Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001190796.3
Sequence Length
4154 nt
GC Content
0.3421
ACUGAGAAUUAUCCUGAGCUGUGUUAACAAACUGACAGAACACAGAAUUUUUACUCAAAAUGGAUUGGUUAAACGUCUUUAAAGAUUUUUUCAGCAUUGGAAAAGUGAAAAGAAAACCUAGUGUGCCAGAUUCUGCAUCUCCUGCUGAUGAUAGUUUUGUUGACCCAGGGGAACGUCUCUAUGACCUCAACAUGCCCGCUUAUGUGAAAUUUAACUACAUGGCUGAGAGAGAGGAUGAAUUAUCAUUGAUAAAGGGGACAAAGGUGAUCGUCAUGGAGAAAUGCAGUGAUGGGUGGUGGCGUGGUAGCUACAAUGGACAAGUUGGAUGGUUCCCUUCAAACUAUGUAACUGAAGAAGGUGACAGUCCUUUGGGUGACCAUGUGGGUUCUCUGUCAGAGAAAUUAGCAGCAGUCGUCAAUAACCUAAAUACUGGGCAAGUGUUGCAUGUGGUACAGGCUCUUUACCCAUUCAGCUCAUCUAAUGAUGAAGAACUUAAUUUCGAGAAAGGAGAUGUAAUGGAUGUUAUUGAAAAACCUGAAAAUGACCCAGAGUGGUGGAAAUGCAGGAAGAUCAAUGGUAUGGUUGGUCUAGUACCAAAAAACUAUGUUACCGUUAUGCAGAAUAAUCCAUUAACUUCAGGUUUGGAACCAUCACCUCCACAGUGUGAUUACAUUAGGCCUUCACUCACUGGAAAGUUUGCUGGCAAUCCUUGGUAUUAUGGCAAAGUCACCAGGCAUCAAGCAGAAAUGGCAUUAAAUGAAAGAGGACAUGAAGGGGAUUUCCUCAUUCGUGAUAGUGAAUCUUCGCCAAAUGAUUUCUCAGUAUCACUAAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCAUUUUAAAGUCCAACUAAAAGAGACUGUCUACUGCAUUGGGCAGCGUAAAUUCAGCACCAUGGAAGAACUUGUAGAACAUUACAAAAAGGCACCAAUUUUUACAAGUGAACAAGGAGAAAAAUUAUAUCUUGUCAAGCAUUUAUCAUGAUACUGCUGACCAGAAGUGACUGCUGUGUAGCUGUAAUUUGUCAUGUAAUUGAAGACUGAGAAAAUGUUGGGUCCAGUCGUGCUUGAUUGGAAAUUGUUGUUUCUAAAUCUAUAUGAGAAUUGACAAUAAGUAUUUUUAUUAUAACUCAGCCCAUACAUAUAUACUAUGUAUGCAGUGCAUCUGCAUAGAACAGUUCCUUAUCCUUGGCCUUCUGUUUUAUUGUUUUUUUCUUUGCUGUUUUCCCUUUGCUUCUAAUAUUACAGUUUUGUAUUUUGUAAACAAAAAUCAAAUAAUGCAUAUCAGAAUCUUUAUAUGGAAGAAAUCCUUUAUUGCCUUUCCUUUGUUUCCUUGUAAAGGCACCCUGUUCUGUUAUGGUUUUUCAUUAUAUAAAAUUAUUAUAUCUAUAUAUGACAUAUGCUAAAAUUUCUUGGAGAGUGUUAAUCUUUUCUGUGACUAAAUAGCAAUAAUAAGUGGAAAAUUAGAAAUUAUUUCCAGGUAUUAUAUUUGUCACAGGCCAUUGUAAAUACCAAGUAUAUUGUGUCUGCCAUAAUUUUUAAAAAUACAUUCAUUGUCUUCAGUCAUACAGCAAGACACAUGAGACAUAGAUUAGAAAACAUGUUGUACAAUUUUAAUUUACAACUGUUGGAAAUAAAAAUCACUUAAUUUUUUUCCAGUGCUUCUCCCUCAUCUGGUUAUUCAAGAAAACAAAACAGUCUCUGAGAUAUUUAGCUUUUCAAACUGUAAAUAGAUGCUCUAGUGUUAUUUAUUUUUUUAAUCCCACUUGUAUUAUUUUACCUCUAGAGCAUCUUGUAUUAGGACAUGUUAUAUUUAUGCCAGUGGGAAAUAAGUUAUGGCCAAGUUUUGCAAAAACAGGAAGCAGUGAGAUACUUGUUUUUUUCUCCUCACUAAAUAUCAGUAAUUGUCAGGAAUGGUAUUACCUAUUUUCAUUUCCUCUUUUCAGCUUUAAGUUUUGUUGAUUGGGACACUAAAACUGAUGUAUACCUGAGGAAAAAAUAGAAUGUGCUCAUGGUUAGGGAAAAUUAUAUUAUUUUUAAUUUUUUAAUUUGUUUUUUAACCAAGUAGGAAUUUGGGUGUAUGGAUAAGAGGCCAAUCUGCUUCUGUAGGCUAUAGAAGAAAACCAGUUGUAUUUUAUGGUCAUAAUUUGUCCCCCUAUUAUUCUGGAGAUUUAAAUUUAAGUAAAGUAGCCAUCAGUAUUUUAAUUGAAAAAUACUAAAGCCACAUAACUGAGUAGGAUGUCGUAUGAUACUUUCAACAAAUUCCCUAAUGCUGCCUAAGCAUAUGGAUGUUUUAAUUCUUUGCUGUUAUAAAUAGAUAUCUAAUACGCCAGAAUUACUGAUGGUAAAAUUGAAGUUGUGUAACUUGUGAAUUUUUUUUAUCAAUGUUUUAAAUAUUAUUUAAAUCUUAAAAUCAUUUAAAGACUUAUGUUGCCACUGGGUGGCAGCCAUGGCUUCUCCCACUAAGCAACAGAAGUGACCAAAUAUAAUUAAGACAAAUUUUCAUCUCUAUUACAUCUGCUUUUAAAACAUUUUAGUUCAUAUUCUAUUAUUUUUCUAACUCAGUACUCCUUUGUUGAGGGUAAUUAUUAGUAGUUAAGUUUUUAAUGGAAAUAAAAAUCAUGUAUGCUUAUCUUUGCUGUAAAAUCAAAUGAAUAUAAAUUGAGGAAAACUUUAAAUUGUUGUAGGAUGACUAGUAGUAAACAUCAUCUUAAUUUUUAACAUAUAUUUGAUGAUGCUUUCCUUUUCUCUGUAUGUUUCUGGGUUUUCCCCCAGUCUUCCUUAUGAAAAAAAUGUAUGUUUGUAAAAAGAGAACAAUUAAUGCUUUGCAUCACAGACAUAAACUAUUCAUAGUAAACUGCACUGAGCUGAUAUUAAUAGAGCAGACUUUUGAGAAAGUAGGAGUGUAGUAGCACUGGAAACAGAAUGCAAAUUUCUGUUCCAUAAUUAGGUUUAUUGUAGCUAUAGCGCUCCCAGAUAACCCAUGUGUGCUAGUAAUAUCUAUUGUGUGCUCUUACUAUGGUAUAAAAACCUCGCUGGAAGCUACUUAUUUUGUACUUAAAUAUUUUACCAAUUUUUAAAAAGUCUUAAUCCAAUGCUUAUACCAGUGACUGUUUUUAUAAUACUUGAAGUAACUUUAAGAACUGAAACAACCCUGGAAAACUCUACAUAGCUAGAUAGUAACAAUACUUGUAUAAGAAACCAAGUUUCCUUAUUCCCAGCCUGGUGUCUGUAUCGUGACACACUACUCUGUGUAUGCUUGGUUUUAGACUAGGAGGAGAGUCCUGGGAAGGGCAAUAUUACAGAAGUUUUCUUCCACAUGAGGAGAAUGCUUAGUUUCAAAUUUAAAUACAUGUGUCAGAUGGAACCCUGCCUAACUCACUUCUACAAAUAACUUCCCCAAAAUCUUAGAAGGUUUUUUAGAACAUGAUAUAAGCUUUGUGACAAAAACAAAUGCCAUUGUGUCCCUUAUUUAGUCAUAAAACCUUAGGAUUCAGCUGAAUAUAUAUUCACACAUGUAUAUUACACAUAUAUCACUAUACAGUUAACACAUGCACCUUGCACUAUUAGUGACAAAUAAUACUGCUAAACAAAAUAGGCUUCAUGCAAUCUAUUGCCAUUGCUAGAAGAAUAAAUAGGCCUAGCAGAUGGGCAACUUGGGUUGUUAGAAUAAGGUCAUUCUUGCAGAAUAUGGCACUUAAAUUAUCUCCAGCUGUAAUGUCCUACCAUAUAAUCCAGAGGUUGCAUAGAAGCAGAGUUGUCACAGUCUCUGUAGCACGUUUGUGAGAAUUCUCUAGGCAGGCCCAGCCCUUCUCUAGAAGUUUGAAUUUCACUCCCACCUUGUUGCUGGGGUACCUUCUUCAGGGUACAUCUAAACACAGUGGCCUUAUACAGAAAUGUUGUUCAACCCACACAGUGCUUUAAAAAAUUAAUUGCCAACAUUUAAAAAUCAGGGAGUUUCACAUAAAAUUCAGACUUCUUGUUUCCCUUUAAAAAUGAGAAGCUAAUAACAUGAGUUGAAUUCCCACAAGUCAACAAUGAGCUGGAAUCUAAUAUGGAUGGUCCUCUUAUCUUUACCAGUGCACAUGGUGAAAAAAUUCAAACAGUAUAAUAAAGUCUUCUUUCAAGUCAAAAUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-974.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1061.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 1144.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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