Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001102402.3

Sequence Length

2205 nt

GC Content

0.5016

CUAAGGGUGUCCGCGGCCUGCCCUCCAGGCGGAGGAGCCCGGACUGCGGAAGGAUGGAGCUGGCCGCCGGAAGCUUCUCGGAGGAGCAGUUCUGGGAGGCCUGCGCCGAGCUCCAGCAGCCCGCUCUGGCCGGGGCCGACUGGCAGCUCCUAGUGGAGACCUCGGGCAUCAGCAUCUACCGGCUGCUGGACAAGGUAGCGGCCAACCCGCUGGAGGACCGCGGGGCCUAGAAUGCGCCGGGGUCGACCUCCCCGCAGGGAGUGCGGGGCGGCAGUCGCGGAAGGGACAGGGGCGCGUCUUCUCCGGCUCAGGAAGGAGCUCCGCCCGGACCCUGUCUCAAGCUCUGGAGCUAGCGCAGGGGCGGUGCCUCCAAGUGACUGCCGUGCAGAUCCAGGGGAGUUGGAAGGUCACAGGAGUUCAGCCUCAGAAGACUGGACUUUAUGAGUAUAAAGUCUUUGGUGUUCUGGAGGACUGCUCACCAACUCUACUGGCAGACAUCUAUAUGGACUCAGAUUACAGAAAACAAUGGGACCAGUAUGUUAAAGAACUCUAUGAACAAGAAUGCAACGGAGAGACUGUGGUCUACUGGGAAGUGAAGUACCCUUUUCCCAUGUCCAACAGAGACUAUGUCUACCUUCGGCAGCGGCGAGACCUGGACAUGGAAGGGAGGAAGAUCCAUGUGAUCCUGGCCCGGAGCACCUCCAUGCCUCAGCUUGGCGAGAGGUCUGGGGUGAUCCGGGUGAAGCAAUACAAGCAGAGCCUGGCGAUCGAGAGUGACGGCAAGAAGGGGAGCAAAGUUUUCAUGUAUUACUUCGAUAACCCGGGUGGCCAAAUUCCGUCCUGGCUCAUUAACUGGGCCGCCAAGAAUGGAGUUCCUAACUUCUUGAAAGACAUGGCAAGAGCCUGUCAGAACUACCUCAAGAAAACCUAAGAAAGAGAACUGGGAACAUUGCAUCCAUGGGUUGAUGUCUCUGGAAGUGCAACCACCCAAUGUCUCUGGAAGUGCCACCUGGAAGUGCCACCUGGAAGUGUCUCUGGAAGAGCACCCACCACUGUUCAGCCUUCCCCUGCUGUUUCUGUCUUCAGAGGCCUACACACUACCACAUCCUUUCUAAGCAUGUUUGCCUGACAUCCAGCUCACUCGUCUGCUUCCUUUCUCGCUCCCCCCAUCCUGGGCUGGGCUGCCUUCUUCUACAGUUCAAUAUGGGGCAGACUAGGGAAACCUUUGCUUGCUUACUAUUAGGAGGGGAAGUCUUCAGUAGGGAACACGAUCAUUCCAUUGUGCAAUUUUACGGGGAUGGGUGGGCGGAGGGACACAACAAAAUUUAAGAAUGACUAUUUGGGCGGGCUGGCUCUUUUGCAGCUUGUGAUUUCUUCCAGCUUGGGAGGGGCUGCUGGAAGUGGCAUUUCGUUCAGAGCUGACUUUCAGUGCACCCAAACUGGAUGACGUGCCAAUGUCCAUUUGCCUUAUGCUUUGUGGAGCUGAUUAGGCUGGGAUUUGAGGUGAUAAUCCAGUAAGUCUUUCCUCGUUCCUACUUGUGGAGGAUCAGUAGCUGUUAUGAUGCCAGACCAUUUGGAGAAGUAUCAGAGGCCUGACCGGACACAUAAUAUGACAACCACAUUUUUCCUCAUCAUCCAUGAGGAAAUGGAUGAUUUCUCUUUUCCAUAUGUCACUGGGGGAAAGGCUGCCUGUACCUCUCAAGCUUUGCAUUUUACUGGAAACUGAGGCGUCAAGAUGGCUGUGGCAGCUAGCAAAAGCAAAGAUGCUUUGUGCAUAGCCUUGUGAAAAAGUAUCUUUCUAUGCAAUAAGAUGAAUUUUCCUCCCAGAAUAUUUAGAAAUGUAGAAGGGAUAACAGUUCACAGCCAGGUAAAAUUUAACUGGUGGCUUAAUGACUCUGCACCUUUUUCUCAGGAAUUCUGCCUAAGUUGUCUGCCUUUUCUACCACCAAAAAGACUUUUAGUUUUCUAUGCUUUCUCCUGAAUUUUGGUAGGGUAAGGUAUUUCUAUGUCAAAGGCACAGCCUUGAUGAUCUCAGGGAAAAAUUUUAAUCACUGUGUAUAAUGAUACUGAACCUUGAUUAAUAACAGAAAUUCAGGAUGUAAAGCCACAGAAUGGGAUUUAUUAAUGUGGGAUACCUCAGACUGUUUGUUUUCUUUCUGGGAAGAAAAGUGUGUUCUAUAAUGAAUAAAUAUAGAGUGGUUUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-779.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -821.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 616.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((.((((((((((((.(((((...((((((..((.....))..))).)))..)))))))).(((((((((((......)))))))))))((((((..((((((((.(((((((.((((((((......)))))...(((....)))(((((((((((((.((.......((((((((.......))))))))..(((((.((....)))))))))...).)))).))))))))..((.(((((((.....))))))).)))))..))))..(((((((((..(((.(((((((......)).)))))...))).....)))))))))..))))))))))).))))))))))((((((((((((((.(((((..((((((...(((((((((((..((((..(((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))..))).)))).)))).)))......))))))...(((((((...(((((((.((((...............)))).))).)))).........(((.......)))((((...((((((..((((((.((((....)))).....(((((...(((((((((....((((...))))...((((.(...).))))...))))))))))))))((((..((....))..)))).(((((((.((((.(((.(((((.((...))..))))).))))))).)))))))...((.......))((.((((...((..((.((.(((((((.(((((.(((((....(((((.((..(((((.......((((((((((.((((((((.((((((((.....))))))....)).))))))))......(((((((..((((.(((....))))))).........)))))))..........(((((..((((....(((((((((.(((.......)))))))..)))))...))))...)))))....).))))))))))))))..)).)))))(((.((((...))))))).......)))))..)))))...))))))).)).)).))..)))))).......))))))..))))))..))))))))))))))).)))))))).))))))))).(((((.(.(((.((.((((((((.(((((((((..(((((((((.(((........((((((.(.(((....)))..).)))))))))..))))))))).))))..))))......((((((......))))))........).)))))))).)))))))))))............................))))).(((((((....((((((..(((..(((((((...((((((((((.((((((((((((...((.....))))).))))))))))).)))..(((((((....((((...((((....((((...((((....)))).....))))..))))....))))...)))))))..............)))))....))))))))))..))))))...)).)))))..)))))))))..)))))..)))))....)))))))......(((.((((((..........(((((((((......))))))))).((((((((.(((((((..(((((((((((((((((....(((((...((((((..((((....)))).))))))....))).))....))))))).(((..((.(((((((((((.((((......))))..))))))))))))).)))............))))).))))).))))......))).))))))))...(((.(((.((((((((........)))..)))))...)))..)))(((.(((((((((((((....((..(((..(((((....((((((......(((..((....(((((....(((((((((((((((((.((....((((((...((..(((((...((((((((((((.....))))))..............))))))....)))))..)))))))).......)).))))))))))).).)))))...)))))))..)))......)))))).....)))))..)))))....)))))))))))))..)))(((((......)))))........)))))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((((((({((((((((((((.(((((,||(({(((,.((,,{{,||..}||,|||,{|||||||}.(((((((((((......))))))))))){{||((,.{({(((((,(((((((.((((((((......)))))...(((....)))|((((((((((({,{{.......((((((((.......))))))))..(((((.((....)})))))||...},,))).))))))))..{{.(((((((.....))))))),|||||,,||}}..((((((((((((,(.(((((((......))}}))))...)))},...}))))))))..}}}}}}})))).)}))))))}){{|{{||||{{|||}|||||,.((((((...(((((((((((..((((..(((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))..))).))))}}))).)))......))))))...((((((({,.{{{,(((.((((...............)))).))),}}|{{{..,,....||...,,,..,.,{((...((((((..((((((.{(((....}}}|.....(((((,,.(((((((((....((((...))))...,{((.{...},)))}...)))))))))))))).{{{..,||,..{||.}},{.(((((((.((((.(((.(((((.((...))..))))).))))))).))))))).}.|{....,..|}((.((((...((..((.((.(((((((.(((((.(((({..{{|,{{..|,..,}}||.}}....(((((((((....((((,...{((((((.....))))))}.{{{|,||||,,,,.,....||||||,..((((.(((....))))))).........}},}},,..........(((((..((((....(((((((((.(((.......)))))))..)))))...))))...)))))))))..))))))))).,||||,,,,|||,.{{{.{{{|.,.})}))))....,,.)))))..)))))...))))))).)).)).))..)))))}.......))))))..))))))..))))))))))))))).)))))))).))))))))).((((({{.(((.((.((((((((.(((((((((.{({{((((((.{{{.......,((((((.,.(((....))),.}})))))},}},,))))))))).)))),.))))..,,..((((((......))))))........).)))))))).)))))))))))........................}}}})))))||{{{{||,...((((((..(((..{((((((,,.|(((((((((,(((((({{((((,{.((,,,,{|.|||{|}}})))))}}.,}}..,||||||,,.,||||,..((((....((((...((((....)))).....))))..))))....}}}}...}))))))..|,,,,,|},,..}}}}}....})))))))))..))))))...}}.)))}}.,|}}}}))}}..))))),.})))),}..)))})))......,{,.{{((((....,{{{{{(({{{{{||,,,,,,)}|||}}}}.{{{{||{||||{{||{..((((((((({(((((((...,({(((...(((((,,,,{{,..,}}))}.}))))}....}}},||,,..}}))))}.(((,,((,({{{{{|||||.|||{,|,,,.||}|,,}}}}}||||||||.|}}.......,,,,,}|||}.}}}}),)})),,,...}}),)))))))).,.,{{}|||.{((((({{........})),,)))))...}}}..,,|{{{|||||||{||||{{...,||,.{||,.|||||,,,,,{{,,{{{,....{{{{{{...}}}}||{{..((((({(((((((((((,,(,...((((((...((..(((((...((((((((((((.....))))))..............))))))....)))))..)))))))).....,.,).))))))))))).).))))),|,|}}|||},,,,},|,..,))))}},,,,.}}}|}..}|,}|,,,,}}))))))))}))}})})))|((((({.{.....,,)))))))))))}.,,.