Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001134759.2
Sequence Length
1620 nt
GC Content
0.3648
GUGGAGCCUGCAAAAGUUGGAGAAGGUGUGGCAGUCCUCAUUUCUGUGGAAUCUGAAGAAGCCCACGCAGAUUUUAAUUCCCACUCUAGAUUCUGGUUCUAAUCAAGGUCCAUGCAUGUGGUGUCAACCCCGUGGAGACAUACAUUCGCUCUGGUACUUAUAGUAGAAAACCACUCUUACCCUAUACUCCUGGCUCAGAUGUGGCUGGGGUGAUAGAAGCUGUUGGAGAUAAUGCAUCUGCUUUCAAGUGCCUGUGUGAAAGCUGGAGAGAGUGUUCUGGUUCAUGGGGCAAGUGGAGGAGUUGGAUUAGCAGCAUGCCAAAUUGCUAGAGCUUAUGGCUUAAAGAUUUUGGGCACUGCUGGUACUGAGGAAGGACAAAAGAUUGUUUUGCAAAAUGGAGCCCAUGAAGUGUUCAAUCACAGAGAAGUGAAUUACAUUGAUAAAAUUAAGAAGUAUGUUGGUGAGAAAGGAAUUGAUAUAAUUAUUGAAAUGUUAGCUAAUGUAAAUCUUAGUAAAGACUUGAGUCUUCUGUCACAUGGAGGACGAGUGAUAGUUGUUGGCAGCAGAGGUACUAUUGAAAUAAACCCACGAGACACCAUGGCAAAGGAGUCGAGUAUAAUUGGAGUUACUCUCUUUUCCUCAACCAAGGAGGAAUUUCAGCAAUAUGCAGCAGCCCUUCAAGCUGGAAUGGAAAUUGGCUGGUUGAAACCUGUGAUAGGUUCUCAAUAUCCAUUGGAGAAGGUGGCCGAGGCUCAUGAAAAUAUCAUUCAUGGUAGUGGGGCUACUGGAAAAAUGAUUCUUCUCUUAUGAUGAUUAAUUCUUUCAUGGAUUUCCUAUGUAAUUAGAGGUACUGUCUUUCCCCCAGUUGUACUUACCCUAUCUUUUCUUUAAUUAACAUUCGAUUCCAUGAGCUUCUUAUGUGAAAAAAUAAGAUUUUUCUUUAGAGAGCAGAAGCAGAAGAGUAAAAUUUAUUGUAUAGCUAGCAAUAUUUUUUUAUGCCAUCUGUCUCAAAUCAAAGAGUCAUCAUAGUAGGAAAUAACAUGUUAGUUGUCAUUUGGCAUGAGUGUGCAUUCCAGUAAUUCUUAAUUGAUAUUUGAUUAAUUCCAUACCUUUGAUUAAAACAUGCUAGUUCAAAAUAAGACUGCUCAGUUUCCAAGGGUUUUCAAGCCUACUUACCUUUAUAAAGGUUCUCUAGUCUCUGAUUAGCCAUGACUGUAUUGGACUUUGAACAUUUUCUGAACUAAAAACCUCUAUUCUAAACUAAUCUCAUUUGGAUGUGUAAGUCUUUUGUAAAGGCAAGAAUAAAUAAUAUCCAGGACAAUUUAUUAGUUUUCUCAGUAUUUUCCCAAAUAUUAGAAUAUUUACUUCAUUAUUGGUUGGCUGCCAAUGACCCCAUAUGUUCUGUGAGAAUAGUAGCUUUAUCUUUGAUAUAAUACAUAGUCUCCAAAUAGGUAAUACUUCGCAAUUGAUUAGAUUUUCAGAGUAGAUUUAGAGUUAUCUGUUUUUCUGGUGAGGGUCAAAUAUUUUUGUUAAUUAAGCUCACAAAUUUGAUAAAUUAAGAAUUAUCUGCAUUUGUCUCGUAACAUAAUAAUGUGUAAUAAAGUCUAUAGAAAAUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-395.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -430.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..((((...(.((.....)).)...))))))).).((((((((((..........((((.((((((...........((((((((((((((.(((((((((......(((....(((((..(((...(((((((.....(((((.(.(((((((..((((((......((((.((.((((((.((((((.((....)))))))))).)))).....)).))))........))))))...))))))).).)))))...(((((.((((((((((((...((((((((.(.....).)))......((((((((((((((....(((((...)))))...)))))..)))).)))))((((((((((((......((((((((......(((((((..((.(((((((((((((((......))))..............(((((((..(((((((((..........((((((....)))))).......)))))))))..)))))))....((((..(((((((((...))))))))))))).((((((((.(((((((((((((...((((((...((((..(((((.......(((((((((((((((((((((((((((((.....((((((.......))))))...(((((((.(.((.((((.......))))...)).).))).))))(((((((((((...)))))).))))).......(((((((((((((...((.((((((.......)))))))).....)))))).............)))))))((((((((((.......(((((((..((..((((((((((((((((................))))..............)))))))).))))..)).)))))))(((.(((....((((((......))))))....)))))).((.(((((.(.((((((..((((((.......))))))...))))))..).))))).)).........))))))))))...((((...((((......((((....))))...))))...)))))))))))).))))).)))))))))).........))))))..........((.((((........))))))...)))))...))))))))))...)))..(((((....)))))........))))).)).)))))))))))........))))))))))).))..........)))))))...............((((((((.......((((((....)))))).......)))))))))))))))).....))))))))))))..)))))...)))))))))))).)))))((((((((.....)))))))).......((((((...))))))(((....((((...))))...)))...)))))))....))).)))))..))).)))))))))...)))))....)))))))))..........))).))).))))((((....))))....................(((((((..(((....)))..))))))).....(((((....))))).......)))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.(((,.((((...{.((.....)}.)...))))))).).((((((((((.......,..{(((,({((((....,,,....((((((((((((((.(((((((((......{{{..{.(((((..(((...(((((((.....{((((.{.(((((((..((((((......((((.((.(((((({(({(((.({....)))))))))),}))).....}}.))))........))))))...))))))).}.))))|,|.(((((.,({(((((({,{,{{(((((((,{({{.{{.,|||{..,{{((({{(((({(({{..,.(((((...)))))...)},)),.)))),)))))((((((((((((,{{,,.{((((((({,....{((((((..((.(((((((((((((((......)))).......,......(((((((..(((((((((..........{(((((....))))}}....},.)))))))))..)))))))....(({{..{((((((({...})))))))))})).(((((((,{(((,{((((({.{,,,{((({..,{((((..(((((....,{,(((((((((((((((((((((((((((((.....((((((.......)))))}...(((({,,.||{,.((((.......)))),,,}|,|.|||||}}}(((((((((((...)))))).)))))..,|,..|{{{{{(((((((...(({((((((.......))))))},.,}..))))))}.,,.......,,}}}}|}|(((((((((,...,,,{(((((((..((..((((((((((((({((,,..........}},.}}}}..............)))))))),,)))..)).))))))){{,((((,,..{{{{{,,,,,,,}}}}}}....|||}}|,((.(((((.{.((((((..((((((.......))))))..})))},)}},.))))),))......}}}))))))))))}..{({{...((((.,,,,.{{{{...,))))}}.})))...))))))))))))},)))),}))))))))).........))))))..........((.((((........))))))...)))))...)))))))))}...|,,..(((((....)))))....}}}}))))).},.)))))))))))........))))))))))).))..........))))))}....,,.,,,.....{(((((((.......((((((....)))))).......)))))))))}}}}}}}.}}.}))))))))))))...,|||,,,||,,||}}}}}}.})}},,{{{|||{.....))))))},},}}}}.}||}}|}}}))}}))||,.}}}||||},,,}}}....,,...)))))))....))).))))).}))}.)))))))))...))))),...})))))))).....,,,..))))})).))}}|,,{....||||{...........}},,|,..(((((((..(((....)))..)))))))..,,.(((({....))))).......)))))))))).......
Back