Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001178126.2
Sequence Length
1300 nt
GC Content
0.5946
GUGACCGCUUCAGGGCAGUUGGUAGAUGCCCCUCUGGGAGAGAUCCCCAGGGGUGACAGCCAUGGACCCUGGAAGGGCCUGGGCUAGGGACAGGGACCAGAGCCAGUCCAGGGAGAGGACAGAGCCAAUGGACUGGGGUGUACUGUAACAGCCCUGCUGGCGAGAGGGACCAGGGCACCGUCCUCCAGGGAGCCCAUGCUGCAAGUCGGGCCAGAGGUGCCCCUGAACCUGAAGGCCAAUGAGACCCAAGACAGGCCAAGUGGGUUGUGAGACCCCUGAGGAGCUGGGCCCUGGUCCCAGGCAGCGCUGGCCCCUGCUGCUGCUGGGUCUGGCCAUGGUCGCCCAUGGCCUGCUGCGCCCAAUGGUUGCACCGCAAAGCGGGGACCCAGACCCUGGAGCCUCAGUUGGAAGCAGCCGAUCCAGCCUGCGGAGCCUGUGGGGCAGGCUCCUGCUCCAGCCCAGCCCCCAGAGAGCAGACCCCAGGUGCUGGCCCCGGGGGUUUUGGUCUGAGCCUCAGUCACUGUGUUAUGUCUUCGGAACUGGGACCAAGGUCACCGUCCUAGGUCAGCCCAAGGCCAACCCCACUGUCACUCUGUUCCCGCCCUCCUCUGAGGAGCUCCAAGCCAACAAGGCCACACUAGUGUGUCUGAUCAGUGACUUCUACCCGGGAGCUGUGACAGUGGCCUGGAAGGCAGAUGGCAGCCCCGUCAAGGCGGGAGUGGAGACCACCAAACCCUCCAAACAGAGCAACAACAAGUACGCGGCCAGCAGCUACCUGAGCCUGACGCCCGAGCAGUGGAAGUCCCACAGAAGCUACAGCUGCCAGGUCACGCAUGAAGGGAGCACCGUGGAGAAGACAGUGGCCCCUACAGAAUGUUCAUAGGUUCCCAACUCUAACCCCACCCACGGGAGCCUGGAGCUGCAGGAUCCCAGGGGAGGGGUCUCUCUCCCCAUCCCAAGUCAUCCAGCCCUUCUCCCUGCACUCAUGAAACCCCAAUAAAUAUCCUCAUUGACAACCAGAAAUCUUGUUUUAUCUCAUUUUUUUUCUCACAUAAAUUGCUAGCCUCCCCGGGGUUCUCAGUGUGGGGUACAGGGAAUUCUGCACCCAGUGUGAAAAUCACCCAAGGGAGGAGGCUCACAGCCUCCCUGAGUCAUCUCCCCAGAGGGUCCUUCCUCUCCCAGUCACCCCUUCUCCAACUCUCCACUGUACCCCUGAGCUACCAGUCUGGCAUCAGUUCAGACCAGUCCCACACCCUCCUAAAUUUUACUUCUCAAUAAAUACCUGAUCAUGUAAAACGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-515.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -536.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 241.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((.(((((((((.((.(((..(((....))).((((.....(((((((((((((..((.((((...))))))..))))..((((.((........)).)))).(((((((((..((.((..((((((((((((..(((...((((..((((((((..((((((((((((.((((((((.(((((((((((...((..(((((((((..((....(((........)))))..)).).)))..)))..))...))))))).......)))))))))..)))))))))))))((((.(((((((((((.((((((.((((((((.((((((((....)))))))).(((((..(((((.(..((.((((...))))....((((...)))).))..).)))))..))))).))))))))..))(((((((((...))))))))).((((.((.(((((((((.(.(..((((((...))).)))..)).))))))..))).))))))....((..((.((((.((((((((((..((((((....))).))))))..(((..(((...)))..)))((((((((((...((((((((((((....)))).)).....(((.....)))(((....))).(((........)))........)))))).))))))))))....)))))))(((((.....)))))..((.(((..(((......)))..))).)).)))).))..))....)))).).))))))).))).))))...))..))))..))))((((.....))))..........)))).)))..)))...((.((((..(((.((.......)).)))..)))).))....((((.(((((((((..................)))))))))))))((((((((....((((((((....))))))))................((((...(((((((((...((((((((............((.........(((((...((........)).....))))).........))...........)))))).)))))))))))...)))).))))))))))))))((((...))))...(((((((..(....)..)))))))(((....))).)))..)).))..))))))))).)))))))))))))....)))))))))...)))))))).((..(((((((....).))))))..))................((((((...(((.........)))....))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...(({{(((((((({,((.(({.,,|,....}||{(((,.....(((((((((((((..((.((((...))))))..))))..((((.((........)).)))).(((((((((..((.((..((((((((((((,.(((,.,({{(,{((((((((..((((((((((((.((((((({,(((((((((((...((..(((,((((,.{(({....,...}}}}...))))..||.,.,,)..)))..))...))))))).......)))))))))..})))))))))))}((((.(((((((((({.((((((.((((((((.((((((((....)))))))).(((((..((((({{{,,{.{{((...))||({..((((...)))).,)),}.)))))..))))).))))))))..))(((((((((...))))))))).(((({((,({(((((((.(.(..((((((...))).)))..)).)))))),.,)).))))))....{,..(({(,,,.((((((((({.,{(((((....))).))))))..(((..(((...)))..)))((((((((((...((((((({((((....)))).)}.....(((.....))){((....}}).||{........)}}.......,)))))).))))))))))....))))))),,,{|},}.{||||,..,|}|||..((({{....,,,..,,)})),.,,,,)),.......)))).).))))))).))).))))..}))..))))..))))|{||..,,.}})),,...,..,.}}|},||},,}}}...{{.((((.,(((.((,......}).))),.)))).)}....((((.(((((((((..................)))))))))))))|{{{((((..,.{((((((({...,,,,)))).}}}}..,..,,,,..((((...(((((((((...((((((((.............,.,,......(((({...{|,.......,}.....}}}}}..,,.....}}...........))))))}},)))))))))...)))).,}})))))))))))((((...))))...,{(({((,{({,..,,})))))})(((....))).)))..)).))..))))))))).))))))))),,,,...,)))))))))...)))))))).,,..(((((((....),})))))..}}..,,,...........{(((((...(((.........)))....)))))},,,.
Back