Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001165030.3
Sequence Length
683 nt
GC Content
0.4451
GCAGUACUCGCUGGGCUGAGGUCGUCUCGGGUGAGGAGGUCGCGCCGGAAGUGGCUCUAGCCGUGGCGCUUCGGCGUAGUAAGGAGCCUGCAACAGAGUUUUGUUGUUUAGGGGGCGCGGCACCGCACCGCUCCCUUCACCUUGCAGCAGCCAUGGCGAAAGGCAGAGUCGCCGAACGAUCGCAGUUGGGCGCUCACCACACGACCCCCGUGGGGGACGGGGCAGCGGGGACGCGGGGUCUCGCGGCGCCUGGCAGCAGAGACCACCAGAAGGAAAAAUCCUGGGUAGAAGCUGGAUCAGCAAGAAUGUCACUCCUUAUAUUGGUGUCCAUUUUCUUAUCUGCAGCUUUUGUUAUGUUUUUGGUAUAUAAAAAUUUUCCUCAGCUUAGUGAAGAAGAAAGAGUGAAUAUGAAGGUUCCCAGAGAUAUGGAUGAUGCCAAGGCUCUAGGAAAAGUUUUAUCCAAAUACAAGGACACCUUUUAUGUUCAAGUACUUGUAGCUUAUUUUGCUACAUAUAUUUUGUAUCCUUUUAACUGAAAAAAUGUUUUCUAAUUUUGUUCAAGAAAAAGUGUAAAAGGUCUGCUCUUCAUUUAUACAUAACUAUUUUCCUUUUAAAAUUUGUUAUUGCAGUGUGACAAUAUUAAAUAAUUGAAAAAUUAAAAUGGAAAAAAAUUAUCACUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-212.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 170.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((((((((((((....((((((..(((...)))......((((((.(((....((((..(((((.((((((.....(((((((....)))))))..((((((((..((...))..))))))))...)))))).)).)))..))))...)))))))))(((.(((.......))).))).))))))..)))))((((((.....))))))..(((....)))((((((((((.((.....)).)).)))))).))...((((....))))...((((((((((((.((..((((((..((.((.......)).)).)))))))).)))..)))))))))....(((((((.....)))))))....))))))))))))).(((..(((((((((((((((((((((.((((...(((......)))...)))).))))........(((........)))...)))))))))))(((((..((((((.......))))))..))))).....((((((((((.........((((((...........))))))))).)))))))...))))))..)))...........((((((((((((.....((((((..(((((....))))).)))))).......)))))).))))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,...((((((((((((((,{(({,{,((((({..,,{|{|{|||,..{{({(({{.((({{{,((((..(((,,.((((((.....(((((({....}))))))..((((((((..((...))..))))))))...)))))),)).))),,)))}...)}}}|||,|(((.(((.......))).))))))),}}..,}}}}((((((.....))))))..(((....)))((((((((((.((.....)).)).)))))).))...((((....)))).|,(((((((((,{.,{{.,((((((.,((.{{.......))})}.)))))))),,})},))))))))},,,.(({{{{{.....)))))}}...)))))))))))))).{({{,.{({,((((((((((((((((.{({{.,.(((,,,,..|}}...}}}}.))}...,,.,,,|||,.......))).}))))))))))))|((((..((((((.......))))))..)))),..,,.(((((({{(((({(({{{..,,,,..}}}}}.,}},.,.,,,})}.)))))))..}})))))}.,......,,,,...((((((((((((..{({((((((..{((((....))))).))))))..,,,..)))))).))))))...,,,,........
Back