Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001166108.2
Sequence Length
5858 nt
GC Content
0.4423
ACAGUUGCCUCAAAGUGACCACGGACCAGGCAGUCUCUAAUGAAUAGGCAAGGCCACAACCUCCAUUCUCCCAGAAAAGAAGAAAUGCUCAUCUGAAAUUCAUCACCUCUCUGGAGUCUUCAAACUGACCAAGCAUUGAAAAGAACACAGUUUCAGAAAACAGUUUCCAGUGCCUCUGGCCUUCCUACUGAAAGCAGACACAGAGUGCAUGAAGACCGUUCAAAUAUGUCAGGGACCUCCUCCCAUGAGUCCUUCUAUGACUCCCUCUCAGACAUGCAGGAAGAAAGCAAGAAUACUGACUUCUUCCCGGGCCUUUCUGCUUUCCUCAGCCAGGAAGAGAUAAACAAGAGUCUUGACCUGGCCCGGAGAGCCAUAGCCGACUCCGAAACAGAAGAUUUUGACUCGGAAAAGGAGAUCUCGCAGAUUUUCAGUACUUCUCCUGCAAGCCUCUGUGAACAUCCUUCCCAUAAGGAGACCAAAUUGGGUGAACACGCCUCGAGGAGACCUCAGGAUAACAGGUCAACACCUGUCCAGCCUCUGGCAGAGAAACAAACUAAGAGUAUCUCUUCACCUGUUUCAAAGAGGAAACCUGCCAUGUCACCCCUGCUCACCAGGCCCAGCUACAUCCGGAGCCUCCGAAAGGCUGAAAAGCGUGGUGCAAAAACUCCCAGCACAAACGUAAAGCCCAAAACGCCACAUCAAAGAAAGGGUGGCCCCCAGAGCCAGCUGUGUGACAAGGCAGCUAAUUUAAUUGAGGAGCUAACAUCCAUAUUUAAAGCCGCAAAGCCAAGAAACAGAAGCCCAAAUGGGGAGUCCUCGUCACCAGACAGUGGGUACCUGUCUCCUAAAAAUCAGCCGUCAGCCCUGCUGAGUGCCUCAGCCAGCCAGAGCCCUAUGGAAGACCAAGGGGAGAUGGAAAGAGAGGUCAAGUCCCCUGGGGCCAGGCAUUGCUACCAGGACAACCAGGACUUGGCAGUGCCACACAACCGCAAGUCUCACCCACAGCCCCACAGCGCCCUCCACUUCCCAGCUGCACCUCGAUUCAUCCAAAAGCUGAGGAGCCAAGAAGUAGCAGAAGGGAGCCGAGUUUAUCUGGAGUGUAGAGUCACUGGAAACCCCACUCCUCGAGUCAGAUGGUUCUGUGAAGGGAAAGAACUGCACAACACUCCUGAUAUUCAAAUCCACUGUGAGGGAGGGGACCUCCAUACCCUGAUCAUAGCAGAGGCCUUUGAGGACGACACAGGUCGCUACACCUGUUUGGCUACGAAUCCCAGCGGCUCAGACACAACAUCUGCUGAGGUGUUCAUUGAAGGUGCCAGUUCAACAGAUUCUGACAGUGAAAGUUUAGCUUUCAAAUCAAGAGCUGGAGCUAUGCCACAAGCUCAAAAGAAAACAACUUCUGUUUCCUUGACAAUAGGAUCAUCAUCUCCAAAGACAGGGGUGACCACAGCUGUGAUUCAACCACUGUCUGUCCCUGUGCAACAGGUUCACAGUCCAACUUCAUAUCUCUGCCGACCUGAUGGAACCACUACUGCCUACUUUCCUCCUGUUUUUACAAAGGAACUGCAAAACACAGCCGUGGCGGAAGGCCAGGUGGUGGUUCUGGAGUGCCGGGUCCGUGGGGCACCCCCUCUGCAGGUCCAGUGGUUUCGGCAAGGGAGUGAAAUCCAAGACUCUCCAGAUUUCCGAAUUCUACAGAAAAAACCUAGAUCUACAGCUGAACCUGAGGAGAUUUGCACCCUAGUUAUCGCUGAGACUUUCCCUGAAGAUGCAGGGAUCUUUACAUGUUCAGCAAGAAAUGAUUAUGGAUCAGCAACCAGCACUGCCCAGCUGGUUGUCACCUCAGCCAACACUGAAAACUGUAGUUACGAGUCAAUGGGAGAAUCCAACAAUGACCACUUCCAACACUUUCCACCUCCCCCUCCAAUCUUGGAGACAAGUUCCUUGGAGUUGGCUUCAAAGAAACCAUCUGAGAUCCAGCAGGUGAACAACCCUGAGUUAGGCCUGAGCAGGGCAGCCCUUCAAAUGCAAUUCAAUGCUGCUGAGAGGGAAACGAACGGAGUCCAUCCCAGCCGUGGAGUAAAUGGACUGAUUAACGGCAAAGCUAACAGUAAUAAAUCUCUUCCAACACCAGCUGUCCUGCUUUCACCCACUAAGGAGCCACCACCUCUGCUUGCCAAACCAAAACUAGGAUUUCCAAAGAAGGCCAGUAGAACUGCUAGAAUAGCCUCCGAUGAGGAAAUUCAAGGCACAAAGGAUGCUGUUAUUCAAGACCUGGAACGAAAACUUCGCUUCAAGGAGGACCUCCUGAACAAUGGCCAGCCGAGGUUAACAUACGAAGAAAGAAUGGCUCGUCGACUGCUAGGUGCUGACAGUGCAACUGUCUUUAAUAUUCAGGAGCCAGAAGAGGAAACAGCUAAUCAGGACAUUGGUUCUCCUCAUGCUUCUGUAGGGAGUCCUCUGGAUGGUCAAAAGGAAUACAAAGUCUCCAGCUGUGAACAGAGACUCAUCAGUGAAAUAGAGUACAGGCUAGAAAGGUCUCCUGUGGAUGAAUCAGGUGAUGAAGUUCAGUAUGGAGAUGUGCCUGUGGAAAAUGGAAUGGCACCAUUCUUUGAGAUGAAGCUGAAACAUUACAAGAUCUUUGAGGGAAUGCCAGUAACUUUCACAUGUAGAGUGGCUGGAAAUCCAAAGCCAAAGAUCUAUUGGUUUAAAGAUGGGAAGCAGAUCUCUCCAAAGAGUGAUCACUACACCAUUCAAAGAGAUCUCGAUGGGACCUGCUCCCUCCAUACCACAGCCUCCACCCUAGAUGAUGAUGGGAAUUAUACAAUUAUGGCUGCAAACCCUCAGGGCCGCAUCAGUUGUACUGGACGGCUAAUGGUACAGGCUGUCAACCAAAGAGGUCGAAGUCCCCGGUCUCCCUCAGGCCAUCCUCAUGUCAGAAGGCCUCGUUCUAGAUCAAGGGACAGUGGAGACGAAAAUGAACCAAUUCAGGAGCGAUUCUUCAGACCUCACUUCUUGCAGGCUCCUGGAGAUCUGACUGUUCAAGAAGGAAAACUCUGCAGAAUGGACUGCAAAGUCAGUGGGUUACCAACCCCAGAUCUAAGCUGGCAACUAGAUGGAAAGCCCGUACGCCCUGACAGUGCUCACAAGAUGCUGGUGCGUGAGAACGGGGUGCACUCUCUGAUCAUAGAGCCAGUCACGUCACGUGAUGCCGGCAUCUACACAUGUAUAGCUACCAACCGAGCAGGACAGAACUCAUUCAGCCUGGAGCUUGUGGUUGCUGCUAAAGAAGCACACAAACCCCCUGUGUUUAUUGAGAAGCUCCAAAACACAGGAGUUGCUGAUGGGUACCCAGUGCGGCUGGAAUGUCGUGUAUUGGGAGUGCCACCACCUCAGAUAUUUUGGAAGAAAGAAAAUGAAUCACUCACUCACAGCACUGACCGAGUGAGCAUGCACCAGGACAACCACGGCUACAUCUGCCUGCUCAUUCAGGGAGCCACAAAAGAAGAUGCUGGGUGGUAUACUGUGUCAGCCAAGAAUGAAGCAGGGAUUGUGUCCUGUACUGCCAGGCUGGACGUUUACAUUUCUCGACAUUAAUAGUGAACCACACCAGGAGAACAAAUACCCAACCCAGUGGCAUCAGCAGUCACAGAGCACCAAGCCAAAAAAAGUACGGCCCUCAGCCAGUCGCUAUGCAGCACUUUCGGACCAGGGACUAGACAUCAAAGCAGCGUUCCAACCUGAGGCCAACCCAUCUCACCUGACACUGAAUACUGCCUUGGUAGAAAGUGAGGACCUGUAAUCCAGCAUUCUUGUUAAAGCUGAAACACUGAAACAGCCAUUGCCUUGACCAACAUAUUCCUUUGUCACAUUAUGUAAAAGGCAGAAACAUACCUUUGACUAUAAGAAAUUAAAAAAAAAACACCAAAAUAAUAUUUUUCUUACUUGAUAUACCAAACUUAGUUUAAGUAGAUAAUGCUAAUACAAAUAUACACAUUGCACAGAAAAUACACAUUUACUGUCCAAUUUAAAACUUUGGAAUUGCUGUGAUUAAAGUGAUCAAAAUGCCAAAAUACUAAAGGAAAUCAAUUGUUCACAGGUAACUACAAUUUGUAUUAUCUACAAGUGCCUUUAAACACAAGAUAUAGGUGCUGUGUAGCCUGAUAGUGUGAAAUGUUUAAUGAGGGAGUUGUACCACAAACAGUACUACAAUGAUUCUGAAGCACAGUGUAUUCAGACAGAUACAGUGAACCAAGUGCAAUAUGUAAGGAUGAAAGAAGAAGAGAUGACAAAGAAAUCCAAGUAAAUGCCUUGUCUUUGCAAAUGUUUUUAUAUUAAAUCAUAAGGAAGGAACUACUUGCCUUAAAUGUUAAUAUCAAAAGAGUUUUCUAACAAGGUUAAUACCUUAGUUCUUAACAUUUUUUUUCUUUAUGUGUAGUGUUUUCAUGCUACCUUGGUAGGAAACUUAUUUACAAACCAUAUUAAAAGGCUAAUUUAAAUAUAAAUAAUAUAAAGUGCUCUGAAUAAAGCAGAAAUAUAUUACAGUUCAUUCCACAGAAAGCAUCCAAACCACCCAAAUGACCAAGGCAUAUAUAGUAUUUGGAGGAAUCAGGGGUUUGGAAGGAGUAGGGAGGAGAAUGAAGGAAAAUGCAACCAGCAUGAUUAUAGUGUGUUCAUUUAGAUAAAAGUAGAAGGCACAGGAGAGGUAGCAAAGGCCAGGCUUUUCUUUGGUUUUCUUCAAACAUAGGUGAAAAAAACACUGCCAUUCACAAGUCAAGGAACCCAGGGCCAGCUGGAAGUGUGGAGCACACAUGCUGUGGAGCACACAUGCUGUGGAGAUUGCAGUGUGUCUGAGGUUUGUGUAGUAGUGGAAGAUUUUAGGUAUGUAGAGCAAGUUGAAAAUGGAUUGAGACUGCAUGGUGGCAUAAAUGAGAAAUUGCCUGUAGCAUCUAGUCUACUUGAAGGAAGUGGAGACAUAAGGAGAGACAAAAACAGGUUUG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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1666.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1778.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 1455.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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