Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001172643.1
Sequence Length
4678 nt
GC Content
0.4994
GCCAAGUUAUGGGUGCGUUCUGCCAGCGUCCUAGCAGUGAUAAAGAACAGGAAAAAGAGAAAAAAUCAGUGAUCUGUGUCGAGGGCAAUAUUGCAAGUGGGAAGACGACAUGCCUGGAAUUCUUCUCCAACGCGACAGACGUCGAGGUGUUAACGGAGCCUGUGUCCAAGUGGAGAAAUGUCCGUGGCCACAAUCCUCUGGGCCUGAUGUACCACGAUGCCUCUCGCUGGGGUCUUACGCUACAGACUUAUGUGCAGCUCACCAUGCUGGACAGGCAUACUCGUCCUCAGGUGUCAUCUGUACGGUUGAUGGAGAGGUCGAUUCACAGCGCAAGAUACAUUUUUGUAGAAAACCUGUAUAGAAGUGGGAAGAUGCCAGAAGUGGACUAUGUAGUUCUGUCGGAAUGGUUUGACUGGAUCUUGAGGAACAUGGACGUGUCUGUUGAUUUGAUAGUUUACCUUCGGACCAAUCCUGAGACUUGUUACCAGAGGUUAAAGAAGAGAUGCAGGGAAGAGGAGAAGGUCAUUCCGCUGGAAUACCUGGAAGCAAUUCACCAUCUCCAUGAGGAGUGGCUCAUCAAAGGCAGCCUUUUCCCCAUGGCAGCCCCUGUUCUGGUGAUUGAGGCUGACCACCACAUGGAGAGGAUGUUAGAACUCUUUGAACAAAAUCGGGAUCGAAUAUUAACUCCAGAGAAUCGGAAGCAUUGCCCAUAGGAGGCAAAAGGUCUAUGGCUCAUGUCUGAAAAAUGCCUGCUGCUGCCAAGUUAGCUAUUGGGAGCAAUCUGGAAAAACUUGCUCCCAGGAGGGCUUUGUGUCUGGCCAGCUUGAUUUUCCUAAUGGUCUCAUCUCCUUUGCUAGUGUCUUUGUCAUGCGUCUCUGGCCCUCGUGGGUAAAUGACAAACGGGACCAAUGGGUUUGCCAAGCCCUUUGCUGUUCGCAGCCUCACAUUCCCCCGGUGCCUCUCCCAUGGCUUUGUGCUGCUGAGUCGCUCUCAUGAAGCCCUUAGGGAGAGCACCUGUUGUGUGCCUGACACCACGCUGGAGCUGUGUACCAAUCGUCUCAGCCUUCAUUAGGAGGCCGAGGUAGGAGUCUUAUAUCCCAGGUGAGGAAUUUGAAGCUCAGAAAGGUUGAGGGGCUCCCCAGAGGUCACACAGCCUGUGUGCAGUGGAGCUGGCACCAUUCAGACUUUCAGCCGACUCAGCAACUUUCCCUUGCCCUGGGCUGCCUCCUCCUGAGAGCUGUUCCCCACCGCCCUGCCUCUUCCGGUUGGAGGCUCUCAUGUCUCUUUGGGGAGAGCUGGCAGUGUGCGGAGCUGAUAACAUUUUCCCAAUAUUGAGCAGUUCCCAAGGACAGUCAGCAUUUCUAGACUUCCACAAAAUUAUGCUGCAUUUGGCUGGAGCCCGGUGUUCAGUGGUUUCCCUGCCCGAGGUCGCUGCAGCCCCAUCUACCACAUCUUCAUGUGGACAUUGAGAUUCACAUGCUGGCUCCUGAAGGGUGCUCAGUCUCCUUGGUGAUUAAGGUCCUGCUUGAACUGCUGCCAACUCCAUGUCAGGGAAGUCGCUUUUGGUGCCUGGCUGGUUUGCCCAGAGCCAAGCUGGGGCAAGGGGCAGCCAGCCCUGGCUUCCAAGGCUCCCGUACUGUCUGUGUCCUUGUAUAAGGAGCUUUGCUCUUGGAAUUACUGAAAGUCUGUGGCCCAAGAGAGAGACACAAGUGGCCUUAAGUCUUUUUGAAGUGUUAUUUCAUCCAGGGAAAUGCCUCGAGCCAUAGAGCCUGAAAUCAUCUUUGUUGGCUCAGAAAAUACCUUAGCUUCACUCAGCUGGACUGCAUUGAAGGCGAGGCUGCCCCUUGGAUCAAGCAGAAAACAAGAGAAAGAAAGAACGUUCCCUUUGGGGAUAGUCUGGAAAGUUGGGAUUUGCAAAUAAAGGCUCUGGAAGCAUUGCUGGUCCUGAAGCUUUGGAGGUGGGCAGAGAGAGCUUCAAGAAGACUAGAUGCAAACCCUGGAAAGGAUUAAGGCUCAACUCUGGAGAAACAGGCCACAGCCUCUCAGAGCAGCUGUUGGCUGUAAAUAGAGGUAGCAAGGCCGCUCCCAGGCCCCUGUGAGUGUGGGCACCUGUGCAUGCAAUGCUCCGACUCUGCAGAGGUGCCAAGUGCCCCUGCUGGGCCAGUCCCAGAGAGUUAGGAAGUCAAGGCCUGCAACUCCUGGUUCUUCCUGUUUGGACCAGUUCUUGUGCCAUUGGCAGGAUGAGAGGCAGCAGCCAGGCGGGAGCUGUGUCUAGCAGCACCUGUAGCCCACGUGCUGCUAAUUAGCUGGAAAACUGGCGAAGGCAGAACCUUUGCUACCAGGAAUCUUGACAUGUGGGGUCUGUCUUUGAGAAUUUGUAAAUGAACAGUCCAAUAUUUCCUCUCGGCUCAUUUUGCACAUCCAUUUUUGGGGAAAUGUGAUUUCUCUCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCCUAAGGCACAAUCUCAAGAGGUCCUGAGACCACGUACCCAUGAUUUUUUUCUUGCUCUGUGAUACCCAAUAACUCCUUCACCUAAGCCCUGUUGUUGAUUUUGAAGUGCUUCCUAGGCCAGUGAUUUUAGCUUCUGCCAGCUGCUUUUGCCAGUAGAUUAACGUGUUUUUAUUUUUCAAACUCCGUGUUUCCUAACGUGGAGUGUAUGGGUCUAAGAGAGCCUGCUGUCCUCCCUGCCUUCCACCUUGGAGAGGAGGCUGGACGCAUCAGCAGUGGCCAGGGCAGGUCGCAAAAUCUCCCAGCCUAGAGACCACACCUGAAACGGCUGAAGCCAGCUUGCACAAGGGCUGCUGUCCCUCUGCGGCAGGCAGAGCUGGUGGGGGCAGGGGUCACAGAGCAGUCAUAGACACCAUGGACCAGGGCAGGAGAAGGGCAGAUGGCACAUGGGCACAACAGGGCCUUGUCCUUAGAGCACUGGGGGGUCAUGGCUGGGAGGGGCAUGGCAGGGGCUGGCAUCCCUGUAGAGCCAGAGGGGCCACCCAGGGCAGUGACAUUCCAGAUAUGUUGGGCUCACCUCAUCCUUGCUGUGAGACUGGAGUUCCAUGGGGACAUGAAGUCAGUACACCGCAGAGCUGCUCAGCUGCUCUACCUCUCGCUGACUUUUUUGUUGCACAUAUACAUUUUCUUUCAAUUAGCAUUUAUUUCAGCUUUUAUUUAAGCUUUUUGACAGUACAUGUAAAAUAUAUGAUUAUAACCAUUUAAAAAUACCUUAUGUACCUGGUUUUUUUUGGAAACUAGAUAGAAAUAUAUUUAUCUUUUACAUAAAAGAAGUGUGUAGUGGGGUGGUCCAGGGCUUUGUGGUGGCUUAGUGGCCAUCGGGGUCCCAGGCUCUUCCCACCUUUCUCUUUUGGGUCCACCUCUUGGCUCCUGGCUUCCUUCCUCUGGGGCCUGACUGUCCAGGAUGGCAGCUGGAGCUCCUGCUCUGGGCACGGUUGGCAUCAGAGCCCACUGCUCCCCAUCCACUCUUUAAUCCAGAUGCUGGUAAUGUCCCUUUCCAAGGCAUAACUAAGAUAAGCUGGAAGGUUCUUACGAGGCUUUGCUAGAGGCCCUGGGAGGUGGGGGGAAAGGCAAGAGGGCAGUGCCCACCCAUAGACCGGGUCACAUGACCUGGCAUCAGCGCCGUGGGGUCCUUUGGGCUUCACCUCCCUCUCCCCUCUGCCCCCACGUCAUCCCACCCUCAUCCUCACCCUCACCAUUCCCAUCCCGUACCGUAAUGUCCCUUGCAAGGCCUAACUCUGUGAGGAAUGAAACCACCUCAUCCUUGUUCCAAUAACAUGAGUGACCGAAUUUACAAACGAGUGAAUGUGGACCUCUGGAAACAUUACCCAGCUUGUUUUUACUUUUCACUUUCUCUUUCUGCCCCUUUCAUUUCCGUAGGAGCCCUUUACCUAGAUGAGAAGUGUCCCCCCGCCUGGGGAAUAUAUCAGUCAGAACAAUCUUCCUGCAGACAUGCACCAUUAGACCCGAGUGACGGUGGUGCCAUUUAAACCUCAGAGCAGGUAAAAGGUGGUCCUGAAACCUGUCUACCCACAGGGUGCUAUGGAAUCUGAAUCACUUCUUUUUUCCUAGAGCCCUGGGGUGGGGAGCUCCCUCAAGUGUUCACAUGUGUGUGGAAUGAGGAACACCCAUCUCCUUGGCCCUCUCCACCCUGAAGAGUUAGUUAUUAAAAUAAUUGGCAAGCUCUUGCAAAUGUCAGUCAUCCAUUGUUCAGAAUGGAAUAGCAAUAAUACAUCCCUGGCUGCCCUGGGCUUGGCCAGGAUUACUCACUGAAGGCCUCAGGGUUACUGGCACACACUUUCUUUUCCUAAUAAUCCCAUCCCCUCAGCUUUCCUAAGGCUAGAGUGAAUUUCGUGUUCCUUUAGUUUACAUAAGAUGGUGAACUUGGCAAAAGCUAUCAUUAAACAGAAGCUAAGAGAAAGCCUAUGUCGUGGAAUCCAGAAUGGGUAUUGCCAUUCACUGCUGUCCACAGAAGCUGUCUUGAAUUUCUUUCUGUGUCUUUUCUUUUUUUUUCUUUAAGACUGUUGUUUACCAGACUGGGCUCUGUGGAACACAGGUGUCCUGGGAGAUGGUUAAUCAUUACAAAAUAUUGGUAACAAUCUAAAGAUGCAUACAUAAGAGAGUGGUCAAAUAAACCAUUUUCCAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1640.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1723.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 1039.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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