Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001145358.2
Sequence Length
6723 nt
GC Content
0.4711
AACAGAGAAGCGGCCGCGGCGGUAGAGGCGGCGGAGACGGUUUCUCCAUCUUCCCCCCUCCCCUUCCCCCCUCGGAGUUUCCCUCCCUCCCUCCCUCCCUCCUUCCCAGUCUGGGCACCGGAGCCUGUGACCGCUUCGUUAGUGGAGAGGUAGCUGGCAGUCCGCUUCGGCGGGCCUGUGCCCCGCGCCGUUCUCGGGGCCUCCCUGCUGAGCUCGCGGCUCACGCUGAGAGGGACACGCAGUGACGAGCGGCCGAAGCAGCUUUGCGGUUUUGUAGUGCAUCCCUGAGCAUGAGCACAGAAUGAAGCGGCGUUUGGAUGACCAGGAGUCACCGGUGUAUGCAGCCCAGCAGCGUCGGAUCCCUGGCAGCACAGAGGCUUUUCCUCACCAGCACCGGGUGCUUGCCCCUGCCCCUCCUGUGUAUGAAGCAGUGUCUGAGACCAUGCAGUCAGCUACGGGAAUUCAGUACUCUGUAACACCCAGCUACCAGGUUUCAGCCAUGCCACAGAGCUCCGGCAGUCAUGGGCCCGCUAUAGCAGCAGUUCAUAGCAGCCAUCAUCACCCAACAGCGGUGCAGCCCCACGGAGGCCAGGUGGUCCAGAGUCAUGCUCAUCCAGCCCCACCAGUUGCACCAGUGCAGGGACAGCAGCAAUUUCAGAGGCUGAAGGUGGAGGAUGCGCUAUCUUAUCUUGACCAGGUGAAGCUGCAGUUUGGUAGUCAGCCUCAGGUCUACAAUGAUUUCCUUGACAUCAUGAAGGAAUUUAAAUCUCAGAGCAUCGACACCCCAGGAGUGAUUAGUCGUGUGUCCCAGCUAUUCAAAGGCCACCCCGAUCUGAUAAUGGGAUUCAACACCUUCUUGCCCCCUGGCUACAAAAUUGAGGUGCAAACCAAUGACAUGGUGAAUGUGACAACUCCUGGCCAGGUUCAUCAGAUUCCCACCCAUGGCAUCCAGCCACAGCCUCAACCACCACCCCAACAUCCUUCCCAGCCUUCAGCCCAGUCAGCCCCAGCUCCUGCCCAGCCAGCUCCUCAGCCCCCACCUGCCAAAGUCAGCAAGCCCUCCCAACUGCAAGCACAUACUCCGGCCAGUCAGCAGACUCCCCCACUUCCACCGUAUGCAUCCCCACGUUCUCCGCCGGUCCAGCCUCACACACCAGUGACAAUCUCGUUGGGAACGGCCCCAUCCUUGCAGAACAAUCAACCUGUGGAGUUUAAUCAUGCCAUCAACUAUGUUAAUAAGAUCAAGAACAGAUUUCAGGGCCAACCAGACAUCUACAAAGCAUUCCUGGAGAUUUUGCACACAUAUCAGAAAGAGCAGAGAAAUGCCAAGGAAGCUGGAGGAAACUACACUCCAGCAUUGACAGAGCAGGAGGUGUAUGCCCAGGUUGCUCGUCUCUUUAAAAACCAGGAAGAUUUGUUGUCAGAGUUUGGACAAUUCCUACCAGAUGCCAACAGCUCCGUGCUUUUAAGCAAAACAACUGCUGAGAAGGUUGAUUCUGUGAGAAAUGAUCAUGGAGGCACUGUCAAGAAGCCCCAACUGAACAACAAGCCGCAGAGGCCCAGCCAGAAUGGCUGCCAGAUCCGCAGACAUCCUACAGGAACCACCCCUCCAGUUAAGAAGAAACCCAAACUGCUCAAUCUGAAGGAUUCUUCUAUGGCAGAUGCCAGCAAACAUGGUGGUGGAACAGAAUCGUUAUUUUUUGAUAAGGUCCGAAAGGCUCUUCGGAGUGCAGAAGCCUACGAAAAUUUCCUACGCUGUCUUGUUAUUUUUAACCAGGAGGUGAUCUCUCGUGCUGAGCUUGUGCAACUAGUCUCUCCUUUCCUGGGGAAAUUCCCUGAGUUGUUUAAUUGGUUUAAAAACUUUCUGGGCUAUAAGGAGUCUGUACAUCUGGAAACUUAUCCAAAGGAGCGAGCCACAGAGGGCAUUGCUAUGGAGAUAGAUUAUGCUUCUUGUAAACGAUUGGGCUCCAGCUAUCGAGCCUUACCAAAGAGUUACCAGCAGCCCAAGUGUACAGGACGGACUCCUCUCUGUAAAGAGGUUUUAAAUGAUACCUGGGUUUCCUUCCCUUCGUGGUCUGAGGACUCUACCUUUGUGAGUUCCAAGAAGACUCAAUAUGAAGAACAUAUUUAUCGUUGUGAAGAUGAACGCUUUGAGCUUGAUGUAGUUUUAGAGACCAAUCUGGCAACAAUCCGGGUUCUGGAAGCAAUACAGAAGAAGCUUUCCCGCUUGUCUGCUGAAGAACAAGCCAAAUUUCGCUUGGACAACACCCUUGGGGGCACAUCAGAAGUCAUCCAUAGAAAAGCACUCCAGAGGAUAUAUGCUGAUAAAGCAGCUGACAUCAUUGAUGGUCUGAGAAAGAAUCCCUCCAUUGCUGUUCCAAUUGUCCUUAAAAGGUUGAAGAUGAAAGAGGAAGAAUGGCGAGAAGCUCAGAGAGGCUUUAACAAAGUAUGGCGAGAACAAAAUGAGAAAUACUACUUGAAGUCUCUGGACCACCAGGGGAUCAACUUUAAACAGAAUGACACCAAGGUCCUGAGGUCUAAGAGCUUACUCAAUGAGAUUGAGAGUAUCUAUGAUGAGAGGCAAGAGCAGGCUACGGAGGAGAAUGCUGGUGUACCUGUUGGCCCACACCUCUCACUUGCGUAUGAAGACAAACAAAUACUGGAAGAUGCUGCUGCUCUGAUUAUCCACCAUGUGAAGAGGCAGACAGGCAUUCAGAAGGAGGACAAAUAUAAGAUAAAACAAAUCAUGCAUCAUUUUAUUCCAGAUUUGCUCUUUGCCCAAAGAGGUGAUCUCUCAGAUGUGGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGAUGGAUGUAGAUGAAGCCACAGGGGCAGUUAAGAAGCACAAUGGUGUUGGGGGCAGUCCCCCUAAGUCCAAGUUACUGUUUAGUAACACAGCAGCUCAAAAAUUAAGAGGAAUGGAUGAAGUAUACAACCUCUUCUAUGUCAACAACAACUGGUAUAUUUUUAUGCGACUGCACCAGAUUCUCUGCCUGAGGCUGCUACGGAUUUGUUCCCAAGCCGAACGGCAAAUUGAAGAAGAAAACCGAGAGAGAGAAUGGGAACGGGAAGUGCUGGGCAUAAAGCGAGACAAGAGUGACAGCCCUGCCAUUCAGCUACGUCUCAAAGAACCUAUGGAUGUUGAUGUAGAAGAUUAUUACCCAGCUUUCCUGGACAUGGUGCGGAGCCUGCUGGAUGGCAACAUAGACUCAUCACAGUAUGAAGAUUCACUGAGAGAGAUGUUCACCAUUCAUGCCUACAUUGCCUUUACCAUGGACAAACUGAUCCAGAGCAUUGUCAGACAGCUGCAGCAUAUCGUGAGUGAUGAGAUCUGUGUGCAGGUGACUGACCUUUACCUGGCAGAAAAUAAUAAUGGGGCCACCGGAGGCCAGCUGAACACACAGAACUCAAGGAGCCUCCUGGAGUCAACGUAUCAGCGGAAAGCUGAGCAGCUAAUGUCAGAUGAGAAUUGCUUUAAGCUUAUGUUUAUUCAGAGCCAAGGCCAGGUCCAGCUGACUAUUGAGCUUCUGGACACAGAAGAGGAGAAUUCGGAUGACCCUGUGGAAGCAGAGCGCUGGUCAGACUACGUGGAGCGAUACAUGAAUUCAGAUACUACCUCGCCUGAGCUUCGUGAACAUCUAGCACAGAAACCAGUAUUUCUCCCCAGGAAUCUACGGCGGAUCCGGAAGUGUCAACGUGGUCGAGAGCAGCAGGAAAAGGAAGGGAAGGAAGGAAACAGCAAGAAGACCAUGGAGAAUGUGGAUAGUCUGGAUAAGCUGGAGUGUAGAUUCAAGCUGAAUUCCUACAAGAUGGUGUAUGUGAUCAAAUCAGAGGACUAUAUGUAUCGGAGGACCGCCCUGCUCCGGGCUCAUCAGUCCCAUGAGCGUGUAAGCAAGCGUCUACAUCAGAGAUUCCAGGCCUGGGUAGAUAAAUGGACCAAGGAGCAUGUGCCCCGUGAAAUGGCAGCAGAGACCAGCAAGUGGCUCAUGGGUGAGGGGCUGGAGGGCCUGGUGCCCUGUACCACCACCUGUGAUACAGAGACCCUGCAUUUUGUGAGCAUUAACAAGUAUCGUGUCAAAUACGGCACAGUAUUCAAAGCCCCUUAACUGCAAAGCCAGAGCAGAUAACUUGGGGUGUGUGUGGGGAUGUGUGUGUGGGCCUAUGCACUCACACACUGAAGAAACAAGGAAGAUGCCUUUCAAGCCUCACUGGGCCUCUCUGGGACAUGGCCACCUGACCUGUGUGUGGCUGGUGCAGCCUGGCACCAAGUGGGCUACCUGUUAGGAACAUGAAUACCUUACAAAGCUGAAGCUGGAACUUUUCCCAAAGGGUUUUGGGUAUAGCCUGCCCUGGAGGGGAAGGAAGUCCAUGCAAGCAAAGACAUGCAGUUUGCUUGCACACACCAGCAGAGCUAAGACUGGAGUCUCCUGUGGCCUAACUUUCAAUGAGGGAACCGGAUGCUGUUCACACUUUGACUGGAUGGAGAUGCAUUUACAAAACAGACUGGAGAAGGACUUAAUACUCAGAUGGAUUGGAACUAUCAUGGUCACUGCUCCUCUCCCCUCCCCACAAAAGGAAAAAAAAGCUGGAUUUGAUUUUUUUUUUCUGGUCACUCGAGCACAUCUAAGAUCACCCAUUAGGUUUUAUCUGGGACCUGCAGUUUGGCUUUGGGAUUGAUCAUCUUGUGGAUUUUAUUCCUGACGAUUCCCUUGCUGCCUACCCUUUUCUCUCCUCUGGUUCUCAACCUCAACGAGUUCAAAUCAGUUGUCCUUUUUAGCUCCCGUGGAACUGUUUUGUAUCUGCCUCUUUACUAGUCUACCUUAGUGCCAUCCACCAGCUUUACUCUCUGACACACACACGCACACACACACACAAUUUUAACUUGUUUUUUUGUACAUAAUGUACAUACUGUCAAUUUUUUAUUAAAAGAAAUAUGCUUUGAUGUGCUAGCAUAACUGCUCUAGCUUCUUGUGUACCAUAGUA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2032.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2152.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 1696.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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