Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001174127.2
Sequence Length
3757 nt
GC Content
0.4416
AGCGUGGCGCUGGCUCCCGGAAUAUGGAGCCCUGGGCGCGGGGGCGGCGUGUCAGGUGGUUGCGGAGCUGAAUCAUAUUCUAAGAACUCAGCCACUCAGGUAUCCACCAUGGUGCUGGGUCCUGAACAGAAGAUGUCAGAUGACAGUGUUUCUGGAGAUCAUGGGGAGUCUGCCAGUCUUGGUAACAUCAACCCUGCCUAUAGUAAUCCCUCUCUUUCACAGUCCCCUGGGGACUCAGAGGAGUACUUCGCCACUUACUUUAAUGAGAAGAUCUCCAUUCCUGAGGAGGAGUACUCUUGUUUUAGCUUUCGUAAACUCUGGGCUUUCACCGGACCAGGUUUUCUUAUGAGCAUUGCCUACCUGGAUCCAGGAAAUAUUGAAUCCGAUUUGCAGUCUGGAGCAGUGGCUGGAUUUAAGUUGCUCUGGAUCCUUCUGUUGGCCACCCUUGUGGGGCUGCUGCUCCAGCGGCUUGCAGCUAGACUGGGAGUGGUUACUGGGCUGCAUCUUGCUGAAGUAUGUCACCGUCAGUAUCCCAAGGUCCCACGAGUCAUCCUGUGGCUGAUGGUGGAGUUGGCUAUCAUCGGCUCAGACAUGCAAGAAGUCAUUGGCUCAGCCAUUGCUAUCAAUCUUCUGUCUGUAGGAAGAAUUCCUCUGUGGGGUGGCGUUCUCAUCACCAUUGCAGAUACUUUUGUAUUUCUCUUCUUGGACAAAUAUGGCUUGCGGAAGCUAGAAGCAUUUUUUGGCUUUCUCAUCACUAUUAUGGCCCUCACAUUUGGAUAUGAGUAUGUUACAGUGAAACCCAGCCAGAGCCAGGUACUCAAGGGCAUGUUCGUACCAUCCUGUUCAGGCUGUCGCACUCCACAGAUUGAACAGGCUGUGGGCAUCGUGGGAGCUGUCAUCAUGCCACACAACAUGUACCUGCAUUCUGCCUUAGUCAAGUCUAGACAGGUAAACCGGAACAAUAAGCAGGAAGUUCGAGAAGCCAAUAAGUACUUUUUCAUUGAAUCCUGCAUUGCACUCUUUGUUUCCUUCAUCAUCAAUGUCUUUGUUGUCUCAGUCUUUGCUGAAGCAUUUUUUGGGAAAACCAACGAGCAGGUGGUUGAAGUCUGUACAAAUACCAGCAGUCCUCAUGCUGGCCUCUUUCCUAAAGAUAACUCGACACUGGCUGUGGACAUCUACAAAGGGGGUGUUGUGCUGGGAUGUUACUUUGGGCCUGCUGCACUCUACAUUUGGGCAGUGGGGAUCCUGGCUGCAGGACAGAGCUCCACCAUGACAGGAACCUAUUCUGGCCAGUUUGUCAUGGAGGGAUUCCUGAACCUAAAGUGGUCACGCUUUGCCCGAGUGGUUCUGACUCGCUCUAUUGCCAUCAUCCCCACUCUGCUUGUUGCUGUCUUCCAAGAUGUAGAGCAUCUAACAGGGAUGAAUGACUUUCUGAAUGUUCUACAGAGCUUACAGCUUCCCUUUGCUCUCAUACCCAUCCUCACAUUUACGAGCUUGCGGCCAGUAAUGAGUGACUUUGCCAAUGGACUAGGCUGGCGGAUUGCAGGAGGAAUCUUGGUCCUUAUCAUCUGUUCCAUCAAUAUGUACUUUGUAGUGGUUUAUGUCCGGGACCUAGGGCAUGUGGCAUUAUAUGUGGUGGCUGCUGUGGUCAGCGUGGCUUAUCUGGGCUUUGUGUUCUACUUGGGUUGGCAAUGUUUGAUUGCACUGGGCAUGUCCUUCCUGGACUGUGGGCAUACGUGCCAUCUGGGAUUGACAGCUCAGCCUGAACUCUAUCUUCUGAACACCAUGGACGCUGACUCACUUGUGUCUAGAUGACUGACAGCCUGAGAGACUCUAUAAGAACAUGUUUUUCUAAGCCCUUUUUGUGCCAGGUGUCCCGUUAACGUCUCUGUUAGUUCAGAGGUGAGUUUUGUUCAGACGUUUUGAACAAAAGGCAAAGAUUUCCUCAUGGGAAGGGUGUUCAAAACUGACAGCUAUAAAUGUAGGUCAGAGACCCACCCACCUCAUAACAGUCAUACACUCCCAGAGUUAAACGAUUGGCCUCUGAUGGCCACACACCCCUAUGGGCUUGUGUCUUGGACUCUGGGAUUUAAAAGAUAUAUAUGUAUAUAUAUUUAUGUAAACCUGAGCAUCUCAGUUUGGGUAGAGUUUUAAGGUUAUAUGAAACUGAUAGAACUUUUGUAUUUUUUUUUUAAAUAUUGUUUUGAUAUAUCAGAUAUUUGUUUUGUCUGGAUCACAAGUGAGAAAGAAAAGAGAACAAUGCUCUUUUUCACAAUGAACUGGUCAAAUUGACUAUCUUGUAAAGUGAUACUUUACUAUGUCAGUGAAAUUUCAGUUUGAUUUUAGUCAACCAGAUUAUAUCCUUUGUAUCUACUGAUAUUAACACAUCAUAUUAACACAUCAUUUCUUAAAAAAACAUUUCUUCUGUUUGGCAAUCAUAAUUAACUCUGGUUAUCAGCCUAUUUUGUAAUUAUUGUCUUUGUCGUCACUUUUCUUGAAUUGUUUUCUAGUCAUUAAACAGAUAUGAAGGCAUUGCCAAAGAGCUUUAAUAUCCAGUAACAAGAUCCAGAAACCACACUUUAACCAGUGAUCAGUUUUCCGUGCUGCAUUGUAACUCAGCUCAUUCUGGCAUUCAAGUUUUAGGCAAAAAAAGAGGAAACUUCUAACAUUUAGCUUGUAAGUCCUGACAUAAGAUAGUGAAGAUAUUUAUCUUCUUUCUAAUAUUUGUAUAGUCCGCCAAUGUAUUUUCUUCCCACUAUUCCCAUUAACAUACCAAACACUGUUUCUAGGUCCAAAGUCUAUUUCUAGGAGUGGCCAAUAUUUGUAUUGUUGAAUCUCCUAGGGAAUGCUAAAUGUUUCACUUUAAAAUACCUAUUUAUACCAAGUAGCAUGAGAUUAGUACUAGAGUGAGAUUUGGAAUAUUAGUCCACAUAUCACAAACUGCUUGCCUACAUGUAUAGAUUUUUUUUUUCACCCACCUUCCUAACCAGGAAUUUGUUUCCUUAAAUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUUGUUGUUAUUUUUUUGAGAAGAGUCUUGCCCUGUCGCCAAGGUGGGAAUGCAUUGACGUGAUCUCAGUUCACUGUAACCUCUACCUCCCCGGUUUAAUCGAUUCUCCUCCUUCAGCCUCCUGAAUAGCUGGGAUUACAGGCACCACAUUUUUAGUGGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCUUGACCUCAAGUGAUCUACCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCACCCAGCGUUUUUUGUUGUUAAGACAGGGUCUUGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCUCAGCUCACUGCAACUUCUGCCACCUGGGCUUAAGCCAUCCUCCCACUUCAGCAUCCCAAAUAGCUGGGACUGCAGGCACACACCACCACACCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACGGGAUUUCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUGUUGAACUCAUGAGCUCAAGUAAUCUGCUGGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUAUAGGCGUGAGCCACUGCAUCCAGCUCACUCCUCAUUUCUUUCUAGCCCCAAAGGUGUUGAGUCAGCAAAUCCUGCAGCCUUUGUGUGACUUUGAGCAUCACUUUCCCCUUUCAGCAUUAAAUAUAUGACCUCUCUGCCUUAUUUUAGAACUUACUACAUUUCAAUAAAACUUUUUAAAAAAUCCA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1139.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1207.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 1081.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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