Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001126118.2

Sequence Length

2629 nt

GC Content

0.5359

CUCAAAAGUCUAGAGCCACCGUCCAGGGAGCAGGUAGCUGCUGGGCUCCGGGGACACUUUGCGUUCGGGCUGGGAGCGUGCUUUCCACGACGGUGACACGCUUCCCUGGAUUGGCAGCCAGACUGCCUUCCGGGUCACUGCCAUGGAGGAGCCGCAGUCAGAUCCUAGCGUCGAGCCCCCUCUGAGUCAGGAAACAUUUUCAGACCUAUGGAAACUGUGAGUGGAUCCAUUGGAAGGGCAGGCCCACCACCCCCACCCCAACCCCAGCCCCCUAGCAGAGACCUGUGGGAAGCGAAAAUUCCAUGGGACUGACUUUCUGCUCUUGUCUUUCAGACUUCCUGAAAACAACGUUCUGUCCCCCUUGCCGUCCCAAGCAAUGGAUGAUUUGAUGCUGUCCCCGGACGAUAUUGAACAAUGGUUCACUGAAGACCCAGGUCCAGAUGAAGCUCCCAGAAUGCCAGAGGCUGCUCCCCCCGUGGCCCCUGCACCAGCAGCUCCUACACCGGCGGCCCCUGCACCAGCCCCCUCCUGGCCCCUGUCAUCUUCUGUCCCUUCCCAGAAAACCUACCAGGGCAGCUACGGUUUCCGUCUGGGCUUCUUGCAUUCUGGGACAGCCAAGUCUGUGACUUGCACGUACUCCCCUGCCCUCAACAAGAUGUUUUGCCAACUGGCCAAGACCUGCCCUGUGCAGCUGUGGGUUGAUUCCACACCCCCGCCCGGCACCCGCGUCCGCGCCAUGGCCAUCUACAAGCAGUCACAGCACAUGACGGAGGUUGUGAGGCGCUGCCCCCACCAUGAGCGCUGCUCAGAUAGCGAUGGUCUGGCCCCUCCUCAGCAUCUUAUCCGAGUGGAAGGAAAUUUGCGUGUGGAGUAUUUGGAUGACAGAAACACUUUUCGACAUAGUGUGGUGGUGCCCUAUGAGCCGCCUGAGGUUGGCUCUGACUGUACCACCAUCCACUACAACUACAUGUGUAACAGUUCCUGCAUGGGCGGCAUGAACCGGAGGCCCAUCCUCACCAUCAUCACACUGGAAGACUCCAGUGGUAAUCUACUGGGACGGAACAGCUUUGAGGUGCGUGUUUGUGCCUGUCCUGGGAGAGACCGGCGCACAGAGGAAGAGAAUCUCCGCAAGAAAGGGGAGCCUCACCACGAGCUGCCCCCAGGGAGCACUAAGCGAGCACUGCCCAACAACACCAGCUCCUCUCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACUGGAUGGAGAAUAUUUCACCCUUCAGAUCCGUGGGCGUGAGCGCUUCGAGAUGUUCCGAGAGCUGAAUGAGGCCUUGGAACUCAAGGAUGCCCAGGCUGGGAAGGAGCCAGGGGGGAGCAGGGCUCACUCCAGCCACCUGAAGUCCAAAAAGGGUCAGUCUACCUCCCGCCAUAAAAAACUCAUGUUCAAGACAGAAGGGCCUGACUCAGACUGACAUUCUCCACUUCUUGUUCCCCACUGACAGCCUCCCACCCCCAUCUCUCCCUCCCCUGCCAUUUUGGGUUUUGGGUCUUUGAACCCUUGCUUGCAAUAGGUGUGCGUCAGAAGCACCCAGGACUUCCAUUUGCUUUGUCCCGGGGCUCCACUGAACAAGUUGGCCUGCACUGGUGUUUUGUUGUGGGGAGGAGGAUGGGGAGUAGGACAUACCAGCUUAGAUUUUAAGGUUUUUACUGUGAGGGAUGUUUGGGAGAUGUAAGAAAUGUUCUUGCAGUUAAGGGUUAGUUUACAAUCAGCCACAUUCUAGGUAGGGGCCCACUUCACCGUACUAACCAGGGAAGCUGUCCCUCACUGUUGAAUUUUCUCUAACUUCAAGGCCCAUAUCUGUGAAAUGCUGGCAUUUGCACCUACCUCACAGAGUGCAUUGUGAGGGUUAAUGAAAUAAUGUACAUCUGGCCUUGAAACCACCUUUUAUUACAUGGGGUCUAGAACUUGACCCCCUUGAGGGUGCUUGUUCCCUCUCCCUGUUGGUCGGUGGGUUGGUAGUUUCUACAGUUGGGCAGCUGGUUAGGUAGAGGGAGUUGUCAAGUCUCUGCUGGCCCAGCCAAACCCUGUCUGACAACCUCUUGGUGAACCUUAGUACCUAAAAGGAAAUCUCACCCCAUCCCACACCCUGGAGGAUUUCAUCUCUUGUAUAUGAUGAUCUGGAUCCACCAAGACUUGUUUUAUGCUCAGGGUCAAUUUCUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUUUCUUUGAGACUGGGUCUCGCUUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGGAGUGGCGUGAUCUUGGCUUACUGCAGCCUUUGCCUCCCCGGCUCGAGCAGUCCUGCCUCAGCCUCCGGAGUAGCUGGGACCACAGGUUCAUGCCACCAUGGCCAGCCAACUUUUGCAUGUUUUGUAGAGAUGGGGUCUCACAGUGUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGGGCUCAGGCGAUCCACCUGUCUCAGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUACAAUUGUGAGCCACCACGUCCAGCUGGAAGGGUCAACAUCUUUUACAUUCUGCAAGCACAUCUGCAUUUUCACCCCACCCUUCCCCUCCUUCUCCCUUUUUAUAUCCCAUUUUUAUAUCGAUCUCUUAUUUUACAAUAAAACUUUGCUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-933.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -975.97

Frequency: 0.0000

Diversity: 684.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..............((..((.....))..)).((((((.(((((((...((((...(((.(((((.(((((((..(((.((((((((.(.((((((........((((((..(((((.....))))).)))))))))))).).)))).)))))))..)))).))).))))).))).))))((((((...(....)...))))))((.(((((..(.......)..))))).)).(((((((((.((.(((...((((.(((....(((.....(((((((((((((((((........)))))))))......)))))))).((((.((((((.....)))))))))).((((((((((....((((.((((.(((..((((((...(((((((....((((((....(((((....)))))..((..((.(((((((((((...(((((((((((((.((((((((((......((((...((((....))))...))))...)))))))...((.(((((.....(((((((((((.....(((((........))))).......)))))..)))).)).....).)))))).))).)))))))))))..))...))))).))))))...))..))..................((((((((....)).)))))).((((..(((..(.((((((.....)))))).)..)))..))))....)))))).((((.(((((((....((((((....((.((((..((.(((.(((...))).))).))..)))).))))))))........))))))))))).......)))))))))))))....((((.......(((((((((.(((..(((((.......(((((.........)))))((((((((.....((((((((...)).)))))).....))))))))))))).)))..)))))))))......))))))).))))))))((((....((((.....))))....))))..(((((((....)))))))..........)))))))))).)))))).)))).)))..)).)))))))))(((((((((((((...(((((((((((((.((((.(......).))))..(((((....(((.((....)).)))(((.(((.(((..((((((((.......((((((...(((((((..........((((.((((((((...........)))))..)))))))((....))(((((..((.((((((((.(((......)))))))))))))..))).))...))))))).))))))(((.(((((((((((((......))))....(((((.........((((((((...((..(((........((..((((...))))..)))))..))...)))))))).......)))))))))))))).)))............(((((((.((((.(((((.(((......)))...((((......))))..((..((.....))..))..(((.(((.(((.((((.............)))).))))))...)))((((((...(((......)))..))))))..)))))))))))))))).((((((..((((((((..........((((((((((....(((((((..((..((((((((.....((((((....))))))....))))).)))..))))))))).)))))))))).....(((((.((((((.((((((((...((((((..(((((......)).)))(((((((((....(((((((.......((....)).......)))))))(((((((((.............)))))))))....))))))))).................((((((........))))))..)))))).))).........))))))))))))))))))))))))..)))))).))))))))))).))).))).(((((.(((((((.(.(.....((((...))))......).))))))))))))))))))............((((((((((...(((((((...(((.(.(((.((((((((((..........)))))....))))).))).)...)))...)))....))))..))))))))))..................)))))))))))))...((((((..((((.((..((((.((((((.((((..((((((((.((((......(.((((...(((.(((..((((.(((((....)).)))))))...)))))))))).)....)))).))))))))))))..))))))...(((((((.....)))))))...))))..)).))))..)))))))))))))))....)))).(((((..(((((......(((((((((((...))).))))))))....)))))))))).....))))))).((((((((.................((((........))))..........)))))))).........................................(((((....)))))......)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,{{{{,,,{{((..,,,,,,.||{((|,((,{{|,{{{{((({({((((,{,{{{.(((((.((((((({.(((.((((((((.(.((((((........((((((..(((((.....))))).)))))))))))).).))))}}))))))..||||,}}}.,||,}.}})},,},||||}{}..(({..{{{{{,(({.{(...|},..|}}.}}}})..)))..,||.,(((,,(({.,,,|,{,},{{{{,||{.,,,|||,,...(((((((((((((((((........)))))))))......)))))))).{(((.((((((.....)))))))))}.({(({(((({..,((({{.{{{{.|||,.||{{||...|||||||||,}||||{,....(((((....))))}..{..{{{,(((((((((((...(((((((((((((.(((((((((,....,,((((...((((....))))...}}}}...))}))},...||.(((({.....{{{|({(((((.....(((((........))))).......)))))..)))),)).....).}}))))}))).))))))))))}..))...))))).)))|||.{{{|{,{,,{{{{{{,{,....,|,.((((((((....))||))))},{(((,,({(,,(,((((((.....}))))).}..|||,,||||...,||,|||.(((({,((.((((...((((((....((.((((..((.(((.(((...))).))).))..)))).)))))))).))}).)).)))))})))),.,,,,.|}||}}}}},|||,,,.||,|}},....||||||{||,|,,.,{({{,,.,,,..((((,........,|||||((((((((..,..((((((((...)),})))))..,..))))))))),,))})),..},,,,,))),.....})))))).)))))))}|(({....((((.....))))....}}},..(((((((....))))))),.........))))}))))).))}})}.))}|,}}},,||{|||}}||||{{,,,.|,}}|||||,,|{|{{..(((,.(((((........|||}|,.}||.,,.,}})))})}}}||||},||....{||{{|{.{{({{{,,{.......((((((...(((((((..........((((.((((((((...........))))}..)))))))((....}}({{((..((.((((((((.(((......)))))))))))))..))).)).,.))))))).)))))){{{,{((((({{|(({|..,,..}))}.,}}|,{{,,,.....}}((((((((...((..(((........((..((((...))))..)))))..))...))))))))..,....,))))))))))))).))}...,.,|||,{{(((((((.(({{{(((((,((({{,,,{|{{...((((......))))..||,|||}...}))}.)),{(((.(((.(((.((((.............)))).))))))...)))|(((({...(((......)))..}))))}..)))))))))))))))).||,|||,...,,,|||}}}},,,,{{((({{{{{,{{{{{(((((({..(({{(((((((((,...|))))))}.....|((({.{|,...,,},}})).,...,..|(|((((((({(.{((((((.(((((,,((((((((.,.((((({..{{{({......}}.})}(((((((((....(((((((..,{...({....)).......)))))))(((((((((.........,...)))))))))....))))))))).................((((((........))))))..}))))).}},....,,,,,)))))))))))))))))),))),.}})))))}{|||||||,|||{|},.|||||{||||,,,,}},,,))})}}))|||}}}))...((((((...(((((..((((((((..((,{,,..,||...}||.........,{{,(((..,....,)},))},.(((((..........)))))...}).}.)))))))).))))).......))))))...............................{{{{.......))))||||||,,{{,...}..))}}}((((((.((((.,((((((((.((((,.....,.((((...{(,{(((..((((.(((((....))}}))))))...))))))))))})....)))).))))))))))))..))))))...{((((((.....))))))}.(((((.(((((((({,.(((((((..({{.....,),))))))).((((.,...,.))))((((((((((...))).)))))))..}}.}))))))))).))).)))))))}{(((((((.................((((........))))..........)))))))),,,}}}}))))).....}}|}},,......,,...,........,.}}}}}.}))}}}}}}},.,,,.