Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001136232.3

Sequence Length

1467 nt

GC Content

0.5521

UGGUACUGAGGAGGCCUAGCAGGGUGAAGGCCACGGUCGCGGCCUUCACGGGUUCCUCGGCCGUCCUGAGUCCCAAAUCCCAAGCUGGAGCCGUUCAGCUCCCCUCCACCGCUUAGAGAUUUGGGGGGCUCUGGCCCCGUCCUUGCGGACCAUUCCGAGGGGAGUCCAGAGGUGUCAGUAAUUAACACUGUGGAUACCUCCCAUGAGGACAUGAUUCACGACGCCCAGAUGGACUACUAUGGCACCCGCCUGGCAACCUGCUCAUCAGACAGGUCCGUCAAAAUCUUUGAUGUGCGCAAUGGAGGGCAGAUCCUUAUCGCCGACCUCAGGGGUCAUGAGGGUCCUGUGUGGCAAGUGGCCUGGGCUCACCCCAUGUACGGCAACAUCCUGGCAUCGUGCUCCUAUGACCGGAAAGUCAUUAUCUGGAGAGAGGAAAACGGCACCUGGGAGAAGAGCCACGAGCAUGCGGGACACGACUCCUCAGUGAACUCGGUGUGCUGGGCCCCCCAUGACUACGGCCUGAUCCUGGCCUGUGGGAGCUCGGAUGGGGCCAUCUCCCUGCUGACUUACACCGGGGAAGGCCAAUGGGAAGUAAAGAAGAUCAACAACGCUCACACCAUUGGCUGCAAUGCCGUCAGCUGGGCCCCUGCUGUUGUACCUGGAAGCCUCAUAGACCACCCAUCGGGGCAGAAACCCAAUUACAUCAAGAGGUUUGCAUCAGGUGGCUGUGACAACCUCAUCAAGCUGUGGAAGGAGGAGGAGGACGGCCAGUGGAAGGAGGAGCAGAAGCUAGAAGCGCACAGUGACUGGGUUCGAGAUGUGGCCUGGGCCCCCUCCAUCGGCCUGCCCACCAGCACCAUCGCCAGCUGCUCCCAGGAUGGUCGUGUGUUCAUUUGGACCUGUGAUGAUGCCUCAAGCAAUACGUGGUCCCCUAAAUUGUUGCACAAGUUCAACGAUGUGGUGUGGCAUGUGAGCUGGUCCAUCACAGCCAACAUCCUGGCUGUCUCUGGUGGAGACAAUAAGGUGACCCUGUGGAAGGAGUCAGUUGAUGGGCAGUGGGUGUGCAUCAGUGAUGUCAACAAGGGCCAGGGCUCCGUAUCAGCAUCAGUGACAGAGGGCCAGCAGAACGAGCAGUGACAAGACAGGUGGGGCCUGGCUCCCCACCCGCCAGCUCCAGGACUGCCCCUUCCUGGGCCAACUAACCAGACAACUGGGAAGAGCCCCCAACUCCAACAGGAUUAUUUUCCCAGGAGGAGUUACAGAUGCAGCCACAGAUUGAUCAUCUGCCUUAACGUGAUCGGAGAUGCUUUGUAAUCUACUGUCCAGCUGAAAGCACUCAUGUUACGAGGAAGAAACUACAAGUGAUGUUCAAAUCUAUUUUGGGUCAUUUUUAUGUACCUUUGGGUUCAGGCAUUAUUUGGGGGGUUUUGUUUCCAAAGGAACUAAAUAAAGUCAUAUUGCUUAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-552.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -576.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 393.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((.((((((((.((....(((((((((.(....).)))))))))......)).)))).)))).))).)))..(((......)))..(((((.(((.(((((...((((........((.(((((((((((((...((((.((((....)))).))))((((((..((((((.(((((((...((((((.......)))).))....))))).))))))))....)))))).....(((....)))((((.(((((.((....)))))))..))))..(((.(((((((((((.(((((((((((((((((((....(((((...))))))))))))).)))..........(((((((((...((((((((..(((....((((((..((((..((((....(((((.........)))))....))))..))))..)).)))).....)))....))))).))).((((.(((((((((..(((..(((((((((((((....((((...(((((.((((.(((((...)).))).)))).)))))...((((((.((.....)).)))))).(((((((((..(((................)))....)))))))))........))))...))))))(((((.((...(((((..(((((.....((..((((.(((.......)))...........((((((..((.(((....)))))..))))))........))))..)).....)))).)..)))).).....)).)))))........)))))))))).))))))...))).)))))))))))))))))))))(.((.((((((.((((..(.(((((((..((..((((((((...(((....)))((((..((((((((..(((...(((..((((((.(.(((...(((((((........)))))))..)).).).)))))).)))))).))))))))))))))))))))..))..))))))).).........(((((((.....))).)))))))).)))))))).)))))))))))).)))........))))))))))))).))........))))...)))))..))).)))))(((((((((......(((((((.......))))))).....((.((((((........)))))))).......((((....))))..(((((((((((((((..(.(((......)))..)..)))))).(((((((((.......)))..))))))(((...((((((..(((.((((((...................)))))))))..))))))))).........(((((((((((..((((((....((..(((....)))..))..))))))..))))))))))))))))))))(((((....)))))........)))))..)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.(((.((((((((.((....(((((((((.{....}.)))))))))......)).)))).)))).))).)))..{{(,..{{{||.{{(((((.{((,(((((,,,{(((,.{,,,..((.(((((((((((((,,{((({.((((....}))).}))|((((((..((((((.{{,.,,..,,||{{{||,.,|||}},,,})},..}}}}},}}}}}|||,...||}}}}.,...(((....))){(((.(({(({{,..,{,|||||,{{,||{..((({((((,(({{((.{{{(((({..,,|||||||.}|,.||.}}}})))).,)))}))})}))}.}}},,.|,(({{(((((...{{((({((,{(((....((((((..((((..((((.,..(((((.,....,,.)))))..,.))))..))))..}),)))).....||}.,|,||||}.|||.{{{{.,||||{{||,..||,.{||{|||((((((..,.((((...(((((.((((.((({{...,}.))).)))).)))))...((((((.((.....)).)))))).(((((((((..{((................}})....))))))))),,...,,.)))),..)))))){{|{|,||,|,|{|||..|||((.,,|.{{,,{{{,.{{||,.....)))...........(((({{,,({.(((....))))).,)))))).,,,,,}.))))..)).,}},}})),)}})))},},..}.}}.|||}}..,{,...}||}}}},}).}))))},|,||}.||}|||||}|||||}}}}|||{.{{{((((((.((((..(.(((((((..((..((((((((...{{{....}}}{(((..((((((((..(((...(((..((((((.({({({,.(((((((........))))))).,)).).)})))))).)))))).)))))))))))}))))))))..))..))))))).).........(((((((.....))).)))))))).)))))))).))))}|||||,,.)))},......)))))}))))))).)},,.,}.}})))},,.)}))),.))).}}}}|{(({(({{{....,.(((((((.......))))))).},,.||,((((((........))))))))...,,..((((....))))..|{(((((((((((((..(.(((......)))..)..)))))).(((((({{,.......,))..))))))(((...((((((..(((.((((((.....,.........,...)))))))))..))))))))).........(((((((((((..((((((....((..(((....)))..))..))))))..)))))))))))))))))))}(((((,...)))))........)))},..})))}....