Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001146280.3

Sequence Length

1059 nt

GC Content

0.5836

AAGAGUUGUCUGAGCCGCCGAGUGGACAGUGGCUGAUUAUGGAGAGCAGAGGCCCACUGGCUACCUCGCGCCUGCUGCUGUUGCUGCUGUUGCUACUACUGCGUCACACCCGCCAGGGAUGGGCCCUGAGACCUGUUCUCCCCACCCAGAGUGCCCACGACCCUCCGGCUGUCCACCUCAGCAAUGGCCCAGGACAAGAGCCUAUCGCUGUCAUGACCUUUGACCUCACCAAGAUCACAAAAACCUCCUCCUCCUUUGAGGUUCGAACCUGGGACCCAGAGGGAGUGAUUUUUUAUGGGGAUACCAACCCUAAGGAUGACUGGUUUAUGCUGGGACUUCGAGACGGCAGGCCUGAGAUCCAACUGCACAAUCACUGGGCCCAGCUUACGGUGGGUGCUGGACCACGGCUGGAUGAUGGGAGAUGGCACCAGGUGGAAGUCAAGAUGGAGGGGGACUCUGUGCUGCUGGAGGUGGAUGGGGAGGAGGUGCUGCGCCUGAGACAGGUCUCUGGGCCCCUGACCAGCAAACGCCAUCCCAUCAUGAGGAUUGCGCUUGGGGGGCUGCUCUUCCCCGCUUCCAACCUUCGGUUGCCGCUGGUUCCUGCCCUGGAUGGCUGCCUGCGCCGGGAUUCCUGGCUGGACAAACAGGCCGAGAUCUCAGCAUCUGCCCCCACUAGCCUCAGAAGCUGUGAUGUAGAAUCAAAUCCCGGGAUAUUUCUCCCUCCAGGGACUCAGGCAGAAUUCAAUCUCCGAGACAUUCCCCAGCCUCAUGCAGAGCCCUGGGCCUUCUCUUUGGACCUGGGACUCAAGCAGGCAGCAGGCUCAGGCCACCUCCUUGCUCUUGGGACACCAGAGAACCCAUCUUGGCUCAGUCUCCACCUCCAAGAUCAAGAGAAGACUCUUCCACCUCUUUUUGCCUGAAUGGCCUUUGGGCACAAGGUCAGAGGCUGGAUGUGGACCAGGCCCUGAACAGAAGCCAUGAGAUCUGGACUCACAGCUGCCCCCAGAGCCCAGGCAAUGGCACUGACGCUUCCCAUUAAAGCUCCACCUAAGAACCCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-392.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -413.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 288.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((((((((((.((((((((((((((........((.(((((((((.....((...))....)))).))))).))))))))))..))))).).))........((((((((..((((((.(((((((((.(((.......((.((((.(((...(((((..(((((((((((((((........(.(((.((((((.((.(((((.((((.(((.((((((((..........(((((......(((((((.(((((.......))))))))))))(((.((((((...(((........))).)))))).))))))))..((((((.(((.((....((((.............))))....))...)))))))))....))))(((((((..(((((......)).)))....))))))))))).))))))).))))).))))).)))))).))))).))))))))))))))))..)))..)))))))))))))))))).))))))..(((((((...(((.((((((...)).)))).)))...(.((((........)))).)...(((((...)))))..)))))))....)))))).))(((((((((((.((((((.(.(.(((......))).).).)))))).)).(((((...(((.(((.......))))))..)))))..........((((......))))....(((((((.((.(((......))))))))....))))..((.....)).(((.((((((((........)).)))))).)))..))))))))).)))))))))....((((((.(((((((......((((..(((...))).....))))....))))))).)))).)).))))))(((((((((....((((.....(((....)))...)))).))))).)))).(((((...(((.(((......(((..((((.......))))..))).....))).)))(((((....)).)))..((((.......)))))))))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,(((({(((((((((((.(((((({(((((((........((.(((((((((,,...{{,..}}..}.)))).))))).}})))))))}..)}})).}.)),......,{{((((((..((((((.(((((((({{(({......,((.((((.(((...(((((..((((((((((((((,.......{(.((,{((((((.,{.(((((.(((,,(((.((((((((..........{((((.....,{((((((.(((((.......)))))))))))){((.{{{{{{,,.(((........)))})))))}.)}}))))}..((((((.(({.({....((((.............))))....))...)))))))))....))))(((((((..(((({......}).)))....))))))))))).))))))).))))).),))).)))))).)))))}})))))))))))))))..)))..)))))))))))))))))).))))))..(((((((...(((.(((((,...,).)))).)))..,((((((......,)))))||..,({{{{...)))}),.)))))))....)))))).,}(((((((((,((((((({,,{(((((......)}}}))},,{((.((((.((((,........}...}))).)))).))}.}.......,}}}}}||({......||||....||||(((.((.(((......))))))))....,,}}..{{,,...}}.(((.(({(((((........)).)))))).)))..))))))))).))))))))).,.|||{{{(.(((((((...,,,(({,..{,,||,|||.,..{|}||,,,.|}}}}}}.,|||{|..,,))))},,.,,|||..,{(((({...(((({,,(|||...,}}|{||,||{|||,.,,,,,}}}|}},})),.,...{((,.({{(....,,.)))}..)})},}}.,)),)))))))},},})}.}}},.{{{{.......})))}},.},,,,,.......