Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001134945.2
Sequence Length
558 nt
GC Content
0.4910
AGUUCCCCAAAGAUAACACAGCUUUGCACAGUGGAUGUUUACUUGCUGGUGGUCUUAUCUAAGAUCAACAUUGGCAGCUGUGCCCGGAGAGGCCUCCAGGGUCCAGAGAAAGGAGUCGAAGAAGCCACCAGCCAAGCUGCAGCCCCGAGCUCUAGCAGGCUGGCUCCGCCCGGAAGAUGGAGGUCAAGCAGAAGGGGCAGAGGAUGAACUGGAAGUCCGGUUCAACGCCCCCUUUGAUGUUGGAAUCAAGCUGUCAGGGGUUCAGUACCAGCAGCACAGCCAGGCCCUGGGGAAGUUUCUUCAGGACAUCCUCUGGGAAGAGGCCAAAGAGGCCCCAGCCGACAAGUGAUCGCCCACAAGCCUUACUCACCUCUCUCUAAGUUUAGAAGCGCUCAUCUGGCUUUUCGCUUGCUUCUGCAGCAACUCCCACGACUGUUGUACAAGCUCAGGAGGCGAAUAAAUGUUCAAACUGUAUGCUGAUGUUCCAAAUGGGAAUUUAUUUCAAAGAGGAAAAGUUAAUAUUUUACUUUAAAAAAAUCAAAAUAAUACAAAUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -184.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 172.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.......((((((((..((((..((((.((.((((((((((((((((((....))))))).....((((....))))(((((.(((.((..((.(((.......))).))...)).))).((((((..((((.(((.....))).)))).)))))))))))((((((.((((((..((((.((((.(((((....(.((((((((....)))))))).)))))).))))...))))..))..(((((...((........)).)))))..........((((((((....)))))))).)))).))))))....((((.....)))))))))....)))))).)).))))(((((........(.((.((((....)))))).).......)))))(((((((((((.(((((((..((....)).))))))).)))).....))))))).............)))).)))).))))......))))))..........((((.(((((....))))).))))............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((.......((((((((..((((..{((({(({((({((((((((((((((....,}))}},.,.,{(((,.{{,,|{|(((((.{{{||||,||,|{|,|.....|||,}}...}}.}}}.((((((..((((.(((.....))).)))).))))))}}|}.{{{|||.{{||||,|||.,.({((,(((((...,,.((((((((....)))))))).)))))),)))}.|,||||..}}..(((({...{{,,......)).)))))...|}...,,((((((((....)))))))).)})),))))))..|,{({{.....))))})}))},.,}}||||.}|.}}}}.{{{{{{..,..,{{{{.,,,{,|,..|||||,,,......))))}|||||||((((.(((((((..{{....}}.))))))).))))...}})))))),}}}}})))},...)))).)))).))))......))))))}...,,....({({.((({{....,)))}.))))............................
Back