Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001127213.2

Sequence Length

1126 nt

GC Content

0.6314

AGAGCGCGCGAGGUUCGGGGAGCUCGGCCAGGCUGCUGGUACCUGCGUCCGCCCGGCGGACAGGCUGCUUUGGUUUGUGACCUCCAGGCAGGACGGCCAUCCUCUCCAGAAUGAAGAUCUUCUUGCCAGUGCUGCUGGCUGCCCUUCUGGGUGUGGAGCGAGCCAGCUCGCUGAUGUGCUUCUCCUGCUUGAACCAGAAGAGCAAUCUGUACUGCCUGAAGCCGACCAUCUGCUCCGACCAGGACAACUACUGCGUGACUGUGUCUGCUAGUGCCGGCAUUGGGAAUCUCGUGACAUUUGGCCACAGCCUGAGCAAGACCUGUUCCCCGGCCUGCCCCAUCCCAGAAGGCGUCAAUGUUGGUGUGGCUUCCAUGGGCAUCAGCUGCUGCCAGAGCUUUCUGUGCAAUUUCAGUGCGGCCGAUGGCGGGCUGCGGGCAAGCGUCACCCUGCUGGGUGCCGGGCUGCUGCUGAGCCUGCUGCCGGCCCUGCUGCGGUUUGGCCCCUGACCGCCCAGACCCUGUCCCCCGAUCCCCCAGCUCAGGAAGGAAAGCCCAGCCCUUUCUGGAUCCCACAGUGUAUGGGAGCCCCUGACUCCUCACGUGCCUGAUCUGUGCCCUUGGUCCCAGGUCAGGCCCACCCCCUGCACCUCCACCUGCCCCAGCCCCUGCCUCUGCCCCAAGUGGGGCCAGCUGCCCUCACUUCUGGGGUGGAUGAUGUGACCUUCCUUGGGGGACCGCGGAAGGGACGAGGGUUCCCUGGAGUCUUACGGUCCAACAUCAGGACCAAGUCCCAUGGACAUGCUGACAGGGUCCCCAGGGAGACCGUGUCAGUAGGGAUGUGUGCCUGGCUGUGUACGUGGGUGUGCAGUGCACGUGAGAGCACGUGGCGGCUUCUGGGGGCCAUGUUUGGGGAGGGAGGUGUGCCAGCAGCCUGGAGAGCCUCAGUCCCUGUAGCCCCCUGCCCUGGCACAGCUGCAUGCACUUCAAGGGCAGCCUUUGGGGGUUGGGGUUUCUGCCACUUCCGGGUCUAGGCCCUGCCCCAAAUCCAGCCAGUCCUGCCCCAGCCCACCCCCACAUUGGAGCCCUCCUGCUGCUUUGGUGCCUCAAAUAAAUACAGAUGUCCCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-495.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -512.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 376.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.((((..((((((((((((((..(((((((((((((((...((((((((.((.(((((((((.....)))))))..)).)).))).)))))(((.((((((((((((((((((...))))((((((...))))))(((.(((((((..((((((.((((((.(.....).)).)))))))).)).....))))))).))).......((.((.(((((((.((((.(((((..((.((.....))((((((.(((...)))))).)))((((((((.....((((((((((.((((.((.((((((((((.(.(((.........((((.............)))).........))).).))).((((.(((....((((.(((((((....)))).)))....))))...))).))))))))))).)).)))).)))))......(((.((((((((((.((.(.(((.......))).).)).))))))))))))).(((...(((((((((((((((((.(((((((....(((((((.....((((......))))........(((...(((((.......))))))))(.((((((((((.(((...)))..)))))))))).)........(((.((..((.(((((((.....((..(((((((....)))).)))..))........)))))))))..)).))).))))))))))))))...)))..))))).)))))...)))).)))....(((((.......)))))..((((...)))).((((((((.((((((...)).)))).)))))))))))))..))))).))).((((((.((......))))))))))..))))).))))))))))).)).)).))).))))))))))).)))))))))))))))))).)))).....)))))).))))..(((((((......((.....))......))))))).....((((((((((((..(((...((...((((...(((...)))....)))))).)))....)))))))))).))....((..(.(((......))).)..)))))))))......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((.(((({.((((((((((((((..(((((((((((((((...({((((((.((.((((((((({,,,.|||||||,.||.}|,|||,|||}|(((,(({{({(((({{,{(({{...}))}((((((...)))))){(({({{{{||}}{,{{((((((....}}}}}}}}}).))),|)))})),,,..,|||}}},}}}.,}},..||,(({(({((((.,(((.{(({{,{{((((,,{,,{.,,,{,|,{,|,}.))),)).}))|{}|||.}}|||,,{,,,.,|......||{,,}}))).}}))}.),}}}))))}),})}|,||{{({{((({{(((,({{({..{{{((,({{{{{{{{{,{{{{,|||({{({(((((((....)))).)))....,((({.(((((.{(((((((({{{(((,,((,,(((((....)))))..}.))))))})..))))))))}.))))).}))))||||{,{||,,..}}}}))|}}|(((((((((((((.(((((((,...(((((((.....{{{{......))))....,,..{{{,,,|||||,,..,|,}},|||||(,((((((((((.(((...))}..))))))))))........,{(({.,,,{,,{((,,(((,....|{.{((((((({{{{||||{.,,..))}}.}}}}.,))))))))}.},,}}}.))))))))))))))...)))..))))),}))))}||}|||.|.|||..(((((.......))))),,|{||},.))}}.((((((((.((((((...)).)))).))))))))})}}},,|||)}|)||||{|{{{,||,,.,,,))))))))))}})}))),})))))})))),))})}.}},.,}))))))))),}))))))))))))))))).)))).....)))))).)))).,{((((({{{,,..{{.,...}}......|)))))}....{((((((((((((..(((,.......(((,,..{{{...)}),...,,,,.),)))....))))))}},,,))}}}}{{..|.{{{......))),)..)})))))))......................