Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001172646.2
Sequence Length
5581 nt
GC Content
0.4023
ACACACAGACACACACACGCACACGCACACACGGGCGCGCACACACACGCGCGUACACACUGGGUCUCCAGGCAGCGGCCGUCGCCGCAUCCCCGGCAGCAGCUCCAGGCAAAGUGACAGAGGACAGUGCUGCUGUGAGUUUGACGAAGUGGACAUCACCUGCAGUCAGUCCAGAGCUGCCCAGUCUUGAAUAUAAUCAUGGCCAAACCUUAUGAAUUUAACUGGCAGAAGGAAGUUCCCUCCUUUUUGCAAGAAGGAGCAGUUUUUGACAGAUACGAGGAGGAAUCCUUUGUGUUUGAACCCAACUGCCUCUUCAAAGUGGAUGAGUUUGGCUUCUUUCUGACAUGGAGAAGUGAAGGCAAGGAAGGACAGGUGCUAGAAUGCUCCCUCAUCAACAGUAUUCGGUCGGGAGCCAUACCAAAGGAUCCCAAAAUCUUGGCUGCUCUUGAAGCUGUUGGAAAAUCAGAAAAUGAUCUGGAAGGGCGGAUAGUUUGUGUCUGCAGUGGCACAGAUCUAGUGAACAUUAGUUUUACCUACAUGGUGGCUGAAAAUCCAGAAGUAACUAAGCAAUGGGUAGAAGGCCUGAGAUCAAUCAUACACAACUUCAGGGCCAACAACGUCAGUCCAAUGACAUGCCUCAAGAAACACUGGAUGAAAUUGGCAUUUAUGACCAACACAAAUGGUAAAAUUCCAGUUAGGAGUAUUACUAGAACAUUUGCAUCGGGAAAAACAGAAAAGGUGAUCUUUCAAGCACUCAAGGAGUUAGGUCUUCCCAGUGGAAAGAAUGAUGAAAUUGAGCCCACAGCAUUUUCUUAUGAAAAGUUCUAUGAACUGACACAAAAGAUUUGUCCUCGGACAGAUAUAGAAGAUCUUUUCAAAAAAAUCAAUGGAGACAAAACUGAUUAUUUAACGGUAGACCAAUUAGUGAGCUUUCUAAAUGAACAUCAACGAGAUCCUCGAUUGAAUGAAAUUUUAUUUCCAUUUUAUGAUGCCAAAAGGGCAAUGCAGAUCAUUGAGAUGUAUGAACCUGAUGAAGAUUUGAAGAAAAAAGGCCUUAUAUCAAGUGAUGGGUUUUGCAGAUAUCUGAUGUCAGAUGAAAACGCCCCAGUCUUCCUAGAUCGUUUAGAACUUUACCAAGAAAUGGACCAUCCUCUGGCUCACUACUUCAUCAGUUCUUCCCAUAACACUUAUCUCACUGGCAGACAGUUCGGCGGGAAGUCUUCGGUAGAAAUGUACAGACAGGUUCUCCUGGCUGGUUGCAGAUGUGUUGAACUUGACUGCUGGGAUGGAAAAGGUGAAGACCAAGAACCAAUAAUAACUCAUGGAAAAGCAAUGUGUACAGAUAUCCUUUUUAAGGAUGUAAUUCAAGCCAUCAAGGAAACUGCAUUUGUCACAUCAGAAUAUCCUGUAAUUCUCUCCUUUGAAAAUCACUGCAGCAAAUAUCAACAGUACAAGAUGUCCAAAUAUUGCGAAGAUCUAUUUGGGGAUCUCCUGUUGAAACAAGCACUUGAAUCACAUCCACUUGAACCAGGCAGGGCUUUGCCAUCCCCCAAUGACCUCAAAAGAAAAAUACUCAUAAAAAACAAGCGGCUGAAACCUGAAGUUGAAAAAAAACAGCUGGAAGCUUUGAGAAGCAUGAUGGAAGCUGGAGAAUCUGCCUCCCCAGCAAACAUCUUAGAGGACGAUAAUGAAGAGGAGAUCGAAAGUGCUGACCAAGAGGAGGAAGCUCACCCCGAAUUCAAAUUUGGAAAUGAACUUUCUGCUGAUGACUUGGGUCACAAGGAAGCUGUUGCAAAUAGCGUCAAGAAGGCUUCAGAUGACCUUGAACAUGAAAACAACAAAAAGGGCCUGGUCACUGUAGAAGAUGAGCAGGCGUGGAUGGCAUCUUAUAAAUAUGUAGGUGCUACCACUAAUAUCCAUCCAUAUUUGUCCACAAUGAUCAACUACGCCCAGCCUGUAAAGUUUCAAGGUUUCCAUGUGGCAGAAGAACGCAAUAUUCAUUAUAACAUGUCUUCUUUUAAUGAAUCAGUCGGUCUUGGCUACUUGAAGACACAUGCAAUUGAAUUUGUCAAUUAUAACAAACGGCAAAUGAGUCGCAUUUACCCCAAGGGAGGCCGAGUCGAUUCCAGUAAUUACAUGCCUCAGAUUUUCUGGAACGCUGGCUGCCAGAUGGUUUCACUGAACUAUCAAACCCCAGAUUUAGCGAUGCAAUUGAAUCAGGGAAAAUUUGAGUAUAAUGGAUCGUGCGGGUACCUUCUCAAACCAGAUUUCAUGAGGCGGCCUGAUCGAACAUUUGACCCCUUCUCUGAAACUCCUGUUGAUGGUGUUAUUGCAGCCACUUGCUCAGUGCAGGUUAUAUCAGGUCAAUUCUUAUCAGAUAAGAAAAUUGGCACCUACGUAGAGGUGGAUAUGUAUGGGUUGCCCACUGACACCAUACGUAAGGAAUUCCGAACUCGCAUGGUUAUGAAUAAUGGACUCAAUCCAGUUUACAAUGAAGAGUCAUUUGUAUUUCGGAAGGUGAUCCUGCCGGACCUGGCUGUCUUGAGAAUAGCUGUGUAUGAUGAUAACAACAAGCUGAUUGGCCAGAGGAUCCUCCCGCUUGAUGGCCUCCAAGCCGGAUAUCGACACAUUUCCCUUCGAAAUGAGGGAAAUAAACCAUUAUCACUACCAACAAUUUUCUGCAAUAUUGUUCUUAAAACAUAUGUGCCUGAUGGAUUUGGAGAUAUCGUGGAUGCUUUAUCAGAUCCAAAGAAAUUUCUCUCAAUUACAGAAAAGAGAGCAGACCAAAUGAGAGCUAUGGGCAUUGAAACUAGUGACAUAGCCGACGUGCCCAGUGACACUUCCAAAAAUGACAAGAAAGGAAAGGCCAACACCGCCAAAGCAAAUGUGACCCCUCAGAGUAGCUCUGAGCUCAGACCAACCACCACGGCUGCCCUGGCCUCUGGUGUGGAAGCCAAGAAAGGUAUUGAACUUAUCCCUCAAGUAAGGAUAGAAGACUUAAAGCAGAUGAAGGCUUACUUGAAGCAUUUAAAGAAACAGCAGAAGGAGCUAAAUUCUUUAAAGAAGAAACAUGCAAAGGAACACAGUACCAUGCAGAAGUUACACUGCACGCAAGUUGACAAAAUUGUGGCACAGUAUGACAAAGAGAAGUCGACUCAUGAGAAAAUCCUAGAGAAGGCAAUGAAGAAGAAGGGGGGAAGUAAUUGUCUCGAAAUGAAAAAAGAAACAGAAAUCAAAAUUCAGACGCUGACAUCAGAUCACAAAUCUAAGGUCAAAGAGAUUGUAGCACAGCACACAAAGGAAUGGUCAGAAAUGAUCAAUACCCACAGUGCUGAGGAGCAAGAAAUCCGAGACCUGCACCUCAGCCAGCAGUGUGAGCUGCUGAAAAAGCUACUCAUCAAUGCCCACGAGCAGCAAACCCAGCAGCUGAAACUGUCCCAUGACAGGGAAAGCAAGGAAAUGCGAGCACACCAGGCUAAGAUUUCUAUGGAAAAUAGCAAAGCCAUCAGCCAAGAUAAAUCUAUCAAGAAUAAAGCAGAACGGGAAAGGCGAGUCAGGGAGUUAAACAGCAGCAACACUAAAAAGUUUCUGGAAGAAAGAAAGAGACUUGCCAUGAAGCAGUCCAAAGAAAUGGAUCAGUUGAAAAAAGUCCAGCUUGAACAUCUAGAAUUCCUAGAGAAACAGAAUGAGCAGGCGAAGGAGAUGCAGCAGAUGGUGAAAUUGGAAGCCGAGAUGGACCGCAGACCAGCAACAGUAGUAUGAAACUCCAAAAUGCAAACUGAAGCAGCAAACCCACAAAGCAUCAAAAGACUCACUCACAAACUUCUGAACACAAACUCCAUGGAUGAAAGCUGUUUAUUUUGUUUCCUUUAUGUGUAAACAAGAUGAUAUCUGAAACCAGAGAGACUUGGAAUGUCUGACUGACUUCUAUUUAACAGCUUGAGUAUUGCAUUUCCUUGGCCAAACAAAAAUAGCUACAAAUCCACAAAAAUUUACUAUUCCAGUAAGGCAGAGUCCAACCAUUGAUAAUACAACUUAAACAUGUUUGCUAUAAAAUACCAUCACAAGUAAAUGAGCUUGGUGUGAACAACUCUCCUUUGUGAUGCCUUAGGACAUGUUUGAACUGCAGCAAAAAACAAAAACAAAAAACAGUGCAUUAGCAAUUUCAUAGCAAGUGCAUGCACUAGGAAAAGAAAACUCUGUCUACAAGUUUAUUAGCAGAAGUGGUGGUCUGCUAGACAAAUAAUUUUGCAAAAUUUUUCUACAUCUAAGUUACCUCAUCAGUAAGUGCCAUGUCUCUACCAUGCCAUCAGAGGCUAAUUUCCUGUAAAAGUUGUGGAAAUUGUUAGAACAAUAGAAAAAUAGAGCAGUGUAUGUGUGCCAAAACUCAUCAUUACUCAAAGGAGAACUGUGUUAGGCACAUUUAAGAAAGUUUACAUCUGACAUUGCUUUAUAGGAAUUGUUUCUGCAGAUUCCGGAUAUUAUAAUUCACACCAUAAAGAUUGUGAAGUGGUUAUUGGCAAACGUUUGUAAAUGUGACCAUGUAUAAAGUAUUUAUACUCUUUAAUUCACACUGUUAGAGAGCAAAAUCAUCUAAGUAUUGCCACAUGACAAGAUUAGUAAACAGGAAUACUAGAACUAUGUUUGCAUGAUACACAAGCACCAAUAAAGACUAAUCCAUACACAGUUAACCUAAUGCCAAAUAAAUACUGGUUAAAUAAAUGUAUGGCACAGAAUAUAAUUUGACUAUCAAGACUUUUAGCAUAAUGAAAAACCCUCUCUCUAUAUAUAUAUGUGUAUAUGAAUUAUGUGGGCAUUCUUGAUACUUCAAGUUCUAGUUUGAAAAAAAUACAUAACUAAUUUAAUUUUACACAAAAAUAUUUAUGCAGAUUUUCAGAAUUUCAUAUCAGGAAAUGACCUUUUUAUGUCUGUUAAAUAUCAAAACAAUUUGCUACAGUGUUAAUCUGCAUGGUCUUUAAGCCUGCUGUAGUUGAGUUGCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1434.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1538.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 1653.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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