Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001135821.2
Sequence Length
1528 nt
GC Content
0.5524
GGGAACUACUCGACCCACAGAGCCGAUCGCGGAGCGGAUUCUGCUUUUAGGAGUACCCGCCAACAAGCGGGACCGAGCAGGAAUCCGUAUCUGGGAACAGGUGAGAGAGGAUGUGUGCUGGGCCUUGGAGGAAGGGGGCCGAGACCGGGCCUUACUUCUGUAACGAUACUGUGAGGCAUCGGAAGGCCAGCCUGUUGUGUCCGUUUUGAAGGAUGCCCCUGUCCCGCUGGUUGAGAUCUGUGGGGGUCUUCCUGCUGCCAGCCCCCUACUGGGCACCCCGGGAGAGGUGGCUGGGUUCCCUACGGCGGCCCUCCCUGGUGCACGGGUACCCAGUCCUGGCCUGGCACAGUGCCCGCUGCUGGUGCCAAGCGUGGACAGAGGAACCUCGAGCCCUUUGCUCCUCCCUCAGAAUGAACGGAGACCAGAAUUCAGAUGUUUAUGCCCAAGAAAAGCAGGAUUUCGUUCAGCACUUCUCCCAGAUCGUUAGGGUGCUGACUGAGGAUGAGAUGGGGCACCCAGAGAUAGGAGAUGCUAUUGCCCGGCUCAAGGAGGUCCUGGAGUACAAUGCCAUUGGAGGCAAGUAUAACCGGGGUUUGACGGUGGUAGUAGCAUUCCGGGAGCUGGUGGAGCCAAGGAAACAGGAUGCUGAUAGUCUCCAGCGGGCCUGGACUGUGGGCUGGUGUGUGGAACUGCUGCAAGCUUUCUUCCUGGUGGCAGAUGACAUCAUGGAUUCAUCCCUUACCCGCCGGGGACAGAUCUGCUGGUAUCAGAAGCCGGGCGUGGGUUUGGAUGCCAUCAAUGAUGCUAACCUCCUGGAAGCAUGUAUCUACCGCCUGCUGAAGCUCUAUUGCCGGGAGCAGCCCUAUUACCUGAACCUGAUCGAGCUCUUCCUGCAGAGUUCCUAUCAGACUGAGAUUGGGCAGACCCUGGACCUCCUCACAGCCCCCCAGGGCAAUGUGGAUCUUGUCAGAUUCACUGAAAAGAGGUACAAAUCUAUUGUCAAGUACAAGACAGCUUUCUACUCCUUCUACCUUCCUAUAGCUGCAGCCAUGUACAUGGCAGGAAUUGAUGGCGAGAAGGAGCACGCCAAUGCCAAGAAGAUCCUGCUGGAGAUGGGGGAGUUCUUUCAGAUUCAGGAUGAUUACCUUGACCUCUUUGGGGACCCCAGUGUGACCGGCAAAAUUGGCACUGACAUCCAGGACAACAAAUGCAGCUGGCUGGUGGUUCAGUGUCUGCAACGGGCCACUCCAGAACAGUACCAGAUCCUGAAGGAAAAUUACGGGCAGAAGGAGGCUGAGAAAGUGGCCCGGGUGAAGGCGCUAUAUGAGGAGCUGGAUCUGCCAGCAGUGUUCUUGCAAUAUGAGGAAGACAGUUACAGCCACAUUAUGGCUCUCAUUGAACAGUACGCAGCACCCCUGCCCCCAGCCGUCUUUCUGGGGCUUGCGCGCAAAAUCUACAAGCGGAGAAAGUGACCUAGAGAUUGCAAGGGCGGGGAGAGGAGGCUCUCAAUAAAUAAUCGUGUAACCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-590.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 288.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((..(((........)))(((....))).(((((((((((((....(.((.(((((......))))))))))))).))))))))((((((((..(((((.(((.(((..(.((((((((...(((((((((((((((((.(((((((((((...............))))))).)))).(((....)))...((((((........))))))(((((((((((((((....(((.((((((((....(((.((((((.((...((((((.((((.(((((.(((.((((.........)))).))))))))........)))).))))))...)).))))))))).)))).)))).)))))).)))).)))))).))...)))).)))))))..))))))......(((((((..((.......))...)))))))))))......)))).)..))).)))..))))).))))))))......(((((((((((..((((((((((((..((((((((..(((((.((((((((((((((..(((((((((.((.((((..((((......)))).))))..))((((((((..((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((...((((.(((..((((.((((((.((((((.....)))))).))...))))...))))..))).))))))))..)))).(((((.(((...))))))))......)))))))((.((....((.(((((((.(((.(((....))).))).))))))).))....))))...))))))))...))))..)))))))).(((...(((((.......))))))))((((....((.(..(((((.(((((((......)))))))..)))))..).))..)))))))))))))))))))))...)))).....)))))))((((((((....)))))))).....(((........)))...(((........))))))))))).((((((((.(((((((.........(((((....)))))))))).....))..))))))))...((....))((((..((((.(.(((((..((((((....))))))..))))).).))))..))))...))))))))..))))).((((((..(((...(((...(((.....)))..)))....))).((((((.(((((((((((((((.((.(((((((((......((((.((....((((((......)).)))).....))..))))....)))))))))..)).))))))).......)))))..))).)))))).((.(((((........))))).)).))))))((((.....)))))))))))...))))...)))))))(((((((...((.(((..((((((((((...(((...........)))....))))..))))))))).))..)))))))(((((....))))).............))..))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({..,,,(,(,,......|||(({....|}|.(((((((((((((...,(.((.(((((......)))))})))))))}})))))))((((((({..{{{((.({(.(((..{.{{{{((((...(((((((((((((((((.(((((((((((....,......,,..))))))).)))).{((....)))...((((((........))))))(((((((((((((((....(((.((((((({....(((.((((((,({...((((((.((((,(((((.(((.((((,,....,..)))).)))))))).}......)))).))))))...)).))))))))).)))).)))).))))))}}))).)))))).))...)))).)))))))..)))))),,,,,.{(((((({,{.,.....,}}...}}}}}}}))))......,))),).,))),)))..)}}}|.})))))}}.....{(((((((((((..((((((((((((..((((((((..(((((.{({(((((((((((..(((((((((.((.((((..((((......)))).))))..))(((((((,..((((((((..(((((((((((({(({({,.((({{(((,..((({.(({{.((((.((((((.((((((.....)))))).))...)))),,,))})},}}).}}}))))),})}}),|,,{,{((({,.|||}||||{....,|||||}||,...,|{{{{.{({{{{|.|{{.||,,,,.,)).)},,))))}}),),,}))))}}...)))))))),..,)))..)))))))).{{,...(((({.......})))),{(((.{,...((.(..(((((.(((((((......)))))))..)))))..).)),,.))))))))))))))))))))...)))).....)))))))((((((({....|))))))),,,..{{({{{....,))).,{(((........)))))}}}}}}.((((((((.((,((,,,,..{{...(((((....))))))),,),.}}.))..))))))))...{{....))((((..((((.(.(((((..((((((....))))))..))))).).))))..))))...))))))))..))))).{(((((..(((...{((...(((.....)))..)},....))).((((((.(((((((((((((((.({.(((((((((......((((.((...,(((({(......)).)))).,...))..))))....)))))))))..}}.))))))).......)))))..))).)))))).((.(((((........))))).)).)))))}((((.....)))))))))))...))))...)))))))|{(((((...((.(((,.{(((((((((.,.(((...........)))....))))..))))))))).))..)))))))|{|||..,,))))}.........,,}.)),.))..
Back