Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001178135.2
Sequence Length
788 nt
GC Content
0.5508
ACUUCCUCCUCGCCCCCACCCAGACCCAGAAGGCGCCACCAUGGCGGCGCCCCCGCAGCCCGUCACCCACCUCAUCUUUGACAUGGACGGACUUCUUCUGGAUACUGAACGGCUGUAUUCAGUGGUGUUUCAAGAAAUAUGUAAUCGCUAUGACAAGAAAUACAGCUGGGAUGUAAAGUCCCUGGUUAUGGGUAAGAAGGCAUUAGAGGCGGCACAGAUUAUAAUAGACGUCUUGCAGCUCCCGAUGUCCAAAGAGGAGCUGGUGGAAGAAAGCCAAACGAAGUUAAAGGAAGUGUUCCCCACGGCUGCGCUCAUGCCAGGGGCGGAGAAACUCAUCAUCCACCUGCGGAAACAUGGCAUCCCCUUUGCACUGGCCACCAGCUCGGGGUCCGCGUCGUUCGAUAUGAAGACAAGCCGCCACAAGGAGUUCUUCAGCUUGUUUUCCCACAUUGUGCUGGGAGAUGACCCCGAAGUGCAGCAUGGCAAGCCAGACCCGGACAUCUUCCUAGCUUGUGCCAAGAGGUUCUCUCCCCCUCCUGCUAUGGAGAAGAGCUCCAUCCAUAGACCUCGUCUGCUCACCGCACAGAAAUGCCAGGGCUGCCGGGAUCCCUUCUCAGCGCUCCUCCUUCUGUGUAAUCAACUGCUUCUCUGCUCUGAUGACACCUGACCGCACCUCCAGCUCACAGCCACAGUGCAUGGAGACCCCGAGCCUUCUACUUGGGUGUCCCACGAUGGCCUCAAACCCAACUUGUCACAAAAGCUACCUCUCCUUCCUGCCACCAAAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -257.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((....((((..(((((((((((((...)))))(((....)))((.((((...(((..(((....)))..))))))).))))))))))........((((((((((..((((((.((((.......)).)).)))))).......))))))))))((((.....))))))))....)))).....((((((.(.(((.(((.((((..........))))))).))).).))))))....)))))).((((((.((.(((..............(((((((((((.(((..((((((((((((((..(((.(((((......)).))).)))..))...))))(((.......))).((((...)))).((((((((..(.((((.((((..(((((((((((.((....)).).......))))))))))....)))).))..)).)..)))))))))))))))).)))............))))).))))))((((((((.((((.((((........((((......))))..(((..(((((..(((((...)))))......((((((((.....(((((.((.((((.....)))).)))).)))..)))))))).((((...((......))..))))...........((((.....(((...)))....)))).(((.(((((((((.......)))))).)))))).))))).))).))))...)))).))))..)))).......))).)).))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((({{{{(..{.((((..((((((((((((,...,})})|||},..,}}{{.((((,..{((..(((....)))..))))))).},,)))))))...,.,..{((((((((((,((((((.,,({.......)).,}.)))))),,...,.})))))))))((((.....))))))))....)))}..,..((((((.(.(((.(((.((((..........))))))).})}.}.))))})....)))))).{(((((,((..{{,........||,..{((((((((((,{{,.,(((({(({((((((,,(((.((({{......}}.))).}}}..))...}}))|{{.,,,,..}||,((((...))}).((((((((.,,{((,,.{|,,.,||{(({{{{(,.,...,,|}.,..,,,}.})))))|||((((,,...,}.))))}),.)))))))))))))))).))),.,,,,......))))).)))))}{(({((((.((((.((({.,,,,,..((((......))))..{{{,.{{{{{..{((((...)))))......((((((((..,..{((((,((.((((.....)))).))))})}}..)))))))).{(((...((......))..}))},,,....,...((({.....(({...}))....)))).{((.(((((((((.......)))))).)))))).}}))).}}}.,}})...)))).)))}..}))).......)))}}},)))))}....,.
Back