Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001130992.3
Sequence Length
1792 nt
GC Content
0.5095
AAGCGGGGAGGAGCGACCGCUACAAUGGAUCCUCCCGCAGGCUUUGUGCGCGCUGGGAAUCCAGCUGUCGCCGCCCCGCAGAGCCCCCUGUCCCCGGAGGGCGCUCAUUUCCGGGCCGCCCACCACCCGCGUAGCACCGGCAGCCGCUGUCCCGGCAGUCUCCAGCCGUCCCGCCCGCUUGUGGCCAACUGGCUCCAGUCACUCCCCGAAAUGCCAGUCGACUUCACUGGGUACUGGAAGAUGUUGGUCAACGAGAAUUUCGAGGAGUACCUGCGCGCCCUCGACGUCAAUGUGGCCUUGCGCAAAAUCGCCAACUUGCUGAAGCCAGACAAAGAGAUCGUGCAGGACGGUGACCAUAUGAUCAUCCGCACGCUGAGCACUUUUAGGAACUACAUCAUGGACUUCCAGGUUGGGAAGGAGUUUGAGGAGGAUCUGACAGGCAUAGAUGACCGCAAGUGCAUGGCUGGAGUGCAAUCGCGUGAUCUCAGCUCACUGUAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGUCACACGCCACCACACCUGGAUAAUUUUGUAUUUUUGGUAGAGACAGGGUUUCACUAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGAGCUCAGGUGAUCCAUCUGCCUCAGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAAGUGUGAGCCACUACACCUGGUUCUUCUUUCCACUGUUUGCUAACUCCCAUGGUGUUUUCUGGCAUCACUUCCAGCAUUAUUUCUAGCCUUACCUCUUCCAGGAAGCCUUCCCUGAUGGGCCUCUGUCUCUACCUUAAAGGCUGUCGAGGUGCCUUCUGACUUCCAUAACCUCCAGCAUUUGUCUACCAGUACUUACCAUUCUGCUGGAAUUCUCUGUCUUCUUACCUUCUUCUCAGAUAAUCUGUGAGCCCUCAAGAGCAGGCCACUGACCUUACUUCCCUCUCUCCAGCACCUACAGCUGGUGCAUAGGAGGUGUGAAACCCAUGAUUGCUGAAUGCCGUUCCCUUGCACAGAACCACGUGGUGAAUUCCUAUUGCUCAGUCAAGGGUCAGUUUAAAGCAGGGAACUGCAGAGCACAGUCAUCAAGAGCAUGAGCUCUAGAGCCAAAUCUCAUCUCCCCACUUCACGGCUGGGUGAACUUCAGGCCUCAGUCUCCACAUUUGUAAAAUGAUGAGAAGCAUACCUGCUCUAGGAGGUUGUCAGGAGUCAACUGGUAUGACAUAUACUUUGCCUAGUACCCUGCCCAGCACAUAAUGUUGGGCAUUAUCAUUAUCAUAACAACACAUGUUGUUAUGAUAUUGAUUAUGGUGACUGAUAAUGACAGCAAUGCUAUCACUCCCACCAGGGAGCCUUCCCUGACCCCCCAGGCUGGGUUGCGGGCCGUCAUCCCUCCCAGCAUAUAGCACAGAGGUGUCAUUGCCUUCUCUCCAGGCUGAGCUACCCCAUGACAGAGCUUCUGUGCAGCCCAGCCUUAGGGCCACCCUAAGUGCUAGGUCCCUGGGAUGAAUGAGUGCAGUUCCACAGGGCCCUGUGACCUUCUCCAGUCCUGUUCCCACCUCCUUAUCCAGAACCUUGGCCUUGAGCACUCCAAUGGUUUAAACUGACUCUAGGAACUUUCUGAAUUGUUUAAGGAAAAAUAACUAUAACAUGUCAAGUUUAUUAGUCUUAACAUUUUCUCAUUUUGUCUUAAUAAUUGUGUUAUCAUUUGCUGUUAGCUUUUUCAUGGUAUUAGAAUUGCAUUCUUUCAUGCUCACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-592.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -624.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 353.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.((((((.(((((.(((.....((((..((((((..((.....))..)).))))))))))).)))))((.((((((((((((((((....))).))).))))....(((((((((.........)))..)).)))).(((.((((((.((((........))))(((((....((((((((((((....((((((.((((...(((.(........).)))...))))))))))....))))))).))))).....)).)))((.((((((((..(((...(((....((((.((..((((..........))))..)))))))))...)))..))))))))))(((((.(....).))))).((.......)).......((((...((...))...))))((((((((.(((((.(((....(((((((..(((((.((...((....((((...(((((((..((......))..)).)))))))))))...)).)))))..)))))))...)))..)))))..))))))))((((......))))(((((((((((.........(((((.((((.....((.(((..(((((((((((((((((........(((.(((((((..........(((((..((((((...)))))).)))))........((((((((((........((((((((..((((((((..........................))).)))))....)))).))))))))))))))....))))))).)))........))))))..(((....)))...)))))))))))..))).)))))).))))).....(((((((.(((((((((............((((((..........))))))......................(((.((((...)))).)))......((((((((..........................(((((.......)))))....(((((.(((((((((((((((.((..(((.(((((((.((.....(((....)))........(((((((......))).)))).....))))))))).)))...)))))))))..(((((....)))))..((((......................))))))))....)))).)))))..((((..(((((...)))))..))))......)))))))).)))))))))..)))))))(((((((............)))).)))....(((((((((.....)))))))))..((((.((((((((((((....)))))))))))).))))....))))))).))))))))))...)))....(((((....)))))(((..((((......))))..))).)))))).)).....)))))).)).....(((((((((((((((......(((........))).......)))))...)))))))))).(((.((((((((((...))))))).))).)))...(((((((((.(((((((((((.(((((((..((.((.....)))))))))))..............((((....))))(((((((((.((....(((((...(((....))))))))....))..)))))))))..............((((..(((((...((((..((((((.......................))))))......))))..)))))...))))......))))))))))).))))).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((..(.(((((.((,....,((((..((((((..((.....))..)).))))))))))).)))))).)))))).((((.{{{,,.....||.|||{||||......|||,,}))).,,..,.(({(.((..{(((,{..|||||,.{(((.,......))))(((((....((((((((((((....((((((.((,{...{,,...{{{{{.,..,,},}}))))))))))....))))))),,)))).....)).)))((.((((((((..(((...(((....((({,((..((((..........))))..)))))))))...)))..))))))))))(((((.{....}.)))}),)}}}))||{||.......((({...,....}}|..}})),((((((({(((((.(((,{{,(((((((..(((((.(({.,...((.{(((...((((((({,{(,...,,}},.}),)))))))))))...}),)))))..)))))}}...},,..})))).)))))))))||{,{{{,{{||,,(((((((((((.,.......(((((.((((.....((.(((..(((((((((((((((((.,,.....(((.(((((((..........(((((..((((((...)))))).)))))........((((((((((........((((((((..((((((((..........................))).)))))....)))).))))))))))))))....))))))).)))......||))))))..(((....)))...)))))))))))..))).)))))).))))).....(((((((.(((((((((.{{,...,....((((((..........)))))).......,|.............{((.((((...}))).))}......((((((((...,,,....,{{{{{{....{.(({((,,,....}}})),),...)))))}},|,.....{((((((.({..(((.(((((({,((...,,(((....|||,,....,.,{{{{{{......))),}})).....))))))))).)))...)}))))))),.(((((....))))).{{(({.....{(((({..({.......)).,)))))}..,,..}))})),,{(((..(((({...}))))..)))).,....)))))))).)))))))))..))))))){{{((((............))}).)))....(((((((((.....)))))))))..((((.((((((((((((....)))))))))))).))))..,}))))))).)))),,)))}..,)))....{{{{{..,,|||}},,})))),)}}}.(((((((((((..{.(({......,))).)))))).....(((((((((((((((.(....{{(........))).......))))),..}))))))))).(((.((((((((((...))))))).))).)))..)))))(((((.(((((((((((.(((((((..((.((.....}))))))))))..............{(({....}})}(((((((((.{{{,,.(((({...,,|,,,.,})))}}}...,},..)))))))))..........,,,.((((..{(({{,{.{(((..((((((.................,.....))))))......)))).,))))}...)))).,,...))))))))))).))))))))),.....
Back