Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001129731.3
Sequence Length
4518 nt
GC Content
0.6164
GUGACGCCGCGCGGCCGCGCUGUAGUGGCCGUCGAGGCCGCCGUCUGUUCGAAGGCUGUCCGACUUCACGGUUCCCCGCGGCUCGGCCCGGGGGCGUGAGUGUCGCCAGCGGGCGACGGGGGGGCGCGCGGUAGGCCCUGCAACAAGGCCAGGGCCUGGGGGGGCCGGCAGGAGAGCGAACCCGAGGCAUCGUGGUGCCAUGGCGGGGCCGCCCCCACGGGCAUGGGCCUGCAGAGCGUGGCCGUGAGGACGCUGAGGGUGGGCGCGCACGGAGCAGAGGCCCACGGGCGUCCGACGGGGGACCUGGACAGAGGGACACCCUUAACGUUAUUCCCUCUUCCCAGGCCUGAAUUGCAGUUCCUGUGCCCUGGCACUAAGACUGGCACCUCCUGCGGCCCAUGCCCUUCGCCUGCAUUGCCCACUGAGUCCCACUCGACUGUCUUCAGCGCGGUUCACACUGAGACCCAGCCCUCUCCCGCUGGCCCCGAGCAGGCCCACCUUUAGGAGGGCGUGAUGGAAAGGCCCCUGGAGAAUGGGGAUGAGUCCCCAGACUCUCAGGGCCAUGCCACCGACUGGAGAUUUGCUGUGUGCAGUUUCAGGGAUGCCUGGGAAGAGGAGGAACCUGCUUCCCAGAUGCACGUUAAGGACCCAGGUCCUCCAAGACCACCAGCCGGGGCCACCCAGGAUGAGGAGCUACAGGGCAGCCCCUUGUCCAGGAAAUUCCAGUUACCCCCAGCUGCAGAUGAGUCGGGGGAUGCCCAGAGGGGCACAGUAGAAAGCUCCUCAGUCCUGUCAGAAGGGCCAGGCCCCUCUGGAGUGGAGAGUCUCCUAUGCCCCAUGUCCUCCCACCUCAGCUUGGCACAGGGGACUCGGGAUGUCCAAGGCCGGGCAGUGCUGCUUCUGUGUGCCCACAGCCCAGCCUGGCUUCAGUCUGAGUGCAGCAGCCAGGAACUCAUCCGCCUCCUGCUGUACCUGCGAAGCAUCCCCAGGCCCGAAGUACAGGCACUGGGACUGACAGUGCUAGUUGAUGCCCGAAUUUGUGCUCCAAGUUCUUCCCUCUUCUCUGGGCUCAGCCAACUACAAGAAGCAGCCCCAGGGGCCGUGUACCAGGUGCUGCUAGUGGGAAGCACGCUGCUGAAGGAAGUGCCUUCCGGGCUGCAGCUGGAGCAGUUGCCUUCUCAGAGCCUGCUGACCCACAUCCCAACGGCGGGGCUGCCCACUUCGCUAGGAGGAGGCCUGCCUUACUGCCACCAGGCCUGGCUGGAUUUCCGAAGGCGGCUGGAAGCUCUACUACAGAACUGCCAGGCAGCUUGUGCCCUGCUCCAGGGGGCCAUCGAAAGUGUGAAGGCUGUGCCCCAGCCCAUGGAGCCUGGGGAGGUCGGUCAGCUGCUACAGCAGACAGAGGUCCUGAUGCAGCAGGUGCUAGACUCGCCAUGGCUGGCAUGGCUACAAUGCCAGGGGGGCCGGGAGCUGACAUGGCUGAAGCAAGAGGUCCCAGAGGUGACCCUGAGCCCAGACUACAGGACGGCAAUGGACAAGGCUGACGAGCUAUAUGACCGGGUGGAUGGAUUGCUGCACCAACUGACCCUGCAGAGCAACCAGCGAAUACAGGCCCUAGAGUUGGUCCAAACACUGGAGGCCCGGGAAAGCGGACUGCACCAGAUUGAAGUGUGGCUGCAGCAGGUGGGCUGGCCAGCACUGGAGGAGGCUGGGGAGCCCUCGCUGGACAUGCUGCUCCAGGCCCAAGGCUCUUUUCAGGAGCUGUACCAGGUUGCCCAGGAGCAGGUCAGGCAAGGGGAGAAGUUUCUGCAGCCGCUGACUGGCUGGGAGGCGGCUGAACUGGACCCCCCUGGGGCACGCUUUCUGGCCCUGCGAGCCCAGCUGACUGAAUUCUCUAGGGCUUUGGCCCAGCGGUGCCAGCGGCUGGCGGAUGCUGAGAGGCUGUUUCAGCUCUUCAGGGAGGCCUUGACGUGGGCUGAGGAGGGGCAGCGAGUGUUGGCAGAGCUGGAGCAGGAACGCCCGGGGGUUGUGUUGCAGCAGCUGCAGCUGCACUGGACCAGGCACCCUGACUUGCCUCCUGCCCACUUCCGAAAGAUGUGGGCUCUGGCCACGGGGCUGGGCUCAGAGGCCAUCCGCCAGGAGUGCCGCUGGGCCUGGGCGCGGUGCCAGGACACCUGGCUGGCCCUGGACCAAAAGCUUGAGGCUUCACUGAAGCUACCACCGGUGGGCAGCACAGCUAGCCUGUGUGUCAGCCAGGUCCCCGCUGCACCUGCCCACCCUCCCCUGAGGAAGGCCUACAGCUUCGAUCGGAAUCUGGGGCAGAGUCUCAGUGAACCUGCCUGCCACUGCCACCAUGCGGCCACUAUUGCUGCCUGCCGCAGACCAGAGGCUGGAGGAGGUGCCCUGCCCCAGGCAUCCCCUACUGUGCCUCCACCAGGCAGCUCUGACCCCAGGAGCCUCAACAGGCUACAGCUGGUGCUGGCAGAGAUGGUGGCCACGGAGCGGGAGUAUGUCCGGGCUCUAGAGUACACUAUGGAGAACUAUUUCCCCGAGCUGGAUCGCCCCGAUGUGCCCCAGGGCCUCCGCGGUCAGCGUGCCCACCUCUUUGGCAACCUGGAGAAGCUGCGGGACUUCCACUGCCACUUCUUCCUGCGUGAGCUGGAGGCUUGCACCCGGCACCCACCACGAGUGGCCUAUGCCUUCCUGCGCCAUAGGGUGCAGUUUGGGAUGUACGCGCUCUACAGCAAGAAUAAGCCUCGCUCCGAUGCCCUGAUGUCAAGCUAUGGGCACACCUUCUUCAAGGACAAGCAGCAAGCACUGGGGGACCACCUGGACCUGGCCUCCUACCUGCUAAAGCCCAUCCAGCGCAUGGGCAAGUACGCACUGCUGCUGCAGGAGCUGGCACGGGCCUGCGGGGGCCCCACGCAGGAGCUCAGUGCGCUGCGGGAGGCCCAGAGCCUUGUGCACUUCCAGCUGCGGCACGGAAACGACCUGCUGGCCAUGGACGCCAUCCAGGGCUGUGAUGUUAACCUCAAGGAACAGGGGCAGCUGGUGCGACAGGAUGAGUUUGUGGUGCGCACUGGGCGCCACAAGUCCGUGCGCCGCAUCUUCCUUUUUGAGGAGCUGCUGCUCUUCAGCAAGCCUCGCCAUGGGCCCACAGGGGUUGACACAUUUGCCUACAAGCGCUCCUUCAAGAUGGCAGACCUUGGUCUCACUGAGUGCUGUGGGAACAGCAACCUGCGCUUCGAGAUCUGGUUCCGCCGCCGCAAGGCCAGGGACACCUUUGUGCUGCAGGCCUCCAGCCUGGCUAUCAAGCAGGCCUGGACAGCUGACAUCUCCCACCUGCUUUGGAGGCAGGCCGUCCACAACAAGGAGGUGCGCAUGGCUGAGAUGGUGUCCAUGGGUGUGGGGAACAAGGCCUUCCGAGACAUUGCUCCCAGCGAGGAAGCCAUCAACGACCGCACCGUCAACUAUGUCCUGAAGUGCCGAGAAGUUCGCUCUCGGGCGUCCAUUGCCGUAGCCCCGUUUGACCAUGACAGCCUCUACCUGGGGGCCUCGAACUCCCUUCCUGGAGACCCUGCCUCUUGCUCUGUUCUGGGGUCCCUCAACCUGCACCUGUACAGAGACCCAGCUCUUCUGGGUCUCCGCUGUCCCCUGUAUCCCAGCUUCCCAGAGGAAGCAGCACUGGAGGCUGAGGCAGAGCUGGGCGGCCAGCCCUCUUUGACUGCUGAGGACUCAGAGAUCUCGUCCCAAUGCCCAUCAGCCAGUGGCUCCAGUGGCUCUGACAGCAGCUGUGUGUCAGGGCAGGCCCUGGGUAGGGGCCUGGAGGACUUACCCUGUGUCUGAGCCCGGGACUGGACGAGCAGUAGAUCCAGCAGCCUGCAGCUCCAAGGAACAUUGCCUCUCUGGAUCUGCUGUGACCAGGGUGUGGCUGACACCUGGGCUACCUCCAACCUACAUGUGCAACGCUGUUGACUACCCUUUCUGAUGUGUGUGGCCAUUGGACUAACUGGCACGGGGCCUCUCUAGGGAAGUCUGGUUGUAGAGCCUGAAUAGGCUCCUGGCCCCAUGACCCCUUCUCCUGUCCCCAGCUCCCAUCCCAGUUGUGGGUUAAGAAUAGGCUAGAGCAGACAUUGGGUGUUUCCAUGCUGUAGGCUGGUGGGGGACCAUGUGCCUCUAGGCAGUGACUAGGGUGCCCCCACCCCUCAGGAAGAACACAGGUGGGCUCCUAGCAGCUGAUCCCCAAUGCCUGGCCUUAAAGCCGAGCUCAGUUACCAUAGGGACAGGUCCACCUCUACUGGGCCCUCAUGCUUGCCUUUCCUGGCCCCCAGGCCCAGCCCCUUUUUACUGGGGCAGUUUCGUUAUUUUGACUUGAUGCCUUUUGAAUAACUUUCAAUAGAAUUGUCUAAAAUUAUCUUACUGGUUGUUAGGCCUUUGGUGUCUCAGAGAAGGAGUCUAGGUCUUUGAUGUGUGAUUUAAUCUUUUAUUUGUUUAUAAUAAAAAAUAGACUGAUAUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2047.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2116.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 960.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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