Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001126241.3
Sequence Length
5026 nt
GC Content
0.6104
GGAUUCAGCCAGUUGACAGAACUAAGGGAGAUGGGAAAAGCGAAAAUGCCAACAAACGGCCCGCAUGUUCCCCAGCAUCCUCGGCUCCUGCCUCACUAGCUGCGGAGCCUCUCCCGCUCGGUCCACGCUGCCGGGCGGCCACGACCGUGACCCUUCCCCUCGGGCCGCCCAGAUCCAUGCCUCGUCCCACGGGACACCAGUUCCCUGGCGUGUGCAGACCCCCCGGCGCCUACCAUGCUGUACGUCGGUGACCCCGCACGGCACCUCGCCACGGCCCAGUUCAAUCUGCUGAGCAGCACCAUGGACCAGAUGAGCAGCCGCGCGGCCUCGGCCAGCCCCUACACCCCAGAGCACGCCGCCAGCGUGCCCACCCACUCGCCCUACGCACAACCCAGCUCCACCUUCGACACCAUGUCGCCGGCGCCUGUCAUCCCCUCCAACACCGACUACCCCGGACCCCACCACUUUGAGGUCACUUUCCAGCAGUCCAGCACGGCCAAGUCAGCCACCUGGACGUACUCCCCGCUCUUGAAGAAACUCUACUGCCAGAUCGCCAAGACAUGCCCCAUCCAGAUCAAGGUGUCCACCCCGCCACCCCCAGGCACCGCCAUCCGGGCCAUGCCUGUUUACAAGAAAGCGGAGCACGUGACCGACGUCGUGAAACGCUGCCCCAACCACGAGCUCGGGAGGGACUUCAACGAAGGACAGUCUGCUCCAGCCAGCCACCUCAUCCGCGUGGAAGGCAAUAAUCUCUCGCAGUAUGUGGAUGACCCUGUCACCGGCAGGCAGAGCGUCGUGGUGCCCUAUGAGCCACCACAGGUGGGGACGGAAUUCACCACCAUCCUGUACAACUUCAUGUGUAACAGCAGCUGUGUAGGGGGCAUGAACCGGCGGCCCAUCCUCAUCAUCAUCACCCUGGAGAUGCGGGAUGGGCAGGUGCUGGGCCGCCGGUCCUUUGAGGGCCGCAUCUGCGCCUGUCCUGGCCGCGACCGAAAAGCUGAUGAGGACCACUACCGGGAGCAGCAGGCCCUGAACGAGAGCUCCGCCAAGAACGGGGCCGCCAGCAAGCGUGCCUUCAAGCAGAGCCCCCCUGCCGUCCCCGCCCUUGGUGCCGGUGUGAAGAAGCGGCGGCAUGGAGACGAGGACACGUACUACCUUCAGGUGCGAGGCCGGGAGAACUUUGAGAUCCUGAUGAAGCUGAAAGAGAGCCUGGAGCUGAUGGAGUUGGUGCCGCAGCCACUGGUGGACUCCUAUCGGCAGCAGCAGCAGCUCCUACAGAGGCCGAGUCACCUACAGCCCCCGUCCUACGGGCCGGUCCUCUCGCCCAUGAACAAGGUGCACGGGGGCAUGAACAAGCUGCCCUCCGUCAACCAGCUGGUGGGCCAGCCUCCCCCGCACAGUUCGGCAGCUACACCCAACCUGGGGCCCGUGGGCCCCGGGAUGCUCAACAACCAUGGCCACGCAGUGCCAGCCAACGGCGAGAUGAGCAGCAGCCACAGCGCCCAGUCCAUGGUCUCGGGGUCCCACUGCACUCCGCCACCCCCCUACCACGCCGACCCCAGCCUCGUCAGGACCUGGGGGCCCUGAAGAUCCCCGAGCAGUACCGCAUGACCAUCUGGCGGGGCCUGCAGGACCUGAAGCAGGGCCACGACUACAGCACCGCGCAGCAGCUGCUCCGCUCUAGCAACGCGGCCACCAUCUCCAUCGGCGGCUCAGGGGAACUGCAGCGCCAGCGGGUCAUGGAGGCCGUGCACUUCCGCGUGCGCCACACCAUCACCAUCCCCAACCGCGGCGGCCCAGGCGGCGGCCCUGACGAGUGGGCGGACUUCGGCUUCGACCUGCCCGACUGCAAGGCCCGCAAGCAGCCCAUCAAGGAGGAGUUCACGGAGGCCGAGAUCCACUGAGGGCCUCGCCUGGCUGCAGCCUGCGCCACCGCCCAGAGACCCAAGCUGCCUCCCCUCUCCUUCCUGUGUGUCCAAAACUGCCUCAGGAGGCAGGACCUUCGGGCUGUGCCCGGGGAAAGGCAAGGUCCGGCCCAUCCCCAGGCACCUCACAGGCCCCAGGAAAGGCCCAGCCACCGAAGCCGCCUGUGGACAGCCUGAGUCACCUGCAGAACCUUCUGGAGCUGCCCUAGUGCUGGGCUUGUGGGGCGGGGGCUGGCCCACUCUCAGCCCUGCCACUGCCCCGGCGUGCUCCAUGGCAGGCGUGGGUGGGGACCGCAGCGUCGGCUCCGACUUCCAGGCUUCAUCCUAGAGACUGUCAUCUCCCAACCAGGCGAGGUCCUUCCAAAGGAAAGGAUCCUCUUUGCUGAUGGACUGCCAAAAAGUAUUUUGCGACAUCUUUUGGUUCUGGAUAGUAGUGAGCAGCCAAGUGACUGUGUCUGAAACACCAGUGUAUUUUCAGGGAAUGUCCCUAACUGCGUCUUGCCCGCGCCGGGGGCUGGGGACUCUCUCUGCUGGACUUGGGACUGGCCUCUGCCCCCAGCACGCUGUAUUCUGCAGGACCGCCUCCUUCCUGCCCCUAACAACAACCACAGUGUUGCUGAAAUUGGAGAAAACUGGGGAGGGCGCAACCCCCCCCAGGCGCGGGGAAGCAUGUGGUACCGCCUCAGCCAGUGCCCCUCAGCCUGGCCACAGUCGCCUCUCCUCGGGGACCCCUCAGCAGAAAGGGACAGCCUGUCCUUAGAGGACUGGAAAUUGUCAAUAUUUGAUAAAAUGAUACCCUUUUCUACAUGGUGGGUCAGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUAACUUUCUUUCUCAGCAUUCUCUUUGGAGUUCAACCUAGCGCCCAUGAGCCAGGCUGAGGAAGCUGAGUGAGAAGCCAGGUGGGCGGGACUUGUUCCCAGGAAGGCCGGGUGGGGAGGAAGCCUAGAGGGAACCCCAGGAAGGGCAAAUCCAGGCAAAUCUGCAGGAAUGCUCUGCCAUGGGAGCAGCUCCUCCCUUGCCACGGCCACCUUCUCUAGCACUGCAAGGUCCACAGGGCAUUGCUUUCCUUUCUAGGCGGUGGCAGUCAGGGAACAGACUGAGGUAGGUGUAGGGGGGUCUAGGCCUUCGUGGAGCACCCCAGGGAGUUAGUAGGCCCCGGGGAGACAGAGUCUGCACAGGCCCUUUCUGGGGCCACCUCCAUCCACGAGGAGCAGCCUGAGCCUUGGUGGCCGAACCUUGACCGUCCCGGAGCACAGCUUCAGGGCAGGGAACCGGAGCCCCUGGGGGGCCUCACGGGUGUGACGAGGCCCUUCAUUGCAGGCAGGUGGGCCAAUGGGAGCCCUCACCCACGCAAGCCGAGACACCACCCAGAGUGCAGGCUGCCUGGCCCCUUCUGGCACGGCCAGCUCCACACCCCCUGCCUAGGGUAUGUGUGGUCCUAAGGGCUAGGAGCUUCCCCUACUAACAUCUCCCAGAAAAAGCAGUUAAGCCCCUCAGGGCACAGCAAGGUUAGACACAGCCCCCAUCCCCAGAUCAGGACUCCAUCUUGCUAAGUGGCAUCACCGUCACCAGCCUCCCCUUAUUUAAAAGCAGCGACUGGUGUUGCCGCAGGUACCUGGUCUACGAAGACGCAGGCAUCCCUCUCCCACCGUCCACCUCCCCGGGGGCCGCUGACAGCACAGUCGCCUGGGUGCACGCUUGUGGGGGCAGCAGGAACGGGGCUGUCGGCUCUCAGGGGAUCUGGCUGCAGCCAGGGCGAGGGCCUGGCCCUUCCUUCCAGCUCCUUCCGGCUCCUUCCAGCUGAAGGGCAGGAAGCUCUGGCCGCUUAGCUUCUAGGGUUCCAUCUCCCUAGAAAGGUGCCCACGCCCAGGGCAUCAGUCAGUAGCGGCAGCAGCAGCAGACUCGGGGCUUUCCCAGGGUGGCGCAGCCACCCCAGCUGCAUGUCACCUCAGCUCUCCAUCUUAUUGCCAUUUUGUAGAUGAGGAAGCUGAGACCAGAAAGGCUAAGACCCAUGCCCCAGGCACCACACCCAUCUCUUGGGGGCUGGGCACCUGCUACCCGAGGCCACCUCCUGAAGCCCCCACUCUUCCCCCAUGUUCCACUUCAGGAGCCGCGGGGGCCCAUCCUGACACCCGGGGUUCCUCAGCCCAGCGCAGAUGUGCUUCAGUUCCAGAGGGCUUGUUGAUUUGUUUCUUAGGUACGUUACCUGUCCACCCUGAGUCCAGUGAGGCUGUCCCAAGAGCCCCUGUAGUGUGCUCCUGGGAAGGGCUGGGGGGGCUGGGGGGGCUGGGAGAGGCCCAGGGGCAGCUGUCACUGGAACCCCAGCCAGAUGUCCAAGGAAGCCGGCCAGAACACGGAGCAGCCAGAUGGCCCCAGCUGCACCUGUCUAGGGAGCCCAUGCAGCCUCCUUGCACUGGAGAAGCAGCUGUGAAAGUAGACAGAGUUGAGACUUCGCCGUGGUCAGGAGAAAAUGCAAAUUCCCAGGAACAAGAAUCCUUUAAGUGAUAUGUUUUUAUAAAACUAAACAAAUCAACAAAUAAAUCUUGAAGGCGGAUGGUUUUCCCAGCAGUGCAGGGGUUGGAGGGAGGCUGCUGGCACUCCUGGGGCCAAGGGGGACAGGCAGUGGUCCUGAGUCUGCUCAGAGAGGCAAGGCAGAAGGAGCUCGCCAGGCAGGUCAGCUCACAUCUGUCCAAGUCGCUCUGGUCAGAAACAGCGACUCUCCCCCAUUCCCCCAGCGUUCCCACCAGGCCUGGGCUGCUGGGAAGCCCUUGCUGUACCCAGGAGCCCGACCCGCAGUAUCCUGGCACAGAGCCACUUGUCACUCAGAACAGUCAGUGUCUCCAACGCACAAACAUCCACUCCUCUGUUACCAGUUAAAGCACUUUAAUGCUUUAAGGUGAAAACGAAAUCCCAUCCGUGUUUUUCGUGUAAGAUCGUGCUUCUCCGAGCAGUAUUAAUGGACGCCCUCCAAUGACAUAACAACUGUUUUUGGUAAUGUAAUCUUGGGAAAAUGUGUUAUUUUUUUAGCUGUGUUUCAGUGGGGAUUUUUGUUUUUGUAACAUAAUAAAGUGUAUGUUCCAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2089.87 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2172.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 1139.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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