Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001167618.3
Sequence Length
2716 nt
GC Content
0.4683
AGACGUUUCCUUGGCUCUUCUGGCGCCAAAAUGUCGUUCGUGGCAGGGGUUAUUCGGCGGCUGGACGAGACAGUGGUGAACCGCAUCGCGGCGGGGGAAGUUAUCCAGCGGCCAGCUAAUGCUAUCAAAGAGAUGAUUGAGAACUGGUACGGAGGGAGUCGAGCCGGGCUCACUUAAGGGCUACGACUUAACGGGCCGCGUCACUCAAUGGCGCGGACACGCCUCUUUGCCCGGGCAGAGGCAUGUACAGCGCAUGCCCACAACGGCGGAGGCCGCCGGGUUCCCUGACGUGCCAGUCAGGCCUUCUCCUUUUCCGCAGACCGUGUGUUUCUUUACCGCUCUCCCCCGAGACCUUUUAAGGGUUGUUUGGAGUAUGCAAAAUCCACAAGUAUUCAAGUGAUUGUUAAAGAGGGAGGCCUGAAGUUGAUUCAGAUCCAAGACAAUGGCACCGGGAUCAGGAAAGAAGAUCUGGAUAUUGUAUGUGAAAGGUUCACUACUAGUAAACUGCAGUCCUUUGAGGAUUUAGCCAGUAUUUCUACCUAUGGCUUUCGAGGUGAGGCUUUGGCCAGCAUAAGCCAUGUGGCUCAUGUUACUAUUACAACGAAAACAGCUGAUGGAAAGUGUGCAUACAGAGCAAGUUACUCAGAUGGAAAACUGAAAGCCCCUCCUAAACCAUGUGCUGGCAAUCAAGGGACCCAGAUCACGGUGGAGGACCUUUUUUACAACAUAGCCACGAGGAGAAAAGCUUUAAAAAAUCCAAGUGAAGAAUAUGGGAAAAUUUUGGAAGUUGUUGGCAGGUAUUCAGUACACAAUGCAGGCAUUAGUUUCUCAGUUAAAAAACAAGGAGAGACAGUAGCUGAUGUUAGGACACUACCCAAUGCCUCAACCGUGGACAAUAUUCGCUCCAUCUUUGGAAAUGCUGUUAGUCGAGAACUGAUAGAAAUUGGAUGUGAGGAUAAAACCCUAGCCUUCAAAAUGAAUGGUUACAUAUCCAAUGCAAACUACUCAGUGAAGAAGUGCAUCUUCUUACUCUUCAUCAACCAUCGUCUGGUAGAAUCAACUUCCUUGAGAAAAGCCAUAGAAACAGUGUAUGCAGCCUAUUUGCCCAAAAACACACACCCAUUCCUGUACCUCAGUUUAGAAAUCAGUCCCCAGAAUGUGGAUGUUAAUGUGCACCCCACAAAGCAUGAAGUUCACUUCCUGCACGAGGAGAGCAUCCUGGAGCGGGUGCAGCAGCACAUCGAGAGCAAGCUCCUGGGCUCCAAUUCCUCCAGGAUGUACUUCACCCAGACUUUGCUACCAGGACUUGCUGGCCCCUCUGGGGAGAUGGUUAAAUCCACAACAAGUCUGACCUCGUCUUCUACUUCUGGAAGUAGUGAUAAGGUCUAUGCCCACCAGAUGGUUCGUACAGAUUCCCGGGAACAGAAGCUUGAUGCAUUUCUGCAGCCUCUGAGCAAACCCCUGUCCAGUCAGCCCCAGGCCAUUGUCACAGAGGAUAAGACAGAUAUUUCUAGUGGCAGGGCUAGGCAGCAAGAUGAGGAGAUGCUUGAACUCCCAGCCCCUGCUGAAGUGGCUGCCAAAAAUCAGAGCUUGGAGGGGGAUACAACAAAGGGGACUUCAGAAAUGUCAGAGAAGAGAGGACCUACUUCCAGCAACCCCAGAAAGAGACAUCGGGAAGAUUCUGAUGUGGAAAUGGUGGAAGAUGAUUCCCGAAAGGAAAUGACUGCAGCUUGUACCCCCCGGAGAAGGAUCAUUAACCUCACUAGUGUUUUGAGUCUCCAGGAAGAAAUUAAUGAGCAGGGACAUGAGGUUCUCCGGGAGAUGUUGCAUAACCACUCCUUCGUGGGCUGUGUGAAUCCUCAGUGGGCCUUGGCACAGCAUCAAACCAAGUUAUACCUUCUCAACACCACCAAGCUUAGUGAAGAACUGUUCUACCAGAUACUCAUUUAUGAUUUUGCCAAUUUUGGUGUUCUCAGGUUAUCGGAGCCAGCACCGCUCUUUGACCUUGCCAUGCUUGCCUUAGAUAGUCCAGAGAGUGGCUGGACAGAGGAAGAUGGUCCCAAAGAAGGACUUGCUGAAUACAUUGUUGAGUUUCUGAAGAAGAAGGCUGAGAUGCUUGCAGACUAUUUCUCUUUGGAAAUUGAUGAGGAAGGGAACCUGAUUGGAUUACCCCUUCUGAUUGACAACUAUGUGCCCCCUUUGGAGGGACUGCCUAUCUUCAUUCUUCGACUAGCCACUGAGGUGAAUUGGGACGAAGAAAAGGAAUGUUUUGAAAGCCUCAGUAAAGAAUGCGCUAUGUUCUAUUCCAUCCGGAAGCAGUACAUAUCUGAGGAGUCGACCCUCUCAGGCCAGCAGAGUGAAGUGCCUGGCUCCAUUCCAAACUCCUGGAAGUGGACUGUGGAACACAUUGUCUAUAAAGCCUUGCGCUCACACAUUCUGCCUCCUAAACAUUUCACAGAAGAUGGAAAUAUCCUGCAGCUUGCUAACCUGCCUGAUCUAUACAAAGUCUUUGAGAGGUGUUAAAUAUGGUUAUUUAUGCACUGUGGGAUGUGUUCUUCUUUCUCUGUAUUCCGAUACAAAGUGUUGUAUCAAAGUGUGAUAUACAAAGUGUACCAACAUAAGUGUUGGUAGCACUUAAGACUUAUACUUGCCUUCUGAUAGUAUUCCUUUAUACACAGUGGAUUGAUUAUAAAUAAAUAGAUGUGUCUUAACAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-840.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -897.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 750.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(.(((((..((((((..((((((((...((((.((.(((((((.((((....((((((((((((....(((((((((..(((.((((((.(.(((((.........(((((((....))).((((........))))..(((((((((.(((((((((((((.............)))).))))....((.(((((((((.....)))))))).).)).......((((((.....(((((((.....))))))).....((((....)))))))))))))))..)))))))))..)))).......))))).).).))))))))...)))))))))(((....))).........(((((((((((((..((((((((.(((((((.(((..((.((((((......(((...(((((.....))))).)))..)))))).)).((((((((.(....(((.((((((.(((((((.(((((...)))))))).))))............(((.((((((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((.((((..(((((.((((....)))).))))).((((((.............))))))..(((((.(..(((.....((((((((((........)))((((..(((((...(((.((..((((...((....)).))))..)).))))))))..))))....(((((...(((.(((........)))........(((.((.....)).)))........)))....)))))((..(((((........)))))..))....(((((((.(((....)))...))))))))))))))..)))..).)))))..)))).))))))...(((((.....)))))((((....))))....((((((((.....))))))))..(((((((((((((.......)))((((((((...)))).)))).))))))))))............(((((((.(((........))))))))))..((((.....))))...........))))))...))))))))).....((((..((((.....))))......))))..........(((.....)))..))))))))..((((((((.(((((.(((......)))..)))))..(((.((((....)))).)))....((((.(((((((((((.((((.(((.(((.............))).))).))))......))))))))))).))))...............((((......))))....))))))))..))))))))))).))).......(((((.(((..((((((....)))))).))).)))))........))))))..)))...).)).)))))).....)))))))).)).)))).))))..)))))))).))))).))))))))).)))...)))).))))))).)).))))..(((((....))).))(((((((((.((...((((((......)).))))....)).)).)))))))....)))).))))......)))))).))))).)........(((((((((((((((((((.(((((((((((((.....((((((.((...((........(((((((((...)))))))))))...)).))))))..((((((.....(((.((((((((((((((.........(((((((.....((((.......((((.....((((((.(((.(((....(((........)))....)))))).))))))...))))..((((......))))(((((((.(((((.....)))..)).)))))))..........))))..)))))))........)))))).(((((..(.(((......))).)..)))))..(((...(((((....)))))...)))((((((((((((((((..(((((((((..((..(.............)..))..))))))))))))))...(((((((.(((((((...(((((....((.....((((.((((((((((((((((.((((((((.........))).))..)))))))))))))))(((.((((.(((((((.....)).)).))).)))).)))..)))).))))))..)))))...))))))).)).)))))...)))))).)))))((((((((...(((((((.............)))))))..))))))))..(((((.......))))).((((....))))))))).))).)))..))))))...))))))(((...((((((((.(((((..((((...(((((......)))))((((((.(((.....))).))))))..))))..)))))....))))))))..)))...........((((((.....(((((((((((..((((((...(((..((..((((....((...))...))))...))..)))...))).))))))))))))))..))))))))))))))))...(((((((....))))))).((((((((......(((((((((((((....))))))).)))))).....))))))))...)))))).))).)))))))..(((((....(((...........)))...)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((({{{,.{((((,(,...)).))))),,|,||((((((.((.(((....})).)).)).))))||{|.(((((((((.,(((,((((({,(,(((((......,|.(((((((....))){(((......}},),,,{.{((((((((.(((((((((((((,{{,........,}}}}.}}})},..,{,,((((((((.....)))))))).}.,||||....|||||}}}.|.(((((((.....))))))),....((((({...))))))}))}))))..)))))))))}.)))),,,,,,,}}})),).).}}))))))...})))))))){{{{...,,((((({...})))))..,,))}}{({{...(((((((..((((..(((.((.(((({....((((((((((((.....)))))..(((......)))....(((((((((((((((((.{{(((((((((.((((((((((((.(((((.((...(((..(((((((((....,,.((((((((.......,((((.((,.((((.,.(((((({{,.,((((.,{((,,..||||.}||||.,,,,,,...,......,}|||}}}}...,|||||...},},}},..,,.}||{|.,,.....))))}))))})})..}}.)))))))))))),,))))))))).)))...))))))).)))))))}},}))}......(((((.{,.,...{(((((.{((,.((((.((.....}}.)})}....)))),)))))}{,,(({{((((,{..{{,,,,,,{,{{({{(((.(((((((.(((....)))...)))))))})).}))}.))),.,},...)))).,,))))})},)))))))))))))))}.((((((((((((((((,,((((((,{{{,||||||||..((((((((((,((.......)}|((((((({...}))).)))),)))))))))).....}},.}}}||{((({(({{...,||||}}}||||||{,.,,,...{({(({{(({{{,,.{((({{({{({,..{,,{,,{.,,,,(((({{{({((.....,||......,|||,,.,......(((,,,..|.|,.,,|.,{{{,.((((((((.(((((.(((......)))..)))))..(((.((((....)))).)))..,.((((.(((((((((((,(((({(,,.,||}}..,,.,,{,..}}}.}}}.))))......))))))))))).))))....,,.....,,,.((((......))))....)))))))),.}||}}....},,......|,,,(((((.(((..((((((....}))))).))).)))))...{{,{(({,{{,|||{{||||||,,{{,,{(((({{,{{{((({.,(((((((((.(((((((........((((.(((({..{((,,..((((.((((((({{(({{{,.......},})))).))))))))))).((((((....{.((.((..(({.(.....}})))..)).)).}..,.))))))........,.))))))).)))).........))))).)).))))))))},,{{{{{{.,..,,....((((((.((...((,.......(((((((({...)))))))))))...)).)))))).,,.||||||..,|||,.,...((((((.,.,....((((((((,.........{(((({...,((((((..,,((,.,..{|,...))..,)))}.))}}}))))))))))))))).,}.))))))...{{{{,,,,,.)))){{|||||,{{,{{,...,))),.}},))}}}))..........}}}.,..)))))),.......}}}}}}},}.}},}..,})))))}})}))}..,,....})))....||||....))))}.,{{{,((((({{{((((.{{{,..||}},.,},,,,.}}.,}}}}.)}}}}.}}}}},)),)))}||||||||,},||||{||||((((({...{{{||,,..||,,..|||||,|||{{((((((((((,,(({{{({(.,....,,.))).)}.,))))))))))))))){({.{(((,((({{((.....)).}}.,)),)))).)))..}}}).}))})}.,|}}}}.,.))))}}..}}}))})).}))),})})))))}{(((((((...(((((((,...........})))))))..))))))))..,,..,,,,,{((((.((.((((....))))..)).))))},{{(((({{.....,)))))))|...((((((((.(((((..((((,,,(((((......)))))||||{{,(((,....}},.)))))),.))))..))))),.,.}}})))))..,,,...)))))).)}))))))))).(((((((((((..((((((...(((..{{.,,,((,...{{,..,},},)))}.,.}}..)))...}}}.)))))))))))))),.))))))))).))).)))))(((((({....))))))).((((((((......(((((((((((((....))))))),,))))).....)))))))))))))))..))))}.))))).))))...)))))))...})),........,}.,})))}........
Back