Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001080508.3
Sequence Length
6430 nt
GC Content
0.4149
ACCGCUCUCCUGCCUGGAAGUGCUGACAGAUCAAGGCAACAAAUUUCAAUUACAAUCCCUAAUUUGUGUCCACAGAGUGUUUUUUACCCAUGUUAGUCCUCUCUGGCGCAUCAGUUGAGGCAGACCUCGGAGCAGCAGGAGGAGGUGGAAGGGGUGGGAGCAAAGGAGUGCAUCAGUGAGAGAGCGCGCGAGAGAGACCCAGGAAAGGAGACUUGGCCGGCGCGUCGCCGGUUCCUGGAUCCCAACACAAGCGAGAAAGCGGAAACGCCAAAUCUGUUUUUUGCCCGCGGUGGGGAAGGGGGCAGAUCUCGGGAGGCCCCGAGAGCCUUUUAGUUUUUGGUGGGGGAAGAGCGAGAGCGCGCGUGUGCCCGCGUGAGUGUAUAUGAGAGAGGGGCGGGCGGGCGCGGGGCGGGGGGGAUGGCCGAGAAGCGAAGGGGCUCGCCGUGCAGCAUGCUAAGCCUCAAGGCGCACGCUUUCUCGGUGGAGGCGCUGAUCGGCGCCGAGAAGCAGCAACAGCUUCAGAAGAAGCGGCGAAAACUGGGCGCCGAAGAGGCGGCGGGGGCCGUGGACGACGGAGGCUGCAGCCGCGGCGGCGGCGCGGGCGAAAAGGGUUCUUCUGAGGGAGACGAAGGCGCUGCGCUCCCGCCGCCGGCUGGGGCGACGUCUGGGCCGGCUCGGAGUGGCGCAGACCUGGAGCGCGGAGCCGCGGGCGGCUGUGAGGACGGCUUCCAGCAGGGAGCUUCCCCUCUGGCGUCACCGGGAGGCUCCCCCAAGGGGUCUCCGGCGCGCUCCCUGGCCCGGCCCGGGACCCCUCUGCCCUCGCCGCAGGCCCCGCGGGUGGAUCUGCAGGGAGCCGAGCUCUGGAAGCGCUUUCAUGAGAUAGGCACUGAGAUGAUCAUCACCAAGGCCGGCAGGCGCAUGUUUCCAGCAAUGAGAGUGAAGAUCUCUGGAUUAGAUCCUCACCAGCAAUAUUACAUUGCCAUGGAUAUUGUACCAGUGGACAACAAAAGAUACAGGUAUGUUUACCACAGUUCGAAAUGGAUGGUGGCAGGUAAUGCUGACUCGCCUGUGCCACCCCGUGUGUACAUUCAUCCAGACUCGCCUGCCUCGGGGGAGACUUGGAUGAGACAAGUUAUCAGCUUCGACAAGCUGAAGCUCACCAACAAUGAACUGGAUGACCAAGGCCAUAUUAUUCUUCAUUCUAUGCACAAAUACCAACCGCGAGUGCACGUCAUCCGUAAAGACUGUGGAGACGAUCUUUCUCCCAUCAAGCCUGUUCCAUCCGGGGAGGGAGUAAAGGCAUUCUCCUUUCCAGAAACUGUCUUCACAACCGUCACUGCCUAUCAGAAUCAGCAGAUUACUCGCCUGAAGAUAGAUAGGAAUCCAUUUGCUAAAGGCUUCCGAGACUCCGGGCGCAACAGAAUGGGUUUGGAAGCCUUGGUGGAAUCAUAUGCAUUCUGGCGACCAUCACUACGGACUCUGACCUUUGAAGAUAUCCCUGGAAUUCCCAAGCAAGGCAAUGCAAGUUCCUCCACCUUGCUCCAAGGUACUGGGAAUGGCGUUCCUGCCACUCACCCUCACCUUUUGUCUGGCUCCUCUUGCUCCUCUCCUGCCUUCCAUCUGGGGCCCAACACCAGCCAGCUGUGUAGUCUGGCCCCUGCUGACUAUUCUGCCUGUGCCCGCUCAGGCCUCACCCUCAACCGAUACAGCACAUCUUUGGCAGAGACCUACAACAGGCUCACCAACCAGGCUGGUGAGACCUUUGCCCCGCCCAGGACUCCCUCCUAUGUGGGCGUGAGCAGCAGCACCUCCGUGAACAUGUCCAUGGGUGGCACUGAUGGGGACACCUUCAGCUGCCCACAGACCAGCUUAUCCAUGCAGAUUUCGGGAAUGUCCCCCCAGCUCCAGUAUAUCAUGCCAUCACCCUCCAGCAAUGCCUUCGCCACUAACCAGACCCAUCAGGGUUCCUAUAAUACUUUUAGAUUACACAGCCCCUGUGCACUAUAUGGAUAUAACUUCUCCACAUCCCCCAAACUGGCUGCCAGUCCUGAGAAAAUUGUUUCUUCCCAAGGAAGUUUCUUGGGGUCCUCACCGAGUGGGACCAUGACGGAUCGGCAGAUGUUGCCCCCUGUGGAAGGAGUGCACCUGCUUAGCAGUGGGGGUCAGCAGAGUUUCUUUGACUCUAGGACCCUAGGAAGCUUAACUCUGUCAUCAUCUCAAGUAUCUGCACAUAUGGUCUGAUGAAGCCUUUAAGUUAAAUGACAUUUGGAUCUGUCUAACAUAUUUUCUUUUUCUUUUUUAAAAGCUAUGUGGAAAGAAACUCUCUGUGGUUUAUAAAAUGUACAUAUAAUAGAAAAUGAAGGCUCACUGGGUUUUUUGACUUUAUCAUGGUGAGAUUGUAAUUAUCUAUGGUAUAUAUGUAUGCUGUAUAUACAUAGCACAUGGAGUAUCACGGCCCCUAUUGUUCCCCUGUUUCAUCCAGUUGCACGGAGUAUUGGCAUGCGUGUAGUAUGUUUAAGCAAAGUUCUCAGACUCUUUUAAAAACAAGAUGGUAAACUUAAAACUUGGCAAUUAUACUAUCCAGAAGAACACUUAUAACUUAAUUUAUCAGAAAAAUGCUCUAAACGGUUUCAUACUUGAUGUAUUGAUAACCAGCAGUAACCAGCAUGUAGAGUCUUGUGAUUUCUGUUAUUCUUGGACACAGUGUGAGAAUCUAAAAUACAAAAGCCAGUUGAAGUCUUAGUGUUAGUCCUGAGGUAUUUGUAAUCAUGAAGGAUCAGCUUUUUCAUUCCUGCUUAUUAUUUACCACACAUACUAUAUGACCUUGGGUCUAUAAAAAAAUCAUAACCCAUAAUAAUUGUUAUUUUCUUAAGGAAGGUAAAGGAGAGGCUUGUGAUUUUUUUUUUUACACUUUCCAUUGGGCACAUAAGAGGUUCUUAUUCAUCUGUAGAGAACAAAUUUCCAGUAUUUUCGAUUUUUUGCUUAUUUUAUAUAUCAAAUAGACCAUUAAAGAAUGUUCUAUAAACAUUUUUAAAUUCCAAUUUUCACCAGGGGAGGAAUAUGUGAUAUGAGUGGAAUGGCAAAAGGAAAAUAAAUCCACCUCAAAUUCAUUGAUUCCAAUGAGAAAUGUCUAUCUUUUAAAUCAAGAGUAAUACUAUUGUUAACUAUACCUUAUGUUUUUGUAUAGUUUGUUUUUAAAUUUAGAAUAUUUUUUCCAUCUUGCUCUGAGCUUCCUGACCGAUAGUAUAUAAGUAAAAAAAAUGCAUUUAUGCUACUUAUUUAUAUCUUGUAAUUCCUACACAUUGAACCCUUUUCCCCUUCUUAACCUUGUCCGUCUGCCUGAGUCUUUCCCAAAACAGAUAGUUCCUAGGCCUGUAUGGUGUUAAAUAACACGGUGAGGAAUUUCAGUAGGUUAUCUCCAGCAAUCUGUCUUUUGGGAGCUAUAGUGCAAAGGCCAAAGCCCAUUACUAUAAAGACCCUCUUGGAGGACUAAGAAGGAAGAUACUAAUUAUGAUAAAGGAACUAUAAAACUUUUAACCUCAACAGAAUUUGUAAUGUCAGAACUGGAGAAAUUAAAAUCAGUAUUAAAUUUUUUAAUUCCUAAAAUAAUAUAUGCAUGGUUGAAGAGUUAAAAACAAGUAACUUUGAGAGCACAGUAUGAGAUAAAUAAAAAAGGCUAAGAAUACAUGAUGAGGCACAUUCCCCUUCUGAGGAGAAAGCGAAAUAACAUGUCUGUGCAUUGACCCAUUCAUUACAUUUCAUGUAUCUUAAGCAAAAGAGCAUGAUUUUCUCUCAUUGCUAAAAAGAGUUGCUUUAACUCAUCCCUGGAUUUGGUGGGGAAAGGGUACAACUCCUGAUUUGCUGUUUCACUUUGAAACAACACAAUUUGUUAGAUACUUAGGGAGAUAUACUGUUGAAUUUGCACAGGAUGUGACUCUGUUUAUACAUAUUAACAAAUUUCCUUUUGGAUUCCUUAGCAGUUCAUCAAAUUAGUAUUAAAUUUUUAAAUUUAAAACUAGCAUGAAGGGACAUGAAAUAUUUGCAGUAGGUGGAUCUAUGUAAGAUGUUUGGGUAUGGCAUUAAUAGCUUGACAAAGAUUUGGGGAAAGGUGUUAAGAAUGAGUCCAUCUCAGCCAAUAGUGCUUGGUGUAUAAUUCAAGAACAGAGAGUUUUCCAUCUUGAAAAAACAUGGAAAGUAAUGCUCUAUACCCAUAUGUAUUAAUAAGAGCAUUUUCCUUCUUGCCGUUGAUCAUUUCAGAUGAUACCACAAUAUGAGUAUAAUUUUUUAUUAAUCUUUUUUCUGGUAAAAUUUUAGCAAUAUUGUACAAAUGCUUUUUUUAGGUUUUACUGUAAAUAUUAAUCACCACGUCACUUCAGAGACUAGCCUUUUAUUGCUGAAUUAAAUGACAUGCAUACAUUGAUAAUUAUAUAUCUGUAUUUUAUUAAAAAGUACUUAAAAUUAUAUUAAAAUAUGUUAUUAAACCCUUUUAUGAUUUUGGAGGGUAAUCAUUUUAAUGUCUAAAAAUAUUGAUCCAAGAAUAAGCACACACAUGCACACCCCAAACGCAAAUUCUGUACCUCUCAAAUACAUGGCAGAAAGAAAUGGGCCUGCUGUUCAUGUUUCAUGUGUUAAAUGUAAUUUCUUGGUGUGUUGACCAUGUCAUUGAAGGUGAAGGCCCUGACAAAUGUUGAACACAUGAAAAUUUGAAUGUGAGAGGAAAGGGAUGGGGUGGUAUGUUUUGUUUUGGGUCCAGGGGAGAAAGGCAAGGUUACAAGAAUGAGUGGCUUGCACCACUGACUAGUGAUGACAGAUUACUUCUAUGCCCCUUGACUAGUAAACAUUCCAAGGGACAUCGCGAUGGGGUGAGGUUGCUGCUAUCAAGACCAGUCACAUUUUGAAAAUUAACACUUGCUUCCUUACAAGCUGCCUUCCAGAGGUCAACAGCUUUUCACAAGUGAGGCACCCAGUUGCUGACCCUUGAUUUCUGGAAUGUAAGGGGU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1852.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1981.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 1751.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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