Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130517.4
Sequence Length
1428 nt
GC Content
0.6401
GUGCCGGAGUCUCCUCCCUUUGGUCCGCUGCAGGUCGCCAAUAUAAAUGCUUGAUGAGUGAAUGAAUGACUUCCGUCUGGGACUUGGUUGCAAAUAAAGCCGAGCUGCAUCUUAGGGAGGGGUGGAGACUUUGCCCCUGUUUGUGCCUUGAAGCCAGCAGGGCCUUGCCCUAGGAUACCUCCACCCACCCUCCUGCCCAGCAAGUGGAGGCCCGCAGCCCGAGUGUCGCCGCCAUGGCUUCGCCGCAGCUCUGCCGCGCGCUGGUGUCGGCGCAAUGGGUGGCGGAGGCGCUGCGGGCCCCGCGCGCUGGGCAGCCUCUGCAGCUGCUGGACGCCUCCUGGUACCUGCCGAAGCUGGGGCGCGACGCGCGACGCGAGUUCGAGGAGCGCCACAUCCCGGGCGCCGCUUUCUUCGACAUCGACCAGUGCAGCGACCGCACCUCGCCCUACGACCACAUGCUGCCCGGGGCCGAGCAUUUCGCGGAGUACGCAGGCCGCCUGGGCGUGGGCGCGGCCACCCACGUCGUGAUCUACGACGCCAGCGACCAGGGCCUCUACUCCGCCCCGCGCGUCUGGUGGAUGUUCCGCGCCUUCGGCCACCACGCCGUGUCACUGCUUGAUGGCGGCCUCCGCCACUGGCUGCGCCAGAACCUCCCGCUCAGCUCCGGCAAGAGCCAACCUGCUCCCGCCGAGUUCCGCGCUCAGCUCGACCCCGCCUUCAUCAAGACCUACGAGGACAUCAAGGAGAACCUGGAAUCCCGGCGCUUCCAGGUGGUGGACUCCCGAGCCACUGGCAGGUUCCGCGGCACCGAGCCCGAGCCCCGAGACGGCAUUGAACCUGGCCACAUCCCAGGUACCGUGAACAUCCCCUUCACAGACUUCCUGAGCCAGGAGGGGCUGGAGAAGAGCCCUGAGGAGAUCCGCCAUCUGUUCCAGGAGAAGAAAGUGGACCUGUCUAAGCCACUGGUGGCCACGUGUGGCUCUGGCGUCACAGCCUGCCACGUGGCACUAGGGGCCUACCUCUGCGGCAAGCCAGACGUGCCCAUCUACGAUGGCUCCUGGGUGGAGUGGUACAUGCGCGCCCGGCCCGAGGAUGUCAUCUCAGAGGGCCGGGGGAAGACCCACUGAAGCUGGGCAGGACACAGGCGAGCUCAGGUGAUGCCGGCCACCAGCAAUGCCUGGCCUGGUAGCUCCGCUUCUGCUUUCACCAAGAGAGUGUUUCUUCACUCAACUCAGGUGGCAUUUGGGGUGACAUCUCAAAGGCCAGGAAUUCCGUUGACUUGUUGGCUGCCAGUAGGGGCGGGAGGAAAGGCGGAGGCGAGCCCUGGAGGAGGGAGGCCACAACUCCGAGCUGCCCACCUGGUGCUGAGCUGGGGCCCCGCCUCCUUUCUGUUUUAUUUUUGAGGAAAUAAAAUAACCAAGUGCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-641.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -664.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...((((((((((....((((.((((.(((.(((((((.....((((((((((((((.(((..((((((.....)).((((((.(((....((((.(((((((......(((..((((((((.......(((((((.(.((......))))))))))(((......)))....)))))))).)))(((((((((((.(((((.((((((((((.((.(((..(((.....)))..)))))...(((((((((((((((....)))))).....)))))))))..))))))))))))((((((.(((((((.((.((((.(((((((....))).)))).)))).)).)))((((.(((.((((((...(((..((((((((((((........))))).....)))))))..))).....))).)))..))).))))))))....(((((...((((((((((((.........((((((((.(.((((((((((((((((((((((((.......)))))).)))))).).)))).).)...))))))))))))))...(((((((((((((((((((((.(((...)))......(((((.((...(((((.((((((...))))))(((((...))))).......(((..(((((.(((..((((......))))..))))))))..)))....(((((...((((................(((..(((((.((((...((((....))))...))))...)))))..)))..(((((.......))))).))))...))))).)))))...)).))))).....((((((.......))))))..)).)))))))).((((.(((.(((((((...)))))))..)))..)))).((((.((((((.(((((..(((.(((...))).)))..))))).))......(((.((((((.((((..(((((...(((......))).))))))))))))))).)))...)))).).)))..)))))))))))...........))).))))))))).)))))....))))))((((((((((........)))...)))))))(((....))))))...)))))))))))..(((((.....((((((.(((.((...)).))).)))))))))))))))))).)))).)))....)))))).))))..)))))))))))..))))))(((.((((((((...)))))))).))).((....)).......))))))).))).)))))))))))))))..)))...))))((((.((((((((((((((.....((((.((((((((....)).))..))))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))..))).).)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((...((((((((((....((((.((((.(((.(((((((.....((((((((((((((.(((..((((((.....)),((((((.(,{....((((.(((((((.....,(((..((((((((.......(((((((,(.((......))))))))))(((......)))....)))))))).)))|((((((((((.{((((.((((((((((,({.(((..((({...,)))..))))|..,(((((((((((((((....)))))).....)))))))))},))))))))))))((((((.(((((((.((.((((.(((((({....})).)))).)))).)).)))((((.(((.((((({...(((..((((((((((((........))))).....)))))))..)))....,))).)))..))).))))))))....(((((...(((((((((((({,,....,,((((((((.(.(((({.{((((.(((,(((({({....,}.,||{|||...}))),)))).))).)))))))))}))))))))...(((((((((((((((((((((.(((...)))......(((((.((...(((((.((((((...)))))}(((((.,,|||}|....,..(((..(((({{(((..((((......))))..))))))))..)))....(((((...(((({,{......}......{||}.,,{{..{{,,..|{|(({,.,,,}}.},}})))}})))))}.,,},,,,|||,,.}),}))}}},)))),..}}})),)))))...)).)))))...,.((((((.......))))))..}).)))))))).((((.(((.(((((((...)))))))..)))..)))).((((.((((((.(((((..(((.{((...))}.)))..))))).}}......(((.(((((,{((((({{,(((...(((......))).))))))))))))))).))).,.)))).).)))..)))))))))))...,,...,,}))).))))))))).)))))....))))))((((((({{({,.....})))...))))))){({....)))}}}...)))))))))),..(((((.....((((((.(((.((...)).))).)))))))))))))))))).)))).}},....)))))).})))..)))))))))))..))))))(((.((((((((...)))))))).))).((....)).......))))))).))).))))))))))))))}.,)))...)))}((({,((((((((((((((.....((((.((((((((....)).))..))))})))....)))))))))))((((((((((....))))))))))..))).).)))...
Back