Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001126114.3

Sequence Length

2645 nt

GC Content

0.5251

CUCAAAAGUCUAGAGCCACCGUCCAGGGAGCAGGUAGCUGCUGGGCUCCGGGGACACUUUGCGUUCGGGCUGGGAGCGUGCUUUCCACGACGGUGACACGCUUCCCUGGAUUGGCAGCCAGACUGCCUUCCGGGUCACUGCCAUGGAGGAGCCGCAGUCAGAUCCUAGCGUCGAGCCCCCUCUGAGUCAGGAAACAUUUUCAGACCUAUGGAAACUACUUCCUGAAAACAACGUUCUGUCCCCCUUGCCGUCCCAAGCAAUGGAUGAUUUGAUGCUGUCCCCGGACGAUAUUGAACAAUGGUUCACUGAAGACCCAGGUCCAGAUGAAGCUCCCAGAAUGCCAGAGGCUGCUCCCCCCGUGGCCCCUGCACCAGCAGCUCCUACACCGGCGGCCCCUGCACCAGCCCCCUCCUGGCCCCUGUCAUCUUCUGUCCCUUCCCAGAAAACCUACCAGGGCAGCUACGGUUUCCGUCUGGGCUUCUUGCAUUCUGGGACAGCCAAGUCUGUGACUUGCACGUACUCCCCUGCCCUCAACAAGAUGUUUUGCCAACUGGCCAAGACCUGCCCUGUGCAGCUGUGGGUUGAUUCCACACCCCCGCCCGGCACCCGCGUCCGCGCCAUGGCCAUCUACAAGCAGUCACAGCACAUGACGGAGGUUGUGAGGCGCUGCCCCCACCAUGAGCGCUGCUCAGAUAGCGAUGGUCUGGCCCCUCCUCAGCAUCUUAUCCGAGUGGAAGGAAAUUUGCGUGUGGAGUAUUUGGAUGACAGAAACACUUUUCGACAUAGUGUGGUGGUGCCCUAUGAGCCGCCUGAGGUUGGCUCUGACUGUACCACCAUCCACUACAACUACAUGUGUAACAGUUCCUGCAUGGGCGGCAUGAACCGGAGGCCCAUCCUCACCAUCAUCACACUGGAAGACUCCAGUGGUAAUCUACUGGGACGGAACAGCUUUGAGGUGCGUGUUUGUGCCUGUCCUGGGAGAGACCGGCGCACAGAGGAAGAGAAUCUCCGCAAGAAAGGGGAGCCUCACCACGAGCUGCCCCCAGGGAGCACUAAGCGAGCACUGCCCAACAACACCAGCUCCUCUCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACUGGAUGGAGAAUAUUUCACCCUUCAGGACCAGACCAGCUUUCAAAAAGAAAAUUGUUAAAGAGAGCAUGAAAAUGGUUCUAUGACUUUGCCUGAUACAGAUGCUACUUGACUUACGAUGGUGUUACUUCCUGAUAAACUCGUCGUAAGUUGAAAAUAUUAUCCGUGGGCGUGAGCGCUUCGAGAUGUUCCGAGAGCUGAAUGAGGCCUUGGAACUCAAGGAUGCCCAGGCUGGGAAGGAGCCAGGGGGGAGCAGGGCUCACUCCAGCCACCUGAAGUCCAAAAAGGGUCAGUCUACCUCCCGCCAUAAAAAACUCAUGUUCAAGACAGAAGGGCCUGACUCAGACUGACAUUCUCCACUUCUUGUUCCCCACUGACAGCCUCCCACCCCCAUCUCUCCCUCCCCUGCCAUUUUGGGUUUUGGGUCUUUGAACCCUUGCUUGCAAUAGGUGUGCGUCAGAAGCACCCAGGACUUCCAUUUGCUUUGUCCCGGGGCUCCACUGAACAAGUUGGCCUGCACUGGUGUUUUGUUGUGGGGAGGAGGAUGGGGAGUAGGACAUACCAGCUUAGAUUUUAAGGUUUUUACUGUGAGGGAUGUUUGGGAGAUGUAAGAAAUGUUCUUGCAGUUAAGGGUUAGUUUACAAUCAGCCACAUUCUAGGUAGGGGCCCACUUCACCGUACUAACCAGGGAAGCUGUCCCUCACUGUUGAAUUUUCUCUAACUUCAAGGCCCAUAUCUGUGAAAUGCUGGCAUUUGCACCUACCUCACAGAGUGCAUUGUGAGGGUUAAUGAAAUAAUGUACAUCUGGCCUUGAAACCACCUUUUAUUACAUGGGGUCUAGAACUUGACCCCCUUGAGGGUGCUUGUUCCCUCUCCCUGUUGGUCGGUGGGUUGGUAGUUUCUACAGUUGGGCAGCUGGUUAGGUAGAGGGAGUUGUCAAGUCUCUGCUGGCCCAGCCAAACCCUGUCUGACAACCUCUUGGUGAACCUUAGUACCUAAAAGGAAAUCUCACCCCAUCCCACACCCUGGAGGAUUUCAUCUCUUGUAUAUGAUGAUCUGGAUCCACCAAGACUUGUUUUAUGCUCAGGGUCAAUUUCUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUUUCUUUGAGACUGGGUCUCGCUUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGGAGUGGCGUGAUCUUGGCUUACUGCAGCCUUUGCCUCCCCGGCUCGAGCAGUCCUGCCUCAGCCUCCGGAGUAGCUGGGACCACAGGUUCAUGCCACCAUGGCCAGCCAACUUUUGCAUGUUUUGUAGAGAUGGGGUCUCACAGUGUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGGGCUCAGGCGAUCCACCUGUCUCAGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUACAAUUGUGAGCCACCACGUCCAGCUGGAAGGGUCAACAUCUUUUACAUUCUGCAAGCACAUCUGCAUUUUCACCCCACCCUUCCCCUCCUUCUCCCUUUUUAUAUCCCAUUUUUAUAUCGAUCUCUUAUUUUACAAUAAAACUUUGCUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-924.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -970.06

Frequency: 0.0000

Diversity: 451.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((.((((....((((.((((((.(((.(.((.(((((...((((...(((.(((((.(((((((..(((.((((((((.(.((((((........((((((..(((((.....))))).)))))))))))).).)))).)))))))..)))).))).))))).)))))))(((.((((((((((...((((((......))))))....))))))........((((((((((....((((.((((.(((..((((((...(((((((....((((((....(((((....)))))..((..((.(((((((((((...(((((((((((((.((((((((((......((((...((((....))))...))))...)))))))...((.(((((.....(((((((((((.....(((((........))))).......)))))..)))).)).....).)))))).))).)))))))))))..))...))))).))))))...))..))..................((((((((....)).)))))).((((..(((..(.((((((.....)))))).)..)))..))))....)))))).((((.(((((((....((((((....((.((((..((.(((.(((...))).))).))..)))).))))))))........))))))))))).......)))))))))))))....((((.......(((((((((.(((..(((((.......(((((.........)))))((((((((.....((((((((...)).)))))).....))))))))))))).)))..)))))))))......))))))).))))))))((((....((((.....))))....))))..(((((((....)))))))..........)))))))))).)))).)))((((.(((((((((...(((((((.......(((((...(.((..(((..(((((........)))))..))).)).)..)).)))))))))).)))).))))).)))).))))).)).)))).((((((...(((((((...((((........((.((((......))))))))))(((((((...((((((((..................)))))).))....)))))))........((((...((.((((.((.((((((((((((((.(((...........)))))))))))))))))...)).)))).)))))).((.(((.(((..((.((((((((.(((......)))))))))))))..)))))).))))))))).))))))(((.(((((((((((((......))))....(((((.........((((((((...((..(((........((..((((...))))..)))))..))...)))))))).......)))))))))))))).)))...).)))))(((((((((.((((.(((((.(((......)))...((((......))))..((..((.....))..))..(((.(((.(((.((((.............)))).))))))...)))((((((...(((......)))..))))))..)))))))))))))))).)).))))......)))))))))))((((((((...((((((((((((..((((((((((((((...))))))))......((((.(((...))).)))).........(((((((((((.(((((((.((((((.((((((((...((((((..(((((......)).)))(((((((((....(((((((.......((....)).......)))))))(((((((((.............)))))))))....))))))))).................((((((........))))))..)))))).))).........)))))))))))))))))).)))..))))))))((((((((.(((((...((((((((...........))))))))...)))))...((((((...(((((..((((((((..((((.........))))..........((.(((........)))))...(((((..........)))))........)))))))).))))).......))))))...............................((((.......)))).(((((..(.....)..)))))((((((.((((..((((((((.((((......(.((((...(((.(((..((((.(((((....)).)))))))...)))))))))).)....)))).))))))))))))..))))))...(((((((.....))))))).(((((.((((((((...(((((((..(((.....)))))))))).((((.......))))((((((((((...))).))))))).....)))))))))).))).))))))))((((((((.................((((........))))..........))))))))......)))))).....)))))))......................)))))..)))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

....{(((((({{(((....((((.((((((.(((.(.((.(((((...((((...(((.(((((.(((((((..(((.((((((((.(.((((((........((((((..(((((.....))))).)))))))))))).).))))}}))))))..)))).))).))))).))),)))|{{.{{,(((((((...((((((......))))))....))))))}.......((((((((((...{((((.((((.(((..((((({...(((((((,,..{(({{{....{((((....))))}..,..,{{.(((((((((((...(((((((((((((.(((((((((,....,,((((...((((....))))...}}}}...))}))},...||.(((({.....{{{|({(((((.....(((((........))))).......)))))..)))),)).....).}}))))}))).))))))))))}.,))...))))).)))))),,,||,.,..,,{.{,,{{...,{|{,((({(({{....||||}}|||.((((..(((..(.((((((.....)))))).}..)))..)))}...,|}}}}),|((({,((,((((...((((((....((.((((..((.(((.(((...))).))).))..)))).)))))))).})}}.)},)))))))))),......)))))))))}}}}},,.||,|||.....||||||{((.{{{,,(({{{,.,,,..(((({.........|||||((((((((..,..((((((((...)),})))))..,..)))))))))}})),))}..}}}}}})))......))))))).))))))))|{((....((((.....))))....))},..(((((((....))))))),,........)))))))))).,,,,.,,|((((.(((((((((...(((((((.......(((({...{.((..(((..(((((........)))))..))).)).}..)),)))))))))).)))).))))).))))}))))).}}.}}}).((((((.,.(((((((......,....,.,.(({{(({{,,..,})),,},,}}(((((((...((((((((...,,........,,...)))))).))....))))))).......,((((,..{|.{{{{.,,.((((((((((((((,(((,......}.,,}))})))))))))))))...}}.)))).))))||},|.||({(((..((.((((((((.(((......)))))))))))))..)))})).},))))))).))))))(((.(((((((((((((......))))....(((({.......}}((((((((...((..(((........((..((((...))))..)))))..))...)))))))).......}))))))))))))).)))...},})))){((((((((.(({(((((((,((({{,,,{|({...((((......))))..||,|||}...}))}.)),{(((.(((.(((.((((.............)))).))))))...)))|(((({...(((......)))..}))))}..)))))))))))))))).)}.))))......))))))))))|((((((((,{.((((((((((((..((((((((((((({...}))))))).....,((((.({,...,,}.)))).......,{({((((((({(,(((((((.((((({,((((((((.,.((((({..(({({......}}.}}}(((((((((....(((((((..,{...({....)).......)))))))(((((((((.........,...)))))))))....))))))))).................((((((........))))))..}))))).)),.........)))))))))))))))))),})),.},,,}},|((((((((.(((((...((((((((,,....,,...)))))))).,.)))))...((((((...(((((..((((((((..((,{,,..,||...}||..........{{,(((..,....,)},))},.(((((..........)))))...)).}.)))))))).))))).......))))))...............................{({{.......)))).(((((..(,....)..)))))((((((.((((.,((((((((.((((,.....,.((((...{(,{(((..((((.(((((....))}}))))))...))))))))))})....)))).))))))))))))..))))))...{((((((.....))))))).(((((.(((((((({{.(((((((..({{.....,),))))))).((((.,...,.))))((((((((((...))).)))))))..}}.}))))))))).))).))))))))|(((((((.................((((........))))..........))))))))}},}},)))))).....)))))))......................))))).})))))))),......