Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001161572.2

Sequence Length

2400 nt

GC Content

0.5942

AAUUCCGGGAAGCUCGCCUUACAACUCCGCGCGGCCUCGGCCCCCUGCGCCGCCCGCCCCACAACAAAACUCAGCGCAGCGCUCCCGGGCGCCCGGUUCAGAGCGACCUGCGGCUCAGAGCGGAGGGGAGACUGACCGGAGCGCGGAUCGGGACAGCGGCCGGGACAGCGGCGAGACGCGCGUGUGUGAGCGCGCCGGACCAAGCGGGCCCAGAAGCGGGUGAGGAACGCGGGACCAGGAGGACGGUCUGCAGCCCAGAGGGCACCUUCUGCAAACAUGUCUGUGGAUCCCCUAUCCAGCAAAGCUCUAAAGAUCAAGCGAGAGCUGAGCGAGAACACGCCGCACCUGUCGGACGAGGCGCUGAUGGGGCUGUCGGUGCGCGAGCUGAACCGGCAUCUGCGCGGGCUCUCCGCCGAGGAGGUGACACGGCUCAAGCAGCGGCGCCGCACACUCAAAAACCGUGGCUACGCCGCCAGCUGCCGCGUGAAGCGCGUGUGCCAGAAGGAGGAGCUGCAGAAGCAGAAGUCGGAGCUGGAGCGCGAGGUGGACAAGCUGGCGCGCGAGAACGCCGCCAUGCGCCUGGAGCUCGACGCGCUGCGCGGCAAGUGCGAGGCGCUGCAGGGCUUCGCGCGCUCCGUGGCCGCCGCCCGCGGGCCCGCCACGCUCGUGGCGCCGGCCAGCGUCAUCACCAUCGUCAAGUCCACCCCGGGCUCGGGGUCUGGCCCCGCCCACGGCCCGGACCCCGCCCACGGCCCGGCCUCCUGCUCCUAGUGCCCGCCCCCGCCAUGCCUCAGCCACGCCCCUCCGGCCUCAGCUCCCUCCCCAAAGUGCCUGAGCGCCGCCUCUGUGCCCAGGUCCCAUUUCUCUGCAGCACUGGCCCCUUGGUGCACACACAUUCCCUUCGUGGGCCCUGUCUUCCUCUUGCAGCCCCCCAAACUGGGACCGAAUGACCCUGGGAAGGGGAACUUGGGUAGGUUGGGGAUGGGGCAGAGGUCUGGAUCUGGGAUCGCCCUUGGCUGAAAGUUUAGCCUUUUUAGAUUGAGAGAUACAGAGCCGGCUUAGAGAACAGCUGUUGGGGGAGAAGAGGGCACCCCUCAUCUUGGAAACUGCUCUUAUUGUGCCAAUAUGCCCUCCAAACCCUCCCAGGAUUCAAAGCUAGGUUUGGCUGUCUGUGACUUACGGGACCGUCCUGCUGAGAAAUUGCACUGAAGAGAUGCCCCCACCUCUGGUUGGGCCUGGGGGUGCCUGGCCUUCCGAAACUAAAAGAGUGGGUGGGAAGACUAGUGAAACCCAGUUCACGGAUGGGGAAACAGGCCUGAGGUCACAUUUCACUUAGUGGUUGUGUUGGGACCAAAACCUGGGUGUCCUCACUGCUGCCCUGAGUCCAGCCAUGGUUUUCAGGGGGACAGUGGACAGGGACUCAGAAAUGUGGUGGGAGGGCCUCCCUGGCUUGGGAGACCGCUCUCUGCAAGGGAGGGGGAGAGAAGCAGAGGGAGAGAGAAGGUGACACGGAUGGAAGAGUGGGAAGGAGCUGGCCUGGCUCAGCCCUAGGCUGUCCCUGCAGCCAGGGUGUCCGGGGGCUGGCCAGUCAGAGAAAGGGGGCCAUGGACUGCUGUGGCAAAUAGGGAGACAAGGAGACAGACCCUGCAGUCCUACUACAGUCUGGAGUGGGGUCCUAAGAAGAAGGGUCCCACCUCAACCCCUGUCAGUGUCCACUGUGGGGUGGGGGCUGACCCCUGCCUUUGAUUGUCAUUCUCCUGGGAAGCCCAGUCUCAGUCCCUCCCCCAACACUGUCCACACUGCCCCUCCCCACUGUUUAUUUAUUGCACGGAUCUAAGUUAUUCUCCCCAGCCAGAGCCCGAGCUCCUGCUCCCUGGGAAAAGUGGCGUAUGGCCCUGAGCUGGGCUUUAUAUUUUAUAUCUGCAAAUAAAUCACAUUUUAUCUUAUAUUUAGGGAAAGCCGGAGAGCAACAACAAAAAAUGUUUAAGCCGGGCGCGGUGGCUCACAUCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGUCCAAGGAGGGGGAUCGCUUGAGUCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGACAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACAAAAAAUACAAAAAUUAGCCAUGCAUGGUGGCUCAUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCACUUAAGCCCAGAAGGCAGAGGUUGUAGUGAGCUGAGAUCGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCAAAAUCCUGUCUCAAAAAAAAAGUUAAAAAAUAUUGCCCGGCUCCUAGAAUUUAUUUAUUUCCUGACUUACAGCAAGCGAGUUAUCGUCUUCUGUAUUUUGUAGACUUUCUAAAUAAAGUCAAAUUCUUUCUUUUUCCACAGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-998.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1040.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 519.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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