Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130057.4
Sequence Length
1454 nt
GC Content
0.6314
CUCCCUUUCAUCAGUCUUCCCGCGUCCGCCGAUUCCUCCUCCUUGGUCGCCGCGUCCUUGGCUGGCGUGUGAGUACCGCGGCCCCCGCCGGAAGGAGUCGGGCGCGACAGAGACGCCCGAGGGGCCGGGAGGGCGGGCGGCCCGGGCUGCGCCAGAAGCUCGCGCCGUUAGGGACUGAGGCACAAGUGCGCCAGCGCGGGCUUAGGGGCCGUGGGCCAAGUGCGGCACUUGGGGCGAGCGCAGAGAGGCGGGGCGACGGAGGCCACGUGGCCGGCUUGGAGGGCGUCCGCGGGACGGGGGCGCCGGGAGCACUGUCUCACGGCGCAUCCCGGUCGUGGAAGCCCCUCGGCCAGGCUGCUGGGGCCUAAGGCCUGUGUUUGCUGCCGUCUCCGUGGGAGACCAGACAUCUGCCCCAGCUGUUUCUCUGGCCUGCAGACCUUCGUACACCACGUCUUUGUCAAGCACCAGUUACUGCACGCAUCAGCUGAGCACGGAGGGGAUAGGCACGGACGCAACACUUUUGGAACUUAGACGCUACAGAAAAAUGGCUACAAACUUCCUAGCACAUGAGAAGAUCUGGUUCGACAAGUUCAAAUAUGACGACGCAGAAAGGAGAUUCUACGAGCAGAUGAACGGGCCUGUGGCAGGUGCCUCCCGCCAGGAGAACGGCGCCAGCGUGAUCCUCCGUGACAUUGCGAGAGCCAGAGAGAACAUCCAGAAAUCCCUGGCUGGAAGCUCAGGCCCCGGGGCCUCCAGCGGCACCAGCGGAGACCACGGUGAGCUCGUCGUCCGGAUUGCCAGUCUGGAAGUGGAGAACCAGAGUCUGCGUGGCGUGGUACAGGAGCUGCAGCAGGCCAUCUCCAAGCUGGAGGCCCGGCUGAACGUGCUGGAGAAGAGCUCGCCUGGCCACCGGGCCACGGCCCCACAGACCCAGCACGUAUCUCCCAUGCGCCAAGUGGAGCCCCCAGCCAAGAAGCCAGCCACACCAGCAGAGGAUGACGAGGAUGAUGACAUUGACCUGUUUGGCAGUGACAAUGAGGAGGAGGACAAGGAGGCGGCACAGCUGCGGGAGGAGCGGCUACGGCAGUACGCGGAGAAGAAGGCCAAGAAGCCUGCACUGGUGGCCAAGUCCUCCAUCCUGCUGGAUGUCAAGCCUUGGGAUGAUGAGACGGACAUGGCCCAGCUGGAGGCCUGUGUGCGCUCUAUCCAGCUGGACGGGCUGGUCUGGGGGGCUUCCAAGCUGGUGCCCGUGGGCUACGGUAUCCGGAAGCUACAGAUUCAGUGUGUGGUGGAGGACGACAAGGUGGGGACAGACUUGCUGGAGGAGGAGAUCACCAAGUUUGAGGAGCACGUGCAGAGUGUCGAUAUCGCAGCUUUCAACAAGAUCUGAAGCCUGAGUGUGUGUACGUGCGCGCGUGCGUGAGGCCCUGCCACGAUUAAAGACUGAGACCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-636.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -660.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 243.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((..((.((((((((.(((((((.(((((.((((((((((((((.(((((.((((((((((((.........((((((((((((((....((..((((((((......).)))))))....)).....))))...((((((.(((((((.....(((.(.(((.((((...))))))).).)))))).)))).))))))..)))))))))).(((((((...)))))))((((((((((....(((.((((..(((.((((...((((((....((.((((.(((((((..(((((((((((.(((......))).)))))).))))).))))))).)))))))))))))))).)))..))))...)))))))))))))((((((((((((((((....(.((((((((.(((((((((.(((((((((....(((((((....((.((...(((...(((........)))..)))...))))...)))))))...)))))............(((.((((((((....((((........))))......(((((........).)))).((((..(((.((.((....)).)).)))..))))...))).))))).))))))).))))))..))).))))))))))))))))..)))).)))))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..(((((((.((((..(((..(((....(((((((((((..((((.(.((...)).))))).........((((((((...))))))))..((((((....(.(((((((((((...........))))).))))))).)))))).)))))))))))(((((.(((((((((.(........((((((((....))))).)))........))))))))))..((((...((.....))))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))).)))))))).)).).)))).).)))))).......((((.....(((......)))))))..(((((((((((((((((((.(..(((.((.(((((.((((.....((((((((((((((((((((.......(((...((((((.....))))))...))))))))))).)))))).).)))))..)).)).))))).)).)))..).)))))))).).)))))))))).....(((((((.((((((((...((........))..))))))))....((((((((.(..(((..(((((.(((.(((((........))))).))).).))))..)))..)))))))))......))))))).......))))))))))..)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((..((.((((((((((((((((.((((,.(((((((((({(((.(((((.((((((((((((.........((((((((((((((....{{..((((((((......).)))))))....)).....))))}..((((((.(((((((.....(((,(.(((.{{{{...})))))).}.})))))}}))).))))))..}))))))))).(((((((...)))))))((((((((((,...{{(.((((..(((.((((...((((((,...((.((((.(((((((..(((((((((((.(((......))).)))))).))))).))))))).)))))))))))))))).)))..))))...}))))))))))))((((((((((((((((....(.((((((((.(((((((((.(((((((((....(((((((....,{.({...{{{...(({.,.,,...||}..}))..,)))).).)))))))...)))))..,,.,,...,{,,({({((((((.{.{(,,,{{{{...{{(||{{.....,,,.}})}.}}),.,,,,.})))..,}}.}}))}}}},}..)).}}.{{.{{{{......}))).}).,)))).)))))),.))).))))))))))))))))..))))},))))))))))....((((((.(..(((((..(..((((((.((..(((((.(..((((((,{((((..(((..(((....(((((((((((,((,,{.{{({,,,|,.}|||}..||,....((((((({...})))))))..{{{{{{.,,.{.(((((((((((.{.......,.))))).))))))}.)))))}.)))))))))))(((((.(((((((((.{........((((((((....))))).)))........})))))))))..{{{(,.{{,..,..}}))))....))))).....))))))....))))))).))))..)..)))))...........)).))))))..)..)))))..).)))))))))))).)))))...)))}.)))))))).)).,.)))).).)))))).)},...((((,....{((......)))))))..((((((((((({(((((((.(..(((.((.(((((.{{{(.....((((((((((((((((((({.......((({{.((((((.....))))))..,))))))))))),,))))).)))})))..)).)}.))))).)).)))..).)))))))}.).)))))))))).....(((((((.((((((((.{{(,........))}.))))))))....((((((((.{.,(((..((({(.(((,(((((........))))).))).).))))..))},.,))))))))......))))))).......,}))))))))..)).
Back