Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001136257.2
Sequence Length
5945 nt
GC Content
0.3554
AAAUGGAGUUUCAAAAUCACAAGCUUCUUUCCCACAUGAACAUAAGACUAGGAGCACAUAUGGAAGAGUAAAGUUGAAGGGAAUUUGGAUGAUGAUUUGGCAAGAUGCUGUGGGAUAGUAACAUCUUUUUGAGGGAAGAAUUGGCUUCCUUUCUUGAAAGUGGUGAAGGUACAGCAUAUAGCUGCAUGGAAGAAACAGUAAUCGGAUGGCUACCUUCUACAUUUUGUAUUAGGAAACAAAGUCCAUUGUAAGAGUCCAUGUUGAUCUUGGAAAUAGAAGGAUUGAAAAAAGCUAAAUUUCCACAAAGAACAAGAACUUGACCAUCUCCUUUUUGAUCUGAAGACUAGGGGACAAUGGAUAUCAUAGAGACAGCAAAACUUGAAGAACAUUUGGAAAAUCAACCCAGUGAUCCUACGAACACUUAUGCAAGACCCGCUGAACCUGUUGAAGAAGAAAACAAAAAUGGCAAUGGUAAACCCAAGAGCUUAUCCAGUGGGCUGCGAAAAGGCACCAAAAAGUACCCGGACUAUAUCCAAAUUGCUAUGCCCACUGAAUCAAGGAACAAAUUUCCACUAGAGUGGUGGAAAACGGGCAUUGCCUUCAUAUAUGCAGUUUUCAACCUCGUCUUGACAACCGUCAUGAUCACAGUUGUACAUGAGAGGGUCCCUCCCAAGGAGCUUAGCCCUCCACUCCCAGACAAGUUUUUUGAUUACAUUGAUAGGGUGAAAUGGGCAUUUUCUGUAUCAGAAAUAAAUGGGAUUAUAUUAGUUGGAUUAUGGAUCACCCAGUGGCUGUUUCUGAGAUACAAGUCAAUAGUGGGACGCAGAUUCUGUUUUAUUAUUGGAACUUUAUACCUGUAUCGCUGCAUUACAAUGUAUGUUACUACUCUACCUGUGCCUGGAAUGCAUUUCCAGUGUGCUCCAAAGCUCAAUGGAGACUCUCAGGCAAAAGUUCAACGGAUUCUACGAUUGAUUUCUGGUGGUGGAUUGUCCAUAACUGGAUCACAUAUCUUAUGUGGAGACUUCCUCUUCAGCGGUCACACGGUUACGCUGACACUGACUUAUUUGUUCAUCAAAGAAUAUUCGCCUCGUCACUUCUGGUGGUAUCAUUUAAUCUGCUGGCUGCUGAGUGCUGCCGGGAUCAUCUGCAUUCUUGUAGCACACGAACACUACACUAUCGAUGUGAUCAUUGCUUAUUAUAUCACAACACGACUGUUUUGGUGGUACCAUUCAAUGGCCAAUGAAAAGAACUUGAAGGUCUCUUCACAGACUAAUUUCUUAUCUCGAGCAUGGUGGUUCCCCAUCUUUUAUUUUUUUGAGAAAAAUGUACAAGGCUCAAUUCCUUGCUGCUUCUCCUGGCCGCUGUCUUGGCCUCCUGGCUGCUUCAAAUCAUCAUGCAAAAAGUAUUCACGGGUUCAGAAGAUUGGUGAAGACAAUGAGAAAUCGACCUGAGGAGCAAAACAAAGGCAUCAGCUCUUACACCAAAAGAGUUAACGCUGUAACCAAAGGUAUAGUUUUGUUUUUUAUUUUAGGAGAACUGACUGGUAAAUGAAGAAAUGGACCAAAUUUUGUGUAAACGAUUAGAAAGAUGAACAAAGUAUUGCCCUUUGACUGGUUUUCUUCUUCAUCCUGAGAAAGAUACAUUCUCUUGCAGCUCUUCAUUCAUUGGUGACAAGCCCCCACCCCGGGACUUUACUAAUGAGCUUGUUAAAGAGGUGCCAAAGAACAUAUUCCUCCUUUCUUUAUUCUUUCUCCACCAAAACCCUCUACUUCAGAAUUUUUUCAGGAUAUUUUUCAGCCCAAGGUCAGAAGAAUGUGUUAAUAUUUUAAAUAAAAUAUCUGGACAUCUACAGCCACUGUGUAAAUAGAACUGCCUAAUGUUGAGAGUGGUUUUUAGCAUUAGGUUUAGCAAGGGGGAGAUCCGUGGGUUGUGCGUCAGCUUUGGGUGAAUUUUGUUUCUACCCUGUCACGGGGAAAGUUCGGGUUGAGUCCAGGAGUGCACACUGCUGCUGCCACCCAAUGCGCUACAUAUCACUUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGUUUUUAAAAGAUCAUUUUAUCUUAAAAAGGAAAGCUGAUCCAAGUAAACACGAAAGUAUUUGACACACCCCACAGAUUUUACAUGUGUGUAAAUGUUUCACUUUAAAAUCUCUAUGACAGAUACACAGGAAACAUGAGAUGGUUUCUGCUAAUGAGUGGCCCUUGAGUACACACUUAGAUGCUGUCUGCCCUGUAAAUUUGGAUCUGGUGCCCCAGGGCAGUCAACUCUUCUAGCACAGGCUGAAAACACGUGUGUGUCAACUGAGGUUCACACCACUUGGGGAAUGAGCCUGUUUUCUUUCCAGGUCAGGCCCUGGUGUGAGAUCAAUUUUAGGGCUCCUAAUUGGAGCACAGAAAUGUAUUUGGUCAAAUUUCAUUGAAGGUGAUUUCUUCCUUUUUCUGUUGUACUUUAUGGAAAAACCAAGAUGGAACCUGAAAGUUAAUGUAUCCUUGCUUUUAGCAAGAGACUCAGUUUCUUAUAACUAGUCCUAAGGACAUAUGCCGCAAUUGAGUAAUUUUACUUUUACCCUAUGAAAAUAACAUGGUGCUGCACUAUAAUAUACUCUCGGAAUCAGUGUGUUAGUUACAGCUAUACAGUGAAGGGGGAUAACUGUUUCUAAAUUUCUUUAAGGUGAUGCCAAAAAAUGGAUUAAAAAAUCUGAUCAGAUUUAAUGUUACCAGAUUUAGUGCAUUAUUUAAUGCUAUUGGAUCUUUUGGAUAAUUCUUGGCUUAAUUUCUUAGCUACUUGAAGGUUAAUUUGCAAGACUUUUAAAACCUUAGAAAAGUUUUAAGGUUGCAAAGUUAUCAACACUGGGGCAGAGGGUGGAGAGGCCAAUGCGGGUAGAAGGAGGCAGUUAUGUUUAUAUUGAAGGUGAAAUUUUUCUUUCAUUUAGAAUGGAAAACAUCCCCAAAUGUAUCAUUAUAAACUAGUCAGCCUUGACUACACAAAAUUGACCUUUAAGUUGCUUGAGAAAAACACAAUGCAAAUCGUUCAGAAGGGUCAACAUCCUUUGGUGCUAAAAUCUUGUGUAUGUUUUCAGAAUGGCUUUUUCUGUAUGUUAUAGAAUAAUCACUAAAGGAAAGGUAGUUGAAUUUAAAGUCAUGAAGCAAGACUCUUUAAUUCAGUUAUUUUAAACAAGAAUUAAAACCCCAAACAUCCUUGGCAGGCUUUGAAGCACACAGAAUUUUCUAGUAUUUCUUAUUAAAUACACCAAUAAUAAACAUAUACUUAGUUUACCUGAUGAGUUUAGACAUAAUUCUAUAUAAUGUUCGCUUAUAUUCAUUUAUUAACUAGCAACACUUGUGCAAGAACAAGGUAUUCUGCUUGAAAACACUGAUUUUUAAGUUCCUGUUGCCCGAUUGUAAAGAAAAUCAUCUGACACAGAAGCCUGGAUUUUGCUCUCCUAACACUGGUGUUUUCCUUGAGCCUCUAAUUCAAAUAAAACAAACUGAUACACCUUACAGCCUUAUUCAUCUGUGUCUGGAUAACUCACUUUUCAUCUAUUGAAUAAGAAAAAGUGUUUAAACUUAAUAAAAUAAAAAAUUGUGCACCAAUUACUACAGAUCCUUGAAACAGUAAGCCUUGGAUUUUAGUCAAGUAAUCCAGUUUUUUUUUAAUUUAAAAAAAACCAUCACCUUUUAAAGAACUUUAAAAACACCUGUGAUGCCAAUGUGGACAUUGCCGCUGCCAUGUCUUUACACGCAUGUGUCGUAUAGCUCUGUCAUCGAGUUGAGGAAGUCCAUGGUUUGCAAAUAAGGGUGGGGGAAUCAAAAUUUCAAGAUGGAAAAAUAAAACAAAUAGUAAAACCCAUUUACAUGUAGGAAAGAAAAGUUGAGCUUCAACCCAAUGUGCCACUUUGAUAUAAAACAAGUAUGAUAUAUAUAUAAACUGAAGAUAUAAAACAAGUAUGAUCUUGCCUUUGAAAUCAUAAAUGUUUGGGGUACCUGUUCUUUGCCAGUUAAGAUACAUAUCUUAUUAUCUUUGUUUUUUUCAAGUCUAUGCUCCUGUUUGAAGCUUUUCCUGUAAUUUAGGUUGUCUGUGAAAUACCUAUAACAUAUAAUUCCUAUAGAGUAUGCCACAUUUUUUUUCUAACUCAUUUCAAAUGAAAUUCUCUCAGAUUCUAGUUUUUGAGCUUGUCCACUAGAUCUGAAAAUAAAGCAUCCUUUCCUGAGUCCACUUGAACUAAUUGUGAAUUUGUUACUUAAUUUACUGGCAUCUUGGGAAACAAGUUUUGCUGUGGCAGGAAGGCUGUUUUGAGAGUGAGCGUUGAGUCUACUCUGGUUUGUGGAUGACAUUGCAUUAGGGUUAUUUCCUGUAUUACCAGUGCCCCCUUGUGGCAAUAUACUUUAUGACUUGGAAUGCAAACACCACUUUUAAAAGCCUGUUUUCAAGUUUUUGAAAGGCAUUUGUUUUCUGUUGUUUGCCAAUAAUCUGAAAGUAUCAUGUGAAAGGAAUUAUUUUAAAAGCAUUUUAAACCUUUCCCAAAGGUAAAAUGUGCUCAGAUUAUAGGCACUUGUAAUUCUAACCUUGUAUCCAUUUGAUCAAAGAAAAUUUGUAGAACAUUUUUACCUCUCAUGAUCACAAUCAUUAGUGUCUCCCUUUAUAACGACCUAUGUUUUGUUUACUUUGAAACACCAAAUUUGUUGUCUUGGUUUUUUUUACAUGACAGAACUCAUGCAGUUUCUUUUUUAGUUGAAAGUUCACAUCUUGCCCCUUGAAUAGUUUGAACAUUUCUUUCUUAAUUCUUUUUUGUUUUUGUUUUGCACUGUAAAACUGAUGAAAACUUUAAGCCAAUCUUAAUGCACUAGCCUCUGUAGUGUAAGGAAGUGUGAGAAGGAGUUUCUUAAUGAGUUUACACGUUUAAAUCAAGCAUAUUAUAAGUUAUAUGCCAUGUGUUGAAGGCUUUUCUAUUUAUAUAUAUAAAGAUUUUUAGUAUUUGUUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1445.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1563.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 1446.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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