Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001178046.3

Sequence Length

2601 nt

GC Content

0.5160

GCACUCCAGCACUGCGCAGGGACCGGAAUUCUGUGGCCACACUGCGAGGAGAUCGGUUCUGGGUCGGAGGCUACAGGAAGACUCCCACUCCCUGAAAUCUGGAGUGAAGAACGCCGCCAUCCAGCCACCAUUCCAAGCUUACUUUGCAAAGAAGGAAGAUGGUUGUUUCCGAAGUGGACAUCGCAAAAGCUGAUCCAGCUGCUGCAUCCCACCCUCUAUUACUGAAUGGAGAUGCUACUGUGGCCCAGAAAAAUCCAGGCUCGGUGGCUGAGAACAACCUGUGCAGCCAGUAUGAGGAGAAGGUGCGCCCCUGCAUCGACCUCAUUGACUCCCUGCGGGCUCUAGGUGUGGAGCAGGACCUGGCCCUGCCAGCCAUCGCCGUCAUCGGGGACCAGAGCUCGGGCAAGAGCUCCGUGUUGGAGGCACUGUCAGGAGUUGCCCUUCCCAGAGGCAGCGGGAUCGUGACCAGAUGCCCGCUGGUGCUGAAACUGAAGAAACUUGUGAACGAAGAUAAGUGGAGAGGCAAGGUCAGUUACCAGGACUACGAGAUUGAGAUUUCGGAUGCUUCAGAGGUAGAAAAGGAAAUUAAUAAAGCCCAGAAUGCCAUCGCCGGGGAAGGAAUGGGAAUCAGUCAUGAGCUAAUCACCCUGGAGAUCAGCUCCCGAGAUGUCCCGGAUCUGACUCUAAUAGACCUUCCUGGCAUAACCAGAGUGGCUGUGGGCAAUCAGCCUGCUGACAUUGGGUAUAAGAUCAAGACACUCAUCAAGAAGUACAUCCAGAGGCAGGAGACAAUCAGCCUGGUGGUGGUCCCCAGUAAUGUGGACAUCGCCACCACAGAGGCUCUCAGCAUGGCCCAGGAGGUGGACCCCGAGGGAGACAGGACCAUCGGAAUCUUGACGAAGCCUGAUCUGGUGGACAAAGGAACUGAAGACAAGGUUGUGGACGUGGUGCGGAACCUCGUGUUCCACCUGAAGAAGGGUUACAUGAUUGUCAAGUGCCGGGGCCAGCAGGAGAUCCAGGACCAGCUGAGCCUGUCCGAAGCCCUGCAGAGAGAGAAGAUCUUCUUUGAGAACCACCCAUAUUUCAGGGAUCUGCUGGAGGAAGGAAAGGCCACGGUUCCCUGCCUGGCAGAAAAACUUACCAGCGAGCUCAUCACACAUAUCUGUAAAUCUCUGCCCCUGUUAGAAAAUCAAAUCAAGGAGACUCACCAGAGAAUAACAGAGGAGCUACAAAAGUAUGGUGUCGACAUACCGGAAGACGAAAAUGAAAAAAUGUUCUUCCUGAUAGAUAAAGUUAAUGCCUUUAAUCAGGACAUCACUGCUCUCAUGCAAGGAGAGGAAACUGUAGGGGAGGAAGACAUUCGGCUGUUUACCAGACUCCGACACGAGUUCCACAAAUGGAGUACAAUAAUUGAAAACAAUUUUCAAGAAGGCCAUAAAAUUUUGAGUAGAAAAAUCCAGAAAUUUGAAAAUCAGUAUCGUGGUAGAGAGCUGCCAGGCUUUGUGAAUUACAGGACAUUUGAGACAAUCGUGAAACAGCAAAUCAAGGCACUGGAAGAGCCGGCUGUGGAUAUGCUACACACCGUGACGGAUAUGGUCCGGCUUGCUUUCACAGAUGUUUCGAUAAAAAAUUUUGAAGAGUUUUUUAACCUCCACAGAACCGCCAAGUCCAAAAUUGAAGACAUUAGAGCAGAACAAGAGAGAGAAGGUGAGAAGCUGAUCCGCCUCCACUUCCAGAUGGAACAGAUUGUCUACUGCCAGGACCAGGUAUACAGGGGUGCAUUGCAGAAGGUCAGAGAGAAGGAGCUGGAAGAAGAAAAGAAGAAGAAAUCCUGGGAUUUUGGGGCUUUCCAGUCCAGCUCGGCAACAGACUCUUCCAUGGAGGAGAUCUUUCAGCACCUGAUGGCCUAUCACCAGGAGGCCAGCAAGCGCAUCUCCAGCCACAUCCCUUUGAUCAUCCAGUUCUUCAUGCUCCAGACGUACGGCCAGCAGCUUCAGAAGGCCAUGCUGCAGCUCCUGCAGGACAAGGACACCUACAGCUGGCUCCUGAAGGAGCGGAGCGACACCAGCGACAAGCGGAAGUUCCUGAAGGAGCGGCUUGCACGGCUGACGCAGGCUCGGCGCCGGCUUGCCCAGUUCCCCGGUUAACCACACUCUGUCCAGCCCCGUAGACGUGCACGCACACUGUCUGCCCCCGUUCCCGGGUAGCCACUGGACUGACGACUUGAGUGCUCAGUAGUCAGACUGGAUAGUCCGUCUCUGCUUAUCCGUUAGCCGUGGUGAUUUAGCAGGAAGCUGUGAGAGCAGUUUGGUUUCUAGCAUGAAGACAGAGCCCCACCCUCAGAUGCACAUGAGCUGGCGGGAUUGAAGGAUGCUGUCUUCGUACUGGGAAAGGGAUUUUCAGCCCUCAGAAUCGCUCCACCUUGCAGCUCUCCCCUUCUCUGUAUUCCUAGAAACUGACACAUGCUGAACAUCACAGCUUAUUUCCUCAUUUUUAUAAUGUCCCUUCACAAACCCAGUGUUUUAGGAGCAUGAGUGCCGUGUGUGUGCGUCCUGUCGGAGCCCUGUCUCCUCUCUCUGUAAUAAACUCAUUUCUAGCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-853.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -903.51

Frequency: 0.0000

Diversity: 607.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((((((((.((((((.((((..((((((..(((((((..(((..((..(((.((((((.((.(((....(((....)))((((((.........))))))......))).))))))))..)))..))....((..((((.....))))..))..((((((((.((..((((.....(((..(((((...)))))..)))...)))).(((((((....)))))))..(((((((.((((..((....))..))))))))))))).))))))))(.(((((..(((((((((....(((((......)))))..))))))..)))..))))).))))..))))))).)))))).))))))))))))....((.(((....))).))...((((((......)))))).))))))))))).((((.((((((...(((((((...((((((((((((.......))).))))))(((.(((.((((((.....(((.(..((........))..).))).....))))))..))).))).((((((....))))))((((((((.(.(((...................)))).))).).))))))).))))))).(((((.....(((.(((.((.((.(((((((((.((((.(((.((....))..))).)))))))))..........((((.....))))((((...((((((.....))))))...)))))))))).)).))).))).))))).............((((((.((((((((...((((((((((((((..(((......)))..)))))))))....)))))..((((((((((...(((((((.((.((..((((.((.((((((((((.((............)))))))))).....((((((((.(((((((.(((((((.((((((((.((....((((((((((.....)))(((.(((((((((((((((((..((((.(..((((.((..((..((((((((....(((....((((((((..((((((....)))))).(((((..(((........)))...(((((((((........((((.(((.....))))))).......))).))))))(((((..........(((((...((((((...((.((.((........)).)).))......))))))...))))).)))))......(((((.......)))))((.....)).............)))))(((((((...(((((.......))))))))))))......(.(((((.......))))).)..))))))))..))).....))))))))....)).))))))..).....(((((....)))))........(((((((...)))))))...))))...(((((((..(.........)..))))))).....(((....(.((((((....)))))).).....)))......)).)))))..)))))))))).))).((........)).(((((((....((..((((((..(((.(.((((....(((((...)))))..(((((((....(((((((((((.......((((..(.(((((...........))))))..))))......)))).))))))))))))))..............)))).).)))..))))))..)).))))))).)))))))....))...))))....)))).)).....(((((((.((((...(((((.((((((..((((((((....((((.(.....((((((....))))))....)))))...)))))))).........((((((....)))))).)))))).).))))..((((((.((....))))))))))))..)))))))...)))))...))))).)).).))))))))).))))))...))...))))....)))))....))))))))))..(((((.(((((((..(.((((....(((((.(((((..((((((...((..............))....))))))..)))))))))).(((((((..((.((.(((((((((.(((((((..((((.((((((((((..(((((.((((((((..(((((((((......))).)))))).((((....))))........)).)))..)))..)))))...(((((..((((.(((...)))))))))))).....)))))))).)).))))..)))))(((((((((...(((((((((((((((...(((.((((((.(((.((((((........))))..)).)))......(((.(((((.........((...((.((((((........)))))).))...))..)))))..)))....)))))).)))))))))))))).....))))....))))))))).......((((.....)))).............)).)))))....)))).)).))))))))))))).)))))))).)))))..)))))))).))))))..........)))))).)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.(((((((((((.((((((.((((..((((((..(((((((..((({,(,..(((.((((((.((.(((....(((....)))((((((..,....,.))))))......))).))))))))..))).,))}...((,.((((.....)))).,))..((((((((.{,..((((..,,.(((..(((((...)))))..))),,.)))).(((((((....)))))))..(((((((.((((..((....))..))))))))))),).)))))))){.(((((..(((((((((....(((((,....,)))))..))))))..)))..))))).}}))..))))))).)))))).)))))))))))),...((.(((....))).))...((((((......)))))).))))))))))).((((.((((((((((,(((((((.(.((((((((((.......))).))))))).}.)))...........((((((........)))))))))).)))).{(((,{....|.,}}}}.((((((....)))))){{((((((.{{((({.....{{...........,|||,...}|||,|}(((((((((((..,((({.{{(({...{{{||.{{{.,,,,,{,|}|,||}||({(.,....},))),.)))),))),.....))))))))))....,{.|{{||,|.{|||||.....))))))}}}),}||}|}.,....,,..,..,}}}.....}}}}}...,,((((((.((((((((...(((((((((((((({{,((....}},)),,,,)))))))}...}))))..((((((((((..,((({(((.,,{((,.((,{.{,.,.||{||||..||,.,.....{|,,|,|||||}||.,..{((((((({.(((((((.(((((((.((((,(((,{{..,.{((((({(((.....)))(((.(((((((((((((((((..((((.{,.((((.{{..(({.((((((({..{,(({....((((((((,,((({,...,|}|||||,(({....(((........)))...{((((({{{.,,.....((((.(((.....))))))).......))).)))))|(((((..........(((((...((((((,.{(({{{.{,...,,...,,.})).)......)))))).,.))))),)))))......{{{((,,,,...}))))|(,..,,}|............,}}))}|((((((...(((((,....,.}))))))))))}......{.(((((.......))))).}..))))))))..}}},},|,}))))))),}}.}}.}}))))..}....,{((({....}))),........(((((({...}))))))...))))...,{,(((({.{,.......},}}))},}}},....|||....{.((((((....)))))),),,,|,|},..,,},)).)))))}.}))))))))).))).((........)).(((((((....((..((((((..(((.(.((((....(((((...))))).,{((((((....(((((((((((.,,,,,{(({{..{,|||||,,.........}))}},..}}}}......))))}))))))))))))))..............)))).}.)))..)))))),.}).))))))).})))))},...}},,.}}}},.,.)))).)).....(((((((.((((...(((((.((((((..((((((((....({(({(.....((((((....))))))....)))))...)))))))).........((((((....)))))).)))))).).))))..((((((.{(....)}))))))))))..)))))})}..)))))..)))))).)).).))))))))..)})))),,,},...)))}..},}))))....))))))))))..(((((.(((((((..(.((((.,,,((((,((((((..((((((...((....,..,,.....))....))))))..))))))}))}.{(((((({{{(({((((.{({,{,||||||||,,{({{.{{{(({{{{{..,,,{{.((((((.,..(((((((((......))).)))))).((((....))))......}})),)||{{,||.,||,,,.,}|||{|}}||{|,(({,||})})})}}}))),...})))))))),)}.}},,..|}{((((((((((({,,(((((((((((((((...(((,(((((,.(((.((((((........))))..)).)))...,,,{{,.{||||},,}|,.,.(({,.{(,(({{((........})))}},|}.,,,...)))))..}}}},}})))))).)}})))))))))))..,.,)))}..,.)))))))),...}}}}{,,.......|||{.{{{.{{{.......})),,..})),))}},.},))})))})))).)))))))).)))))..)))))))).))))))........,.}))))).)))).