Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001174097.3

Sequence Length

1586 nt

GC Content

0.4704

CUUGCAGAGCCGGCGCCGGAGGAGACGCACGCAGCUGACUUUGUCUUCUCCGCACGACUGUUACAGAGGUCUCCAGAGCCUUCUCUCUCCUGGUAGGUUUCGGCUCAGGACCCUGAAUCCUGGCCCACAGGCAAGCCUGAUGGGACGUGCGGGGUAGUACUUGUAUGGGGAGACGCGGGAAGGAGGAAGAAGCACAUCUGUCCUCCGCGGCCUUUAGCUCUGAGCAUCCGGCCGCGGGCCCUGACUUUGCCGCUCAGUUUGGGGCGCAGGGGGGGCCGUGCCCUGGCGGAGGAGCAGAAGGCAGAGGGUAGCAGCUGCGGCUCAGCGGAGAGACUUGUUGCAUUUGCAGCUAAAACCAGGCCCUACUUGUCCUUGUGCAAAAUGGCAACUCUUAAGGAAAAACUCAUUGCACCAGUUGCGGAAGAAGAGGCAACAGUUCCAAACAAUAAGAUCACUGUAGUGGGUGUUGGACAAGUUGGUAUGGCGUGUGCUAUCAGCAUUCUGGGAAAGUCUCUGGCUGAUGAACUUGCUCUUGUGGAUGUUUUGGAAGAUAAGCUUAAAGGAGAAAUGAUGGAUCUGCAGCAUGGGAGCUUAUUUCUUCAGACACCUAAAAUUGUGGCAGAUAAAGAUUAUUCUGUGACUGCCAAUUCUAAGAUUGUAGUGGUAACUGCAGGAGUCCGUCAGCAAGAAGGGGAGAGUCGGCUCAAUCUGGUGCAGAGAAAUGUUAAUGUCUUCAAAUUCAUUAUUCCUCAGAUCGUCAAGUACAGUCCUGAUUGCAUCAUAAUUGUGGUUUCCAACCCAGUGGACAUUCUUACGUAUGUUACCUGGAAACUAAGUGGAUUACCCAAACACCGCGUGAUUGGAAGUGGAUGUAAUCUGGAUUCUGCUAGAUUUCGCUACCUUAUGGCUGAAAAACUUGGCAUUCAUCCCAGCAGCUGCCAUGGAUGGAUUUUGGGGGAACAUGGCGACUCAAGUGUGGCUGUGUGGAGUGGUGUGAAUGUGGCAGGUGUUUCUCUCCAGGAAUUGAAUCCAGAAAUGGGAACUGACAAUGAUAGUGAAAAUUGGAAGGAAGUGCAUAAGAUGGUGGUUGAAAGUGCCUAUGAAGUCAUCAAGCUAAAAGGAUAUACCAACUGGGCUAUUGGAUUAAGUGUGGCUGAUCUUAUUGAAUCCAUGUUGAAAAAUCUAUCCAGGAUUCAUCCCGUGUCAACAAUGGUAAAGGGGAUGUAUGGCAUUGAGAAUGAAGUCUUCCUGAGCCUUCCAUGUAUCCUCAAUGCCCGGGGAUUAACCAGCGUUAUCAACCAGAAGCUAAAGGAUGAUGAGGUUGCUCAGCUCAAGAAAAGUGCAGAUACCCUGUGGGACAUCCAGAAGGACCUAAAAGACCUGUGACUAGUGAGCUCUAGGCUGUAGAAAUUUAAAAACUACAAUGUGAUUAACUCGAGCCUUUAGUUUUCAUCCAUGUACAUGGAUCACAGUUUGCUUUGAUCUUCUUCAAUAUGUGAAUUUGGGCUCACAGAAUCAAAGCCUAUGCUUGGUUUAAUGCUUGCAAUCUGAGCUCUUGAACAAAUAAAAUUAACUAUUGUAGUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-489.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -519.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 472.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((..(((((.(((((((((((((....(....)....)))))))))))(((....(((((((((((((...(((((..(((((((((.((((((((((((((((((.......))))).((((((((....)))).)))).((((((((......)))))))).((((((......((((.(..(((((((((..(((((((((.((((((.(((((..((....(((.((((.(((...((((((.((((......))))))))))))).)))))))...))...))))).))))))...((((.((....)).)))).)))))).)))..(((((....))))).....(((.(((..((((((((...(((......)))..............((((((((((...(((((..........))))).(((...)))...........))))))))))...)))))))).))).))).))))))).))..).))))......))))))))))))..)))))))((((((.((((.((((((((((((((((.........(((.((......)).)))..)))))))))).))))))............((((((....(((....)))....))))))(((((.....((((((....))))))))))).)))).)))))))))))))))..)))))..((((...)))).....(((.(((.(((((....((((.(((..(..((((((..((((..((((((((.(((.((.(((((((((((((..((((.((((((........))))).)))))........(((.....))).(((((((..........)))).)))..((((((((((((((.((((((((((((....(((((.....)))))((((((((..((....))...)))))))).........(((((((.((......)).))))))))).)))))).)))).)))))...((((((....)))))).)))))))))..)))))))).))))).)).)))..))))...)))).))))....)))))).)..)))))))....))))).)))..))).....((((...(((.(.(((.(((((.(((.....(((((((......(((((((.((..((....))....))))))))).((((..........((((..((((((((((((((..((((......))))..))......))))))))))))..)))))))).......((((.((((((.((..........)).)))))).)))).))))).)).....))).)).)))))).))))...))))....)))))).......)))))))..))).)).)).))))))))..........((((((((((((((.....((((((..(((((.(((...((.....((((((.((....)).))))))....))..))).))))).))))))....)))))((((....)))).((((((.((((.......))))..)))))).............)))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{{((,((((((.({(((((((((((....,....}....)))))))))))|.|.{{{(((((((((((((...(((((..(((((((((,(((((((((((({(((((.......})))).((((((((....)))).)))).((((((((......)))))))).((((((.{.{,,{{({,({.{{{(((({{,.(((((((((.((((({.(((((..{(.,,,(({{(((({((((..((((({{((((......)))))))))))))}))})))}..,)),,,))))).)))))).,,({((.({..|,)).}))).)))))).))),,(((((....))))).....(((.(((..((((((((..{(((......))}..{{,...}}}...{((((((((|...(((((..........))))).{{{....,}..........,})))))))))...)))))))).))).))).))))))).))..}.)))).,....))))))})))))..)))))))|(((((.((((,{{{(((((((((((((...,.,,..{{(.{{..,,,.),.}}}..)))))))))),))))}}|,,,........((((((....(((....)))....)))))),,{,,....,((((((....)))))))}})},)))).)))))})))))))))..)))))..{(({{.,||||,,.,,{,..,((,({{({....((((,(((,.{..{{{(((.,((({,{(((,(((({((({,,.{{({(((((((((..{{{(,{(((((........))))).}}))),,,,,...{{{.....|||,,((({{{,},.,,,,..))})})))}}||,|||||{||||{,|{((((((({{,..,}||{||....,||}}}{(((((((,.((....}|,..}}})))}}.}}}}}},,(((((((.((......)).)))))))}),)))))).)))).))))),..||||||,,,,))}},,.,,}}||}},..))))}}||.}||||.,}.}}}..,})}}..))},.}))),,..}))}}},},,}},}})},,,.}}}}}.}}}..,}},....((((...((,,(.(((.{{(((.(((...,.{((((((......,((((((.{(..({....,}....}}))))))|((((.{.,,......|||,.,,}|||||,,,(((((((((.{{((((.({{...))).)))),}},,}),)))}})))),|||,.....,|(((.((((((.((..........)).)))))).)))).))))),)}.....})).)}},}}))).))})...))))....)))))).......))))))).}))|,||,},,||}||}||..........(({{{{{{{{((((.....((((((..{{{{{.(((.,{({.....((((((.((....)).))))))....},,,})),)))}}.))))))....})))}{(((....)))),((((({.((((|.....,))))..)))))).............}))))))))...