAGGACGAGGACGAGGAGGAGGACGAGGAGGCGGCGGCGCCGGGCGCGGCGGCGGGGCCGCGGGGCCCCGGGAGGGCGCGAGCAGCCCCGGUGCCCGUCGUGGUGAGCAGCGCCGACGCGGACGCGGCCCGCCCGCUGCGGGGGCUGCUCAAGUCUCCGCGCGGGGCCGACGAGCCAGAGGACAGCGAGCUGGAGAGGAAGCGCAAGAUGGUCUCCUUCCACGGGGACGUGACCGUCUACCUCUUCGACCAGGAGACGCCAACCAACGAGCUGAGCGUCCAGGCCCCCCCCGAGGGGGACACGGACCCGUCAACGCCUCCAGCGCCCCCGACACCUCCCCACCCCGCCACCCCCGGAGAUGGGUUUCCCAGCAACGACAGCGGCUUUGGAGGCAGUUUCGAGUGGGCGGAGGAUUUCCCCCUCCUCCCCCCUCCAGGCCCCCCGCUGUGCUUCUCCCGCUUCUCCGUCUCGCCUGCGCUGGAGACCCCGGGGCCACCCGCCCGGGCCCCCGACGCCCGGCCCGCAGGCCCCGUGGAGAAUUGAUUCCCCGAAGACCCGACCCCGCUGCACCCUCAGAAGAGGGGUUGAGAAUGGAAUCCUCUGUGGAUGACGGCGCCACUGCCACCACCGCAGACGCCGCCUCUGGGGAGGCCCCCGAGGCUGGGCCCUCCCCCUCCCACUCCCCUACCAUGUGCCAAACGGGAGGCCCCGGGCCCCCGCCCCCCAGCCCCCCAGAUGGCUCCCCUGACCCCCCUGACCCCCUCGGAGCCAAAUGAGGCAGGAAUCCCCCCGCCCCUCCAUAGAGAGCCGCCUUUCUCGGAACUGAACUGAACUCUUUUGGGCCUGGAGCCCCUCGACACAGCGGAGGUCCCUCCUCACCCACUCCUGGCCCAAGACAGGGGCCGCAGGCUUCGGGGACCCGGACCCCCCAUUUCGCGUCUCCCCUUUCCCUCCCCAGCCCGGCCCCUGGAGGGGCCUCUGGUUCAAACCUUCGCGUGGCAUUUUCACAUUAUUUAAAAAAGACAAAAACAACUUUUUGGAGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2494.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2570.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 1388.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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