Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001145520.1
Sequence Length
5068 nt
GC Content
0.4347
GGAGUUGGGAGGCUCCCGGCGCGGGGUCCCGGGCUCGUGUCCCCGCCUUUGUGUCUGGAGCUCGGGCGCGGGAGGCGCUGGGGACGGCGCCCGGGCGGAGCGGCUGAGCGGGCUGCAGCCGGGGUCCCGCCACCUCUCCCUGGUCCACCGCCGGCAGCCCACUGUCUGCGGAGAGCAGAUCUGGGGACAAGAGGAAGGAGAGGAAGGUGUUGAAAAGUCUCCUCUAGAGCUUUGGAAGGCUGAAUGCACUAAACAUGAAGAGCUUGAAAGCGAAGUUCAGGAAGAGUGACACCAAUGAGUGGAACAAGAAUGAUGACCGGCUACUGCAGGCCGUGGAGAAUGGAGAUGCGGAGAAGGUGGCCUCACUGCUCGGCAAGAAGGGGGCCAGUGCCACCAAACACGACAGUGAGGGCAAGACCGCUUUCCAUCUUGCUGCUGCAAAAGGACACGUGGAAUGCCUCAGGGUCAUGAUUACACAUGGUGUGGAUGUGACAGCCCAAGAUACUACCGGACACAGCGCCUUACAUCUCGCAGCCAAGAACAGCCACCAUGAAUGCAUCAGGAAGCUGCUUCAGUCUAAAUGCCCAGCCGAAAGUGUCGACAGCUCUGGGAAAACAGCUUUACAUUAUGCAGCGGCUCAGGGCUGCCUUCAAGCUGUGCAGAUUCUCUGCGAACACAAGAGCCCCAUAAACCUCAAAGAUUUGGAUGGGAAUAUACCGCUGCUUCUUGCUGUACAAAAUGGUCACAGUGAGAUCUGUCACUUUCUCCUGGAUCAUGGAGCAGAUGUCAAUUCCAGGAACAAAAGUGGAAGAACUGCUCUCAUGCUGGCCUGUGAGAUUGGCAGCUCUAACGCUGUGGAAGCCUUAAUUAAAAAGGGUGCAGACCUAAACCUUGUAGAUUCUCUUGGAUACAAUGCCUUACAUUAUUCCAAACUCUCAGAAAAUGCAGGAAUUCAAAGCCUUCUAUUAUCAAAAAUCUCUCAGGAUGCUGAUUUAAAGACCCCAACAAAACCAAAGCAGCAUGACCAAGUCUCUAAAAUAAGCUCAGAAAGAAGUGGAACUCCAAAAAAACGCAAAGCUCCACCACCUCCUAUCAGUCCUACCCAGUUGAGUGAUGUCUCUUCCCCAAGAUCAAUAACUUCGACUCCACUAUCGGGAAAGGAAUCGGUAUUUUUUGCUGAACCACCCUUCAAGGCUGAGAUCAGUUCUAUACGAGAAAACAAAGACAGACUAAGUGACAGUACUACAGGUGCUGAUAGCUUAUUGGAUAUAAGUUCUGAAGCUGACCAACAAGAUCUUCUCUCUCUAUUGCAAGCAAAAGUUGCUUCCCUUACCUUACACAAUAAGGAGUUACAAGAUAAAUUACAGGCCAAAUCACCCAAGGAGGCGGAAGCAGACCUAAGCUUUGACUCAUACCAUUCCACCCAAACUGACUUGGGCCCAUCCCUGGGAAAACCUGGUGAAACCUCUCCCCCAGACUCCAAAUCAUCUCCAUCUGUCUUAAUACAUUCUUUAGGUAAAUCCACUACUGACAAUGAUGUCAGAAUUCAGCAACUGCAAGAGAUUUUGCAAGAUCUACAGAAGAGAUUAGAGAGCUCUGAAGCAGAGAGAAAACAGCUACAGGUCGAACUCCAAUCCCGAAGGGCAGAACUGGUAUGCUUAAACAACACUGAGAUUUCAGAGAACAGCUCUGACCUCAGCCAGAAACUUAAAGAAACUCAGAGCAAAUACGAGGAGGCUAUGAAAGAAGUCCUUAGUGUGCAGAAGCAGAUGAAACUCGGUCUUGUCUCACCUGAAAGCAUGGAUAAUUAUUCACAUUUCCACGAGCUGAGGGUCACGGAAGAGGAAAUAAAUGUGCUAAAGCAGGAUCUGCAGAAUGCAUUAGAAGAAAGUGAAAGAAAUAAAGAGAAAGUGAGAGAGUUAGAGGAAAAACUGGUAGAGAGGGAGAAAGGUACAGUGAUUAAGCCACCUGUGGAAGAGUACGAGGAAAUGAAAAGUUCAUAUUGCUCUGUUAUUGAGAAUAUGAAUAAGGAGAAAGCAUUUUUGUUUGAGAAAUACCAAGAAGCCCAAGAAGAAAUCAUGAAAUUAAAAGACACACUAAAAAGUCAGAUGACACAGGAAGCCAGUGAUGAAGCUGAGGACAUGAAAGAAGCCAUGAAUAGGAUGAUAGAUGAACUCAAUAAACAGGUGAGCGAGCUGUCACAGCUGUACAAAGAAGCCCAGGCUGAGCUGGAGGAUUACAGGAAGAGGAAAUCUCUAGAGGAUGUCACAGCUGAAUAUAUCCAUAAAGCAGAGCAUGAGAAACUGAUGCAAUUGACAAACGUGUCCAGGGCUAAAGCAGAAGAUGCACUGUCUGAAAUGAAGUCUCAGUAUUCAAAAGUGUUGAAUGAGUUGACCCAGCUCAAACAACUGGUGGAUGCACAAAAAGAGAACUCUGUCUCUAUCACAGAACAUUUGCAAGUGAUAACCACGCUGCGGACUGCAGCAAAAGAGAUGGAAGAAAAAAUAAGCAAUCUUAAGGAACACCUUGCAAGCAAGGAAGUGGAAGUAGCAAAGCUGGAGAAACAACUCUUAGAAGAGAAAGCUGCUAUGACUGAUGCAAUGGUACCUCGGUCUUCCUAUGAAAAACUCCAGUCAUCCUUAGAGAGUGAAGUGAGUGUGUUGGCAUCGAAAUUAAAGGAAUCUGUGAAAGAGAAAGAGAAGGUCCAUUCAGAGGUUGUCCAGAUUAGAAGUGAGGUCUCACAGGUGAAAAGAGAAAAGGAAAAUAUUCAGACUCUCUUGAAAUCCAAAGAGCAAGAAGUAAAUGAACUUCUGCAAAAAUUCCAGCAAGCUCAGGAAGAACUUGCAGAAAUGAAAAGAUACGCUGAGAGCUCUUCAAAACUGGAGGAAGAUAAAGAUAAAAAGAUAAAUGAGAUGUCGAAGGAAGUCACCAAAUUGAAGGAGGCCUUGAACAGCCUCUCCCAGCUCUCCUACUCAACAAGCUCAUCCAAAAGGCAGAGUCAGCAGCUGGAGGCGCUGCAGCAGCAAGUCAAACAGCUCCAGAACCAGCUGGCGGAAUGCAAGAAACAACACCAGGAGGUCAUAUCAGUUUACAGAAUGCAUCUUCUGUAUGCUGUGCAGGGCCAGAUGGAUGAAGAUGUCCAGAAAGUACUGAAGCAAAUCCUUACCAUGUGUAAAAACCAGUCUCAAAAGAAGUAAAGUGGAUUCCUUGGCAGGACACUGCCCCUUGUCAUCUGUCUUUGUGUUAGAUCCAGAGUUGUCGGCAGCCGCUGCCAUUGUUCUCAUUCGUGGUAUGCACUGUGGCCUAGCGUAGCUUCUUCCCUUUCCAAAGGUUUCUGAGGACUUCUCCCAGGAGAAGACUGCCCGCCUCAGAACUGCUUAGAGACUUCAAACCAGCAGAGGUGAAAGUCCCUGUCAUCCCUUCAGAUUCCAGAGCUGGGAUCAGCCAUGCCCAGAGGUCUGGUCCUGAUGCUGGCAGGGGGGCCCCCUCCUCCAUCCCUGACUGGCUGAGUGGCUUUAUCACCACCGAGUGAUGUGCUGAGGCCUCCUGCAGUGAAUGCUCCUUCCAUUCCUGUACUCGGGCAGUGCCAUUCAGCACAGGAGAGCUCUUUUUGCCUUUGGCUUUCAAUUCCAAAACAUGAUUUAAUUUCUAACUAAAUUAGUAUGGCACUAGUUAUGAAGUAUCUGCUUAAAACCCUUCAUCAUGAUAUCCUGUGGAUUUAAAAACUCUAAUUCCAUGUUUUCUUCCCAUCUGCCUUAUAUAUCUCAUCACCCUGCUUAUCAAUAUUCAGUUUGAUGAGCACUAUUAACUAAAAUAUGAAACUUAAAAACAAAAGCAAGUUGUCCUUAAAAGUUCUUUUUUUAAGUAAAUUGUUGACAUACUGCAAAUUUUCUAUGCAAACUUGCCUCCUGCUGUUAUCUGUGAAGCUCAGGAAAUCCAAACAUUUGUGUUUCAACAAGGGACAGUAAACUGUGUGUUUACAGCCAAAAGAAAUGCCUCAUAGUUCUUAACCUCAACUUUUGUAGAAGUAUUUUUUUCUCUGUAAUAUUUUUAUUGGCUCAUAAAGAUGUUUUCAUAUCUGAACUCCUAAAUAAGUGAAAUUACAGUAGAUUAUAUUAACAAAAUACUUUUUAGGUAGCCAUGCUUGAGACUUUUUAAAAAUAUAACUUUUUCCUUAAAGUUUUCAGCUAUAGCAAAAGGUAGUUAUGUAUGCCAGACCUAAUAUGAGCUGCCACCAACACCCCUAGAACUUUCAGCCAUGGUGUCUUCAGAAUUGUAGCGCAUUUCUGAAUCUAGCAAAUCCUCCUUUUACCCGUUGAAUGUUUUGAAUGCCCUGACUCUACCAGCGCCCAUAAAUGAUCUCUAGAAGGACUGUUAGUACCAAUCUGUUUUUCAACUUUGAAGCUAAAAACCCUGAUAUGGUAAUAUUAUGGUGCAUAGCAGAGGUCUCGGAAAAAAAAUAUUUCUGUUCACUUUACUUUCAGGUUAAAAAUGUUUCUAACACGCUUGCAACUUCCCUUAUGGCAUUAAUCUUGUUGAGGGAGAGAGACAGAAUCCUGGACUCUCCAAAGUAUUUAACUGAAAGUAGGGCCUGCUCUGACAGGGCCCAUGUCCCACAAGGCUGCUUGGCCUCAGUGGGUGCUUGGCUGUGCUGGAUGAUAUGUUGAUCUGUAUUGGAUAAGGACCAAUGACAGCAAAGCAAAAAUGGCUUUAAAGCUUGGUGUUACUUUUCUUAAGUUGUUUAAUUAUAGUUAAGCAAUUUCAAAAAUGCUCCAAAGAAAUGUGAAAGGACCUUUUGUCACAGCACUUCAGAAAAUACACAACAGCCCCUUCUGCCCCCGCACAGAAAUGCUGCAGAGUAUAUAAAACUUGAGACAUUUUUGUAGGAUGCCUGACGAGGUGUAGCCUUUUAUCUUGUUUCCGGAUGCAUAUUUAUUACGAGUACUCUGGUUAAAUAUUGAAAAGUUAUAUGCUGUAGUUUUUAGUAUUUUGUCUUUGUA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1435.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1528.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 1122.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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