Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001185158.1

Sequence Length

1621 nt

GC Content

0.4658

GCUUGCCUGCAAACCUUUACUUCUGAAAUGACUUCCACGGCUGGGACGGGAACCUUCCACCCACAGCUAUGCCUCUGAUUGGUGAAUGGUGAAGGUGCCUGUCUAACUUUUCUGUAAAAAGAACCAGCUGCCUCCAGGCAGCCAGCCCUCAAGCAUCACUUACAGGACCAGAGGGACAAGACAUGACUGUGAUGAGGAGCUGCUUUCGCCAAUUUAACACCAAGAAGAAUUGAGGCUGCUUGGGAGGAAGGCCAGGAGGAACACGAGACUGAGAGAUGAAUUUUCAACAGAGGCUGCAAAGCCUGUGGACUUUAGCCAGCAAGCUCAGGAUAACAUCACGAGUGCCCGGCUGCUGCAGCAGGAGGUUCUGCAGAACGUCUCGCAAGAAAAUGAGAUGUUUUCCAUCAGAGACAGUGCACACAGGCGGUUUCUGCUAUUCCGGAGAGCAUUCAAACAGUUGGACGUAGAAGCAGCUCUGACCAAAGCCCUUGGGGAAGUGGACAUUCUUCUGACCUGGAUGCAGAAAUUCUACAAGCUCUGAAUGUCUAGACCAGGACCUCCCUCCCCCUGGCACUGGUUUGUUCCCUGUGUCAUUUCAAACAGUCUCCCUUCCUAUGCUGUUCACUGGACACUUCACGCCCUUGGCCAUGGGUCCCAUUCUUGGCCCAGGAUUAUUGUCAAAGAAGUCAUUCUUUAAGCAGCGCCAGUGACAGUCAGGGAAGGUGCCUCUGGAUGCUGUGAAGAGUCUACAGAGAAGAUUCUUGUAUUUAUUACAACUCUAUUUAAUUAAUGUCAGUAUUUCAACUGAAGUUCUAUUUAUUUGUGAGACUGUAAGUUACAUGAAGGCAGCAGAAUAUUGUGCCCCAUGCUUCUUUACCCCUCACAAUCCUUGCCACAGUGUGGGGCAGUGGAUGGGUGCUUAGUAAGUACUUAAUAAACUGUGGUGCUUUUUUUGGCCUGUCUUUGGAUUGUUAAAAAACAGAGAGGGAUGCUUGGAUGUAAAACUGAACUUCAGAGCAUGAAAAUCACACUGUCUUCUGAUAUCUGCAGGGACAGAGCAUUGGGGUGGGGGUAAGGUGCAUCUGUUUGAAAAGUAAACGAUAAAAUGUGGAUUAAAGUGCCCAGCACAAAGCAGAUCCUCAAUAAACAUUUCAUUUCCCACCCACACUCGCCAGCUCACCCCAUCAUCCCUUUCCCUUGGUGCCCUCCUUUUUUUUUUAUCCUAGUCAUUCUUCCCUAAUCUUCCACUUGAGUGUCAAGCUGACCUUGCUGAUGGUGACAUUGCACCUGGAUGUACUAUCCAAUCUGUGAUGACAUUCCCUGCUAAUAAAAGACAACAUAACUCAAGUCUGGCAGACUUUCUUCUCUAUUUCUGGAUGAAUGCCCAGUGAGACUGUGUUGUACAGCUAGAAAAGGCCUUCUUCCCAAUAGCAAGGCUGUGCAUCUAGCCUCAAGCUCUGGCUGAACUUUGUGGUCGACAUCAAUCUAAAGAUACAGUGUCUGACUAUAACCUUGUUCCAAAAACCUAGGCAAAGAGUAUAUGUAGGAGGUGGGAUAUCACUUCCAUGACAUAAGUGCUAUUGCAGAGCCGUGGCCACCCAGGAACUCCUGACUGCUUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-506.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -535.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 438.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((......))........................((((((((.(((((((.((((((.(((....((((..(....)..))))....))))))))).))))))).....((((......))))...((((((....))))))((((.....(((..((((((..(((....(((((..(((.(((((((.((((((((((.((((....((((((...........)))))))))).))))((((((...((((((.((((...(((((((.(((((((........((.(((((....))))).))......(((......)))((((..((((..((.((((((.((.(((....)))((((((((((.(((((((((((........)))))))))))...(((((((..((.(((.(((((.((((((((...(((((...............))))).)))))))).)).))).((((.....))))....))).))..)).))))).((((((.((((..((....))..))))...))))))..)))))))))).....)).)))))).)).)))).))))..)))))))...)))))))(((((((..(((((.((((((........((((((.(((((.((((...)))).))))).))).....(((.((((((....))))))..)))))))))))))))))..)))))))((((((...((((((((((((((((.......))))))))(((.....)))..............(((.(((((......))))).)))........(((((((...(((((...((((..((((.((......)))))).))))....)))))..))))))).......))))))))))))))..((((((((((((...)))))))........(((((((((......)))((.((((((..((.....))..)))))).))((((((.((.((........)).)).))))))....))))))((((((.(((.......))))))))).....((((((((((((.(((((.(((.(((((.....))))))))....((.(((((...((((...))))......))))).)).....................))).)).)))..))))))))).)))))..))))))))))..))))))......)))))).))))))))))))))).....)))...))))))....)))......))))..((((......))))((((((...))))))..((((((((.((((...............((((((((.((((...((((((....(((.(((........))).))))).))))))))..))))))))...((((((...((((((((.......)).)))))).....)))))).....(((((.(((((((.(((((((((((((..(((....)))...))))).))))))))....))))..........)))..))))).(((((.((((((((....))))))))...))))))))).)))))))))))))))).....((((....))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

((......))...................,....(((((((({(((((((.,{{{{||{{{,,,,((({.,(,,,,,.,||||{..{||||||||}.}}}}}},.....{(((......)))}...((((((....))))))(((((((((.((((((..,...(..((...))..)......))).)))..))))).))))}}}}}||||.||...}}}}}}..,},.|||||||(({(((((((((((((({(((((,{,.{((({,{({(,(((((........((.(((((....))))).)).....{((({.{{..{({(,{({,.,,|}}.,}||||||.||}}||||,|||{(({{{{|||||(((((((((((........)))))))))),..{((((((({{(({,,,.(((((.((((((((...(((({,..,...........})))).)))))))).)).}}}{(((..{((...{|{{.,|,|{|...,,{{|||..((((((.((((..{,....,}..))))...))))))..))))),,)))}},)))}.))),,)})),,}}|,|||}|,|}}|||,..,||||||}(((((((..(((({{((((((.,.,.....,,(((.(((((.((({...}})).))))).))).....{({.((((((....))))))..)))).))))))))))))..))))))){{{(((,,.{{(((({({(((((((.,,,...}}}}))||(((.....)))},...,........{{{.(((((......))))).}},........{((((((...(((((...((((..((({,((.....,)))))).))))...}))}))..))))))}....,..}}}}))}))))))),.{{{{(((({({.,,.{((((({........,,,)))))))|||.,|))||||||,,|}}}|}}},,)),.}}|||||||((((((,((.((........)).)),})))}},.....,.}}}||||,,|||}}...,}))}||},}|{{{..((((((((((({.(((((.{,,,(((((.....}}}}}},,....((.(((((...((((...))))......))))).}}....,}}}}}.,,}},}},}}),),}).}},.}))),}}))},)))),)))}}.))}))),,)))))}............,||||,.|}},,,,.........,....{{{|{(({,((,{,..,,||,{,,((((.((((,||..{((((|,..))))))...,))}}))}))))}.,,||,.......,((((((((.((((...((((((....{((.{{{........))).)}}))})}))))))..)))))))).}}))}})....)))))))))))))|,}||,,|||||},....}))))),,,,||,}))}}|{,,.(((((((((((((..(((....)))...))))).)))))))).,,,)))),.........,|({{..(((((((((.((((((((....))))))))...))))}.,)))).)))),.)))))))).....((((....))))..,}......