Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001130055.4

Sequence Length

1161 nt

GC Content

0.5978

CUCCCUUUCAUCAGUCUUCCCGCGUCCGCCGAUUCCUCCUCCUUGGUCGCCGCGUCCUUGGCUGGCGUAAAGCUCCUCCUGAGCUUGGAUAAACUGCAGGAGCGAAGGGGCUGACCGUUUGUCGGGACGCAGUUGAAAGAGUCGCUGUGUCCUGCUCCGGGCUCUCCUGCUGGAGAGGAGAGGCUUGCACGUGCCUGUCGUCUGCGCAAGCUUUGAAGCUCAGACUUGGUCUCUGUUAGGAGAGAUGAAAAAUGGCUACAAACUUCCUAGCACAUGAGAAGAUCUGGUUCGACAAGUUCAAAUAUGACGACGCAGAAAGGAGAUUCUACGAGCAGAUGAACGGGCCUGUGGCAGGUGCCUCCCGCCAGGAGAACGGCGCCAGCGUGAUCCUCCGUGACAUUGCGAGAGCCAGAGAGAACAUCCAGAAAUCCCUGGCUGGAAGCUCAGGCCCCGGGGCCUCCAGCGGCACCAGCGGAGACCACGGUGAGCUCGUCGUCCGGAUUGCCAGUCUGGAAGUGGAGAACCAGAGUCUGCGUGGCGUGGUACAGGAGCUGCAGCAGGCCAUCUCCAAGCUGGAGGCCCGGCUGAACGUGCUGGAGAAGAGCUCGCCUGGCCACCGGGCCACGGCCCCACAGACCCAGCACGUAUCUCCCAUGCGCCAAGUGGAGCCCCCAGCCAAGAAGCCAGCCACACCAGCAGAGGAUGACGAGGAUGAUGACAUUGACCUGUUUGGCAGUGACAAUGAGGAGGAGGACAAGGAGGCGGCACAGCUGCGGGAGGAGCGGCUACGGCAGUACGCGGAGAAGAAGGCCAAGAAGCCUGCACUGGUGGCCAAGUCCUCCAUCCUGCUGGAUGUCAAGCCUUGGGAUGAUGAGACGGACAUGGCCCAGCUGGAGGCCUGUGUGCGCUCUAUCCAGCUGGACGGGCUGGUCUGGGGGGCUUCCAAGCUGGUGCCCGUGGGCUACGGUAUCCGGAAGCUACAGAUUCAGUGUGUGGUGGAGGACGACAAGGUGGGGACAGACUUGCUGGAGGAGGAGAUCACCAAGUUUGAGGAGCACGUGCAGAGUGUCGAUAUCGCAGCUUUCAACAAGAUCUGAAGCCUGAGUGUGUGUACGUGCGCGCGUGCGUGAGGCCCUGCCACGAUUAAAGACUGAGACCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-486.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -508.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((..((.((((((((.(((((((.(((((.((((((((((((((.(((((.((((((((((((((....(((((((.......)))......(((((((.(..(((((.(((.....)))((((((((((.((.....)))))))))))))))))...).)))))))(((.(.((((..(((((((((.(((((((((((((.(....((((.(((.((...((.((((((......)))))).))...))))).))))(((((........).)))).((((..(((.((.((....)).)).)))..)))).............).))))))).)))))).))).))))))..))))).)))))))....))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..(((((((.((((..(((..(((....(((((((((((..((((.(.((...)).))))).........((((((((...))))))))..((((((....(.(((((((((((...........))))).))))))).)))))).)))))))))))(((((.(((((((((.(........((((((((....))))).)))........))))))))))..((((...((.....))))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))).)))))))).)).).)))).).)))))).......((((.....(((......)))))))..(((((((((((((((((((.(..(((.((.(((((.((((.....((((((((((((((((((((.......(((...((((((.....))))))...))))))))))).)))))).).)))))..)).)).))))).)).)))..).)))))))).).)))))))))).....(((((((.((((((((...((........))..))))))))....((((((((.(..(((..(((((.(((.(((((........))))).))).).))))..)))..)))))))))......))))))).......))))))))))..)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((..((.((((((((((((((((.((((,.(((((((((({(((.(((((.((((((((((((((..{((((((,{{(,|{{{,.,..,.,,.)))),,||.|}||}}}..||,|},},|((((((((({,((.....)))))))))))))((((.((((((((....))))}(({(..(((((((((.(((((((((((((.{,,{.((((.(((.((...{(.((((((......)))))).)}...})))).)))}|||{{,,,,....},|||}.((((..(((.{{.{{.....,.)),)))..))))..||,..,}))..,.))))))),,))))).))),}))))).,)))),))).))))....))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..((((((,{((((..(((..(((....(((((((((((,((,,{.{{({,,,|,.}|||}..||,....((((((({...})))))))..{{{{{{.,,.{.(((((((((((.{.......,.))))).))))))}.)))))}.)))))))))))(((((.(((((((((.{........((((((((....))))).)))........})))))))))..{{{(,.{{,..,..}}))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))}.)))))))).)).,.)))).).)))))).)},...((((,....(((......)))))))..((((((((((({(((((((.(..(((.((.(((((.{{{(.....((((((((((((((((((({.......((({,.((((((.....))))))..,))))))))))),,))))).)))})))..)).)}.))))).)).)))..).)))))))}.).)))))))))).....(((((((.((((((((.{{(,........))}.))))))))....((((((((.{.,(((..((({(.(((,(((((........))))).))).).))))..))},.,))))))))......))))))).......,}))))))))..)).