Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001130689.1

Sequence Length

1454 nt

GC Content

0.4058

GGAUUUGGGCGGGAAGCGGAGCCCCGCCAGCGCCCGCCCUGGCAGCUGCGGGCUCCGCGCCGACCCUCCGGCUUCCCCUCUCCCCCCUCGGCCCCGUCAGGUGGACGCGGAUCUGUCAACAUGGGUAAAGGAGACCCCAACAAGCCGCGGGGCAAAAUGUCCUCGUACGCCUUCUUCGUGCAGACCUGCCGGGAAGAGCACAAGAAGAAACACCCGGACUCUUCCGUCAAUUUCGCGGAAUUCUCCAAGAAGUGUUCGGAGAGAUGGAAGACCAUGUCUGCAAAGGAGAAGUCGAAGUUUGAAGAUAUGGCAAAAAGUGACAAAGCUCGCUAUGACAGGGAGAUGAAAAAUUACGUUCCUCCCAAAGGUGAUAAGAAGGGGAAGAAAAAGGACCCCAAUGCUCCUAAAAGGCCACCAUCUGCCUUCUUCCUGUUUUGCUCUGAACAUCGCCCAAAGAUCAAAAGUGAACACCCUGGCCUAUCCAUUGGGGAUACUGCAAAGAAAUUGGGUGAAAUGUGGUCUGAGCAGUCAGCCAAAGAUAAACAACCAUAUGAACAGAAAGCAGCUAAGCUAAAGGAGAAAUAUGAAAAGGAUAUUGCUGCAUAUCGUGCCAAGGGCAAAAGUGAAGCAGGAAAGAAGGGCCCUGGCAGGCCAACAGGCUCAAAGAAGAAGAACGAACCAGAAGAUGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAUGAAGAUGAGGAGGAAGAGGAUGAAGAUGAAGAAUAAAUGGCUAUCCUUUAAUGAUGCGUGUGGAAUGUGUGUGUGUGCUCAGGCAAUUAUUUUGCUAAGAAUGUGAAUUCAAGUGCAGCUCAAUACUAGCUUCAGUAUAAAAACUGUACAGAUUUUUGUAUAGCUGAUAAGAUUCUCUGUAGAGAAAAUACUUUUAAAAAAUGCAGGUUGUAGCUUUUUGAUGGGCUACUCAUACAGUUAGAUUUUACAGCUUCUGAUGUUGAAUGUUCCUAAAUAUUUAAUGGUUUUUUUAAUUUCUUGUGUAUGGUAGCACAGCAAACUUGUAGGAAUUAGUAUCAAUAGUAAAUUUUGGGUUUUUUAGGAUGUUGCAUUUCGUUUUUUUAAAAAAAAUUUUGUAAUAAAAUUAUGUAUAUUAUUUCUAUUGUCUUUGUCUUAAUAUGCUAAGUUAAUUUUCACUUUAAAAAAGCCAUUUGAAGACCAGAGCUAUGUUGAUUUUUUUCGGUAUUUCUGCCUAGUAGUUCUUAGACACAGUUGACCUAGUAAAAUGUUUGAGAAUUAAAACCAAACAUGCUCAUAUUUGCAAAAUGUUCUUUAAAAGUUACAUGUUGAACUCAGUGAACUUUAUAAGAAUUUAUGCAGUUUUACAGAACGUUAAGUUUUGUACUUGACGUUUCUGUUUAUUAGCUAAAUUGUUCCUCAGGUGUGUGUAUAUAUAUAUACAUAUAUAUAUAUAUAUAUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-409.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -438.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 382.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((...(((((((((.((.((((((......))).)))))))))))))).))).)))(((..((((((((((((((((((..((.((((...(((.(((((.(.(((.....((((..........))))))).))))))(((((...)))))((((....(((((((.((.((.(((((((((...................)))))..(((((((((..((((.((((.((((...))))...)))))))))))))))))((((((((.((((...(....)....)))).)))))))).....(((((......)))))......(((((..(((........))))))))..(((.(.......((((...........))))....).)))....((((.(((....((((((((((((((((((.......((((((((........((((....((((((.....)))..)))..)))).........))))))))....(((.((((....)))))))............(((((........(((......))).........))))).....(((((......))))).((((...))))..))))))))))).)))))))....)))..))))..))))))))..))))))).)))).)))...)))).))..)))).)).)))................)))).))))).)))......(((.((((((.((((((..((((((.((.((.((((((((.((..((((((....(((((.....)))))..((((....))))..((((((....(((((......))))).....))))))...(((((.(((((..((......)).))))).)))))......................(((((((......))))))).))))))..)).)))))))))).))....((((((((((....))))))))))(((((((((((......(((.....((((..((((......(((((...((...((((((.((((..((.((..(((....(((((((....(((((((...)))))))..))))))))))..)).))....)))))))))).))...)))))...))))..)))).....))).)))))))))))..))))))....((((.(((((((......))((((....))))...(((((((((((((.................)))))))))))))......)))))))))....(((((....((((((..((((((.(((..........)))))))))..))))))...)))))....((((((((((((((.....)))))))).))))))....))))))..)))))).))).((((((((((((((((((....))))))))))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((...((((((...(((((((((((,{((((((......))).)))))))))))))).))).))))))..((((((((((,((,((((,,(((({{,.||,||,{({((.,.({{.....,((({.......}}))},}},.})))))||||,...,}}}}({((.,,.(((((((.((.((.(((((((((.....,.......,.....)))))..(((((((((..((((.{(((.({((...}))),..)))))))))))))))))((((((((.((((...,....}....)))).)))))))).....(((((......)))))......(((((,,(,,......,,)},)))))..(((.{.......((((...........))))....}.)))....((((.(((....((((((((((((((((((.,...,.((((((((...,....((((....((((((.....)))..))),.)))).........)))))))).,||(((,((((....)))))},...........,|||||...,.,..,(({{{...,}|.........||||......,||||.}))}).,.,,.((((...))))..)))))))))))}}})))))....)))..))))..)))))))}..))))))).,)),.}.,...,,})))).)).))))).))))).............{((((((.{((((((((...,(.........,}...}))))))}.{{((.(({(((((,{({(((({(((,({{{|(((((.....)))))..((((....))))..{{{{((,{..{(({{,,,,,,}||||.....||||||{|..,,||}|}|||||{,,,,,.,||{{|||||}}}},...,,.{{{((({.{{({,..,|||{{||}}}},,))))}}).)})))},.,|{|}}}}}}}}}.}},,..{(((((((((....))))))))}|(((((({{(({..,,{{({({,,..,,})}}|{{{,,...{{{((({,,{{{{{,,((({{..,{,,{({,{,,{|||||,{((((((....{(((((,...)))))}}..))))))}..}}}}},,|||||}}}}))}}.,..,,,}}||}},,}}}}},,}|,,.........)))))))))))},..,}}},,},||||,|||||||......,,((({....))))...(((((((((((((...{{.......,,,..)))))))))))))...,}..))))))))}}..,((((....((((((..((((((.({(,.......)})))))))))..)))))).,.))))|.,..((((((((((((((.....))))))))}}))))).....}}},...,).))))))).((((((((((((((((({....)))))))))))))))))}