Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001129727.3
Sequence Length
4582 nt
GC Content
0.6076
GCUUCCUGAAGCCAGGAGGGUGGGAAGAGAGGUCUGGCUGGGAGUUAGGGAUGGAGCAGGACAACUCCAAGGCUCCCCUCUGGCAGCCAGACCUGCUCAUGAAGAAGGCUCCUCGGUGAGGAGGGUGAGGCUCAAAGAGCAGAGUUCCUGGAGCGCCCCCAGCAGGCCUGAAUUGCAGUUCCUGUGCCCUGGCACUAAGACUGGCACCUCCUGCGGCCCAUGCCCUUCGCCUGCAUUGCCCACUGAGUCCCACUCGACUGUCUUCAGCGCGGUUCACACUGAGACCCAGCCCUCUCCCGCUGGCCCCGAGCAGGCCCACCUUUAGGAGGGCGUGAUGGAAAGGCCCCUGGAGAAUGGGGAUGAGUCCCCAGACUCUCAGGGCCAUGCCACCGACUGGAGAUUUGCUGUGUGCAGUUUCAGGGAUGCCUGGGAAGAGGAGGAACCUGCUUCCCAGAUGCACGUUAAGGACCCAGGUCCUCCAAGACCACCAGCCGGGGCCACCCAGGAUGAGGAGCUACAGGGCAGCCCCUUGUCCAGGAAAUUCCAGUUACCCCCAGCUGCAGAUGAGUCGGGGGAUGCCCAGAGGGGCACAGUAGAAAGCUCCUCAGUCCUGUCAGAAGGGCCAGGCCCCUCUGGAGUGGAGAGUCUCCUAUGCCCCAUGUCCUCCCACCUCAGCUUGGCACAGGGUGAGAGUGACACCCCAGGGGUAGGGUUGGUAGGGGACCCAGGUCCAAGCAGGGCGAUGCCAUCUGGCUUGAGCCCUGGGGCAUUGGACAGCGACCCUGUGGGCCUUGGAGACCCUUUAUCAGAAAUAUCAAAGCUGCUGGAGGCAGCCCCCAGUGGAUCCGGCCUCCCUAAGCCUGCUGACUGCCUCCUGGCCCAAGACCUCUGUUGGGAGCUGCUGGCCAGUGGUAUGGCCACCUUGCCAGGGACUCGGGAUGUCCAAGGCCGGGCAGUGCUGCUUCUGUGUGCCCACAGCCCAGCCUGGCUUCAGUCUGAGUGCAGCAGCCAGGAACUCAUCCGCCUCCUGCUGUACCUGCGAAGCAUCCCCAGGCCCGAAGUACAGGCACUGGGACUGACAGUGCUAGUUGAUGCCCGAAUUUGUGCUCCAAGUUCUUCCCUCUUCUCUGGGCUCAGCCAACUACAAGAAGCAGCCCCAGGGGCCGUGUACCAGGUGCUGCUAGUGGGAAGCACGCUGCUGAAGGAAGUGCCUUCCGGGCUGCAGCUGGAGCAGUUGCCUUCUCAGAGCCUGCUGACCCACAUCCCAACGGCGGGGCUGCCCACUUCGCUAGGAGGAGGCCUGCCUUACUGCCACCAGGCCUGGCUGGAUUUCCGAAGGCGGCUGGAAGCUCUACUACAGAACUGCCAGGCAGCUUGUGCCCUGCUCCAGGGGGCCAUCGAAAGUGUGAAGGCUGUGCCCCAGCCCAUGGAGCCUGGGGAGGUCGGUCAGCUGCUACAGCAGACAGAGGUCCUGAUGCAGCAGGUGCUAGACUCGCCAUGGCUGGCAUGGCUACAAUGCCAGGGGGGCCGGGAGCUGACAUGGCUGAAGCAAGAGGUCCCAGAGGUGACCCUGAGCCCAGACUACAGGACGGCAAUGGACAAGGCUGACGAGCUAUAUGACCGGGUGGAUGGAUUGCUGCACCAACUGACCCUGCAGAGCAACCAGCGAAUACAGGCCCUAGAGUUGGUCCAAACACUGGAGGCCCGGGAAAGCGGACUGCACCAGAUUGAAGUGUGGCUGCAGCAGGUGGGCUGGCCAGCACUGGAGGAGGCUGGGGAGCCCUCGCUGGACAUGCUGCUCCAGGCCCAAGGCUCUUUUCAGGAGCUGUACCAGGUUGCCCAGGAGCAGGUCAGGCAAGGGGAGAAGUUUCUGCAGCCGCUGACUGGCUGGGAGGCGGCUGAACUGGACCCCCCUGGGGCACGCUUUCUGGCCCUGCGAGCCCAGCUGACUGAAUUCUCUAGGGCUUUGGCCCAGCGGUGCCAGCGGCUGGCGGAUGCUGAGAGGCUGUUUCAGCUCUUCAGGGAGGCCUUGACGUGGGCUGAGGAGGGGCAGCGAGUGUUGGCAGAGCUGGAGCAGGAACGCCCGGGGGUUGUGUUGCAGCAGCUGCAGCUGCACUGGACCAGGCACCCUGACUUGCCUCCUGCCCACUUCCGAAAGAUGUGGGCUCUGGCCACGGGGCUGGGCUCAGAGGCCAUCCGCCAGGAGUGCCGCUGGGCCUGGGCGCGGUGCCAGGACACCUGGCUGGCCCUGGACCAAAAGCUUGAGGCUUCACUGAAGCUACCACCGGUGGGCAGCACAGCUAGCCUGUGUGUCAGCCAGGUCCCCGCUGCACCUGCCCACCCUCCCCUGAGGAAGGCCUACAGCUUCGAUCGGAAUCUGGGGCAGAGUCUCAGUGAACCUGCCUGCCACUGCCACCAUGCGGCCACUAUUGCUGCCUGCCGCAGACCAGAGGCUGGAGGAGGUGCCCUGCCCCAGGCAUCCCCUACUGUGCCUCCACCAGGCAGCUCUGACCCCAGGAGCCUCAACAGGCUACAGCUGGUGCUGGCAGAGAUGGUGGCCACGGAGCGGGAGUAUGUCCGGGCUCUAGAGUACACUAUGGAGAACUAUUUCCCCGAGCUGGAUCGCCCCGAUGUGCCCCAGGGCCUCCGCGGUCAGCGUGCCCACCUCUUUGGCAACCUGGAGAAGCUGCGGGACUUCCACUGCCACUUCUUCCUGCGUGAGCUGGAGGCUUGCACCCGGCACCCACCACGAGUGGCCUAUGCCUUCCUGCGCCAUAGGGUGCAGUUUGGGAUGUACGCGCUCUACAGCAAGAAUAAGCCUCGCUCCGAUGCCCUGAUGUCAAGCUAUGGGCACACCUUCUUCAAGGACAAGCAGCAAGCACUGGGGGACCACCUGGACCUGGCCUCCUACCUGCUAAAGCCCAUCCAGCGCAUGGGCAAGUACGCACUGCUGCUGCAGGAGCUGGCACGGGCCUGCGGGGGCCCCACGCAGGAGCUCAGUGCGCUGCGGGAGGCCCAGAGCCUUGUGCACUUCCAGCUGCGGCACGGAAACGACCUGCUGGCCAUGGACGCCAUCCAGGGCUGUGAUGUUAACCUCAAGGAACAGGGGCAGCUGGUGCGACAGGAUGAGUUUGUGGUGCGCACUGGGCGCCACAAGUCCGUGCGCCGCAUCUUCCUUUUUGAGGAGCUGCUGCUCUUCAGCAAGCCUCGCCAUGGGCCCACAGGGGUUGACACAUUUGCCUACAAGCGCUCCUUCAAGAUGGCAGACCUUGGUCUCACUGAGUGCUGUGGGAACAGCAACCUGCGCUUCGAGAUCUGGUUCCGCCGCCGCAAGGCCAGGGACACCUUUGUGCUGCAGGCCUCCAGCCUGGCUAUCAAGCAGGCCUGGACAGCUGACAUCUCCCACCUGCUUUGGAGGCAGGCCGUCCACAACAAGGAGGUGCGCAUGGCUGAGAUGGUGUCCAUGGGUGUGGGGAACAAGGCCUUCCGAGACAUUGCUCCCAGCGAGGAAGCCAUCAACGACCGCACCGUCAACUAUGUCCUGAAGUGCCGAGAAGUUCGCUCUCGGGCGUCCAUUGCCGUAGCCCCGUUUGACCAUGACAGCCUCUACCUGGGGGCCUCGAACUCCCUUCCUGGAGACCCUGCCUCUUGCUCUGUUCUGGGGUCCCUCAACCUGCACCUGUACAGAGACCCAGCUCUUCUGGGUCUCCGCUGUCCCCUGUAUCCCAGCUUCCCAGAGGAAGCAGCACUGGAGGCUGAGGCAGAGCUGGGCGGCCAGCCCUCUUUGACUGCUGAGGACUCAGAGAUCUCGUCCCAAUGCCCAUCAGCCAGUGGCUCCAGUGGCUCUGACAGCAGCUGUGUGUCAGGGCAGGCCCUGGGUAGGGGCCUGGAGGACUUACCCUGUGUCUGAGCCCGGGACUGGACGAGCAGUAGAUCCAGCAGCCUGCAGCUCCAAGGAACAUUGCCUCUCUGGAUCUGCUGUGACCAGGGUGUGGCUGACACCUGGGCUACCUCCAACCUACAUGUGCAACGCUGUUGACUACCCUUUCUGAUGUGUGUGGCCAUUGGACUAACUGGCACGGGGCCUCUCUAGGGAAGUCUGGUUGUAGAGCCUGAAUAGGCUCCUGGCCCCAUGACCCCUUCUCCUGUCCCCAGCUCCCAUCCCAGUUGUGGGUUAAGAAUAGGCUAGAGCAGACAUUGGGUGUUUCCAUGCUGUAGGCUGGUGGGGGACCAUGUGCCUCUAGGCAGUGACUAGGGUGCCCCCACCCCUCAGGAAGAACACAGGUGGGCUCCUAGCAGCUGAUCCCCAAUGCCUGGCCUUAAAGCCGAGCUCAGUUACCAUAGGGACAGGUCCACCUCUACUGGGCCCUCAUGCUUGCCUUUCCUGGCCCCCAGGCCCAGCCCCUUUUUACUGGGGCAGUUUCGUUAUUUUGACUUGAUGCCUUUUGAAUAACUUUCAAUAGAAUUGUCUAAAAUUAUCUUACUGGUUGUUAGGCCUUUGGUGUCUCAGAGAAGGAGUCUAGGUCUUUGAUGUGUGAUUUAAUCUUUUAUUUGUUUAUAAUAAAAAAUAGACUGAUAUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2041.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2109.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 965.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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