Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001142316.2

Sequence Length

1749 nt

GC Content

0.5683

GCCGCCCCCUCUCUGCCCUCGGCGGCGAGCAGCGCGCCGCGACCCGGGCCGAAGGUGCGAGGGGCUCCGGGCGGCCGGGCGGGCGCACACCAUCCCCGCGGGCGGCGCGGAGCCGGCGACAGCGCGCGAGAGGGACCGGGCGGUGGCGGCGGCGGGACCGGGAUGGAAGGUUAAGUCCUGAGCAGCAGCAGCAGCUGCAGCCGCCUGGAGCCAGGCUGCGCGCCCCGGCCCCCGCCUCGGCCGCGGCGCGCCCGCAGCCCGGUGAUUCGCUCUCUCUCUUUGGCGUUUGAAGGGAGCGCGGUGACUGUCCUUGAGCGCGGAGGGGCGAGCUCGCCGGCGGAGCGCCGGAGCAAGCGGAGGCGCAGGAGCGGCGGCGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCCGAGCACCCGAGGGGGUCCGAGCCCCGGCAGCCGGCCAGCCCCGCGCCACAAAGGGAGCGCCCCCGCCGCCCGGCACCCCGCCUCCCUCCCCAAUGUCCUCGGCCAUCGAAAGGAAGAGCCUGGACCCUUCAGAGGAACCAGUGGAUGAGGUGCUGCAGAUCCCCCCAUCCCUGCUGACAUGCGGCGGCUGCCAGCAGAACAUUGGGGACCGCUACUUCCUGAAGGCCAUCGACCAGUACUGGCACGAGGACUGCCUGAGCUGCGACCUCUGUGGCUGCCGGCUGGGUGAGGUGGGGCGGCGCCUCUACUACAAACUGGGCCGGAAGCUCUGCCGGAGAGACUAUCUCAGGCUUUUUGGGCAAGACGGUCUCUGCGCAUCCUGUGACAAGCGGAUUCGUGCCUAUGAGAUGACAAUGCGGGUGAAAGACAAAGUGUAUCACCUGGAAUGUUUCAAAUGCGCCGCCUGUCAGAAGCAUUUCUGUGUAGGUGACAGAUACCUCCUCAUCAACUCUGACAUAGUGUGCGAACAGGACAUCUACGAGUGGACUAAGAUCAAUGGGAUGAUAUAGGCCCGAGUCCCCGGGCAUCUUUGGGGAGGUGUUCACUGAAGACGCCGUCUCCAUGGCAUCUUCGUCUUCACUCUUAGGCACUUUGGGGGUUUGAGGGUGGGGUAAGGGAUUUCUUAGGGGAUGGUAGACCUUUAUUGGGUAUCAAGACAUAGCAUCCAAGUGGCAUAAUUCAGGGGCUGACACUUCAAGGUGACAGAAGGACCAGCCCUUGAGGGAGAACUUAUGGCCACAGCCCAUCCAUAGUAACUGACAUGAUUAGCAGAAGAAAGGAACAUUUAGGGGCAAGCAGGCGCUGUGCUAUCAUGAUGGAAUUUCAUAUCUACAGAUAGAGAGUUGUUGUGUACAGACUUGUUGUGACUUUGACGCUUGCGAACUAGAGAUGUGCAAUUGAUUUCUUUUCUUCCUGGCUUUUUAACUCCCCUGUUUCAAUCACUGUCCUCCACACAAGGGAAGGACAGAAAGGAGAGUGGCCAUUCUUUUUUUCUUGGCCCCCUUCCCAAGGCCUUAAGCUUUGGACCCAAGGAAAACUGCAUGGAGACGCAUUUCGGUUGAGAAUGGAAACCACAACUUUUAACCAAACAAUUAUUUAAAGCAAUGCUGAUGAAUCACUGUUUUUAGACACCUUCAUUUUGAGGGGAGGAGUUCCACAGAUUGUUUCUAUACAAAUAUAAAUCUUAAAAAGUUGUUCAACUAUUUUAUUAUCCUAGAUUAUAUCAAAGUAUUUGUCGUGUGUAGAAAAAAAAACAGCUCUGCAGGCUUAAUAAAAAUGACAGACUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-700.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -728.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 389.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((.(((((((((((((....(((((((((..((((.(((...))).)).))(((((((.((.(((..(((((.(........)))))).))).)).))))))).)))...))))))(((((.((((((((.(((((((.(((..((((.........))))..)))))).((.(((((....))))).)).(((((....))))).(((((((.(((((........))))).))))))))))).))))))....)).)))))((((...((((((((..((((((((((.(((((((.....((.(((((((.(((((((.(((((((((((((((.((..((((.(((((.......(.((((.(((.((((((((((.(((.((.((.(.((((....))))))).)).))).).))).))).)))))))))).).......))))).)))).))))))).(((((((((....((((..(((((((((((((((.(((((((((((((..(((....)))..)))).((((..(......)..))))(((((...((((((.((.((....)))).)))))).....)))))...))).))))))........)))).......)))).))))))).(((.((((((((.....))))))).).))))))).)))))))))((((.((.............))))))...)))))))))).))).....))).).))))))).))..))))))).)))))).))))....)))))........)))...)))).((((.(.(((((((.(.((...)).).))))))).).)))).......)))))))(((((...((((....))))...)))))((((((((((((((.((((.(...((((((.(.....).))).)))))))).))(((..((((......)))).)))(((((......))))).....))))))))))))....(((((.(((((....))))).)))))((((........)))).....))))))..))))).)))))..((((((((((...(((((.(((((((.....)))).......).)).)))))..((((((((((((((((((((...((((.........))))...))))))))))).......)))).))))).((...(((((.(((.......(((..(((.((((((((((((((((..((....(((((((((((((....(((((((..((((.((((....)))))))).)))))))))))))((.....))........)))))))...))..))))))..........))))))))))...)))..)))((((.(((..........(((((((((.......)).)))))))..))).))))(((((............))))).((((.(((((((.....)))))))....)))).....))))))))...)).....((((((((.((.......))..))))))))(((((...(((((.(((...)))..)))))...))))).......((((((...)))))))))))))))).(((((((((((((((((...(((((((((((((((((....)))).)))))...................)).))))))..))))))))......))))).))))..))).......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((.(((((((((((((.....,.))))))..((((.(((...))).)).))(((((((.((.(((..(((((.(........}))))).))).)).))))))).(((....)})|}(((((((((((((((((.(,((({({(((.{((((,{...,,{.,..}})))}.{{.(((((....))))).||.(((((....))))).||{{{{|,|||||,,,,,,.,})))|,||}}}}})))).)))))))...,}.)))))})}},,..,((((((..((((((((((.(((((({.({..((.(((((((.(((((((.((((((((((,((((.,({{(,(({(((((.{{.{{{({((((.(((.((((((((((.(((.((.((.(.((((....))))))).)).))).).)))},)).)))))))))).....{{{.,,,})}))))}))))}}}.,|{((((((((((((((..(((((((((((,,...,((,,((,,,(((..((({{,.|||{,,,||{((,,..(,.....,..}}))(((((...((((((.((.((....)))).)))))).....))))).}}))).,)))))))}))))}}}..}}.....)))).))))))).(((.((((((({.....})))))).).))))))).)))).)))))))|}||}}}.}}......}),,)))}..)))))))))).))).....))).).))))))).))})))))))).)))))).))))....)))))}.....(((((((.(((.,((((.(.(((((((.{.((...)).).))))))).).))},........,.((((((.(((((....)))))..)))))).,.((((((((((((((.{(((.{...((((((.(.....).))).))}.)))),}}(((..((({......)))).)))(((((......))))).....))))))))))))...,(((((.(((((....))))).)))))),..,}}))).)))))))..}))))))..))))).)))))..((((((((((...(((((.({.,(((.....}}}}.........}}.)))))..((((((((((((((((((((...((((.........))))...))))))))))).......)))),})))).({...({(((.((,.......{{(..(((,((((((((((((((((.,{{{{,,(({((((({,{{({{{{,(({({{{.{,,{.{{||},,})))))}|}|||||||,||||||.,...}}}},,,..,},)))))))...))..)))))).........,)))))))))).,,}))..}}}{(((.(((..........(((((((((.,....})),}))))))..})).)))}(((((..........,,|)))).,|||.(((((((.....)))))))..,,}))),,,,.}}}})))}...)).....((((((((.(({...,,,},..)))))))){((((...(((((.(((...)))..)))))...))))}.......((((({...}))))))))))))))).(((((((((((((((((...((((((((({{{,((({....}))).}}}}|........|||.,,},,.}}).)))))}..))))))))}.....,}))).))))..))).......................