Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001145160.2

Sequence Length

2598 nt

GC Content

0.4665

ACUCUGCCCCACAGCCACAGCCCCUGACUGCCGCAGCCCCCACAGAGCCCGCCGCGCACCCCACGUCCCCCACGCCAGCGCCCAGCCAUGGAGGCCAUCAAGAAGAAAAUGCAGAUGCUGAAGUUGGACAAGGAGAAUGCCAUCGACCGCGCGGAGCAGGCGGAGGCGGAUAAGAAAGCCGCUGAGGACAAGUGCAAGCAGGUGGAGGAGGAGCUGACGCACCUCCAGAAGAAACUAAAAGGGACAGAGGACGAGCUGGAUAAAUAUUCCGAGGACCUGAAGGACGCGCAGGAGAAGCUGGAGCUCACGGAGAAGAAGGCCUCCGACGCUGAAGGUGAUGUGGCCGCCCUCAACCGACGCAUCCAGCUCGUUGAGGAGGAGUUGGACAGGGCUCAGGAACGACUGGCCACGGCCCUGCAGAAGCUGGAGGAGGCAGAAAAAGCUGCAGAUGAGAGUGAGAGAGGAAUGAAGGUGAUAGAAAACCGGGCCAUGAAGGAUGAGGAGAAGAUGGAGAUUCAGGAGAUGCAGCUCAAAGAGGCCAAGCACAUUGCGGAAGAGGCUGACCGCAAAUACGAGGAGGUAGCUCGUAAGCUGGUCAUCCUGGAGGGUGAGCUGGAGAGGGCAGAGGAGCGUGCGGAGGUGUCUGAACUAAAAUGUGGUGACCUGGAAGAAGAACUCAAGAAUGUUACUAACAAUCUGAAAUCUCUGGAGGCUGCAUCUGAAAAGUAUUCUGAAAAGGAGGACAAAUAUGAAGAAGAAAUUAAACUUCUGUCUGACAAACUGAAAGAGGCUGAGACCCGUGCUGAAUUUGCAGAGAGAACGGUUGCAAAACUGGAAAAGACAAUUGAUGACCUGGAAGAGAAACUUGCCCAGGCCAAAGAAGAGAACGUGGGCUUACAUCAGACACUGGAUCAGACACUAAACGAACUUAACUGUAUAUAAGCAAAACAGAAGAGUCUUGUUCCAACAGAAACUCUGGAGCUCCGUGGGUCUUUCUCUUCUCUUGUAAGAAGUUCCUUUUGUUAUUGCCAUCUUCGCUUUGCUGGAAAUGUCAAGCAAAUUAUGAAUACAUGACCAAAUAUUUUGUAUCGGAGAAGCUUUGAGCACCAGUUAAAUCUCAUUCCUUCCCUUUUUUUUUCAAAUGGCACCAGCUUUUUCAGCUCUCUUAUUUUUUCCUUAAGUAGCAUUUAUUCCUAAGGUAGGCAGGGUAUUUCCUAGUAAGCAUACUUUCUUAAGACGGAGGCCAUUUGGUUCCUGGGAGAAUAGGCAGCCCCACACUUUGAAGAAUACAGACCCCAGUAUCUAGUCGUGGAUAUAAUUAAAACGCUGAAGACCAUAACCUUUUGGGUCAACUGUUGGUCAAACUAUAGGAGAGACCAGGGACCAUCACAUGGGUAGGGAUUUUCCAUCCAGAGCCAAUAAAAGGACUGGUGGGGGCCGGGGGUGGCUAUUGUGGGAAGUCAUAACCCACAGAUAGAUCAACCUAAGAAUCCUGGCCCUUCUCCACUCUCCACCAUGCAGGACAAACAUCUUCUCAAGCAGUCAACGUAGAAUGCUUGGGAAAUAGUCAUAAUUACCCACAUAUAGUAAUUAAUAGAUGGUAAUUAAUUGAUCCUUGAUGUGAUGUUCUUUUGCAUAUUUCCUUCAUUCUAAAGUUGUUCCCUGGCCGGGAGCGUUGGCUUUCGCCUGUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCCAGGACAGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCCAGCCAACAUGGCGAAACCAUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAUGGUGACGCCUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAACCCAGGAAGUGGAGACUGCAGUGAGCCGAUAUCGCACCACAGCGCUCCAGCCUGGUCGACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAGAAAAAAUAAAAAUAAAGUUGUUCUCUGAAGAGCAAAUGUCUCAUUCCAGUAAUGACCCACUCAGCAGGAAUAUGGUGGAGUUCAGUCCAAUUCAGGUCAGCCAUAUCCAAAAGACCACAAGUCAUUACUAAGUUGAGCAAAAGAGUUUUUAUCUAUUAGCAGAAAGGGCCUCUCUGGCAGCAGAGAUUAAAAACUGGCCCAACUUCAUUUCCAUACUUCAGGGAACAGCAAAUUGAGGAUUUACUUAUCUAGGACUUGAAUUCCUUCUUUGGGACCAAGUUAAUAAAAGACCAAGAAACUCCUGAUUAAACUGGAUAAUGAAGGAUUCUGUAGACAGGGCUGCACGUAUCGGCUUUGUUUGACUUCUCUUUUCUCAGUUAACAUCUCAGAGCUAGAACAUUCCACAUUCCCCAGCAGCGUGUGGGGGCUGACUAAAGUUUACAAUUCCAACUAAAAAUCACCCUGCUUCUGGCUUAUCUGAAUCCCUUACCCACCCCACCCCACCACCCUACUCCUAUUUAUUCAGCACCACACUACCCAGGAAAUACACUAGCAAAUUGUGCAAUGGAAUAAAAUCCACACUUUAGAUUCUUGCAACUGUAUCAUAUGUAAUAGUAUCACUUUUUCUACAUUUUGGUCAAAUAAAUUUUUACAUAAACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-759.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -810.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 511.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((.......((..(((.......)))..))........)))))......((((......(((.....)))...))))(((....))).(((((......((((((((((((..(((((((((((..(((((...(((.(((.((((.....)).))))).)))..........((((((.......))))...)).(((((.(((((.((....)).)))))............((((((....(((.((((((((.......))).....((((.........))))((((((.((..(((...))).((..((((((((((((((..((.(((((((....(((((((.((.((.....)))))))))))((((((((((((((((((((((((.(.(((((...(((((((....(((..(((((...(((...(((((((..(((((((((((((...(((((((........)))(((((((((((((.((((.(((((..((((((.......((..((((((((...((..(((...))).(((((((((((((((...((((((.......)))))).)).))))).....(((((.(((((...(((((.((((((((.(((((((((((((((.(((..(((((((..((....(((.((..(((.((.((((...)))).)))))..)))))))..))))))).......((.((((.....)))).))........(((((........)))))((((((....((.....))..((((.(((((((((......)))......(((((....)))))..............((.(((((..(((...)))..))))).))..........))))))))))..))))))..))).))))))))..(((((((((..((((...........))))..)))).)))))....((((...))))...))))))).))..)))))).)))))......))))))))))......))).)))))..((((((.((....)).))))))......(((((.............))))).)).....))))))))..))....))))))..).))))))))..)))))))..)))).))......)))).)))))))))))))..))...))))).))).)))))..)))..)))))))...(((...((((........))))....))))))))..).))))))).((......(((((((..............((((((.....(((((((....))))))).........((.(((((.(((.((.((..(((((((((((((((.........(((((((((((...((......(((.(..((((.....))))..).)))......)).)))))(((((((((((((((((((((((((.........)))))).)))).)).))).......)))))))))).....)))))))))).))))..........((((((((((.((......)).)))))))))).......((((((((....(((........)))...)))))))).)))))))..)).)).))).))))).)).....((((((((((((((((.(((.(((((((((((((....))))))........((((((....)))))))))))))...))).))))..(((((((((((.((((...((((((((.....((((..((((((......................))))))..))))(.((.(((((....)))))..)).)))))).))).((((..((((((....(((((...(((((.(.((.(((...((....))...))).)))))))).)))))......))))))..)))).))))...................((((((((((((((......((.((((....(((((((((....((....(((.((((((.((.((.(((...))).)).)).)))))))))....))......)))))))))....))))))..(((.......))).......(((.(((((((((((....)))))).........)))))...))).........))))))))))))))....((((......)))).....((((((...((((.....)))).))))))...............)))))))))))....))))..)))))))).))))))....))))))).....)))))))))))))))))))...((((.((((..........))))))))....)))))))..))..)))))).))))))))..))..((((.........)))).........)).))))))))))).)))...))))))............)))))......))))).(((((((.....((((......((........)).......)))).....))))))).)))).)))))))..)).))))(((((..(....)..)))))......))))))......)))))......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((.......((..(((,....,.)))..)).,......))))),,.{{.((((......{{{.....}}}...)))),{,},..})).(((((....{.(((({{((((((..(((((((((((..(((((..,(((.(((.((((.....)).))))).)))|,........{||{{{..,,...,|||,..,,.(((((.(((((.((....)).)))))............((((((....(((.((((((((.......|||.....{{{{..|,....,||||{(((({,((,,{{{...}}}.((..((((((((((((((..((.(((((((....{(((((,,((.((.....))))))))))|((((((((((((((((((((((((.(.(((((...(((((((....(((..(((((...{{{...(((((((..(((((((((((((...{((((((........)))(((((((((((((.((((.(((((..((((((...,{..((..((((((((..,({..{{,...|||{{,{{((({{((((((...((((((.......)))))).)).))))}.||,.{{{{|||,{({{{{(((((.{(((((((.(((((((((((((((.(((..{((((((..((,...{(,,((..((,{((.((({...)))).)))))..))))))}..))))))),......({.{(((....,)))}.}}........(((((........)))))((((({,...{(.....}},.{{((.((({{{({,...,,|)}}......(((((....)))))..........,,..{(.(((((..(((...)))..))))).)}..,.......},}))))))},.))))))..))).)))))))),.,{{((((((..((((...........))))..)))).}}|||,{,.,{{,...}})),}}))))))).))}}))))))})))),,,.|,,||,,}))))}......))),))))),,{(((((.(,....}}.}))))},,,{(..{{||,}|........,.)))}},)}.....))))))))..)).},.))))))..),})))))))..))))))}.,)))).))......)))}.)))))))))))))..))...))))).))}.)))))..)))..)))))))...{((...((((........))))....))})))))..}.))))))).{,..,,..(((((((.......,,..,..((({((.....(((((((....))))))}.........||.|,,(({({,,{{,,,..|)}}|..,|||||||}........(((((((((((...((......(((.(..((((.....))))..).)))......)).))))){((((((((((((((((((((((((.........))))))}}))).)),})).......)))))))))}.....))))))...{{{{((((({.(((((((((((((((.((......)).))))))))))...{(({((((((((.,..(((........)))..,))))))))..))))....)))))..)))))},,,))}}...(((((((((,(..((({{,,.(((((((((((((....))))))........((((({....}))))))))))))...},,.,,,,..((((((((((({((((,..({{{{(((.....|||{..{{{{{|,,,,...,..............)}))))..}||||.((.(((((....)))))..)),})))||,||}.((((..((((((....(((((...(((((.,,((.(((.{,{{....})}..))).)))))))).)))))......))))))..)))).}))),..................((((((((((((((.,..,,((.((((....(((((((((....{{....((,,((((((.((.({.,{{...,}}.}).)).)))))))))....}}......)))))))))....))))}}..{{{.......}}}.......||,.(((((((((((....)))))).........)))))...,,},,,,.....))))))))))))))....{{{(,.....}}}),,,..((((((..,((({.....)))).)))))).............),))))))))))).,}}),,}.})))))))).)))))),...))))))).,.,.))}))))))))))))))))}..{(((.((({.........,)))})))}....))))))),.))..)))))).))))))))..))..,,{,......,,,),)).....,,..)),))})))))))).)))...))))))..,,,,,.....,}}},..,.,.))))).{((((((.....((({......((........)).}.....)))).....))))))}.)))).)))))))..))}})))(((((..,....}..)))))......)))))).,....)))))......................