Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001112741.2
Sequence Length
4303 nt
GC Content
0.6024
GACCGCGCGAACGAGCAGGCGACGGGCGAGCAGCAAGCGGAGCAGCAGCCCGGGCGGCAGCAGCGUCGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCCGCUCCGCGCCUCGCCUCACCGGCCUCGCUGGCCUCACCUCGCCGCGCCCGGACCCGCCACCCCCGCCUCCCCGCCCGACCUCCGCAGCCCCCGUCUCGGCCGGCAGCGCCCACCGCCUGCCCGAAGCGAGGAGCGGAGUGCGGGGCGCAGAGGCACCGGAGCCAGUGCCCGCCGGCCCCGCAAAUCAAACCCAGCCAGGAGAACCCCCGCCUGGCCCCGUGCAGCUCCGCGACCGCCGGGAGCUGUCCCUUCAGCACCGCCGCGGGAGCCCAAGUCCGAGCGCAGCCCAGCGGAACCCCAGCUCGAGCCCGGGCUCACGGAGAGCAGCGCUCGGCGUUAGCCGCACGAGCAACACCCCGGGUGCCCCUGCCCAGGGGGCCCGCCAUCUCCUCCAGGAGGCGGGGAGAAGGAACGAGGAGGGCGGGCGGGCAGGCGGGCCCGCCGCCGGGGGGAGCAGGCAGCCAAGCAAGGAGAGAGGGAGGGGGCCGGAGCCCGCCCUGCGUCCCGAGCUGCAGCCCGGCCACGCAGGGAGGAAGGCAGGCGGCAUCCAUCUCCCCCGCGCCGAGAGCGCGCCGCGGCGACCACCUCACAGAGGAGCGCGAAUUUCCCGGCCCUGUCUCCUCCCCUCCCCCUCCUGGGGGCUGGCCUCUAGUCCGGCCCCGGGAGCGGCUGACCUUUCCCCCAAAAGCUUUGUGCCGAUUUCUCCAUUUUCCCGCGGAGAUGGGGACGGGAGCCCGGCCCCCCAACCCAUUUUCCCCACCUCCCGGGGCUCGCUGCUGAGCCCGCCCCCCUCCCUCUUUCCCCCUCACUCCCUCCCUCCCUCCCUUUCUCCCUCCCUUUCUCCCUCCCUUCUUUCCUCCUCUGCCUCCUCCGCUGCCGGACCAGCUCCCUCCCACAUCUGGCUCCUAGAGACCCCUGGGAUCCCGCGCACAUUCCCCUGGACCGGCACCCGACAAAGCGCCCGGAGAGGCUUGGCUCGCUCGUUGGGGUGGCCAGAGCCGCAGGCCUCUGUUCCCCCCGACGGCUGGGGGGAGGGGGGAAGAGGGCGCGCGCCCCCCUCCCCGGCGCCAACUCCCCCUGGCGGCCGCUCCCAUGGGUGUCGCUGGGCCGCGCCAUGCCUAAGGGGGCGCCGCGAUGGGCCAAGGGGACGAGAGCGAGCGCAUCGUGAUCAACGUGGGCGGCACGCGCCACCAGACGUACCGCUCGACCCUGCGCACGCUGCCCGGCACGCGGCUCGCCUGGCUGGCGGAGCCCGACGCCCACAGCCACUUCGACUAUGACCCGCGUGCUGACGAGUUCUUCUUCGACCGCCACCCCGGCGUCUUCGCGCACAUCCUGAACUACUACCGCACGGGCAAGCUGCACUGCCCAGCCGACGUGUGCGGGCCGCUCUACGAGGAGGAGCUGGCCUUCUGGGGCAUCGACGAGACCGACGUGGAGCCCUGCUGCUGGAUGACGUACCGCCAGCACCGCGACGCCGAGGAGGCUCUGGACAGCUUCGGCGGCGCUCCUCUGGACAACAGCGCCGACGACGCGGACGCCGACGGCCCUGGCGACUCGGGCGACGGCGAGGACGAGCUGGAGAUGACCAAGCGCCUGGCGCUCAGUGACUCCCCGGAUGGCCGGCCUGGCGGCUUUUGGCGCCGCUGGCAGCCGCGCAUCUGGGCGCUCUUCGAGGACCCGUACUCGUCCCGCUACGCGCGGUAUGUGGCCUUCGCUUCCCUCUUCUUCAUCCUGGUCUCCAUCACCACCUUCUGCCUGGAGACCCACGAGCGCUUCAACCCCAUCGUGAACAAGACGGAGAUCGAGAACGUUCGCAAUGGCACGCAAGUGCGCUACUACCGGGAGGCCGAGACGGAGGCCUUCCUUACCUACAUCGAGGGCGUCUGUGUGGUCUGGUUCACCUUCGAGUUCCUCAUGCGUGUCAUCUUCUGCCCCAACAAGGUAGAGUUCAUCAAGAACUCGCUCAACAUCAUUGACUUUGUGGCCAUCCUGCCCUUCUACCUGGAGGUGGGGCUGAGCGGCCUGUCCUCCAAGGCAGCCAAGGACGUGCUGGGCUUCCUGCGCGUCGUCCGCUUCGUGCGCAUCUUGCGCAUCUUUAAGCUGACCCGCCACUUUGUGGGCCUGCGGGUCCUGGGCCACACGCUCCGAGCCAGCACCAACGAGUUCCUGCUGCUCAUCAUCUUCCUGGCCUUGGGCGUGCUGAUCUUCGCCACCAUGAUCUACUACGCCGAGAGGAUAGGGGCACAGCCCAAUGACCCCAGCGCCAGUGAGCACACGCACUUUAAGAACAUCCCCAUCGGCUUCUGGUGGGCCGUGGUCACCAUGACGACCCUGGGCUAUGGAGACAUGUACCCGCAGACGUGGUCCGGCAUGCUGGUGGGGGCUCUGUGUGCGCUGGCGGGCGUGCUCACCAUCGCCAUGCCCGUGCCCGUCAUCGUGAACAAUUUCGGGAUGUAUUACUCCUUAGCCAUGGCUAAGCAGAAACUACCAAAGAAAAAAAAGAAGCAUAUUCCGCGGCCACCGCAGCUGGGAUCUCCCAAUUAUUGUAAAUCUGUCGUAAACUCUCCACACCACAGUACUCAGAGUGACACAUGUCCGCUGGCCCAGGAAGAAAUUUUAGAAAUUAACAGAGCAGAUUCCAAACUGAAUGGGGAGGUGGCGAAGGCCGCGCUGGCGAACGAAGACUGCCCCCACAUAGACCAGGCCCUCACUCCCGAUGAGGGCCUGCCCUUUACGCGCUCGGGCACCCGCGAGAGAUACGGACCCUGCUUCCUCUUAUCAACCGGGGAGUACGCGUGCCCACCUGGUGGAGGAAUGAGAAAGGAUCUUUGCAAAGAAAGCCCUGUCAUUGCUAAGUAUAUGCCGACAGAGGCUGUGAGAGUGACUUGACCAGGCGGCUUGGCCGAGGACACUGGUGGCUAUUAAGCAUCUGGGUGGACCUGCAGCCCCUCCUCACCCUCGGACAGAGUAAAUUCACGCCAUGCAGGUUUGCCGGACGAGUCCGAGUGGCCCAGGCAUUGUACUAGGACGGACGUAGCUUUUUCUACGGCCAAAUGGUAACUGACCGUAGAGGAUUUCUUUUCCUUCUUUUCAUUUUUUAAAAUUUUAUUUUAUUUGGGGAGGGGGGGUGGAGGGGCUCCUUAGCAUGACUUGCAUGAAGUUAAACAGAAAACCCAGCAAACCAAACCCACCAACCCCCUGCAACUGUAUGAUUACCCUGAACAACAAUAAUGAAAAGAAAAACAUCAAAGCCCUCUAUUUUCUUUCAAAGCUCUUGACUUUCACACACGUUGUUGGAGCCAAACUGUAACGGCGUUCAGUAGAAACCUGUACAUUUCUGGGGGUGAGGGGCGAGGGGAGGAGGGACAGAGAUGGGGAAUGGAUUGCUUCCUUUUUGUACACAAGAUCAAGAGGAAAGCUUCCAAAAAGGGCAGUCGGUCAGUCAUCGGUCAUAUUGACCUCACCUUCAUAGUUCAUCUCUCACGUGGAAACUGAGAACUUUGCUCCAAAUAGAAUUGUGGAAACUCGCACGGCUGCCUUCUUCCCCGUUUGGCAUGCUUGUGACCCAGCGGAUGUCUCCCCAAGACCCCUGACAGCAGCUAGUCUAGGUUGAUUCUCUCAUCUUAUCGGUGUGUAGAUCCAGUGUGACCAACUUUCAUAACAAAUUGUUCAUAGUAAAUAAUCACCACCGUAUGGAUUUUCCAAGUGUUCCAUUAAAACCAGGAUGUAGAGCACCAAAAGAUCAGGACCACGGGAGGAGCAGCCUCCUCCACCUUUACUAAGGCACAACCUGGCAUUGUAUGCAAUUUAGUACUUCAGAGUAAAAACCUGCAUGCCCAAUGUUAUGCAAAGCGAUUCUAGCAUGAAAUAAAUUUUGUAUCAUGGUUUCUGUAUAGUCUAAAGCAGAUUUGUUUUCCUGAAGCAGUCGGAGGUUUGCAGAGACACACUUCUGCAUCUCGAAUAAAUAUAGUAUUUUCCCAACAGAAACAGAGGACAGUAGCUUGGCUUUGGUCUGAUUCUAAAAUUAGUGGGGUGGGGGGGAAGGAUGAUAUUUUUGAAAAACACAUGCUUGAGUUGAAAAAAAUGCAACAUCUCAAGCUUUCACUGCAGCUCACAACAUUUCCUGGAAAGAGAGCAAUGAUGCUUUAGCUCAACAACCUCCCCUCCCUGGGCCCUGGCCCCCAAUAAUAAAAAACUGACUUUUGAGAUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1735.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1809.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 1275.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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