Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001135154.3

Sequence Length

1717 nt

GC Content

0.5510

GCCCGGACGCAGUGAGGGGGGUCGGCGCGCGUGUCUACGCGGACGCACCGGCUAAGCUGCUUCUGCCGCCGCCGGCCGCCUGGGACCUUGCGGUGAGGCUGCGCGGGGCCGAGGCCGCCUCCGAGCGCCAGGUUUAUUCAGUCACCAUGAAGCUGCUGCUGCUGCACCCGGCCUUCCAGAGCUGCCUCCUGCUGACCCUGCUUGGCUUAUGGAGAACCACCCCUGAGGCUCACGCUUCAUCCCUGGGUGCACCAGCUAUCAGCGCUGCCUCCUUCCUGCAGGAUCUAAUACAUCGGUAUGGCGAGGGUGACAGCCUCACUCUGCAGCAGCUGAAGGCCCUACUCAACCACCUGGAUGUGGGAGUGGGCCGGGGUAAUGUCACCCAGCACGUGCAAGGACACAGGAACCUCUCCACGUGCUUUAGUUCUGGAGACCUCUUCACUGCCCACAAUUUCAGCGAGCAGUCGCGGAUUGGGAGCAGCGAGCUCCAGGAGUUCUGCCCCACCAUCCUCCAGCAGCUGGAUUCCCGGGCCUGCACCUCGGAGAACCAGGAAAACGAGGAGAAUGAGCAGACGGAGGAGGGGCGGCCAAGCGCUGUUGAAGUGUGGGGAUACGGUCUCCUCUGUGUGACCGUCAUCUCCCUCUGCUCCCUCCUGGGGGCCAGCGUGGUGCCCUUCAUGAAGAAGACCUUUUACAAGAGGCUGCUGCUCUACUUCAUAGCUCUGGCGAUUGGAACCCUCUACUCCAACGCCCUCUUCCAGCUCAUCCCGGAGGCAUUUGGUUUCAACCCUCUGGAAGAUUAUUAUGUCUCCAAGUCUGCAGUGGUGUUUGGGGGCUUUUAUCUUUUCUUUUUCACAGAGAAGAUCUUGAAGAUUCUUCUUAAGCAGAAAAAUGAGCAUCAUCAUGGACACAGCCAUUAUGCCUCUGAGUCGCUUCCCUCCAAGAAGGACCAGGAGGAGGGGGUGAUGGAGAAGCUGCAGAACGGGGACCUGGACCACAUGAUUCCUCAGCACUGCAGCAGUGAGCUGGACGGCAAGGCGCCCAUGGUGGACGAGAAGGUCAUUGUGGGCUCGCUCUCUGUGCAGGACCUGCAGGCUUCCCAGAGUGCUUGCUACUGGCUGAAAGGUGUCCGCUACUCUGAUAUCGGCACUCUGGCCUGGAUGAUCACUCUGAGCGACGGCCUCCAUAAUUUCAUCGAUGGCCUGGCCAUCGGUGCUUCCUUCACUGUGUCAGUUUUCCAAGGCAUCAGCACCUCGGUGGCCAUCCUCUGUGAGGAGUUCCCACAUGAGCUAGGAGACUUUGUCAUCCUGCUCAACGCUGGGAUGAGCAUCCAACAAGCUCUCUUCUUCAACUUCCUUUCUGCCUGCUGCUGCUACCUGGGUCUGGCCUUUGGCAUCCUGGCCGGCAGCCACUUCUCUGCCAACUGGAUUUUUGCGCUAGCUGGAGGAAUGUUCUUGUAUAUUUCUCUGGCUGAUAUGAUGGAGUUUUGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGCCAUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCGCUUGGGUUGAAGCGAUUAUCCUGUCUAAGCCUCCCGAGUAACUGAGCCAGCCAUGUUUGUUAAUAAAAAUGGGGACAAUACUGUAUAUAUAUGGUUAUAUUUUAGCUUUUUCACUUUUCAGUAUCUCCUGAGGCUUUUCUCAUGUCAUUAAAUAUUUUUCUAAUUUAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-662.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -691.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 532.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((.((((((((.((((((((((....))))((.(((..(((....((.(((((.(((.(((((((((.((((........))).).))))).))))))).))))).))..))).))))).(((...((((.......))))...)))((((.(((((((((..(((((.....(((....((.......))..)))...))))).........((((((....))))))...))))))))).)))).....))))))))))))))))))........((((....))))(((.((((((.(((((..((((.((((((((....(((((.((((..((((......)))))))))))))((((((.........((((((((..(((.........)))...))))))))..(.((((((((.....(((.((((((.((((((..((((....)))))))))))).)))).))))))))))).)..))))))....(((((......((((.((((((((......)).))).)))))))......)))))......(((((.((((((((((((.((..((((((....((.(.((((((((((((..........)))))).))))))).))((((((....)))))))))))))))))))))).(((((((((..........(((((..((((....((((((((....((((((((((.........))))).(((.((.((((((((((..(((((((((.(((((....((...((((.(((......)))))))(((((.(((......))).)))))...(((((((((.......)))))))))(((((.((....))))))).......((((......))))))....)))))..))))))))).((((((.((((((..............))))))))))))......(((((((..(((((((.((.....)).)..))))).)..))))))).)))))))))).))...)))((((((((((.((......)))))))))))))))))..))))).)))....)))))))))((((((((((.(((...))).....((((((.........))))))))))))))))..((((((.(((.(((.((((..((((((.((......)).)).))))((((((((((((((.((((.((((...)))).....))))....))))))..)))))))).....((((.((....))))))(((((.(((((((...))).))))))))).)))).)))))).))))))........)))))))))..))))..)))))..)))))))).....))))..)))...)).)))))).)))(((((........))))).((.((((..((((..(((((((((((((((......)))))))))))))))....((((((((...))))))))((((((((.((((((((.(((.((.......))))).))))..))))...))))))))....))))..)))).))..(((((((..(((..((((((((..((((.((((....)))).))))))(((....)))........(((((.....))))).........))))))..)))..))))))).......)))........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,(({((((.((((((((.(((((({{(({{{,.,||||||||.,((({...((.(({{{,({(|((({{(((,{(((,{(.{{{{{||}.,.,,},}})))))))},)))).))},|||,}||||{(({...{{((.......})}}{{{|,,((((.(((((((((..{((((,,,,.(({....{{.......))..)))...))))).........((((((....))))))...}}))))))).))))...,,)))}})}}))}}}}}}}}........{{{{...,}}}}({(.{(((((,((((({{{{((.(({{{{||.|,.(((((.((((..((((......)))))))))))))|||||..,,,,})))((((((((..(((.........)))...))))))))..,.((((((((.....{((.((((((.((((({..((((....))))}))))))).)))).))))))))))).},{|||,,|,...(((((......((((.((((((((......}),))).)))))))......)))))...,}.|||||.((({(({{{{(||((..{{((((..{{(({(.((((((((((((.,......}.)))))).))))))}.}|((((((....))))))}}}}|||||||||||,.,((((,,,,.|||}...,)),))}.|}||}.,}}}}}}})))).}}||||.|{(({........,||||}|||||||||||,((((({.{((((((,..{((,,..}}}.}}}}))){((((......||||||(((,{,,{,...,,,})))})))),...}||||{{{(,{{{,...{(((((({((...})},,)))))),,}.,}}}},}||}}}..{{|.{(((......)))}.)))||{((,.(((,((((,,,,,..}}}}}}}..}}}))))))))))})}}}},.(((((((..{(((((,.((.....)).}..))))).}..))))))),|}|}}|||}||||,,,|||((((((((({{{(......)))))))))))).|||},,||||{|||..,}}}}||||,..{(((((((({.{{{..,}}}.,...{{||||.|,......)}))}})||}}}}}})||{(({{{.{{{.,{,|((((,.((((((,{{......||,||,|||}{{||||||((((({.{{{{.{{{(.,.|}}}.....||||,...|}}}||..|}})))}}{{{{{.,.|}||}..,{{{||.(((((.(((((((...))).))))))))).,),)}))),||{|,,,,.....)))}}}}}},}},.,}})},.,},}},.)}}))})),,,,.)))),,)))},.}),})}})),)))(((((........)))))..,.{|{{..{{{{..(((((((((((((((......)))))))))))))))....{({((({{.,,)))))))){({{{{|{,|||||||{.{{{,||,....,.))))),)))}..)})),..))))))))...,)))}..}))).}}..(((((((..(((..((((({,,..((((.(((,....,}}}.))))||{,,...{||,,,,,{.,.{{{||,,,..))),,.........})))))..)))..)))))))....,,.)}}..,,,,,.........,,,,,...